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Entry information : NoffRboh04-1A (Nasoff1105g0359870.t1)
Entry ID 18514
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh04-1A (Nasoff1105g0359870.t1)
Name (synonym) NoffRboh04-1A (Nasoff1105g0359870.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh04-1A
start..stop		 S start..stop
NoffRboh04-1B 1855 0 1..920 1..920
AlyRboh04 1786 0 1..920 1..920
AtRboh04 1777 0 1..920 1..921
TsRboh04 1716 0 3..920 1..928
Literature and cross-references NoffRboh04-1A (Nasoff1105g0359870.t1)
Protein sequence: NoffRboh04-1A (Nasoff1105g0359870.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   920
PWM (Da):   %s   103229.03 Transmb domain:   %s   o378-397i517-539o559-581i739-756o
PI (pH):   %s   9.27
Sequence
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LQSLQHAKNG VDVVSGTRVK SHFAKPNWRQ VYKRIAVQHP GKRIGVFYCG APGLTNELKK LALDFSRKTT TKFDFHKENF 

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Remarks
Promoter►
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GTAGCAATGC ATGTTCAATG ATGAAGACAA GCCTTCTCCA GTAATCAAGG GACCATTTTT ATCAGTTGTG AGTACACTGA GGAATTCTGG CAATGGCATT TCACAAACTG GGTTTTTCAC  ACATTAACAG CTGTACACAA GTGGCCATCG GTCAGTTCTG CTTCCTCACC TTGCTTACTT CGTAGACTTG TATCCCAAAA TACGCTCTAA TTACTTTGGA AAGAAAGGAA CTCCAGATCA  ACTACTGCAA GTCCTAGACA AAAACATCAG AGATATGATC CTAGCAAGGA GGGGACGAAA GGGTTTCGAA ACCTCATGCA AAAATGGTTA TCTAATTGAT CTTTAGAGTT ATGATCTCTC  AAAAATCGAC TTTGTTTTTC ATTCTTTTTT GGTAAGAGTT ATATATTTTT TTAACTTTCA TCCCTTTTGT AAATCAAAAC CTTCATATTA GTGAATTTCA CATATTGTTT AAAATTTCAG  AAAAGAAAAT AAAAGTAAAC CCACTTTGTG GTTAAATTTT TTCAAAAATA CATAATATAT TATCATTATA TATTAATAGT ATATTTATTC TATGTATATT GAATATTTAA TTCAATATTT  AAGAATATAT GATTTTCTTC CATTTCCATT AGAGTCACTC CTTAATCCTT CATATTTTAG TAAACATGTT GTTTTTATAA GAGTTAACAT GAGTTTTTTT CATAATTAAC TAATTCGAAG  ATACAAAGGT AAACATTAGA ACTTTACAAT CTCCTATCCA GCCTATGCAT GCTCTTCAAC ATTAAACTTA TTAATGTTTT AGCATGCATT CATCTAGGTT CTCATCTATA TATAAACTCT  CAAACATTTG ATCAAAGAAC ATTTATAGAC CCTGGGTCAG ACCTTGCCCT TCTCTTACCA GCTGCCCACC CATAAACGTA CATGGAATTT TCATGATCAA AAGCAAACAT AATTAATCCC  AACCCAAAAT TGCGTAAGCA TTTCAGTTTA ACTAGAAACC AAGTCTAAAT GTCGAAAGAA AAATAAAAGA TAACCAATAT TGCCACGCAG ATGTTTTCGT TCCTTGTTCA CATCAGTTTT  TATCAAGCAG TACATTTTGT ATATTTTATA AACCTTCCTC TCTCTCTTTT TAAAGACGTC CGATGTTATT TTGTGAAATA AAAAAAATCA ACTCATTCAT TACCACATGC TTAAAATTAC  TAAACCTAAG TCATATTGCT ATAAATTAAT CAGTCTTTTA TTTCTAGAAA CAAAAATAAT TCAAAAACGA GATATCTCAC ATGGAACTAT ACATAAATCC AATTTAAAAA TAGTTCGCCT  ATAACACTAG GTGAGTTATA TATTGGAAAA CAGATTACAA GTTAAACGTT GTAAGCAACA TATTTATATC GTTCCATGAA AATGCGCTCC AAAATGAATT ACGTACAGAT TTGACTTTAG  TAAAAGACAG TCCATCCCTA CAGGCTATAG GCAAAATATC AGTATTTTTT TACTGATTGC TATACAAATA GGATTAAATA CAACATAAGT AAACTCTCTT CCGTTCTACT AAAATCTTAA  TTAATCATTC TTTTTCATGA AAATTGACAC GCGGTTATTA AATATAGATA AATAAAGTAA TAACGAATTG GTGTTGAAAT GTATAAATGA CTCGGTGTGG ATGAATAGAA ATGCATACAA  AAAACGAATG AAATGAATGA AAAAAGTCAA AATAAATATT CAGCAAATAT TTTGACCGGA CCAGGGCGGT CCATCCATAG TTTCTCATTA CCTTCCCTGA TTTTAACACA TATGAATTGC  AATTTGCATG CCACTTATAT TCTTTTGCCT CTATAAATAT TTTACACAAA AAACCAATAT CTTCCACAAA CAAAATCAAA CACATTTTTG GTTGCGGATC TTTTCTTCTC TCTGTCAAAA 
TAGTAAACTC ACGTGTCTTG TTATTTTGCA AAAGATCTCT TTGTGTGTGT TCTTGGCCAA ATCAAGTTTC TTGAATTTCT 

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Terminator +►
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ATTAATAATA TACAAGTTGT AGAAAAATAA AATAAGAATC TGCAGGTAGA TATTTATTTT AAATTCTTTT CATTTTATGA AAAATCATCA TCTGAGCTGT CTTTTTGTTT CTTCTTGTTC  CTATTGTTTT TTGTTTACTA TTTCACTACT TGGGTTAATG CTAAATATAA GTATAAGATA CTGAAGGTTT AGCTGCAACT TTGGTGTTGT AGTCATGTAA TTATGGAGTT ACTGTAACCA  TATTTTGAAC TGGCATTCGT ATCTTTTTTC ACAAGTAGAT ATAGTTTTGG TTTTGAATAT TCATTACTCG GTTAGATATC ATGACAATAT TTATACAAAT GGATTTAACC TTATTATAGA  ATCATTAGTT CTAAGGGTTG TATTTTGAAT TAAGATATAT ATGACTGAGC TTTAATTCAG ATTCTATTAT GGACTTTTAA AAAAAAATAC TTGATTAGGT GGTCATTATA AGAAAATTGA  CTTTCTTAGA CATCCGAAAA CAGTATCTAA CTATACCATA GCATAGTAGG AAACGCTTTA TTATAGCCTA TCACAGTAGG TCGAAGACAT ATATAACATA AAATATTTAT TTGTGTTTTT  GTATTATTAG TTATTATAGC ACATTATTTG CTGCATATTA TACATTACAA TAGCAGAAAT ATAATGATAT TAATGTTATT AGTCACACTG TTCCAGAATT ATTACAAGAG CATCTAAAAC  CCTGACATAC TCTTCTTGGT ATCTCAAATT ATATTTTTGA TATAATTTAA TTAAATTTTA AATGAAAAAG AAAATAATTT AATGAATGAT TGACATGTGG ATAAATAATT TTCTCATACA  TTTTTTGAAT TTCTCAACTT TTACTTACTT TTCTTATTAT TTTTTATATT TTATTAGTTA GAAACCCTAT GAGAGACCAA GTACTATAAT ATTACAATAG CATTTTGTAT TATGCAATTT  CTTGTAGTTT AATTTTTTTC TAGCACCTAA TTTGTAATTT CGATCATATT GGTATTTATC TAGAAAATTA TACTGAATTA AAGGGAGTAA AGAGAATTAA AATATGATGT CAATGAAAGT  ACAAAAATTA CATGAAACAT GTCAAAATAA TGAAGTTACA AAGATATTAA CATAAAACAA AAATTCAATG CTAATCCCAA CATTAGAGCA TTCTCAGCCT TGAAGATACC TTAAGCGTAT  CTGAAAAGTA TGATTATAAT TAGTTAAGAA TAAATAAATT ATTTATTTAA ATCTTAAATC ATAAAATTTA ATTTTAACCA ATTTTAGCAT GACAGATGTT TATATACTGT TTCTAAAAAT  CTCTTAAATG AGATATATAT CTCAATTTAT CTAATACTTT TGTTATTTTT TTTTATTAGA TAGATACCCT TCCTCAACTT CCCGTTGGAG GTGCTTAGTT TCAGAAAACA TTGAGTATAT  ATATGCTATT TTGACTGTAT GAGAAACTTC AAAATATCAA ACAACTTACC ATCTTAAAAT CCGGAGCTAT CTTCTGCACT GACCATAGTT TGAACTTTCA CCGGAGGGTT TCTCTGCTGG  TGCAGCCTGT AGTTCATGAA CCACATTACC AACAACTTGG TCACTATATA TGTTTCCTCA ATCGCAACTT CATCCTTATA GTCTTCTTGT TGATGTTGAT GTTGATGTTG ATGTTGGTCC  TCTTGCATAC TATAATTATT GACACTATCA TCTTTAACTT TGACCGCATT TACGTAATCT CTTGCCTCAT GCTCAAGAAG ATAATCAGGA ACTGGAAATT CAAACCAACT GATATCAACT  AGAAATTTAG CATAAAAACA AAACAAATTC ATCACTTTGA ATATGCTGAG ATAGAAAATG ACAAACCGAT TAACCTTTGC TCTTCCAAGA CGTGACAAAC AAAACTTAGG GTTTTTGTTG 
AGGGTTAGGA GGACTTAGAT GAGCTTTATG CTTGTTTTCA AATAAATAAG CAAAAAAAAG AAAAGAAACA CCTAAGTAAT 

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DNA ►
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ATGAAAATGA GACGAGGCAA TTCAAGTAAC GACCAAGAAC TTGGGATTAT ACGAGGAGCT AACTCAGACA CCAACTCTGA CACCGAAAGC ATCGCTAGCG ACCGCGGCGC CTTCAGTGGT  CCACTTGGCC GGCCTAAACG CGCGTCCAAG AAAAACGCAA GATTCGCCGC GGATCTTCCC AAGAGAAGCA ACAGCTTAAG CAGCGGCCAC GGTGATGACG ACGACGAGTA CGTAGAGATC  ACGTTGGACA TCAGAGACGA CTCGGTGGCT GTTCACAGTG TTCAACAAGC GGTTGGAGGT GGGGACCACT CAGAGGATCC GGAGCTTGCA CTTCTTACGA AGAAGACGCT TGAGAGCACT  CTCAACAACT CCACTTCTCT CTCTTTCTTC CGTAGCACCT CCTCAAAAAT CAAGAACGCC TCCCGTGAGC TCGGGCGCGT GTTCTCTAGA CGCCCTGCAC CTGCCGTGAA ACGGTTCGAC  CGTACGAGCT CCGCGGCCGT CCACGCTCTT AAAGGTCTTA AGTTCGTCGC CACCAAGACC GCCGCGTGGC CAGCCGTGGA CCAACGTTTC GATAAACTCT CCGCTGATAA CAACGGCCTC  TTAGTCTCTT CCAAGTTTTG GGAATGTTTA GGTAATTATA TCTTACTAAG CTATTTTATT ATATTATATG TTTTTATTTT CGTTAGTTTG AAATTTTGGA TTTTATTTTA GGAATGAACA  AGGAATCAAA AGACTTTGCC GACCAACTCT TTAGAGCATT AGCTCGTCGG AATAACATCT CCGGTGATGC AATCACAAAA GAACAGCTAA GGATATTTTG GGAACAGATC TCAGATGAAA  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CDS►
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TAG 

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