Entry information : PnodAPx13(Potnod000021g0392170.t1)
Entry ID 18746
Creation 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodAPx13(Potnod000021g0392170.t1)
Name PnodAPx13(Potnod000021g0392170.t1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2003]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodAPx13
start..stop
S start..stop
PotacuAPx03 585 0 1..286 1..286
PnodAPx15 578 0 1..284 1..284
ZmaAPx02 501 0 1..286 1..285
CrubAPx03-1 471 3.16e-170 5..285 4..285
Literature and cross-references PnodAPx13(Potnod000021g0392170.t1)
Protein sequence: PnodAPx13(Potnod000021g0392170.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   286
PWM (Da):   %s   31475.21 Transmb domain:   %s   o260-282i
PI (pH):   %s   6.61
Sequence
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Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPPPVVDAE YLKEIEKARR DLRALISSKN CAPIMLRLAW HDAGTYDVNT KTGGPNGSIR NNEELKHGAN AGLQFSIDLC EVVKAKHPKI TYADLYQLAG VVAVEITGGP TIEFTPGRKD  SLVSPMEGRL PDAKQGHKHL RDIFYRMGLS DKDIVALSGA HTLGRAHPER SGFEGPWTAE PLKFDNTYFV ELLEGEKEGL LKLPTDKTLL EDPAFRRYVE LYAKDEDAFF RDYAISHKKL 
SELGFTPSSS SGTITDTRII AHSAFGVAVT AAVVILSYCY EVSRRK 

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Remarks
Promoter
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACACTCAAAT AAGGTATGAT CTTTTATTAA TGATGTGACT GTATTTTCTA CTTCTTTTGT TTAGACAGCA TTTAACGAAT ACATTTCTTA GAAGCAGAGT AGTTGCTATA GTCTGAAGTA  CTCTTTGTTA GGAGATAATA ATTTTCTTAC ACCATCACGA GCATTTAGAA TAGAAATTTC TTCTATAAAA TATAAATTGT TTGGAGAATG ACAAATACGC CATATCAACA CATCTTTTCT  ATCCCAACCT CAGTTTACTT TCACAATATT TGCAGAATAG GATAGTGGTG GAAAAGTTTG GATGCAACAC TAGTTTTGGT TCGAGTAGCA TCTCTGATAT GGCAACAGAT TTTCTACCCA  CTACCAAATG GCTTGGTTGT AGAACTCTGG TAGATGAAAA TTCTCTGGGA AGAACAACGC AGAATGCATT TAAGGTGGAG AAGGACAGTG CTTTGGACAC CAATTATTTA ACTAGCGTGT  GCTTATCGCC AGACATCGAA GAAGAGGATG ATGAGATAGA AGATTGGTAA ATGTGTTATT GTGCCTTGTC TCTCCCCTCC GTGTAATTTG TAAATTGCTG AGAAAAGTAA TTTGGCATCT  GGTCGGTGAA TGCACATGAT CTTCTTGAGC AATACGAGTT GAATGCGTCC TTCATTAGTG CATTTGTTAA ATTAATTGGA TTTTATGCGT TCAAAGGGGG CTAGTGTGCA CAAGACAGGT  GTCATATGGT CATATTAGAG ATGTTACCGG TTAAAATGTC ATCCCGGTCG TATTGGATTA TGAACTTTTC TGTACTGTAG TCTGTAGGCA CATCTCTGAG CACGTGGGAT GGAACATCAA  CGGCAGATTT ACTTCAGGGT AATCTTTGGG TTTCTTTTGC CATTCATCGG CCGAAAGTGA TTGGGGCGTG AAAAGTTTAT CCCGAATGCT TTGTTAAAGG TGGTGGTAGA TTATGTACGT  ATATTGTTTA TTGATAAAGG ATTATGTACG TATATTTTTT ATGCAGTTGA AATCTTGGAT GCTACTACAG TACTACTCAT TCGTGTATTG TATATCCCGA AAGCTACGCA CCGTGAGGTT  TACTTCGAGA TATTATGGGT GGAATCAGGA CAAAGAAAGG AAAAGCCAAG CACAGATGGA TGGACAGAAG ATGGATAAGA TTAAGGTGTA TATATTTTTA AAGCTGACGT ATGTTCCTGC  GACACATCTA GATCTTGTTG ATGCCCTCCA CCCGAGCTGA TTTTAATCAG GACTCACTTG ATTTAAAATG GTTTTCTTTA AATTTGGTTT GAACTTTGAA GTTGGCAAAT GTGAATGATC  GCATAATTGT TCTGTGGAAG AAATAAGGTT GGTTGTATTG TTTAGAATTT CCCGATGTTT GACCAATATT CTGTTCTCAC GTATCGACTG CTTTTTGTCG TCACCCCAGG TCTTAAGTTT  TAAATATTTC TTCTACTGAT TTTTTACCTC CAGTCATTGC GGCAGAATAT TCTCAAGCAT CTTCTGCATC CAATCCTTTA TTATTTTTCA CTACCATTAC TTAAAATGAA TGCCACTTTT  CATATAACAA ACATATTAGC GTTATAATAA CAAGCTAATC AAAACAGATA TATTGAAGAA TACCAGTTAT TATCTATTCT AACCGGGATA TTAAAAATGC AAAAATATTT TATAAGTTAA  ATTTTTGATT TAATTTTCAA CCTAATATAT GTGAAATTAT CATTTTATCT CTTTTTCAAC AATAAATTTC AAAAAGAATA AAATAGTAAT TTAACATTTA TTAAGTTGAA AATTAAATAA  AAATTTTATG CGGGACTTGA TCGACTAGAA TTACCTCGTG AAAATGGTTA ATTAGAAAAA AATTTAAAGG AAAAATACAA GAATGAAGGC ACATAAACCA AGGAGGCGGA AATGGAGAGA 
TAACAGCCAA TAATAATTTA TCTCATCCCA CCACCGTTTC TCTCACAGTC ACCCACGAAA TGACGACAAT AATATCTCCA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCTCCAGTTC AGGTACCATA ACTGATACAA GGATTATAGC TCATAGTGCC TTCGGAGTTG CTGTTACTGC AGCCGTGGTG ATCCTGAGTT ACTGCTACGA AGTTTCGAGG AGGAAGTAAA  AAAAATTATA GTCTCAGTAT AAAGTTGTGA CATTTTGTTA TTGATGCTGC ATTTCTATGT TACTGCTACC CATATGTCTC TAGTCTCTAC TCTCTAGAAG CCGTTTTCCA TAAACCCTAA  GAGACCAAAA CATATTTCTG CTTGACAGGG TGTCCATACT TGTATTTCCT TTTCATGTTA TACAGTTTTT TTTTTTGCAC TTATCATGTT ATACAGTTGA TTGATGTTAT CTCTGTTATC  TTGTCGAGGA CCAATGGCAC TTTCTAGATT TTTAAAATTT ATCACGTTTG TGAAAAATCA CGGCATGAAA TTAGTTGATG TCCCTTGATG GAGCAGACCC CTGACCCTCA AATTGGAGAA  TGTGATAACT GACAAGTGCG TTAGCCATTA ATAATATAAT ATATGTAAGT TTAGCAATTG GGTAAATGTA TAACCTTAAC CCATATACCC ATATGCAAAA TACATGATAC GTTTCACTTC  TTCACAGAGA AGATTTAATA ATATCAATCG TTGCAGCTCT ACTCTTGCAA ACTACACAAA TATATATTAA GATAAAATCA ACATTGCTCT CTTAATTTAT GCTATTCTTA GTCATCAACT  GTTTGCTCTG GATGCAAACT GAGCTTCCCT TGGTAATATT GATAAGTTGC AAGACAAATT CCATAGGTCC TTGTGACCCT AAATAAATGC AAACAGATAA AGTTGGAGAG ATGTATCATC  CAGTGTTACC ACAGATTTAA TGCAACAACT TGTGGTAACA AGGTAGGAGA AATGTTAAAT CAAATGATAA CCTTGTCATC TTAGGATTTA GGTACCCACA ATTCAATTCT TTGTCCTTAT  GTATAGAGGC AAACGAGAAA CGCAAGTTAA ATTGATAAGG TTTTTAACTA AAAAGAACTC TTTTCTAGTC GTAGAGGAAA CAAATCTCCA TCACTTAGAT GTCATCTGAA AGTGGGGACA  TCAGAAATGA TACAGAGTGA TGTTCTATTG GCACCAATCT CAATCCAATT CCTTAATTAC CCAACTTGCT TGTAAACTAG AACTTCCACC ACAAGGTTGT GGGGGAGAAA AAGAACAAAA  AAAAGTACAA GGAAGGTAGA GAAACTTCAA AGCTTCCTTC CACCTTACCA ACTTCATCTC CAACACTCCA CCAAGTCTCA CTTACTCCCA CACTCTCTTC TCACCTTCTA GAAACCTTTT  GTTCACGAGC ATTACTAAAA CTAAAATAAT GAACCATGAT CATATATATA TGTAGTCCTT TTCAGTTTAT CAAGAACAAG AATCTAGTAC ATGAAACTTG AATTCACTGG TTGATATATC  ATTACTTTAC TTGTATAGAA TGTCGTTCAC CATTTCACTT TGATAATTTG AGATTTTGAG ACTTAAATTG CAGTTTTTAG CATAGAATCA AAATATTTTC CAACTTAGTT GGTGGAGATG  GGTTTGGGGC ACAGTTGGGT TTCACCCACC TCTCTATCTT CCACTTACTT GACCTAACTA AAAGTGCTGG TATAAGGTGT TTGGCACCTG CTCTTTTAGG TATACCCCTA ACTTGCCAGT  TGCCACTCCA AGGCTATTTG GGCAAGAACA AGAATTCTTG AAATTCTATA TGACCTTTTG TCTTTTCTTT AGTTTAATAA TGAGCAGGTT AGGTGCATGG AGGCTAATCA ACCTCATTCT  CACAATCAAA TTGTAATCAT GCACTAAAAT AATTAAACTT GTTATTTTTT TACACCCTAG ATTATTCTAA AAACCACACT GTGTTAGCAT TACCTAAATC CACTAATATG TGGATGACAA 
TTAGGGTATA AAACAAGAAC ATGTGAATTC CCTTAATTAT TCCCCTAAAC AAACTGATAT TAATTATGGT ATAAAACAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCTC CTCCAGTAGT GGACGCCGAG TACCTGAAAG AGATTGAGAA GGCGAGGAGA GACCTCCGTG CACTCATCTC CAGCAAGAAC TGTGCACCGA TCATGCTCCG CCTCGCGTAA  GCTCAAAGAG CACCGACACA TGCAATCCTC TCACTTTCTC CTCTTCTAAC TCGATTCCTT CTGTATCTCT TTATTTTGAG TCGTTAATGT TAACTTGAAG GTGTTTATCG GTGGCGTTTG  TGTTTGTTTG TTTTTGCAGA TGGCACGATG CTGGGACCTA CGACGTCAAC ACGAAGACTG GTGGACCGAA TGGATCGATC AGGAACAACG AGGAACTGAA ACACGGAGCC AACGCCGGGT  TGCAGTTTTC GATTGATCTT TGCGGTGAGA TGTGACCGAT TATTTTAATA GCACTTAGTC TGTGACATGG TTGAGTTTTC CTGTTGTTTT CGTTTCGTCT ATTTTGACTT TATTTGGATG  AAGTTTTGTT CAAGGTAATG GTTTAGAAAT GAATTTGCAA AATTTGAATT CCCTTAGCAG GTTCTCAAGT AGATAATCTG TTAAATTCAC TTAGGACTTA GTTCCTCCTT TTTGTACTCA  TACTGCTTCT CTGGAGCGTA ATCATCCACA AACAGACTCT AGAATAAGCA ATACTTTTTC TGGTGCTATT GATTTATTAC TTGTTCATCA CCAACTATAT GAGGATAAGC TTTTAGTTTA  TAGGAAATTA CATCAAATTT CAGTTAGAAA TTGGGGCTAG GATTTTTAGC GTATACACAT GTTCTATATC ACATTTTGGA CTAACTTTCT AGTTGCTTGT AGAATTTGTT AGTTTTTATT  TACCATCAGA TTGTTTAATT GCTTTTGCTT GGCATTTACA CAGGTTTTGT CCTAGAAGTA CATCATTGAT AAAAATTTAT CATGTTTTAT TCGTTTGTCT ATCTTATTTG CTTTGGCTCT  TCTGTACATC AGTTGATATT TTGTAATTTA ATGGTTCACT TCATGCGAAG TGAGCTCATA TGCTATTGAG CTGTGCAGAT AGATATACGA GACTTCATTT CGCTACTCAC ATTTTTCTTT  GCCTTATTAT CAGAGGTTGT CAAGGCAAAG CATCCAAAGA TTACATATGC AGACCTGTAT CAGGTAATTC TTCTATAGTA AGTTCAGACT TCTCTGGGAG TTAGTTTCAG AATCTTGCAG  TATATACAGA AGAACTTTAA TATGGTTTCT TTTCTCTGTT CTGGAAATTA CTCTGTACTG ACCACCAAAA GGCAGTTTAA AATAGTTTAA TTCTCTCCAA TGGATATTTA GACATTACGG  ATTCTGATTT TCTTGGACGT ATGATGTGAT AATTTAGCGG TTTAAGCGGG AGTATCATCT CTATTGGTGT TTAGATTTGC CAGAGCAATA TCTTGTCATC TATTCTGCAA TATGTGATTG  CACTTGAGCC ATGTGCATGT ATTTTGTTTT CTACGGCTTT GCCCATTCTA TAGATTGAAA AATAATACTG TTGTGCTGTT GAATTTTTGG TGTTAAGCTT GCTGGAGTTG TTGCAGTTGA  GATCACTGGA GGTCCCACCA TTGAGTTTAC CCCGGGTAGG AAGGTAGGTG CCGTGTAAAA TTTTATTCCA TTCAGTTTGC TGGCAACTTA GGATAAAACT TAGCAGGGGA ATGCTTTCTT  GCTACCAGGA TTCACTTGTT TCACCTATGG AGGGGCGTCT TCCAGACGCC AAACAAGGTA AATGGGTAAT ATATTTAGCA GACCATTTGG CAAGTGCCAA TTATTTCCTT ACCAACTTAT  GCTATCTTAT TTTAGGTGTG GAATGAGTGG AAATACTTAT GTAATCTTTT TTGTTGTTGA AGTCTATGGT GTAGATTACC ATAATAGAAT GTCTTGGAGC TATTACCATC TCACTTATGT  TGGTTGCACA TCTCTCCACT AATATGTTAA AGTGGGTCTA GAAAGTCTAA GTACCGGTAA GATTGGATTA GGCTCCAGTG CCATGTTAAT ATGTAGGCAT CTAACTCCAA AACATCTGCC  ATCAAGTGGA AAGACATTAT CTTTACAGAT TCATTGTGTT CTCTACAATT TTTTATGTGG GACTGTTCTC AACATTTGGA ACTAGAAAAG AATTAAAATG TAGAATGATG TTTGGATTCA  TTCAGACACC GTGCTTGTGT TGATTTTCTC TGCAATTTTT CCTGATATTA TCGTGATTCA GACAGATCAT ATTCCATCAT TATTATTTCT TTTGATGATC GCATTTTTAG TTCTGCTCCT  GTGCATATAA AAAGCTGTAT GTTTCACCAT ATTATGACAA AATTCTACAG GCCACAAGCA TCTCAGGGAC ATTTTTTATC GCATGGGTCT TTCAGACAAG GATATTGTCG CACTGTCCGG  TGCCCATACG CTGGTAATCT TAAAATATGT GATCTCATGC CCGTTTGCCT ATATCCGTAC TGTACTTGTA CTTTAGATAA CTTTCCTTAT TGCATACTAT ATCATTGTTG GCTTTGGTGT  AAAGGGAAGG GCACATCCTG AAAGATCTGG CTTTGAAGGT CCTTGGACGG CAGAACCTCT AAAATTCGAC AATACATACT TTGTGTAAGA CCGATAAGAT GTGGATTAAT TTAGAATCTA  CACTGAAGTG GCATGAAACA AATAAATATA TTTAATTTTG AACTTACAGG GAACTTCTTG AAGGAGAAAA GGAGGGGCTT TTGAAGCTCC CCACAGACAA AACTTTACTG GAAGATCCTG  CATTTCGTAG ATATGTTGAG CTTTATGCAA AGGTACTCCA AATGTTTTTT TTTCCTCTTT TCCCTTTTGT CTACTAGCAA ACTTAGCTGG TTAAACCTGA TTAACTAACA ACGTATGCCG  TATCACATAA CATCTAATGT TGTTTGTTTT CACAGGACGA GGATGCATTT TTTAGGGACT ACGCCATATC GCATAAAAAG CTCTCTGAAC TAGGATTTAC TCCATCCTCC AGTTCAGGTA 
CCATAACTGA TACAAGGATT ATAGCTCATA GTGCCTTCGG AGTTGCTGTT ACTGCAGCCG TGGTGATCCT GAGTTACTGC TACGAAGTTT CGAGGAGGAA GTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACCTC CTCCAGTAGT GGACGCCGAG TACCTGAAAG AGATTGAGAA GGCGAGGAGA GACCTCCGTG CACTCATCTC CAGCAAGAAC TGTGCACCGA TCATGCTCCG CCTCGCATGG  CACGATGCTG GGACCTACGA CGTCAACACG AAGACTGGTG GACCGAATGG ATCGATCAGG AACAACGAGG AACTGAAACA CGGAGCCAAC GCCGGGTTGC AGTTTTCGAT TGATCTTTGC  GAGGTTGTCA AGGCAAAGCA TCCAAAGATT ACATATGCAG ACCTGTATCA GCTTGCTGGA GTTGTTGCAG TTGAGATCAC TGGAGGTCCC ACCATTGAGT TTACCCCGGG TAGGAAGGAT  TCACTTGTTT CACCTATGGA GGGGCGTCTT CCAGACGCCA AACAAGGCCA CAAGCATCTC AGGGACATTT TTTATCGCAT GGGTCTTTCA GACAAGGATA TTGTCGCACT GTCCGGTGCC  CATACGCTGG GAAGGGCACA TCCTGAAAGA TCTGGCTTTG AAGGTCCTTG GACGGCAGAA CCTCTAAAAT TCGACAATAC ATACTTTGTG GAACTTCTTG AAGGAGAAAA GGAGGGGCTT  TTGAAGCTCC CCACAGACAA AACTTTACTG GAAGATCCTG CATTTCGTAG ATATGTTGAG CTTTATGCAA AGGACGAGGA TGCATTTTTT AGGGACTACG CCATATCGCA TAAAAAGCTC  TCTGAACTAG GATTTACTCC ATCCTCCAGT TCAGGTACCA TAACTGATAC AAGGATTATA GCTCATAGTG CCTTCGGAGT TGCTGTTACT GCAGCCGTGG TGATCCTGAG TTACTGCTAC 
GAAGTTTCGA GGAGGAAGTA A 

Retrieve as FASTA