Entry information : PnodAPx08(Potnod000016g0295900.t1)
Entry ID 18741
Creation 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodAPx08(Potnod000016g0295900.t1)
Name PnodAPx08(Potnod000016g0295900.t1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodAPx08
start..stop
S start..stop
PnodAPx07 513 0 1..251 1..251
PotacuAPx07 505 0 1..251 1..251
CcampAPx07 443 3.26e-160 1..250 1..250
CcampAPx04 440 5.82e-159 1..250 1..250
Literature and cross-references PnodAPx08(Potnod000016g0295900.t1)
Protein sequence: PnodAPx08(Potnod000016g0295900.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   251
PWM (Da):   %s   27413.95  
PI (pH):   %s   5.58
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGKAYPTVSA EYQTSVDKCK RKLRGLIAEK NCAPLMLRLA WHSAGTYDVR TRTGGPFGTM RYPEELAHGA NAGLDIAVKL LEPIKEHFPI ISYADFYQLA GVVAVEITGG PDIPFHPGRP  DKEAPPVEGR LPDATQGTDH LRTVFITQMG LSDKDIVALS GGHTLGRAHK ERSGFEGAWT TNPLIFDNSY FKELVSGGKE GLLQLVSDKV LLDDHAFRPL VEKYAEDEDA FFVDYAEAHL 
KLSELGFAEA C 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTGATCTTCA TTCTCCTTCT GAAGTGTTTG TCTTCTTTTG ATTGTGTTCT GCAAATAGTA AGACCAAGTA TTATATCACG AATTATGTAT ATTTATCATT ATTGAAACAT AGATATCATT  TTTCTAACAA GTGAGGTATT GTTTTCTTAT TCCTCGACTT GATGATTTTC GTGACCAATT AAGGGGTACT ACTATTTGTA CTAAACTTGA TCTAAAATGT GGATACAATC AAGTTTGTCT  TAATCCTGGA GATGAATGGA AAGCAACCTT CAAAAAAGTA AATTTCTAAT GGTTTATTTT GATAATATTT TAAGTTATAG TTCCAACTTT GAAAGGCATA TGAAACATTT GAGAGCCATT  CTAACAATCT CGAGGAAAGA AAGTCTATAT TGTACTCTAA AAATGTGCTT TTATGGTTGA TCAATTCTGT TCCCAGTCTA TATTATATCT AGAAAAGGTT TGCAAGTGGA TGAGTCTAAG  ATTGCAACAA TTCAGCAATT CCCAACACCA CAAGCAATTA CCGAAATCCG CAGGTTTCAT GGCCTTGCAT AATACTATAG AAGATTCCTT CCACATTTTA GTTGAGTCAT CGCATCCACC  AATCAGTAAT TGCATGAAAG GAAGTTAATT TTCTGGAGCA ATGACACTGA AACGGCCTTT TAAACTATTA AAAGGAAGCT AATCTCCGCT CCAATTTTCA TTCTTCCCAA TTTCAGGCGT  CCTTTCGAAA TACACAATGG GAGATCTTGT TTGAGCAGTT CTTTCTCAAG ATCGGTTTCC GTCTCAGGCT TGCAGGTCTT ATTCGTACTT ACGATGTGTT CAATGTCAAA CATATTTTTC  CTTATTTTGG TGGTTCTATG AGTGTTGCTG TGGAATGTGA TGGGATCGTA TAATAGTGGA ATGACTAGAG ACAACATGGT ATGGAGGACG ATTTCAAATA AAAGGGAGGA AAGCAGCAAT  AAATGTAGTA ACTTGCTATG TCCTCGTCAT TTCCTCTCTA AATTGATCGC AAGACAAGTT GGCAAGCATC ATCGTGGTCT CCATGTCGTT GATTGCCAAC TCAGTGGTTG ACATTCCTCG  CTACGACACG TATTGTCCTC TCTATCTGGT CATGACGATA TGGATGACGA AATGTGGGAA GATACCTACC TTCCTCACCA TGTTACTTGT AAATAATGAG TATGTAGCGA GCATTAGCGA  GTAACACCCA GTGAGGATGT TGTATTTTTT TTCATTTCAG ATTAGTGACG GGTGAGCAAA TAGCGATCAC TATTGAGGAC ATGTTGCAGA TTTCAATAAG TGATGGATGA GGGTTATATA  GCCATAGTTG TATGGTAGAA GTTCCTTACG ACTTAAGCAT TTCTAATGGT ACGGAAATGA GAGAATTCTA GTAAGTAGGT CATGAGGCGT AGACAAAGTG AAGTACCTAC ACTACCTAGT  CAAATGCAGT ATATTTAAGC AATTAGTCAG TAAAAAATGT TGACAAAGTG AAGTACCTAT ATCACCTGGT GATCCTGATT TGAAGCTTGA CGAGGACGTA AGAGTCTAAA TGTGAAAAGA  TGTAATACCC AGAAGTATAA CTTCACATCA TTAATTTAGA AGTGACGGAT GGTGAATATA TAAAAATAAT TGTACGTTAA AAATACTTTA GGACTTGAGT ATTTTTCAGT AATACTGAAA  TGAGAAAACT CAATCAAGTA ACACATGAGC TGCATTTCAC GAATTGTGGA CTTGATAAGT ATAGGTAGAG GTCATGACAT CATAGCATAG GAACATCTTA TTTTGAATAA TTATCTTGGT  TATGTCAGTT GACAGCATTC CAGGAAGATC AACATCCACG TTTTTATCCT TTTCACCATC AATTCTTCAC TCCCATACCA TCATCCTCAC CGTACCTTTC TTCATCACGG TTTATATCAC 
ATATATCAGT CCTGTTGGTA AAAGATTTCA GTGCTCGTGG AACCTTGGAA GCCCATAAAT TTTTGTGATC CAACAATCTT 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTGGACACA CCTTGGGTAG GGCTCACAAG GAGAGATCTG GATTCGAAGG AGCTTGGACA ACAAATCCTC TCATCTTTGA CAACTCCTAC TTTAAGGAGC TTGTTAGTGG AGGGAAAGAA  GGCCTACTTC AGTTGGTTAG TGACAAAGTC CTCTTGGATG ATCATGCATT TCGTCCTTTG GTTGAAAAGT ATGCAGAGGA TGAGGATGCG TTCTTTGTTG ATTATGCTGA AGCTCACCTT  AAGCTTTCGG AATTGGGATT TGCCGAAGCA TGTTGAAACA AAATCTGTTA CTAGTCTTAT TTGAACTAAG CATGTCGTGG ACTACTTGTT GTTAGACGAT GATATATGGA AAACAAAGCA  TCTAGTTGTG TAATAAGATA TTGTATTTGT TGAAGTTGGT TTTTTACTAA GTAATTAAGA ACCTCTACAG AATTCTTAAA TATGACATGC ACAGATTAAT TAATTCATAT AAGACTTGAT  TACAAAAATA ATGCAATTAC AATGTGGACT TATAGAAGAT ACTTTGACTC TTTTATCTGA GTAAGGAACT ACCTATACAG TTTAACCATG TGTCTGGAAT GTTACAATGG AAATGCTATC  TACAACATTT ATGCATCTAG GAAATTTTGG GATTTCAAGT GTTCGATCAT ATGTTGATGT TTGGGTGGTT TTGTATGCTC TTGGAGTTCA TGTAAAGTGA ACTTCATGTT GTAAGGGTTA  TGCGAAAGAT ACTTTTCATT CAAATCCAAG AGACTTCACG TTGAAAGGGT TTTCCTATTT TGAGTTTTTC ACGTAAATCT TTGAAGTTCG TTTACCACAT GGTATTAGAG CCAATTGGGT  TTGGATCATG TTGACCGTCG CTTGCTCCTT TCGTTGCCTG TCCACTAGTG CAAGTACTGT TGGGGTCGCT GACGAAGATC CGACCGTCTG TTTTTCGATC CGATACCTGT TTTTGAATCC  TCTTCTTCTT TCATTCTGTC TATTCAGATT TTCAATCTAT CACTACCTTT GCCACTGCCA GTTGTCAGAA TCCTAGCCAC TCCTGACACT ATCAGGGACT CCTACTAAGA TCCAACCGTC  AATTTTTTTT ATTTGGGACC TTTTTTGAAA TCCTCTTGAC GTATTCTTTC ATCTTGTTGA GTTTGTTTTT TGACGCTACA AAGTTTGTCC GCGTCACCGC TGCTGATCGG TGTTTCCAGC  GGTCATTCTG ACGGTCGTTA TAGGATCCAA TCACATACTT GGACTCCTCT CTCCATTCCG GTTCTTCGAG TGGAGTTATA TTTCTCATCC ACTAGCCAAT TTCTCCAGCT AAATTTTCTG  GCAAGGTTTG CTAGCATAAT CCGCTATTGT TTTTGTTGGT GGTAGGGTTC GGAATTTCCA TATGTCTACT GGAGAAGGAG GCTCAAAATG GATACTATAC TGACTCATAT CTCAAAGATG  GAGATTCTAC CAGCTCATAT CACTATTGTT CGTTTGAATA AAGATAACTA TTTGATGTGG TCTGCTGCCT TTGAGATTGT CATTTCTTGT CGGGATTGTT TCTGCTATGT TGATGATTCA  AAAAAGGCTC CAGCCCTTAT AGATAAGAGT TATTTTAATT GGCACGTTAA GGATAGTCAA GTATGGAAAT GGTTGGTTAA ATCCGTTGCT CCTGATATTC AACCCTAGCT TCCGTGTAAA  AAGAATGCTC ATGAATAATG GAAATTTCTA GAGAGTATGT ATGGTCAGAA GGAACAGGAT GTTCGGACTT ATCAGATCAC TCGGGAGATG TATACTATGA CTCAAGGAGA CCAGTCTATG  GCTTCTTACT TTACGACTCT TAAAGCAGAG TAGGAGGAAC TTGATTATTA TACTGACGAT ACCTGGGGAT GTAATTATGA TCAAAAGCAT CATTAGGGTC GTATATGGAA AGAACTTGTT 
TTTGTCTTCT TACGTGGTCT CAGTCATGAA TTTGAGCATA CAAAAAGTGA ACTTTTCACT TATGGCGTCA GTTTTAATAG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAAGG CGTATCCGAC AGTGAGTGCT GAGTATCAGA CTTCAGTGGA CAAGTGCAAG AGGAAGCTCC GTGGTTTGAT CGCGGAGAAG AATTGTGCTC CTTTGATGCT CCGCTTAGCG  TGGCACTCGG CGGGGACTTA CGATGTGAGG ACGAGGACAG GTGGGCCTTT CGGAACCATG AGGTACCCTG AGGAGCTCGC GCATGGTGCT AATGCTGGAC TTGATATAGC AGTGAAGCTT  CTTGAACCGA TCAAGGAACA CTTCCCTATC ATCTCCTACG CTGACTTCTA TCAGTTGGCT GGAGTGGTAG CAGTTGAGAT TACAGGAGGA CCTGACATCC CGTTCCATCC GGGTAGGCCG  GACAAAGAAG CTCCTCCAGT GGAAGGCCGC CTTCCTGATG CAACCCAAGG AACTGATCAC CTGAGGACCG TTTTCATCAC TCAGATGGGT CTGAGTGATA AGGATATCGT AGCTTTGTCT  GGTGGACACA CCTTGGGTAG GGCTCACAAG GAGAGATCTG GATTCGAAGG AGCTTGGACA ACAAATCCTC TCATCTTTGA CAACTCCTAC TTTAAGGAGC TTGTTAGTGG AGGGAAAGAA  GGCCTACTTC AGTTGGTTAG TGACAAAGTC CTCTTGGATG ATCATGCATT TCGTCCTTTG GTTGAAAAGT ATGCAGAGGA TGAGGATGCG TTCTTTGTTG ATTATGCTGA AGCTCACCTT 
AAGCTTTCGG AATTGGGATT TGCCGAAGCA TGTTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAAGG CGTATCCGAC AGTGAGTGCT GAGTATCAGA CTTCAGTGGA CAAGTGCAAG AGGAAGCTCC GTGGTTTGAT CGCGGAGAAG AATTGTGCTC CTTTGATGCT CCGCTTAGCG  TGGCACTCGG CGGGGACTTA CGATGTGAGG ACGAGGACAG GTGGGCCTTT CGGAACCATG AGGTACCCTG AGGAGCTCGC GCATGGTGCT AATGCTGGAC TTGATATAGC AGTGAAGCTT  CTTGAACCGA TCAAGGAACA CTTCCCTATC ATCTCCTACG CTGACTTCTA TCAGTTGGCT GGAGTGGTAG CAGTTGAGAT TACAGGAGGA CCTGACATCC CGTTCCATCC GGGTAGGCCG  GACAAAGAAG CTCCTCCAGT GGAAGGCCGC CTTCCTGATG CAACCCAAGG AACTGATCAC CTGAGGACCG TTTTCATCAC TCAGATGGGT CTGAGTGATA AGGATATCGT AGCTTTGTCT  GGTGGACACA CCTTGGGTAG GGCTCACAAG GAGAGATCTG GATTCGAAGG AGCTTGGACA ACAAATCCTC TCATCTTTGA CAACTCCTAC TTTAAGGAGC TTGTTAGTGG AGGGAAAGAA  GGCCTACTTC AGTTGGTTAG TGACAAAGTC CTCTTGGATG ATCATGCATT TCGTCCTTTG GTTGAAAAGT ATGCAGAGGA TGAGGATGCG TTCTTTGTTG ATTATGCTGA AGCTCACCTT 
AAGCTTTCGG AATTGGGATT TGCCGAAGCA TGTTGA 

Retrieve as FASTA