Entry information : NoffRboh04-1B (Nasoff1845g0418800.t1)
Entry ID 18518
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh04-1B (Nasoff1845g0418800.t1)
Name (synonym) NoffRboh04-1B (Nasoff1845g0418800.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh04-1B
start..stop
S start..stop
NoffRboh04-1A 1855 0 1..920 1..920
AlyRboh04 1805 0 1..920 1..920
AtRboh04 1793 0 1..920 1..921
TsRboh04 1727 0 3..920 1..928
Literature and cross-references NoffRboh04-1B (Nasoff1845g0418800.t1)
Protein sequence: NoffRboh04-1B (Nasoff1845g0418800.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   920
PWM (Da):   %s   103777.51 Transmb domain:   %s   o378-397i517-539o559-581i739-756o
PI (pH):   %s   9.59
Sequence
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Remarks
Promoter
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TAAACTCACG TGTCTTGTTA TTGGCAAAGA TCTGTGTGTT TGTGTGTGTT TCTTGGCCAA ATCAAGTTTC TTGAATTTGG 

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Terminator +
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ATTAATAATA TATAAGTTAG TTTGATTTCC ACGAAGAGAA TTTCTAGATT GATAATATAT AAGTTGTAGA AAAATAAAAT AAGAATTTGC AGATAGATAT TTTATTTTAA ATTCTTTTCA  TTGTATGAAA ATCATCATAT GAGCTGTCTT CTATGATATG AGAAAACCAA GCTCCCTAAT ATCGTGTCAG AAAACCAACC AGCTTTTATC TCTGGAAGAT ACATCACAGA TAATATATTA  ATTGCTCATG AAGTATTTCA TTCACTACGT GTTAGAAGAA GATGTGCTAA TTCATATATG GTCGTTAAAA CGGATATAAG CAAAACTTAC GATAAGATTG AATGGAACTT TCTGGAAGCG  GTCTTAAGGA AGAAATGATT TAGTGATACT TGGATATCTT GGATCATGAG ATGTATCAAG AATGTCATAT TTTCCGTTTT AATTAATGGA AGCCCCTATG GAAATTTTGG GGCTGGGCGT  GGCATACGAC AAGGTGATCC TCTTTCACCA TACATATTCA TCTTATGTTC TGATGTTCTT AGTTCATTGA TCAATGAAGC TCAACGGAAA GGAACTATTG AAGGTATTAT ATTAAGTAAT  AGCGGACCTG CTATATCTCA TTTGTTATTT GCGGATGATT CCCTTTTCTT CATCAAAGCT GACAAAGAAA ATAGCCAACA ATTACTCAAA ATATTTAAAG ACTATGAAGA TGCTTCATGA  CAGCTTATCA ATCTTGACAA GTCATCTATT ACCTTTGGGA ACCGAGTTTT TCAACATACA AAGAATAGTA TAATGAGGTA TCTTAGCATA CCTAATGTTG GAGGAGGAGG GAAGTACCTT  GGTTTACCAT AACAGTTTGG TAGAAAGAAG AAAGAAATGT TCCAATATAT TAAAGAGAAA GTGCAAAACA AAATAAATGG ATGGCAAACA AGATTTTTGA TTACAGCTGG GAAAGAAACT  CTCATCAAAG CGGTAGCATT TGCGATGTCT ATACATTCTA TGAATATTTT TCAATTATCA GTTGAATTAT GTTCAGAGAT AAGCAGTATG GTTGCAAGAT TCTGGTGGGG AACGACTCCA  CAAAATAGAA AGATTTCATG GGTGGCATGG AAAAAGATGA CGGTTCCAAA AAGAAGTGGC GGACTTGGAT TTCGTGATTT ACGTAATTTC AACCAAGCTC TTTTAGCTAA TTAGGTATGG  AACATAATGC ATCATCCTAA TAGCCTAGTC TTTAAAATTC TTAAAGCTCG ATATTTTAGA GAGGGTGATA TGCTAAATGC TAGAAGAGGG GCAAATCCAT CATATGGTTG GAATTCACTT  CGTTTTGGAA ATGAACTTAT TCGTAAAGGA ATGCAATATT GTGTTGGTAA TGGGGAAACA ACAAGAATAG GATTAGATCC GTGGATTCCA GTAGAAACAC CTAGGCCACC TAGACTGTTA  TCAAATGTAG ATCCCACAAC CCCGGTCAAA GATATTATTA ACCCGATCAC AAAGGAATGG GATGAACATA AAATAAGGTC AATGATACAC CAAGATGACC ATTATGCGAT TTTCAAAAAA  TTTCTGCCAT CTCATCATGT AAAGGACAAG ATCATATGGA GTAGGAAAGA ATGGTATCTA CACTGTTAAA ACATGATACA TGTTGGCAGC CATTAGAGAT TCAGAGACAG AACAACCAAA  ACCACCATTG GCGAATCATC CTGATATTGC AGACAAGATC TGGAAACTAC AAATAGCTCC TAATCTAAAA CATTTTATAT GGAGAATAAC TTTAAAGGCG ATTGGAGTGG CTGAAAATTT  AGTACACCGA AATATGCAAG TCAACCATTA CTGCACACGA TGTTGTACGG AAACAAAGAC TACAAACCAT GTATTTTTCA CTTGTTACCA ATCTGAAGCG GCTTGGCGAG GATCTGGAAT 
CCCATATGGA TTTTTGGCCA ATCATGAGGT AAATGTTGAA GACAAGATAA GATATCTTAT CAAGCTTTCG GAAGATTTTA 

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DNA
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CDS
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TAG 

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