Entry information : NoffRboh01-1A (Nasoff698g0300090.t1)
Entry ID 18511
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh01-1A (Nasoff698g0300090.t1)
Name (synonym) NoffRboh01-1A (Nasoff698g0300090.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh01-1A
start..stop
S start..stop
NoffRboh01-1B 1738 0 1..886 1..895
AlyRboh01 1558 0 2..886 7..897
AtRboh01 1554 0 1..886 7..902
TsRboh01 1547 0 1..886 1..907
Literature and cross-references NoffRboh01-1A (Nasoff698g0300090.t1)
Protein sequence: NoffRboh01-1A (Nasoff698g0300090.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   886
PWM (Da):   %s   100923.02 Transmb domain:   %s   o328-345i468-490o510-532i692-709o
PI (pH):   %s   9.62
Sequence
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IAVKHPKTKV GVFYCGAVGL VKELRHLALD FSHKTSTKFV FHKENF 

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Remarks
Promoter
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCAACCCTC ACCCTTAAAC CGGACAAAGC ATGAGCCATC TCATGATTTG TCTCAGCAGT CTTGACTTCT CTATTATCAG CCACTATAGC TACTTTTGAT CTTAACATTT TAGATGCACA  ACAGGAAAGA CATTCCTTTC CAGAATCTGA TATAGCAGAT GATAGCCTAA GGCACGATAC AGGATCATCA CTGCTCAATA TATGTCTACA ATAGCTTACA AGAGAATTCA ATCTCTCAAC  TTCACCATCA GGTTTAGGTG GATAAAACCC AGAAACTGGA GAATTAATTT CGTTTTCCAT CAGAGCAAAA ACCCTCTTGC TTCTCTTCCC ACTAGAAAAG GTTCCTTGAG ACTGTCCTGA  CGAAAATGAT GCTCCAATCA TTCGATATCT ATCTTCAGAA ATCAAAGTAT CTCTTCCTTC AAAATCAATC TCCTGAACCA CAAAACCAAC TCGATCATGT TTATAGCACA ACCCTTGTTT  CCCACAAACA AACAATACCT CATCACCAAT AGAAATCTCC TGAATTTTGG CTTTCCTAAC CTTAACACGA TTAACATAAA CACCATTCAA AGAAACCCTA AATTTCAAAC TTCCCTTATC  CAGCTCATCA CCTCCAACTA CTATTCTCCT AAACTCATCA AAAACAACTT GACTAAAACC ACCCGAAGGC AAGAGTATCA CGCCATCAAT AATGTAAAGT TTGTGACTTT GGCTATCAAA  TAGAATCTGA CAGTGCTTTC TACTGACAGC ACCATGATCA AAAGCGAAAT CGCAAAACCC ATCACTACTT CGACCTATCG TGTACAGCCG ATCTGATTCA ATGTGAATTG ACTCTATAGA  CAAACCAGAC GACCCAGAAA TCAATGGTTC ACCAATATTG TGAATACGAA CCAAAACTTT CTCGCAGTGT CGCCTTTTCA TATCTCAGCA AAAACCAAAT CGAATTCTTA CATATCACAT  ATGATATAAC GAAATAATAA ACCCTTAAGA AAATAGGAAT GATATAAATT TCAAAGAGGC TTGACTTCGG AAGCAAAACC CTTTTCCCCG AATTGAGTTC CGATTTCTGG GATTTTCCCT  CTCAAATCGA TGTGCTTTGG AACTGTCTCG CTTTCTGTTT GGACACTAGG ATTAAATTAC CCTTCACCTA AATACTATAA CTTTCCCGCT TTAACACACC TGTTGTTACT TAAATTCTCT  TACCTTCAAA TTTTATGGTA AAGTTTTTAT CATATATAAA TCCTTTTATT TTCAAGGTCA TTGTTATAAT TTGTTGGTTT CGAATGCCAC TAATGATATT AGTAAGATGT GTAATTACGT  GATAGTTTTC TGTGTGACTT TTCCATGATT TATTAAAGAA AAGTCAAAAT CTCATATTTG TTTGACAGAT TATTTTTTGC AAGTAGTAGG TAAATATAAA ATGCTGTATT TATTAAGCAG  GTGGGTTGGA TAATTATTTA TCAATTCAAA AAAATAATAT AAAAGAAAGG ATTTAGATTT TAATGTTTGA TCAGATGAAA CATGACTTAT GTATTATATG ACGATTAAAC TCATTAAAAT  TTGAATATCC TGACCATAAC TTATAATAAG TCTCATATTT GACGTGGCTC GGTATTGCGC GGGAGATTTT ACTAGGAAGA GAAAATACTA ACACAACTCA TATAAATTTT CTAACCAACC  CAAACACACA ACAACAATTT TAAAATTAAA GTCTCCTCTC ATGCTTTGAA ATTTTCTTAA TTAATTTTTT TTCTTAATTA GTTAAGATTC AAAATTTCTA TAGGCTGTTA AAATATTTTA  CAATTTTTAA AAGACTATGC AAAACAATAA ATTAATTTCA GAGTGTATAC TTGGTGTATA CTTATGGTAT TCCGGATTTG TTAATTTAAA TAACTTAACA AGTTCGTCTC TCTGGTTAAG 
TTTGTTCAAC AATTCAAAAT CATTGGCTCT CTCATTGTTC GATCCTTCTT CAAAAACATA TTTGAAGAAT CAAAAGTGAA 

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Terminator +
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAAATAAAC GTTTGGAGAT GTATATATAT AACAATATGC TCAAAGAGTA TTAGTGGTTG AAATTGTAGA AAATGTACAT ATATAATGTG ATTTGATTCA GTTTTGATTT TGCAATAAAA  AAAAAAAAAA AAAAACAAAG GAACTCTTAC CCTGAGAGCT ACTTAAAGCT TACTTTAGCT TTCTTTTTGA GTCTCTGAAA GCTAGGTTTC ATGAGCTGGC TTGATGAAAT TGTTTGCTGG  TTAGAAACCT GACTTGACTG AAAAGGAATC AGAGGCTTCT TCTGAGTCAA GGCACACACA TCCGGTGAGA TGGGGTTACC TATGACTACG CTTGGTGATC CAACTTTTCC TCTCATCTTC  CTCGGAACTT CAAGTCTTTC CAAAATCATA GACGTTTTCA TATCGGCCTG TTTGTTGTTA CTCTGTATAG GAGAAAGAAC TCGGCGGTCT ATGTTTGGTT TGGGTGTAGT TACAACCGGA  GAAGAAGACT TCATGAGAAC CTCCTCAGTG ACTACTAGTT GTTCCCATTC TTTAGTAATG GAAGCTGTTG TTTTGTCTTC TTCATTAATC ACATGGACAT CCTGAAGGAT GGCTTCTTCT  ATGGATCTCT GTCTCGTTGG AATTACAGAA TCTGAAACTA CTGAGCTCAC TTCTTCATAT GTTGCATCTT TCGTGTTTGA ATGTAATGAA CTTCAAGAAA CAAGAGAAAA AAGTTTAGAG  ACCTGTAACA GCTTTTCAGG AATACTAATG AAGCAGAGAA GAGAGGAGGA GAATAATCAC CCAAATTGAA GACTTTCCTT CACAATGATG TTCAGTTTTT GGTGGAAGCC TCTGTTGTGG  ATCAGAGGAT TGTAGTCTGT TGATTCAATC TGCTTAAATT TCAGAAAGAA AAGACAAGTT ACAAGGCTAA ATACCAAATA TGAATATCAA CAGATTGAAA TGAGATCGAC CTTTAACAAA  GCGCCTTTGA CAGAGATCTC AATTTCTCTG GGAGTAGAGC ACTCGGAAAA CTGACTGATA TTGGAAGTAG GCAGGACTTC CTCTGATCCT GCCAATCTCT GCAAACAATT TTGTCTGTTA  AACTAAGAAA CTGCAAAAAC TCAAGATGTA ACGCAAACTT ATCATTTGAT ATAGGGAGAA AACTATTCAA AAGGCTAATG TTATTTGATT ACCCTCAGAA GCATTGGACC ATTTTCTGAC  GGTAGAAGAA TGTAGTAACA ATGAAATTCC ACTATTTTCA AGGTGTCTAG ATTACAGTTT GAAGAACAAA CCAAGCCTTG GTCCATCGAA AATAGTGCGC CACATAGTCC CTGAAAAACT  GTATTCCTAG CTGCTTAGGA AAAATGTGAG ACATTGGGTA ATTATACCTG AGCTACTGCA ATGTGGGTTT CTTTAGGGAA AGACTGCTTA CTCTGAGTGT TCAGATCTGG TTGATCCATT  TCTTCCGATA AAGCTTCCGC TTCATGACAA CTTGAAGGGC TTAGAATGTA AGGCGTCCCA AATATTAGGC CTATGCCAAA GTATACTTGG ATCAAGGTCT CTGTTATGGA GGAAAATAAA  AAGAGAGGAC ACCAGAGTAG CTGAAAGTGT TACCTTCACT GAGAGAAGTT AGATTAGTCC TCTCTATGAC ATAGAAATTA ACTTGGGAAG AAATTGGATG AAGTTTCTGG AGGCTATGGA  TTGAAGGCAA AAATAGGACA GTTCTGTCGC CAACTTTCAC ACAATTTTCA ATCACATCAA ACTTTCCAAG TTCATGATCG TCTACTGAGC ATTGCAGCTT CTCCCTTTTT CTTTTCACTG  AATCTCGTAA TGGGATGCCG TGGCACCTAC ATGTCTGTAA AAGGAAACAA AGGAAATGAA AAACTGTAGT GGACAAAGCA TTACCTGAAG TAACTTATGA AACATACAAT CGGAAAGTAT 
CAAGTATTGG CCTAATGATG TGAAGAGTAA GATTATTGGA ATATATGAGA TTTAATTTTG GGGTTTGGCT CAGTACTCGA 

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DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAAAAGT TAGGATTCGA AGACCCAAGC GGCACAGAAA CTCCGTACGG AGGACAGTCA TCGGCGGCTA GCAATTATTA CGAGGAAGAT GAACCATACG TGGAGATCAC GCTCGATATT  CACGACGATT CCGTCTCCGT TTACGGTTTA GAGTCACCGG ACCATATCAG CGCCGGTTCA AAATACGAAG ATCAATCACT TCTAAGAGAA GGTCGTTCAG AGAGAAGTAA CTCAGTATTG  AAACGCATGG CTTCTTCAGT TTCTAGCGAA CTGAGACGAG TTACTTCTTC CGTTTCTTCG TTATCCCCGC AACAACCACT AGCTCGATTC CGCCGTTCGA AATCTAGAGC AGAGGTTGCG  CTCAAAGGTC TCAAGTTCAT CACCAAGACT GATGGCGTCA CTGGTTGGCC TGGAGTTGAG AAACGGTTCG GTGAGATAAC TATGACTACC AATGGATTAT TACACCGGTT TAGATTCGGT  GAATGTATTG GTTAGTTCAA CATATCACTC ATTGTTTTAT CCTGTTTTGA AACTTCAATG ATTATATAAA CTTTTGAATG TTAGGGATGA ATTCGAAGGA GTTTGCCTTG GCATTGTTCG  ATGCTTTAGC AAGGAGGGAA AACGTTAGTG GAGATTCAAT TGACAAGGAG GAGCTTAAAG AGTTCTGGAA GAAAATCACT GATCAGGATT TTGATTCAAG GCTACGAACT TTCTTCGCCA  TGTAATATAA ATATTTCAGT TCATTTTATA TTACTATCCC ATATATAATG AACTTTGAGT TTCATATTCA AGTGTGGTAC TGTACATATA CTTCAGGGTC GATAAGGATT CGGATGGGAG  GTTGAATGAA GCTGAAGTTA GAGAGGTAAT ATATTGATTT TACTAATCTT GAAGCTCTCT GCCAATTGTG ATCTTCTTCA TTAGTATCTT CTTGTACAGA TTATAGCTCT AAGTGCTTCT  GCAAACGAGC TGGATAATAT TCGGAGACAA GCTGATGAAT ATGCTGCTTT GATTATGGAA ACTCTAGATC CCTATCATTA TGGGTACATC ATGGTATGTG AATGAGGTTC GTTTTTTATT  CATCTTATTT AGTTAGAAAT GTTTTAGTGG TTTGTGAGTG TTTTTTGATG AGTTTGGAGG CACTTGCTAC AATGCCTAAC AGATAGAGAA TCTCGAGATA CTTTTGTTGC AAGCGCCGTT  GCAGCCTGTG AGAGATGGGG ATAATAAGAT TCTGAGCAAA ATGCTAAGTC AAAAGCTAAA GGTTTCGCAG AGTCGAAATC TTGGGGCGAG GTTCTACAGA TGGATGAAGT ATTTTGTGTT  TGATAACTGG AAGAGAGTGT GGGTGATGGC TCTATGGATA GGTGCTATGG CCGGGCTGTT CACTTGGAAG TTCATGCAGT ATCAGAAAAG ATCCGCTTAT GAAGTTATGG GAGTTTGTGT  TTGTATAGCT AAAGGAGCTG CAGAGACGCT TAAATTAAAC ATGGCTGTAA TTTTGTTACC AGTTTGTAGG AACACCATCA CTTGGCTCCG GACCAAAACC AAGTTAGGTG TTGTTGTTCC  TTTCGATGAC AGCCTTAATT TTCACAAGGT AATGTTTACA GCTTCTTGGG GACTAAAAAA GAGGTTATAT TCATATACAT AGGAATACTT ATGGTTGAAT CTTACTTTCA CAGGTCATAG  CAATAGGAAT TACAGTTGGA GTCGGAATCC ATGCTACAGC TCATTTAACC TGTGATTTCC CCAGGCTAAT AGCTGCAGAT GAAGACACGT ATAAGCCAAT GGAGCAGTAT TTTGGGGTAC  AGAAAAAGAG ATATATGGAC TTTGTGAAAT CGGTTGAAGG AGTTACCGGG ATTGCAATGG TTATACTTAT GACCATAGCC TTCACATTAG CTACACCATG GTTCAGACGT AATAAGCTCA  AGCTTCCTGG ACTACTGAAG AAAATAACAG GCTTCAATGC CTTTTGGTAC TCTCACCACT TGTTTGTTAT TGTCTACATG CTGCTCGTTA TTCATGGATA CTATCTCTAC CTCACCAAAA  CTTGGTACAA GAAAACGGTT AGTAACTTAT TAACCACTAG ACCCAACACA AAGTTTCAAT ATGGACTCTG ATTTTGGCTT TCATTTGATT AAATAGACGT GGATGTACTT GACGGTACCG  GTGGCTCTTT ACTTGTTAGA AAGGCTGATT CGTGCATTAA GGTCAGGCAT TGAGGCTGTT TCTATACTAA AGGTAGAATC TATAGACATT TCTCCATTGG AATATCCCTG AAAAAGAGGA  GCATCTACAT GTATCTCTAT TGTTACCTTA CTTCTTCAAC AGGTTACTGT GTTACCTGGG AATGTCTTGT CGCTTCAGAT GTCAAGACCA AACAACTTCA GATACACAAG CGGACAATAC  ATGCATCTCA AATGCTCTGC AGTTTCTTCC TTGGAATGGT AATAAGAGTA ACTCTCATGT TGTCTGAATA TATTAACTAA ACAGTGGTTT TGCATATAAA CAGGCACCCA TTCTCAATTA  CCTCAGCTCC AGGAGATGAC TACCTTAGTG TCCACATCAG GGTTCTAGGA GACTGGACTA ATCAATTAAG ATCATTATTC TCTGAGGTAT TTCCCCTAAA CATAAACACA AAGATATTAT  GAATTGGATC CAATTATGTA ATTTACTTGT ATCTATCTGA ACCTCAGGTG TGTAAGCAAC TCCCTCCTGA TGAAAACAGA CTCAACAGAG CCGACTCAAG GCACTGGAAT AGCAACCCTA  AGTAAGTATA TCAATAACTG TCCATCAGTT ATTCACTGAA GTATATAGAG AGTATTTAGA AATTAGATTA AACTTTGAAC TGTAATCCCT TAGCTTTCCA AGAATCCTAA TTGACGGTCC  ATATGGAGCA CCGGCACAAG ACTACAAGAA GTTCGAAGTT GTTCTACTCG TGGGTCTAGG AATTGGAGCT ACTCCGATGA TCAGCATTGT CAAGGACATA ATTAATAACT TAAAAGGAAA  CATAGAAGAA GGGAGTAACC GAAGACAGTC ACCAATCCAC AACATGGTCA CACCTCCTCT TTCCCCAGCA AGAAAAAAAG AGATGTTCAG AACCAAGAGA GCTTACTTCT ACTGGGTCAC  AAGAGAGCAA GGGTCATTTG ACTGGTTTAA GAACGTGATG GACGAAGTGG CCGAGACAGA CCACAACAAG GTAATTGAGC TGCATAATTA CTGCACCAGC GTCTACGAGG AAGGAGACGC  TAGATCCGCA CTGATCACGA TGCTCCAGTC GCTGAACCAT GCCAAGAACG GAGTGGATGT TGTGTCAGGG ACGCGTGTGA TGTCCCATTT CTCTAGGCCA AACTGGAGAA GTGTTTACAA  AAAGATCGCT GTGAAGCATC CCAAGACTAA AGTGGGTGAG TTTCTTTAAC TAACAAAACC ACCACTCTCA TCTATTTATG CATATGAAAA TAATGTGAAT ATTTAATAAA ATTGGCAGGA 
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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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TTCCACAAAG AGAACTTCTA A 

Retrieve as FASTA