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Entry information : NoffRboh03-1A (Nasoff1150g0365310.t1)
Entry ID 18515
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh03-1A (Nasoff1150g0365310.t1)
Name (synonym) NoffRboh03-1A (Nasoff1150g0365310.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh03-1A
start..stop		 S start..stop
NoffRboh03-1B 1815 0 1..908 1..906
AtRboh03 1724 0 1..908 1..905
AlyRboh03 1721 0 1..908 1..906
TsRboh03 1711 0 1..908 1..913
Literature and cross-references NoffRboh03-1A (Nasoff1150g0365310.t1)
Protein sequence: NoffRboh03-1A (Nasoff1150g0365310.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   908
PWM (Da):   %s   102193.73 Transmb domain:   %s   o352-374i495-517o537-559i719-736o
PI (pH):   %s   9.83
Sequence
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Remarks
Promoter►
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AAAGACAATT TTCACATATT TTTGTTTTCT TATTTTTACC TGCAATAATC ATGTTTAAGG AAAATTATAT TAAAAATTTG AGAGTTACAG AAACAACCTA CAAATGAAAT ACAAAATACA  GAGACACTAG CTTGCTTCCA ACAAATTTGG ATGCTTATAA TGTTCGGACA CACACAAACC CTCCTCAAAA TAAGAACATA CTAGCTTGCA TCCAACTAAT CTGGATGCTT AGAAAAAGTT  CGGACACACA CGAACCCTAC TCAGAATTGT ACCCAAAACA TGACACAACT CGAGGAATAC GAAAAGAAGA TTAAGAATAA CGTACCAGAA TTGAGTGTAA TTAGCAGATC AAACCCTACT  CCGATTTTTT TATGCGGTTT ATGAGTTCCC ATATGAACTC AAAATGAGAC ATCCTTTTAC ATTTGATCAA TACTTCTGGC CCTATTCCTT GTGCTGTCAT TCTGATTTCC ATGACATCTT  CGGATTCAAC CTTCTATTCT AGAGTAGGGG GAAAGCATGA CCGGCGTTGT AAAGCCTAAG GCTACAAGCA AAAAGATAAT TATGGCCGGT TAAACAATAA CTGAGTTTTA AAAAGAAATA  AAAATAAAGT TATGTCTTGT TAAGGGAATA GAACTTTTAT CACCGGCCAG CCCAAGGAAC TTTTCATTGC AATTTATGCC TGTTTAAATA TATATTCTGA AGTAGGGCTG CAAATCCAAA  CTTGGTTTGT TTAGGCTCGA GCCCTACGGA GAGAATGGTG GAAGTTGTAC ATTAAGTAGC ACCATACCAC TTTTGAGTTG AAAAACGTGA CAAACTGATG TATTTGGCTT AGAGAGGGAA  TGATCTTGTT ATTGGTTAAG AAAGATGTAG ATGTGTTTTG TTAAAATAAA GAATATGGAG AAGAGCAGAA CTAGAAGTTG TTCTCTTAGT TGAGATTTTT TAGTCAGCCA AAAAATATAT  ATAATCAATA TTAATTAATA TCAAACTATC AAGTTTTAAG AAGATTTGTG ACAAGTTTTC TTTTTAATAA ACTGTATCTT AAAGTTAAAA GGAATAAAAA AATCACACTC CCAATTAATG  ATGAGGTAAC TATAACATCA CTATTCGGTA TGAAATTCAT CGTTAAAACA ATTTTATATT AATGAAAGAT ATATTTGAAT ATTTCGTTGC TAAAATTAAC AGCTATTGTC GCTGTTTGAT  TGTAGTGATA CTATGTGTAT AGTCATTGTT AGTTGTATAC ATAGACATAG ATTCTCTTTG TTCTATGGGC AGTTTCTTCT TAAATATAAT TTTTTATAAT GTATTTTGTT TTAATAAATT  GCAATTTGCA TTTGCTAACA ATTTATGTAT TTTTAAATGC TAAAATCAAA AAAGAATCAT AATGTTTTTC AAGAAATAAG TTTCCAACAT TCGCAATGGA CTTTTTAAAA AACCGTGGAC  TATTGTTTCT CAAGTATAAA AAAAAAATCT CAACTTTGTT ATATAGTATT TGTTTATCTT ACTTAATGTT GGAGAATGTT TTTGCATCAC AAATGCACGT TATAACACCA ATCAATTTGG  ATTTTTTTTT AATTTGCATC ATAGATGACA AATATGGTGG ACCAAGTCGG GCCACGTCTC TCTTACTTAT TCAAAATTTT ATAACTAGTC GTTGGATTAA GTACTCTCAT CTCTCTTCAC  TGTTTATAAA TATATCCATT TTCATTCTCC TATCAAAATC AGTTAATATA GTTAACTTTC CCAGAACTTT TCAGAAAGAG ACACTTTCCC GGAAAACACA TTCTTCAACT TTTTTTTCTC  TCTTCTTATA ACTGCCGGAA AATTTCAGCA TTTTGCTTTC ATTTTCGATC TGCATTTTTC TTTCCTGAGA AAAATAGACT TTAGAATGCT GCAAAGATGA GTTCATAATC TCTTTCAGTT 
CCGATCAACA AAGTCATCAT CAATTTCCAT TTTTTAACTT TCCCGGTGAA TATTCCGGCG ACCACACTTA AGAAAAAGAA 

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Terminator +►
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AAGAGACTCA GAGTTAAAAG ACATGAACCA AAAAAGAGAA GAAGCATGAG TTATATATAT GTTTCTTGTA ATTTCACTTC CCTCACTATT TTTATTTTTT CCTATGTATA CATGATATCT  TGACTGTAGA TTTCCCTCAC ACCTTTTGGT CGTATGTTTC AATTGTTTTT TTCTTTGGAA AATGTAACCT TCATTATACT CTCCATTAAA ATGCTGCAAA AGAGCAAATG TTTTACAAGT  GAGAAAGAAT TGCGAGATTA GAGCAGGCTC ATCTGTTAAA AAACTCAGTT GAATTTCTCA AAATTAGAAT AATAAATTGT TTTGTTTGAA ATACCTATCT CTAACAAGAA GATTTAGAAT  CTACTAAAGA ATAATAAAAA ATAAGATATT AGTATCAGTT TATTATATCT CAATTTTTCT CTTATTTTTT TAATTTTTAA TTATTTTTAA TCTTTAAAAA CTCGTTAAGA ACACGTCGTT  GTAACTGTTC GTATATATAT ATATATGTAA AATGGAATGC TATTATAGTA GTATTGCTAC CTTAAAGACT TAAAATTTTG TAAATCTCTT TTACATTTTT GTAAACACAG AACAGTTTGA  GAATTGATAT ACAGTATAAC CTCTACAAAT TAATATTCAA TGAATTAATA ATATCTCTAA ATTAATAAAT TATCATGATC CCAAGTAGGG TTGATATAAT ATTTGACACA TTTCGATAAG  ATAATAAGAT AATATTTTTT TTTTGAAATT TCTATATAAA TATATGGTCT CACTAATAAC ATAAATTAAT AATCATATAA ATATATTATA TATATAATAT ATTTTAGTGA AATATGATTT  TAATGTTATT TATTTATTTA TAAATTTATA ATTTTGTGGG AGTTTATTTA TATTTTTCTT AAAAATATCA ATAATATATG ATATTATTTT TTCAAATTAT ATCAAAATTT ATTTTAAAAT  TTATATATGC AATGATTATT TTCTAATATG TACATGCATT AAAACACATT GAAATATTAT TCTATTTTTT TAATTTTTAT GAAATATTTT ATGAAATTTA GCAAAATTTC TATAAATTAA  TAATTTATTA ATTTATGATA AATTAATACC TCTTTAAATT AATAAAATTC TACGGTCCCG ACCTTATTAA TTTGTAAAAG TTTTATTGTA TACAGAGATT GCAAATGAAA TAAGAACTAA  AAACAAAAGT AATTGTATTG GGGTTTTTCA AACACAAATC AATTCACTAA TTAGTATGAT ATTGTCCATT TTGAGCTTAT TAGTCAACTT CGCACAATTT TGTTTATTGA GTTTCTCATC  AAAATATATT AAACTAATTA GTGATTGATT ATATTATATA TTATATACTT CTTATCTAAT CTTTTCAATG TGGGATAATT TGGTATATTA TACTCCAACA GTTTGGTATT ATATATTATA  CTCCAACAGT TTATTATATA ATATTATACT CTAATCTTCT TATATATTAT ACTCCAACAG TTTGGTAGCC TATATAGTCT TGCTTTCTAG TTGATTATTT GTGTTTTTGC ATGAAGTGTT  TTATATTATG TGACACTAAA ACATATTGTA TTCATAATCT AGGCGGCTCT GATTTTTTTT TTTTCGTTTT TTTCATTGAC CACTTAAACA TTCGTCAACG TTATTTATTA ACTGCACCAG  AATTAATAAA AAAAAATCGT TCTGCTGTAC GTCCACTTTG ATGTTATGAT ATCGTAGTCC GTAGAATAAT TTTTTTCTTA CAATATCTTA GCACATCCAT TAATGGTATC AGAGTTTTTA  ATTAATAAAA AATAATAAAA AGTATGTGAA ATGTGAGATA CGGTTTTAAA TATAAAACTT CAAAAATTTG TATTTATCTA CCTGTCATAC GGTATTGGAT TATTTTGTTT TTTATTTAAA 
TTTTAATTAT TTAATTAAAT TATATCAAAA TTTTAACTAC CAGTAAACGC TATGTTTCAA ATGATTCTGA GAGATCTTTA 

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DNA ►
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ATGCAGAGTG TGGGTTTTGA AGTGTCAGGC TATCATTCCG ATCCCGAAGC GGGAAGCAGT GGTCCAATGA GCGGTCCACT GAGCGGTGGT CAGTTACCAC CGATATTTAA AAAACCAACA  ACTAAGAACT CTGGATTCAC GACGGAGGAT AGCCAAAGAG CACCGTCGCC ATACGTGGAC CTCACGTTAG ATGTTCAAGA CGATAGAGTA TCTGTACAAA GTCTAAAACC AGAAGGTGGA  TCTAGCATTG AAGAGAGTCC GGAGCTCACA TTGCTTAAAC GTAACCGTCT TGAGAAGAAA ACAACTGTTG TGAAACGTTT AGCTTCTGTT TCTCACGAGC TTAAACGTTT AACTTCTGTT  TCTGGTGGTA TGAGAAAACC ACCCAGAGTA CCGGTTAAGT TAGACCGGAC TAAATCAGCA GCCACTCAAG CTTTGAAGGG ACTTAAGTTT ATTAGTAAAA CCGATGGTGG TGCTGGCTGG  AGTGCTGTTG AGAAACGGTT TAATGAGATC ACTGCTACTA CTGGTGGACT ATTGCTTCGT ACTAAGTTCG GTGAATGCAT AGGTACATTG AAATGTTTGA TTTTATTCCA GATTATCAAA  AGATTTTGAA TGTTTTAATG AATAAGGTTT AATGTAGGGA TGGCTTCTAA GGATTTTGCT TTGGAACTGT TTGATGCATT GACTAGACGA AGGAATATAA CAGGAGAAGT GATTGATGGT  GATCAGTTAA AGGATTTTTG GAAACAAATT AATGATCAAA GCTTTGATTC TCGGCTTAAG ACTTTCTTTG ACATGTAGAG TTTTTTTTTT TTAGATTTTC CAATTTTTTA GTCTTTTTGT  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CDS►
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