Entry information : PnodRboh04(Potnod000004g0060490.t1)
Entry ID 18764
Creation 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodRboh04(Potnod000004g0060490.t1)
Name PnodRboh04(Potnod000004g0060490.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodRboh04
start..stop
S start..stop
PnodRboh10 1825 0 1..892 1..894
NnRboh01 1429 0 16..892 16..890
MpudRboh02 1402 0 7..892 4..886
CclRboh03 1400 0 10..892 2..889
Literature and cross-references PnodRboh04(Potnod000004g0060490.t1)
Protein sequence: PnodRboh04(Potnod000004g0060490.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   892
PWM (Da):   %s   100536.31 Transmb domain:   %s   o341-360i481-503o523-545i705-722o
PI (pH):   %s   9.38
Sequence
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Remarks
Promoter
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AAAAAAAAAC AGATTTAAGC ACAAATGGTG AGGACATGGA CAGTTTTTGG AGAGGACGCC AAAAAGCGAG GACAGACGGC ATAGACATGG CCAGACAATA GCGAGGATAC TATTTAGCAA  GGACATATGA TGAGCACAAG TCATCATCAT GTCCTCGCCA ACCAGTGAGG ATGTCTAGTG AGGATATGGA CAGGAAATTA ATGGAGAGGT TGTGACCTGA CGAGAACATG GCAAGGACAT  TGATTTTACT TGTTTTTTAG ATTAATTTAG AAGAATGCTC AAAAATATAC AAAAAAGTAT TCTTTAGACT TATAATGAGC TAATCATGTG CAAAAAAATG TGATAAAGTC TAAGCAAGGA  ATGCACAAAA AACATGCAAA AAAAAAGAAT GCATAAAAAA TATGGATAGC AAAATCTTAA CGATGACATA CTTAGCGAGA AATGTCCTCA CTAGAGCACT TGGCATATAT GGATGCTAGC  GAGGAGATGA AACAGATTGT CCTCGTCAGC ATGTACTCGT GAAAATTGTA TTTTTTTTTG TAGTTTTGAG TATTTTTAAG TGTAAAAAAA ACATTTGATC ATCCTATATT TGACCATTAT  CCATGAGCTT AAACCGACTG ATAGGCTCCT ATTTAACCCC ATTAATTAAG TAGCTAATTG TTTTAATTTA TCCCATGAGC TTAAACCTCA ATAGATTGGA CTGCTAACTG TTAACTAACA  TTAATTCTCA GTTCCCACGT GATCCAACCA AAAGAACCTC AATAGATTGG ATGGATGAAC CTCTCCCATC TCTTTACGTT CATAAACGAC GAAATGTCAG AAGCAAACAA ACTAGGGTTT  TGTAACGTAG TACGCAATTG AGGATAATAT CAAAACAACT CAACTCCGGA CTGTTTCGGT ATTTACTTTA TACACAGATC AGCAGATATT ATCCCTTCTC TCAGACCAAC CCCACTTCGA  TGGTTTTTGA TCTCCACCTC CGGATTTGAA TTATTCAAAC CTGGAGATTA AAGAACGACA AAGATAGTAG TAGTAGTATA TAACCTACCA AACCTTCTTG TGTCTTCAGT CATGGACTAA  CCAAGAAGGA ATGCCATCCA AACCGTGTGA TCATCACAAC AGAGAACAGA AATATCTTCT GACGTTTTGA TGAAATCTTG AAATTCTCAC CTTTTACTGT CAATTGTAGT TGTTAAATCT  TACCAACCCA CCAAATCAAG GTAAGTCAAC TCGTATTGTA CATATTTGTA TCCGCATGTG CGTTGCAAGA AAAATGATTA ACCACTGTAA AAGAAGATCT ACCAACCCTT TTGTTTTGCA  GAAGGGAACT CGTGTTGTTA GCGGATGTCC ACGGAAAAGG GGTGAAATTT TCTTACATCT CTTGTGTTGT TATGCAAGTC ATCGTGGTTT GGATTCTGGT CATTGGATAT CGAAGGGGGC  GCCCATGGGA TGATGGATTT TTGTGTGTTT GACTATTGTG ACCACCAACG ACTTCTACCT TCTCTCCAAC TCAATTTGCA TAATTCAACA CACACATGTG ACATATATAT ATATATATAT  AGACACACAC ACACGTACCA TCCCAATTGT TCTCAAACCC ATCACGCTCA ACAACAGCTA CATCACTGTC CAACTTCCCC TGCTTCGATT CTCTTCCTTT CCTAACCAAA CTCGAAGCCA  AGGTACAAGC TTAGAAATAC TGTTCGTGTA AATTTGAGTA CATATCTTGC AGGAACAGAA GAAGCAGGAA AGGGAAAAAA ATGTTCGGTC GTCGAGGTAG AAAGAACGAA GCAGAAGACG  GGTTTCCGGA CACCGCTTCG GATCCCGGGG CCTCAACGGT TGGCTTCAGT GGTCCACTGG AAGACGGCAA GGCCACGTCC GGGATCAAGA AGAACGCGAG GTTCAAAGGT GACGAGAACG 
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Terminator +
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CTTAGTTGGG CTTTTGACAT TGTTATTAGC TCTTTTGTAC TTCCTACTGA TACTATTTGG ATTTAGTTTT AATATGCCAA TATGTCATGT TTAAGATTCA ACAAGATAAT CCTACTTAAA  AATGCCAACT AATATACCCT GCAGGTAGAT ATACTTTTGT TAAATTTGAC GTAAAATACC AAAATTATCT ATCTTCTGTT AAAAGCTTGC TTTAAAATAA TTAATTTTGT ACAAGTTAAT  CCTTATTGCT TTTGAATCAT TCGAGAATGG TAAGGTTGTA TAAACCTAGA AAATTGATTA AAATTTATAA TAAGCTTCCT GCCATTCGGC ATTTAAAGTT AAAATTAGTA AGAAATTTAA  ATCCATACAA TTCCAAGTTT TTTTTACGCA AAAGAGCATA ATATCATTTA AAGTTCAAAA TGTTGCAAGC GATAAATAGA GTCACTCCTA ATACACAAGG AGCTGTTATA GTGTTGAATC  AAAATCTAAT GTTCTGGTAA GTGGGATAGG TCCATTAGAG GGCTGAAAAA CCTCATTTGT TCAAGAGTGA TGGAAAAATC CTACCTAGAA CCTAATCTAT AAATGAATTA GACAACGCAC  ATAAAATTTA GCAACATACG TCATGGTCAT TGTAAAATCT GTTACTTTTA ACTAATAAAA ATATGTTTGA TTTTGGATAA ATTAATTTAA TAATTGAATG ATTTAACCTA AGACCGAATT  CGATTAAACT TCTGGAATCA GTCTGACAAG ACTACTCAAC TTTGTTAGGA ATCTCTTACA CTATTTGACA AGACAGGTGC ACTTTAACTT TAAGTCACCT CATTGTCATA AACTTTCCAC  TTCTTCTTAT TTAAGCCCTC TCCCCCAATT CAAAAATCAC CTAGGGAAAA AGTGAAAAAT TCCAATTTCA TTCCCCTCTC CCGACGGATT TCTTCTCTAC TTCTTCCTCA ACCACCACCA  GTGACCACAG ATATCATCCC TCCTCCGATT TCCACTACCG ACGACCTCTC CTCACTGCAG ACTATCGCGC GATAGCCTCA TGCTGCTACA TGCTGCCACA TTTTCTGAAG TTTGCCTGTA  CCCTAAACCA CTGTCGCCGC TGTCTCCAGT CACTGCCTCC GCACCCCCAG CCTTCCCCGC ACAGTTTCCA ACCTCCCTTA TCGACAGTTC CCGGTGGAGG GAGATTCAAA GAAGACCGAA  TCCATGAACG AAGATGATTG GACGAAGAAG AATAGACAAG TGGTGGTATT CATTTGACAA TGGGTTGATG ATTCGATGTA TCATCATGTG TCGAAGGAGA ATGATGCAAG CGCGCTGTGG  AAGAAACTTA CAGACTTGTA TGAGTGCAAG TCGGCATTAA ACAAGGCAGT GTTGATTAAG AACTTGATCA ACATGAAGTA CAAGAATGAC ATCACATTGA CTGAGAACAT GGGTCATTTC  AAAGACTACA TCAACCAGTT GACAGACATG GGGATCAAGT TCGACGATGA GGTGTCGTGA CTGCTCTTGA TGAGGTCGCT ACTGGTTAAC TAGGAGATGA TGGTAGTAGC TCTTACTTCA  GCACCACAAG ACAAGGTGAC CTTGAGAATG GTGGTGGCTA GCATGCTGAA TGAGGAGCTG AGGAGAAAGT AGGGAGACAA CGACTCCCAA GCTATGGTGT TGGAGAACCA TGGTTAGCAC  AAGTGATGAG ATTTTGGAGA GAATAGAGGT TGAAGTAAAT CATGGGTAAA TCGAAACCAC GCAAAAGTGT AGTCTACTAC AATTGTGAGA AGGCCGGCCA TATCAAGAGG TTCTGCAAGC  AACTGTGGAA GGACGGTTTT GGATGCAGGG AGGAGGAAGC TAATGTCTTC GCGAGCAGTG ACGGAGACGT AGTCATCATG TACGATGAAG GATTAGTTAA CCTCACCTAT CAGGATTTAG 
CTTGGGTGAT CGACTCTGGA GTATCTTTCC ACATCAGTCC CATGAAAGAG AGTTTCGCCC CTTACATCGC CACAAATTTT 

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DNA
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ATGTTCGGTC GTCGAGGTAG AAAGAACGAA GCAGAAGACG GGTTTCCGGA CACCGCTTCG GATCCCGGGG CCTCAACGGT TGGCTTCAGT GGTCCACTGG AAGACGGCAA GGCCACGTCC  GGGATCAAGA AGAACGCGAG GTTCAAAGGT GACGAGAACG AGGCCTATGT CGAGATAACC CTAGACGTCC GAGACGACTC GGTCTCGATC CAGAACATCA AAGGTGGAGA CGAACGTGAC  GCGGCCATGC TGAGTAGGAC TCTGAAGGAC TCTGCCTCCT TCGGGTCACA TTTCTCTCAA AAGATAAGGC AGGTGTCACG TGAGCTCAAG AGGATGACGT CATCAAAGCG GTTCGATAAG  ATCGACCGGA CCAAGTCGGG CGCGGCCCGA GCCCTCCAGG GGCTCCAGTT CATGTCCAAG AATGTCGGCA CCAACGGGTG GCCGGAGGTG GAGAAACGCT TCCACGAGCT CGCCGTCGAC  GGTTCACTCC CACGTGCGAA CTTCGCCAAG TGCATAGGTA GTAATCAACG ATAGATTCCC CCTAATTGCC AAATTTGGGT TGGTATGTCT GACGTCTCTT TTTATATTTT GTTAAATCAC  ACGTTGATTA AATTGGTAAT TGCTGCAGGA ATGATGGAAT CAGAAGAGTT CGCAGAGGAG TTGTTCGATG CGTTGGCTCG ACGGAGGGGA ATCGTTTCTT CTTCATTGAC GTTGGAACAG  CTCCGAGACT TCTGGTCCCA GTTGTCAGAT GAGAGTTTTG ATGCCAGACT TCAAACCTTC TTTGACATGT GAGTCATGTT CATCTTGTTT AAATTAGTAG GTTGTTTTGG ATGAATGAGT  TGTCGTTCGT ATAAGTTCAT AATGCAACTA AAGCCACGTT GGGGGTGGGG GGGATAAAGT CAGTTTTAGT ACTTTGATTT AGGACTTAAG ATTTTTATTG TTGACTTTTT TTTGGTAGTA  AAGGACGGCA TGTTAGATAT AATTTACAAG GGCCCCGTTC TATCTTACTT TTTTAATTAA AGAAAATGCA ATCCACCTAA ACAGTATGAT TTCGACTAAA GAGTAGTAAT CTATTCTGGT  ACAGTTGGAA CTCCTTGCAG TAAGACATCA GTTGATAAGG ACATGAGATT GGAATCTTAT ACAATTATAT CTTGATGATA AATTAATAAA TGCTATTGAC ATATAGAACA ATGAAAATTT  AGTTAAAAGA TAAGATATAG TAAAAGTAAA ATATAACAAC TTAAAGTACT CAAGTTATAA ATTTTCTTCG ACGGTTCGGT ATAGGACAAC AAAAGTCGTC CTATAAGGAG GGGGGGTGCA  TTTTCTTCAA ACATCTACGA TTTAATTTAA AAAAATCAAA ATTTATAAAT CAAAATTGAA ATTTATTTCT TAAGAGATAA ATATTCAGAA AATTCTTTTC AATTAGAAAA CTAAAAACTA  ATTGAGAAAA AGAGAGATTT TGCTAGTATT TATGTTAAAT TGTTATTTGT ATCATCCACA AATGCGTTGA CTTACATAAC AAAAAAGAGT CAACTTTTGC GAACGACAAG GTTCTTCAAA  TAGCTTCGTA GTTCGTACTA ACGTTGACTT TGTTTACTTT AAAAAAGGGT GGACAAGAAC GCCGACGGTC GAATCACTGC CGAGGAAGTA AAGGAGGTAC TCTTCTTTTG ACATTTTCAT  TTTACCACAC CCATAATAAA ATTCAACCTT AATTCTTAAT TTACAAGTAA TTGTAATCTC AGATCATCAG CCTGAGTGCC TCGGCGAACA AGCTATCCAA CATCCAGTCA AGTGCTGGCG  AGTACACCGC TCTCATCATG GAGGAACTCG ACCCTCACGA CCTCGGATAC ATCGAGGTCC GTACAGCAAC CACAATCAAC AATAAAAAAA CATGAATCAA GAATTTACCA TTTCATCTCA  ATTCGATGTA TATGTTGCAG GTCTATAATC TTGAGACTTT ACTACTACAA GCCCCACACA TGCAACAGCC AGAAAAGGGA AAGCACAGCT CCAACATGAG CAAGCTACTA AGCCAGAAGC  TAGTCCCGAC CAAAGACACC AACCCGTTTC GCCGCGTCTA CCGTCGGGTC TCCTACTTCT TGGAAGACAA CTGGAAGCGC GTCTGGGTCA TGGCTCTGTG GCTCGCGGTC TGCGCCGGGC  TCTTCGCTTG GAAGTTCATC CAGTACCGAC ACAGAGCCGT GTTCGATGTC ATGGGCTACT GTGTGACTAC AGCCAAGGGC GCGGCCGAGA CCACGAAGCT CAACATGGCC CTCATTCTCC  TCCCAGTCTG CCGTAACACG ATCACGTGGC TACGTAGCAA GACTAAGCTC GGAGCGGTCG TGCCGTTCGA TGACAACATT AATTTCCACA AGGTTTTGGC AGCCGGTGTC GCTGTTGGAG  TCGGGCTCCA CGCCGTGGCT CACTTGACAT GTGACTTCCC TCGGTTGTTG CACGCGACCG ACGCAGAGTA TGAGCCGATG AAGCCGTTTT TCGGGGATCA ACGGCCGAAT AACTACTGGT  GGTTCGTGAA GGGGACCGAA GGGTGGACAG GGGTGATCAT GGTTGTGTTG ATGGTCATTG CTTATGTCCT GGCGCAGCCA TGGTTTCGGA GGAACAGGTT GAGCCCCAAG AATCCATTGA  GGAAGTTGAC AGGGTTCAAT GCTTTCTGGT ACTCGCATCA TCTGTTTGTT ATCGTCTATG TCCTGTTCGT CATTCATGGG TACTTCCTCT ACCTCAGCAA GAAGTGGTAT AAGAAGACGG  TAAGAATTCT GGCCTGAATT ACACAAATGG TTGAATGATT AAATTATACT TGTTTTAAGC TTGAGAGTTT TGATTCTTGC TTGTAGACAT GGATGTACTT GGCCGTGCCG GTGCTTCTTT  ATGCCGGTGA ACGTCTGATC AGAGCATTCA GGTCCGGATA CAAGACAGTG AAGATTCTGA AGGTAATATT TCAGATTAAG AAAATTCTAG TGATTAATAT ACTAAATTTG ATGTGATTAT  CTAAATGGAT GCAGGTGGCA GTTTATCCTG GTAATGTTCT GGCACTCCAT ATGTCAAAAC CAAGTGGATT CGATTACAGC AGTGGTCAAT ATGTGTTCGT CAATTGCTCT GCTGTTTCTC  CCTTGCAATG GTACATCACA GAACAGAGAT GATACACATG CTTTGATTGT TTCCTTTGTC TTGCTTTTGA TCATGATTTC AAGTAATGGT GAATTCCGTC AGGCATCCGT TCTCCATCAC  ATCGGCGCCC GGTGACGATT ACCTGAGCAT CCACATCCGT ACAGTCGGAG ATTGGACGAC GAGACTAAAA GCCGTCTTCT CTCAGGTCTG CCAACCAGCC GCCGATGACC AGAGTGGCCT  TCTAAGAGCT GATTTATTCA AGGGAGACAA CGCCCCAAGG TACTGAAACA TTGAAACTCC TCTGTTCTTG ATTCGCTCGA CTTGACTAAT AATTATTGTT GACTAACCAT GAAAATTTCA  GACTCCCAAG GCTGCTGATC GACGGCCCAT ACGGTGCTCC GGCACAGGAC TACAAGAACT ACGACGTGCT CCTCCTAGTA GGCCTCGGCA TCGGCGCAAC GCCTCTGATC AGCATAGTCA  GGGACGTAAT GAACAACATC AAGCAAGCCT CGGACGACGA GACAAGCACT GTCGAGGACG GGTCAGCAGC TAAGGCGAAG AAGCCAACGA CCTTCATGAC GAAACGAGCC TACTTCTACT  GGGTCACACG CGAGCAAGGC TCGTTCGAGT GGTTCCGTGG CGTGATGAAC GAGGTGGCCG AGAAGGACAA GGACGGGGTG ATCGAGCTCC ACAACTACTG CACGAGCGTG TACGAGGAAG  GGGACGCCAG GTCGGCGCTC ATACTCATGC TCCAGTCACT CAACCACGCC AAGAACGGGG TCGACATCGT GTCTGGGACT CGTGTCAAGA CACACTTCGC CAGGCCCAAC TGGCGCAGCG  TGTACAAGCA CGTTGCCATC AACCACAACG CCCAGCGCGT GGGTGAGTCT AAGTCGGTCG CTGGGCACGA GCCCACGAAC CTTGTTTTCC TTCGATCTTG TGGAATAGAT CGAACCAATT  GATTTGGTTT TGACGAGGTT TTTCCTTTTT TTCCAGGTGT GTTCTACTGT GGGCCCCAGA GTTTGACAGG AGACTTGAGA CAGTTGGCGC AGGATTTCTC CCACAAGACG AATACCAAGT 
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CDS
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ACGAATACCA AGTTCGAGTT CCACAAGGAG AACTTTTAA 

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