Entry information : PnodRboh03(Potnod000003g0052120.t1)
Entry ID 18763
Creation 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodRboh03(Potnod000003g0052120.t1)
Name PnodRboh03(Potnod000003g0052120.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodRboh03
start..stop
S start..stop
PnodRboh07 1866 0 1..912 2..913
CescRboh02 1301 0 18..912 20..953
VvRboh07 1281 0 56..912 51..917
DgloRboh05 1247 0 54..912 57..927
Literature and cross-references PnodRboh03(Potnod000003g0052120.t1)
Protein sequence: PnodRboh03(Potnod000003g0052120.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   912
PWM (Da):   %s   103207.4 Transmb domain:   %s   o351-373i483-505o534-556i714-731o
PI (pH):   %s   9
Sequence
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*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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RGFDIVSGTR VRTHFARPNW NDVFERIASK HPGKTVGVFY CGMPVLAKEL KRLAYELSQR TTTRFHFHKE YF 

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Remarks
Promoter
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TGGCGGCCGA TGCCGGAGAT CATCAGACCA TCGCCGTATC GCTGATTTCC TCGCAATGGA ATCCGAGACA GAAGACGAAG 

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Terminator +
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GAATTACAAA TAATTACCAT ACAAAAGTCA AAGTAAAAAA CAGAGAAATT TTGTCATTAT ACGGTTTCTG TAGTAATAAT TACTATATGC CAGTAGGCTA AATTGTTTCC ACTATTTTTC  CACATTATAA GAATGAACAT GTTTAAGTAT CCAAGTAAAA AGTTGCACTT GGAATTGTAA TTATGTGTAA GAAACTTTTG ATTTAATAAT AAAGAGGGTT CTGTTGAAAT GTATGTAAAT  TAACTTTGAA GTATTTACAT CAATATTCTC TTTCTACAAT CTATTTGCAT AGATATTCTC TGTCGATAAT TGCTTCTATA TTCCTGCTCG ATTAAAGGTT TGCATCGGTA TCACTACCGT  CATCCAAGCA TCACTTACTA CCGTTTACTA CAGTAAAATG AAATTTTTAC CCTCAACTTT TTAACTCGAA CTGTCTTATT GACTTTTGTT AAATCCTACT ATCATTGATT GAAACCTTGT  AAACCATCAT CTGATTTAGA TCTTATGGAG AGAACCCTAA ATCACTCAAG AAATTAGCTT TTCTTCTCTT CGTATTTGAC TTGTTCCTCC ACTTTGTTCT CCAAAACTTT GCAGTTCACA  ATCGATTACA CACTTCGCAT ATACTACTAG AATTTTGAAT TTTAACCAGG AAAGTTTAAC AGAAACTAAC AAAAAACAGT TGCTTAATAG AAATTTACGA GCAAATATCT CGCAACATGT  AGCGAGCAAC TTGCGAGCGA TCTTTCCTCA CTAATTCTTG ATAACTATTT AGCCAGCAAT TAGCGACCAA CCAACCAGCA ACCTTAGTGG CAATTAGCGA GAAAATTAGC CAGGAAACTA  TTCCTGGCAA TTCCCTTGCA ATTTATGCAT TTTACAAAAT AAAAATAAAA CATATTTATT ATTCATCCAA AAAGCCTGGA AAATAGTTTT CATTATCTTC TGTCAATGTT AAAAAGTCTA  TAAAAAATTT TGGACAAGTT TAGATGAAAT TAAGTAAAGA GACACTTTGA GTATACTTCT TAAGTATGTT TAGAATGTAT ATGAGTTTAC TTTTCATTTT ACAAACGTAT ATGTGATCTA  AATTTTTTCA ATAAATTTTA TTTGAAACAT ATTATCCCAA AGAAGATAGT AGAGAAGTTA ATTTCAATTT TAGTTGTACA AATTTTTTTA GTTAATAATT ACAAAATCAA GATTATCAAA  CAAAAAATAA AATAAATTCA TTCTTCATCC AAAAAATCCT TAAAATAGTT TCAATTATAT TGTGTCAGTG TTAGAAGGTA TAGAAAAATA TTTGGAAAAG TTTGGATGAA ATTTAGCAGA  GAGATACTTG GACTGAGCAT ACTTCTTTCG TATGTTTAAC ATGTATATGA GTCCACCTTT CATTTTGCAA AGGTAGAAGT GATCTAAATT TTTTCAACCA ATTTTAGTTG AAATATATTG  TTACAATGAA GATAGTAGAG AAGTTAATTT ATATTTTAGT TGCACAAATA ATATTTACTT AATGATTACA TAAAATCAAG ATTATCAAAT AAAAAAAATA AAATAAATTC ATTTTCGTTC  AAAAAATCCA AAAAATAGTT TCAATTATTT TGTTTCAATG TAAGAAAGTA TATGAGTTCA CTTTTCATTT TACAAAGGTA TAAGCGATCT AAATTTTTTT AACTAATTAT ATTTGAAACA  TATTATCACA ATTAAGATAT TAGGAAAGTT AATTTCAATT TTAGTTGCAC AATAGTTTTT AGTTAATAAT TACATAAAAT CAAGATTATC AAACAAAAAA ATAAAATAAA TTCATTCTTC  ATTCGAAAAA TCCTTAAAAA AGTTTAAATT ATCTTGTGTC AATGTTAACA AGTATAGAAA AAAATTTAGA AAATTTTTGA TGAAATTTAG TAGAAAGACA CTTGGACTAT ATTTCTTAAG 
TATGTTTAAA ATGTACATTA GTCCACTTTT CATTTTGTAA AGGTATAAGT GAAACTTCTT AAGTATGTTT AAAATGTACA 

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DNA
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ATGGAGATCG GCGGTGGCGG CCGATGCCGG AGATCATCAG ACCATCGCCG TATCGCTGAT TTCCTCGCAA TGGAATCCGA GACAGAAGAC GAAGAAGAAA GGAATCTTAA TTTGGAAAGG  CGAATGGCAC CGGGCACTCC ACTCCCGGAT GACGACTGCA ATTCGGAGGA CTTAATGGAA GTAACGCTGG AGCTTGAGGG CGAAGGTATC ATCGTACGGA ACGTTACTCC GTCGTCAACA  GGAGGAGGAG GTGATACCAC AGGATCTCTA AGCAGGTGCT CGTCTACGGC GGCGAGGATA CGCAGGAAGT TCGCGTGGCT GAAAACACCA TCTCCCAGGA CATCCGGAGA CCTTTCATCA  ACCGCGATGA TGGCAGCTAG GGATCAGAGG AAAATCCAAG CGAAGCTGGA GCGGACAAGG TCCGGCGCAG ACAGAGCACT CAAAGGTCTA CGATTCATAA GCAGAACAAC TGGATGCGTC  GATTCCCCAG AGGAGATGTG GCTTGTAGTG GAGCAACGCT TCCACCTACT CGCCCGCGAT GGATTCCTAT CCCGTGAAGA CTTCGGCGAA TGCATCGGTA TCTCAAAAAA AACTGAGAAT  TTTCCGCCTA ATTTTCCTTT CCACCTTTCT TCCGATCCCT AGGTATTCAC TCTGTTACGC CTGTTTTTCA AATCCAGGGA TGGTGGAGAC GAAGGAGTTT GCGAAGGGAG TCTTCGACGC  TCTGACGCGG CGGAGGCGGC AGAATCTGCA GAGGATAAGC AAAGAGGAGT TGTACGATTT CTGGATTCAG ATCTCAGATC AGAGCTTCGA CGCTCGACTG CAGATCTTCT TCGACATGTA  TGTTGTGTTG ACCCGTGTAC TCCCAACTAT TCTTTCATTT CCCTCAAAAA TATTATTATA TTATTATTAT TATTTGAATT AAAGAACATC AGTATTTGCC GTTTATGGAA ATGAAATGTA  CGGTGGCGAC CATGACAATT GACAGGGTGG ATACCAACGT GGATGGACGA ATTACGAGAG AAGAAGTACA AGAGGTATAG ACCGTAGGTC TTCTTTCCTT TAACCTTGTT CTTTCCTGTG  GGAAAAGTTT GATGTAAAAG TATTTACTAA TTCGACAAAT TATGGGGTAA AAACGACGAA ATACAACAGT TGATAGTTCT GAGTGCGTCG GCGAACAAGC TGTCGAAGCT CAAAGAGCAG  GCGGAGGAAT ACGCTTCTCT CATCATGGAA GAGCTCGACC CGGAAAACCT CGGCTACATT GAGGTCAAGA AGAAAATAAT TACCTTCCTT AATTTACCAT ATTATTATTA CCTTCGAAAC  TCTTTCCAAC TGGAATTATT CCTTCTTCCT GTTTCAGATT TGGCAGTTGG AAGCGTTACT GTTGCAGAGA GACAGGTACA TGAACAACAG CAGACCACTG AGCACAACGG CCTCGAAGAT  GATCGGTAAT CCGAGGGGTA TAGTACGGAT GATTGGATGC TCCTTGAAGT GCGTGGCTCA CGAGAACTGG CAGAGACTCT GGGTGGTGGT GCTCTGGGTT GTTGCAATGG CTGGATTGTT  CTTCTGGAAG TTCTTCCAGT ACAGAAGACA CTCGGCTTTT CAGGTGATGG GCTACTGTCT TCCGGCTGCG AAAGGGGCTG CCGAGACTTT GAAGCTCAAC ATGGCTCTTA TACTCCTACC  TGTCTGCCGG AACATGATTA CTTGGCTGCG TTCCACCGCC GCGAGGTTGA TGGTGCCGTT TGATGACAAC ATTAACTTCC ATAAGGTAAA CGACATCTCG TTAGGTTGGT CCCAAATCCC  AATCACTTCA CTTCCTGATT GCTATTTCTC ATTTATGTGG AAAAAAGTTG CTACTTCTCA CGCGATTGCG ACGTCTATTT TTCTATCGTC CTTGATGATT GATGACAGAT GATTGCGGTG  GCGATCGTCT GTGGTGTGTT CGTCCACGCC GGGAATCACA TGGTGTGCGA CTTTCCAAGA ACGATCAACT CCTCACCGTC GATGTACGCA TACGTGGCGC AAGATCTCGG TAGCAAGAAG  CCGACGTACG GTGCGCTCCT CACCGGAGTG GAGGGCGTCA CAGGTATCGG AATGGTGCTA CTGATGGGAA TCGCCTTCAC CCTAGCGACG AGCGGTTTCC GGAAGAATGG GGTGAGGTTA  CCGTATCCTC TGAACCGTCT AACGGGTTTC AACGCCTTCT GGTACTCTCA CCACCTACTG GCCTTCGTCT ACGTTCTGCT CATCCTCCAC GGCTACTTCG TTTACCTTGT TCACAAGTGG  TACAAGAAGA CGGTGAGCTA ACGCTCCTAC CATTTCCACT TTATTATCTG TTAATTAATC ATCTAATCGG TGTTGGTTTG TTTACTAATA ACTTGTTTGA TTATTAGTGC AGACGTGGAT  GTATATGTCT GTTCCATTGC TTCTGTATTT AGGTGAGCGT ACTTTGAGGA CCTTCCGTTC AGAGTCATAT ACGGTGAAGA TACTCAAGGT ATTATTCATT TATTCCAACT TCTTTAATAA  ATAAATATCA TCGGTGAAGC ACAAAAAATA ATAAGATAAG ATGGTAGAAG AAGTTAGTTG AAAATGGTCG TTTGCACCAA GATTCCATGA AAGTTACATG ACACTTGCTT CATAGAAGAA  CTGGAATAAT TGATGAGGAA AGCTGGTGGA AGAATGAGAT TATCATGTGG GGGTGATAAC CAAAAGTTTT TTTTTTCTAA AAAAAAGGTG GATAGGAAAC AACCAGCAGA AGAGTCCAAA  GGTGTTTGTT GGTCTATGTT AATGCATCTC TACAAATGTT ATATGCTCCG TTACAGGTGT CAGTGTTACC AGGGAATGTG TTGGCAGTGG TGATGTCCAA ACCTCACGCT TTCAAGTACA  AAAGTGGACA ATACATCTTC CTCAAGTGCC CAGCAATATC ACCTTTCGAA TGGTATTTGT TTTGTGTTTG GAGCAGATAG TGCTGAGAAA GAGCATACTG ATGCTACTAA CTGGTTTCTG  TGAAAAACAA AAACAATGGC AGGCACCCCT TCTCTATCAC CTCCGCCCCT GGAGATGACC ATATGAGCGT TCACATCCGG ACCGTCGGAG ACTGGACGCA GGAACTGAGA AGAGTCTTCA  CTGAAGCTAA CAACTCACAT TCTGTTATAG GTCGAGCAAA GTTTTCGGAT TCCGGTGTGG TGTATCAGAA GAGGTACTTA CTCAAGTAGG CTGCACATGT TCAATTACAT TATCATATCC  CAGTTTTATA GACCGCTCGT ATTTTATCTC TATTTCCTTA TTTCTTATTA AAATGAGAAA CAATTTGAAG TGCTGTCCTG TCATATGCTC CAGCTTGCCC CGATTACTTG TGGATGGACC  ATACGGAGCC CCAGCACAGA ACTATACCAA TTACGATGTC CTCCTACTTG TCGGACTTGG AATTGGAGCT ACACCTTTCA TAAGCATCCT CAGGGACCTC CTCAACAACA TTAAGATGGC  AGAAGAACAG ACTGTATGTG ACGATGTGTA AATACTTCTC CTTTAAAATT CACTGTTTAG AGTCATGTGC CATCTGCTGT TTTTCATTTT TTTTCCTGTG ATCTTTGTCG TTGATGAGCA  GGACTCAAGT ATTGATATGA GCAGGTCGGA GGATAGTGCT AATAGTTTCG GTTCCACTTC AAACATCAGC ACCAAAAAGA GGAACCAGAG GACCAGCAGT GCCCACTTCT GTTGGGTTAC  AAGAGAACCA AACTCCTTTG AATGGTTCAA GGGTGTCATG AATGAAGTTG CAGAAATGGA CCAAAAGGTA AAAGGACTTC TTCTTTTCCT TCTAAGCTTT TAAGTCAAGA CCATTAAACT  TCAAAAAGTT AAGTCTTCCA TGAAAATAGG GTGTCATTGA GATGCACAAC TATCTGACCA GCGTCTATGA AGAGGGAGAT GCAAGAACAA CTCTTCTAGC CATGGTCCAA GCTCTGAATC  ATGCAAAACG TGGTTTCGAT ATCGTCTCAG GCACACGGGT ATTTCTTTCA TTTAAATTGA TAAGGAAGAA ATACCAACAA AGCTTCTTGT ACACTTTAAA TGACAAATGG CATCAAACAT  CACTACAATC CAAATACTGT TACTCATTTA TGTTGCTTGT GCATATTTAT GATGACTGTG GCAGGTGAGA ACCCATTTTG CCAGACCAAA CTGGAATGAT GTGTTCGAGA GAATTGCCTC  GAAGCACCCA GGGAAAACAG TAGGCAAGGA TGAACGTTCC TAATTACTGC AAATTCTTGT ATGTAAGAAG TGATTGATCT GATTTGATGA ACTACTACTT TTTTTCTTGT TCAGGAGTTT 
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CDS
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ATGGAGATCG GCGGTGGCGG CCGATGCCGG AGATCATCAG ACCATCGCCG TATCGCTGAT TTCCTCGCAA TGGAATCCGA GACAGAAGAC GAAGAAGAAA GGAATCTTAA TTTGGAAAGG  CGAATGGCAC CGGGCACTCC ACTCCCGGAT GACGACTGCA ATTCGGAGGA CTTAATGGAA GTAACGCTGG AGCTTGAGGG CGAAGGTATC ATCGTACGGA ACGTTACTCC GTCGTCAACA  GGAGGAGGAG GTGATACCAC AGGATCTCTA AGCAGGTGCT CGTCTACGGC GGCGAGGATA CGCAGGAAGT TCGCGTGGCT GAAAACACCA TCTCCCAGGA CATCCGGAGA CCTTTCATCA  ACCGCGATGA TGGCAGCTAG GGATCAGAGG AAAATCCAAG CGAAGCTGGA GCGGACAAGG TCCGGCGCAG ACAGAGCACT CAAAGGTCTA CGATTCATAA GCAGAACAAC TGGATGCGTC  GATTCCCCAG AGGAGATGTG GCTTGTAGTG GAGCAACGCT TCCACCTACT CGCCCGCGAT GGATTCCTAT CCCGTGAAGA CTTCGGCGAA TGCATCGGGA TGGTGGAGAC GAAGGAGTTT  GCGAAGGGAG TCTTCGACGC TCTGACGCGG CGGAGGCGGC AGAATCTGCA GAGGATAAGC AAAGAGGAGT TGTACGATTT CTGGATTCAG ATCTCAGATC AGAGCTTCGA CGCTCGACTG  CAGATCTTCT TCGACATGGT GGATACCAAC GTGGATGGAC GAATTACGAG AGAAGAAGTA CAAGAGTTGA TAGTTCTGAG TGCGTCGGCG AACAAGCTGT CGAAGCTCAA AGAGCAGGCG  GAGGAATACG CTTCTCTCAT CATGGAAGAG CTCGACCCGG AAAACCTCGG CTACATTGAG ATTTGGCAGT TGGAAGCGTT ACTGTTGCAG AGAGACAGGT ACATGAACAA CAGCAGACCA  CTGAGCACAA CGGCCTCGAA GATGATCGGT AATCCGAGGG GTATAGTACG GATGATTGGA TGCTCCTTGA AGTGCGTGGC TCACGAGAAC TGGCAGAGAC TCTGGGTGGT GGTGCTCTGG  GTTGTTGCAA TGGCTGGATT GTTCTTCTGG AAGTTCTTCC AGTACAGAAG ACACTCGGCT TTTCAGGTGA TGGGCTACTG TCTTCCGGCT GCGAAAGGGG CTGCCGAGAC TTTGAAGCTC  AACATGGCTC TTATACTCCT ACCTGTCTGC CGGAACATGA TTACTTGGCT GCGTTCCACC GCCGCGAGGT TGATGGTGCC GTTTGATGAC AACATTAACT TCCATAAGAT GATTGCGGTG  GCGATCGTCT GTGGTGTGTT CGTCCACGCC GGGAATCACA TGGTGTGCGA CTTTCCAAGA ACGATCAACT CCTCACCGTC GATGTACGCA TACGTGGCGC AAGATCTCGG TAGCAAGAAG  CCGACGTACG GTGCGCTCCT CACCGGAGTG GAGGGCGTCA CAGGTATCGG AATGGTGCTA CTGATGGGAA TCGCCTTCAC CCTAGCGACG AGCGGTTTCC GGAAGAATGG GGTGAGGTTA  CCGTATCCTC TGAACCGTCT AACGGGTTTC AACGCCTTCT GGTACTCTCA CCACCTACTG GCCTTCGTCT ACGTTCTGCT CATCCTCCAC GGCTACTTCG TTTACCTTGT TCACAAGTGG  TACAAGAAGA CGACGTGGAT GTATATGTCT GTTCCATTGC TTCTGTATTT AGGTGAGCGT ACTTTGAGGA CCTTCCGTTC AGAGTCATAT ACGGTGAAGA TACTCAAGGT GTCAGTGTTA  CCAGGGAATG TGTTGGCAGT GGTGATGTCC AAACCTCACG CTTTCAAGTA CAAAAGTGGA CAATACATCT TCCTCAAGTG CCCAGCAATA TCACCTTTCG AATGGCACCC CTTCTCTATC  ACCTCCGCCC CTGGAGATGA CCATATGAGC GTTCACATCC GGACCGTCGG AGACTGGACG CAGGAACTGA GAAGAGTCTT CACTGAAGCT AACAACTCAC ATTCTGTTAT AGGTCGAGCA  AAGTTTTCGG ATTCCGGTGT GGTGTATCAG AAGAGCTTGC CCCGATTACT TGTGGATGGA CCATACGGAG CCCCAGCACA GAACTATACC AATTACGATG TCCTCCTACT TGTCGGACTT  GGAATTGGAG CTACACCTTT CATAAGCATC CTCAGGGACC TCCTCAACAA CATTAAGATG GCAGAAGAAC AGACTGACTC AAGTATTGAT ATGAGCAGGT CGGAGGATAG TGCTAATAGT  TTCGGTTCCA CTTCAAACAT CAGCACCAAA AAGAGGAACC AGAGGACCAG CAGTGCCCAC TTCTGTTGGG TTACAAGAGA ACCAAACTCC TTTGAATGGT TCAAGGGTGT CATGAATGAA  GTTGCAGAAA TGGACCAAAA GGGTGTCATT GAGATGCACA ACTATCTGAC CAGCGTCTAT GAAGAGGGAG ATGCAAGAAC AACTCTTCTA GCCATGGTCC AAGCTCTGAA TCATGCAAAA  CGTGGTTTCG ATATCGTCTC AGGCACACGG GTGAGAACCC ATTTTGCCAG ACCAAACTGG AATGATGTGT TCGAGAGAAT TGCCTCGAAG CACCCAGGGA AAACAGTAGG AGTTTTCTAC 
TGTGGGATGC CAGTATTAGC TAAAGAACTG AAAAGATTAG CATATGAGCT TAGTCAGAGG ACCACAACGA GATTCCATTT CCACAAGGAG TACTTCTAA 

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