Entry information : NnRboh06 (Nelnuc025000g0030120)
Entry ID 18759
Creation 2023-05-24 (Sebastien Cabanac)
Last sequence changes 2023-05-24 (Sebastien Cabanac)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: NnRboh06 (Nelnuc025000g0030120)
Name (synonym) NnRboh06 (Nelnuc025000g0030120)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Nelumbonaceae Nelumbo
Organism Nelumbo nucifera (sacred lotus)    [TaxId: 4432 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NnRboh06
start..stop
S start..stop
NnRboh05 1524 0 1..935 1..945
CcaRboh05 1491 0 1..935 1..945
CcaRboh01 1491 0 1..935 1..945
CclRboh01 1473 0 1..935 1..946
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '18759' 'join(36528042..36528663,36528793..36528952,36529050..36529098,36529942..36530055,36531873..36532292,36533467..36533853,36533953..36534048,36535026..36535141,36536028..36536195,36536288..36536447,36537080..36537277,36537378..36537506,36538709..36538787,36538933..36539042)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 36528042..36528663 620 N° 2 36528793..36528952 158 N° 3 36529050..36529098 47 N° 4 36529942..36530055 112
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N° 9 36536028..36536195 166 N° 10 36536288..36536447 158 N° 11 36537080..36537277 196 N° 12 36537378..36537506 127
N° 13 36538709..36538787 77 N° 14 36538933..36539042 108  
join(36528042..36528663,36528793..36528952,36529050..36529098,36529942..36530055 ,36531873..36532292,36533467..36533853,36533953..36534048,36535026..36535141,365 36028..36536195,36536288..36536447,36537080..36537277,36537378..36537506,3653870 9..36538787,36538933..36539042)


exon

Literature and cross-references NnRboh06 (Nelnuc025000g0030120)
Protein sequence: NnRboh06 (Nelnuc025000g0030120)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   935
PWM (Da):   %s   106214.04 Transmb domain:   %s   o373-392i512-534o554-576i585-602o
PI (pH):   %s   7.97
Sequence
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Send to Peroxiscan
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VRTHFARPNWRKVFSRTCSKHPNAKIGVFYCGAQLLAEELRKLCHEYNQEGSTKLEFHKEHF

Retrieve as FASTA  
Remarks deletion of 15 amino acids after the 80th position
Promoter
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CTTACACTTG TGCCCGACTG CTGGAGCTTC TGATATAAAA AACAGTGTCT GTGACTGTGA ATCCAATTTC GTTTCCCGCA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
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Retrieve as FASTA  
DNA
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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ACGCTTGATCTCCAAGATGACGATACCATCATTCTCCGAAGCGTCGAATCGGCTACCGTCATTGATATAGATTTGGAAGTCTCCATCGGAAGTGAGACGGAGACGCCAGCATCATCGAGA
TCGCCCACGGTTAGGCGTAGTTCTTCCAATCGGCTACGTCAGCTTTCTCAGGAGATTATAGCTGAGCTTAAGAGGTTCTCGTGGGGCCAGCATGGCCGTGCGTCTCGAACGCCGTCTGCT
TCTGCCTCGCCACCCTCTGCCGCCCAGAATGGTGCCGGCACCTGCTCCGCTTTAGATTCAGTTTTGGCCGCTCGAGATCTCCGGAAGCAACGAGCGCAGCTCGAACGATCTAAACCCGGT
GCTGAAAGAGCTCTTCGAGGGCTGAGATTCATTAGCAACAAAAGTAACCAAGGCGTTGACAAGTGGAATGAAGTCGACAACAACTTCAATGAACTTGCGCAGGACGGTCTTCTCCACCGT
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AAGAACTTCACGAGTTCTGGTGTCAAATTACCGACGAGAGCTTCGATTCTCGGCTCCAGATCTTCTTCGACAT
ATGTGTGCATTCAAACGAACTCAAATAGTTCTTTTATTATTTAGTCA
ATCCGTATTATTATATTTATGCTTGACATATATACATCGTACATTAATGCAGGGTGGACAAGAACGAAGATGGACGAATCACTGAAGCAGAAGTGAAGGAGAGGTATCTTATTCTTATTA
TTGTCTTTACCACCTCGTCTCGTTGTCGTGCTTACACACTTTTATTTTCTCTATATATTATTTTAACCAACTCCCACTACTAATCAACCTCAACCTCCGTCTCCGTCAAATATTTACCGG
TTTCTTGCGTGAAGAAGTACACTGTGTTGGAGCAGAAAATAGTAAAACCACTCTCCGATAATCAGATTCCGGCGATATAGAATAGGGAGAAGTACCAATCAGCCCAGATCAGAATTTACT
AGACGAAGCCTCGACCATTTCCCAGGGGATAAGCACTTGGAGCTAGGGAGTAGGGACAGGGTCTCTTTAATTTTAATTTATTAATTAAACACCGATAGATAGGGATTTGGTGAAGTTAAC
AAGGACGAAGATATCGAAACCAACAACTCCAACCTGCTTCTGCTTGTGCTTAAGAAATTAAGGCTGTGTTTGGTTAAAAGAATGAGTATTTGAAGAACGGGTTTCCTAGAATGAATTATG
AGCCCGAAGAAGAAGCAATTTTCCTACATCCGGTTTTATATAGGCTATGTTTAGTTTGATAAAACAGAAAGTTGAGGGAATCAGCAGGGAAACGTAGGTTAAGGGTGTCCTAAACACACC
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CAATTTACGGAAATAATATATGATGGATAGACATGGGCAGGTGATTCGGAGTCTCTCGCCTCTCGGTTTTGTTTGGGGTTAATGTACGTATTTTGGTTTCATTTTTGTTTCCGTTTTGTA
CACGAGAACTGGCACGTGATTATGGAGGGTTGGACTTGGGAGAAAAATTGGAAGGGAAATGGTGACAATAATATAATAATTACTAAAAAAAGGTAGGAATAAGAAAGGTGTATGAAAAGA
AGAAACATAATTAAGAAATTAAGGTGACGCAGGCCTTCCCTTAAAAAATAAGGGAACAATATAGATATGTCCCTCACTATTTAATAACATTTCTCTTTCAAGTGTCCTTTTCTTGTAACG
TTTTTAGGTAAGGGTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGCATGCCCCACGAAATTATCCATGTATTCTGAAAGCATTATCATCCATTGCCACATTGTAAATATCTCACATGT
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ATCAAATATCAATTTTAAATATATATCATTTAGAAAAAGATTTTCAAAACACCTATATCTGAGACCCATTAATACAAATTCCAAGGTTTTAAAAATTGACCCGGAAATAAAACCGTTCTA
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CTTCTCTTTGTGCTATGTCCCAGATCTGAATTTGTGTCTCAGACTAGATCTCAGATTTGAGTTCTCTCTTTGCAACTTTATATTTTGAATCGCTGGTCGGGTCAAACGAGTCGGCGGTTC
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TTTGTTGCTTATGCTCAATTTGAAAAGAGTATAAATACAAATATGTACTGTAAAAATACATACAAAATAATACAAAATACAAGGTTTTTCACTTTATATATTTGTATTTGTACTCCTTTC
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AGAAGAATGCATTCAAGGTGATGGGTTACTGCCTACCGACGGCCAAGGGTGCGGCCGAGACCTTAAAGTTCAACATGGCTCTCATCCTGTTTCCAGTTTCCAGAAACACCATAACCTGGC
TCAGGTCCACCAAGCTCGCCCTGTTCCTTCCTTTCGATGACAGCATCAATTTTCACAAG
AGGTAAACCTTCGGTGCTTCTCTCCCACAATTATCACGTTTTTACACATTTTCTTGGACTA
TTTACTAAAATATCCTCTATAGTTTCATGAATTTATTAAATCCAATCGTTTTAACTAAAGTATCCCCTATAATTTTCAATCAATTTACTTAATCGACCATTCATTAAATAAAAGCGGGAA
ATGACAGTTTTAACCCTAACATCCATTCAAATAAATTTAATGAAAAGAAAGTAAAAACAAAAATGTCATTTTTGCCTTAAATAAAATATGGACAACCATTTTACTTTTTTCTATTTGGTC
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TGCATGAATGTTATGTATAGTGAATGTATTGTTTTTTGTTTTTTCATGAAGGGTTAGTTTGAAAAGAGCACAAATACAAATATGTATAGTATAAATTATAAGGTTTTGTACTCTATATAT
TTGTATTTATATATTTTTTAAATTGAGACCAGATATAAAAAAAATAAAAGAATTAATATATTTTTTATTGTTCATTGGACAAGTTGGTTCTGGTTCAGGTTGGGTTCAACTGTTCAAGTT
AAGCCAAACCTGTTCCAAAGCCAATCAGATTGTCTTATGTAGAGGAAGAAAGGTTTCGGCTTCATTTCGAAAAGTATAGAGAAAGATTAGGTAATTTCCATTTGAAGAGATAATTGAGGG
TTTGTGTTTTTCAAAACAAAATCCCACTGCAATTAATAATTTATTTCAATTCACTTCCATTCAGATTAAATCCGACACCCATCCGACTATCCGAGTCAGTTATATCGGATTTCCGATTTG
AAGTTTCAATAACTGAATTGAATACGGATGTGCAGACCATAGCGGCAGCAATCGTGGTAGGCGTTATTCTTCATGCCGGAAACCACATCACTTGTGACTTCCCACGTCTCATTCATGCCT
CTAGCGGCGAATACGAAGGTTACTTGAGAGATGATTTTGGGGATCACAAGCCCACGTACGGGAAACTGGTCCGAGGTGTGGAGGGCATCACTGGAATCCTGATGGTGCTGTGCATGGCAG
TCGCCTTCACCCTTGCGACGCGGTGGTTCAGGCAGAGCCGTGTTAGCCTCCCTATGCCGTTCCACAGGCTCACCGGCTTCAATGCATTCTGGTATTCGCACCACCTTCTTGCCATTGTCT
ACACATTGCTCGTCGTTCACGGCACCTTTCTCTACCTCGTCCACAAATGGTACCTCAAGACG
CGGTAATCGCTAAATTAACATTTCATTACTGGTTTCTTTGGTAATATGCACTTTAGTT
GGTGGTTTAACTTTTGAGTTGTGTTTGTTTGTAAAACATGCAGACGTGGATGTATCTAGCTGTTCCTGTTTTGCTTTATGCCGGAGAGAGGATCCTGCGCTTCTTCCGCTCTGGCTTTTA
CTCTGTTCGCCTACTGAAG
AGGTAATCACTTATCCTGATAGCATGTTAATTTGCCAGGGTCTCGAAAGTGGGCCCAATTCAGAACCATCTGAATGTGTGCCAAGTGTTTGAAACTTTGAA
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TTTTGATGGGTGGAAAATACTAATGTGAATATCTTTTCCTAGTGATTGACATAGACTACTCAGTTACTAGAGGTTGGGGACTTGGGGTCAAATTTAATAATTCTGAAATTTTAAAGATAC
TTAGTGATTATGCATTATATCCCCCTTGACTGTACCTCTATTTGAATCAGTTGCTCATATGGATCTAGGATCTACTTTTCCAAGTTGAACCTGAAGATCACTTAATACCTGTTAGAACTC
TCACGTAGGGCCATCATTGCTTACCAGTGTTTGTGCAATTGTGACTTACACTTTGTTTCACGCAAGTGGGTTGCTTGGCTGAATGCAATATTCCCAAATATTAGCAACCGAGGTGTGCAA
CCGATACTGCCTTGGCAGTGCATACCTCAGTAAACCTTAATTCCAAAAAAGGCATTAGCCAATTCAACCGGTTCTATCATCTATGGCCAAGTATATTCCTAATATTTGGGGAGCATTATG
CATAAGCAAGATCCTTGCTGTTGATTGATGCTATGGGCAGGCACCCGTTGGGACATGCCTCTGTTGACTGCCTTTATGTTGCCTTTTTTTTATATATATATTATTTATTTTTCAAAGCAA
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TGGTAACTTTACAACAGTATCACTTATTTTGCACATAATCAATTAATATAGACACTGCATATCTGTTTTGGTATCCAAGCCATTTC
ATATTCGAGTCACCGGCTGTGTCTCCATTTGAGTGGTAACTTTGCAACAGTATCACTTATTTTGCACATAATCAATTAATATAGACGCTGCATATCTGTTTTGGTATCCAAGCTATTTCA
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ATTCTTATTTAATGGTCACGATCTTCTCTCAGATATCAGTAACACTTCAACCCAACCCAGAAATTATTTTAGTACTACTCAATATTGTTTCTAAACTTTGACATATAATTATTTGATAAT
ATTTGGTGTAGATGTCTTTCTATGCGAATAATTTGCATGTTATGCTGTTAAGATATTGCCAACATTGATTTTCATACTACAGGCACCCGTTTTCAATTACATCAGCTCCTGATGATGATT
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CCAAGAAAAA
AAGTATATAACATATTCTAACCTGCATTGAATTCAATATTTTTCTATTTTCTTTGTGTAACACTGACTCAATTTATATCCTTTTCTGAATCTAGTTTTCCAAAGCTCTTA
ATAGATGGGCCTTATGGAGCTCCAGCACAAGATTACTGCAAATATGATGTATTGTTACTTGTTGGGCTTGGAATTGGAGCAACACCTTGCATCAGTATTCTGAAAGATTTGCTGAACAAT
ATAGTCAAGATGGAGGAACAAGCA
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TCTTCCACTTTAGCCACACAGGATTTTAAGCTATTGATTTTTCCATACGACATTTGTTTACATTCTGTAAGTTGCTTCTTTCTCTAGTTTTATTCTCTACATTTTCAAAACCAACCTGTT
TTCTTTTTCTCTTTTTTAACGTACTGATAACTTTGCTGAATCTCAGTAATCAAGTCTCATGGACTCACCATCAGGTCTCCAGTTAGTAAAGCTTCCTGTCCTATTTCTGGGACAATACTA
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CDS
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
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