Entry information : PnodRboh06(Potnod000004g0079700.t1)
Entry ID 18766
Creation 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodRboh06(Potnod000004g0079700.t1)
Name PnodRboh06(Potnod000004g0079700.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodRboh06
start..stop
S start..stop
PnodRboh08 1888 0 1..924 1..924
CescRboh04 1481 0 18..924 27..932
ZmaRboh01 1452 0 2..924 3..936
SpolRboh04 1444 0 20..924 8..921
Literature and cross-references PnodRboh06(Potnod000004g0079700.t1)
Protein sequence: PnodRboh06(Potnod000004g0079700.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   924
PWM (Da):   %s   104783.9 Transmb domain:   %s   o372-391i512-534o554-576i738-755o
PI (pH):   %s   9.69
Sequence
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Remarks
Promoter
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CCGACCAGGC GCCGGTGGAA TAATTGACAG GACGAAGTCC GCCACGGCTC ACGCCCTTCG GGGTCTTCAG TTCATAAGCA 

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Terminator +
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AATAAACTTC CTCAAGCATT TTTCTTCATT TACATACATA CATACGTTCA CTCCTGAGAT TAAAATTAAT GCCAAGTAGA GCAGGTTCTT ATTTTATTGT AATTTGGGCA GGAAGATGAT  GACGAAAAGA TATAAACGTA AATAGAAGCT AGAAAAATAA TCTTGTTTTA TGCCAATATG TAAAGGATAG ATAACTTCAT GTATTTGGAA AACTTACTTA TATATGCTTG TGCTTCACAA  TGACGTTGTT TTATAAATCT TTGACCTCAG TGTATAATGT CGAGCAGTTC CATGCAATAA TCACCCTAGA TCTTCAAACA AGTATAAAAA ACATCTCGGC TAGACGCAAA AAAAAAATGT  CATGTACAGG AATATTGAAT TTTATATTTT GCAAAAGAGA GAAAAAAATA TTGTAACCTC TAGGTTAATC ACCATGCTTC TGTATATAAC GAAAAACAAA TGTGATTGCT CCGTGGATCC  AAAACGACAA GAAGAAACAT ACTTCGAAGT AGCAAGCAAA CTCCAATCTC CATGTGCAGG TCTAAGTGAC TGTCATCCCG TTTCTACACA AGGATGATAT ACAAGCTTAA CAGCTCAAAG  AAAAAAATGC CATTATTTGA CAAATTTATA AGCAAAGAGC TCTAAATTAG ATTCTGAATT GAAAGATTTT AGTGTGTAAC CTGTCTTAGT TGCCGAGCAT TAACTAGTTA TCTGCTTTCT  TTTTAGTCTC TGAAAACTAG GCTTCATTGC CTGGTTACTG CTTGTTGAAC TGACGGAAAA CAGAGGTTTC TTCAGCCTCC CGGTTGCAAT ATTTTGTGAA GCTTGAGTAA GTGTGCACTG  CTTTGGGTGC TCCAATCTTT CCAAAATCCT TGATGTCTTT TCAGTCACAG GTTTGCTTTG GGATGATAAG ATTTGATTTT CAACTAGTGA TCTCGAAAAT GCCTGAGGCG AAAGATTATC  TTTTACATTG TCGACTATAA GAAGTTGTTC CCACTCTGCA GTCATGCTTG ACATGTCATC CTCAATCCAA TCTTCAGAGG GTTTCATTTC AATATCTGGA ATTTGATGCG TTGATGATTG  TGTGAGCATT GAATCCTCTA ATCCTGGAGG ACCCCTATGC TTATGACCAA AATTGACATT CTTCTCTCGG ATTGCTCTGA AAGAAATTAA TTACAAACAT AAACAAATGC TTTTTGCTCA  AACTTGAAAT ATTTTACATT AACCACGTGG CAGTAAATGC ATTTACCTTC TTGTTTAGAA GCAAGATTCA ACAATTCCAG CCACAAAGTT GAAATGAAAT AATCATTAAC ATCACCATGA  ATAATTGACC AAAAAAATCT TTTAAGAAAG ATCACTTGAA AGTTCGAGTA TCCTGAAGCC AGCGGTCCAC AGAATCTTAT AAAACTCGTA AATTCTATAG ATAAGTATCC TGAAGTTTAA  GATGCGTATT AAGCGTGATT AGGGCCAAGC TACCTACCGA TTTCAAATAG GAATGCATAA ATAACCTAAA ACTGGTAAGT GTGTCTTTTA GTGTATTTGA TTGCTAAATA AGGTTTAGCT  GTAATGAACG AAAAAGACAG GTGAGTACAG ATACATTATT GTGTTTTTTT TACTTTGCAC CAAATTAAAT TGCAGACTTC TATGTAACAC GGTCGTGCTC ATGGTATTAA ATATGTATGA  CAAATGTTTC TATTCTTTTA AATATGTATT GCAGTTGACG ATTACCCAAA TTGCAAGCTC TCTTTGACTA GCAAATTAAG CTTCGTGTGA AAAGCTCTCT CGTGCAGAAG AGGGTCATAA  TCAGCTACTT TCATCTGTAA CACAAACATG TAATGCCAAT TAGAGAAGAT AAGTAGACTC GTAAATAGAA AGTACCTCTG TCAACATAAA GTATCTTCTT GATGAGCAGA AACAGGTCCC 
GTTGTTGATG GGATATGTCA TGGTTTATGA AGGCTGGTTC TGAGACAAGT CTCACCTTCA ATATAGATGC ACGAACTGAA 

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DNA
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ATGCAGAATT CCGGCAAGGA TGAGGTAATT GAGTTGGGTC GCCGGAGGAG AGGAGGTGAC CGGATGGCTT ACAGTGGACC CATCGAACAA AGTTCCTATT CTGGTCCATT CAGTGGTCCA  CTTGTTCACA AGAAAGCCAC GACCAAGAAG AGTGCGAGAT TCAACATCCC GGAGACATCG TCGGAGGCCA GGGAGAAGCA ACGACGGGAG GAGGACCAGG ACTACATCGA GATCACTCTC  GACGTCCGTG ACGACTCCGT CGCGGTGCAC AGCGTCAAGC CGGCAGCTGG TGATGAATTG GAGGATCCAG AGGTGACCCT TTTGGCCAAG ACTCTGGAGG GGAAATCGCC TTTCGGAACG  TCGATGATGA GGACGGCGTC GTCTCGAATC CGGCAGGTGT CACAGGAGCT GAAAAGGCTG GCGTCCAGTG CTCTCCGACC AGGCGCCGGT GGAATAATTG ACAGGACGAA GTCCGCCACG  GCTCACGCCC TTCGGGGTCT TCAGTTCATA AGCAAGACCG ACGGCGCCAA GGGGTGGCCG GCGGTGGAGA AGCGATTCGA CGAGCTCTCC AAGGACGGAA TTCTCCAGAG ATCCCAATTC  GGGCAATGCA TAGGTAAAAA TTAAACACCT TGAATCACCT GATCTAACGG TTCTTCGGAA ATTAAACGCT CGCTAAAGTT TTGATCTTTG TGAAACTACA GGGATGAAGG AATCGAAGGA  GTTCGCGATC GAACTGTTCG ACGCTCTGGC GAGGAGAAGT TTCATAACGT CGAACACCAT CAACAAGGAC GAGTTGAAGG AATTCTGGGA ACAGATCATC GACCAGAGCT TCGACACTAG  ACTACAGATC TTCTTCGACA TGGTCGACAA GAACGCCGAC GGTCGGATCG GAGAAGCCGA AGTCCGAGAG ATCATCGCTC TCAGTGCCTC TGCCAACAAG CTTTCGAAGA TCCAAGAACA  AGCAGATGAG TACGCTGCTC TCATCATGGA GGAACTCGAC CCCAACAATC TTGGATACAT TGAGGTAAAA AAAAAACAAA TTCCATAAAA TAAAATCACG TTTTGATTGA ATTTGAATTT  GAATAACCAA AGATTGAACT TTTTTAATGG ATTTGATTGA ATTCAGATTT ATAACTTGGA GATGTTGCTT CTGAAAGGGC CGAACCACGA GCTGACAAGA ACAGGGAACA GCAAGATGTT  GAGCCAAATG CTGAGCCAGA AGCTGAAACC AACGAAAGAA CCAAACCCAA TCAAGAGGTG GTACAAGTCG ACCAAGTACT TCATGGAGGA CAACTGGAAA AGGGTTTGGG TTCTGGCGAT  TTGGGCTATG ATATGTGCTG GTCTGTTCAC GTGGAAGTTC ATACAGTACA AGCACAGAGC AGTTTTCCAT GTGATGGGTT ACTGTGTTTG TGTTGCAAAG GGTGGCGCTG AGATGACTAA  GTTCAACATG GCTCTGATCT TGCTCCCGGT TTGCCGGAAT ACCATCACTT GGCTGAGGAA CAAGACCAAG CTCGGCGTCG TTGTGCCCTT CGATGATAAC CTCAACTTCC ACAAGGTATC  GTTTCCTTTC CAATCTCTCT CTCTCTGTCC AAAATCAAGT TTCTGTTTCA CAGACCAAAA AATAAAATAA AATAAAATTA ATTTAAAGAA ATATGTGAAA TTATTCATTA ACAGACTAGA  TTTTTAATTC AATGGGATCG ACAGAAGTAC TTTTTAAAAT TTAAATCATG CAGCTTGACT GACGATACAT TTTTTTTAAC CTTTTATCGT ATTTTACTTG TTTTTGTTTA AGAATTTGTG  GATTACGACT TAATAGGTTA AAATATATAA TTAAATTTTT AAATTCAACT TAAAACCAGT TGAATTCAAG TGGATTTGTG TTCAGATGGA AAAGTTACAA GAATCGACAC CCATCAATGT  CCATTAGATG ATCTACAAAA GTTAACAGAT CGATTTCTGC CAAGGAAAAT GGTGGACGGT TTCAGATTAC TAATAAAGAA CAAAAGTAGC ACAAACAAAT CTTTGTAATT GTCCAAATTC  CAAAAGGACC ACCAAAGAAC AAAAATTATT ATTGACTTTG AGTTGCTAGA GGACAAGAGA ATTTATTATT TGCTTTCTTC ATTTCAAGCA ATGGAGACAA ATTCATTGAC CAATTCTTGT  TCTTTCCTTT TTTTTCTTCA ACAAAGAAAT ATTATCTTCA TTTACGTGAA ATTATCGAAA ACACCCCTGA CATTTGTGAA AAAAAATCTT CAGGTGATTG CCGTCGGAGT GGCCATCGGC  ATCGGCCTCC ACGCGATCTC CCACTTGACA TGTGACTTCC CACGTCTCCT CCACGCCACA GACGCCGAGT ACGATCCGAT GAAACGATTC TTCGGCGACA CACGGCCACC GAACTACTGG  TGGTTCGTGA AGGGAACCGA GGGTTGGACG GGAGTAGTGA TGGTGGTACT AATGGCCATA GCCTTCACTC TAGCAACACC ATGGTTCCGT CGGAACAGAC TCAACCTTCC AAAACCACTG  AACAAGCTGA CCGGATTCAA CGCCTTCTGG TACTCCCACC ACCTGTTCGT CATCGTCTAC GCCCTCTTCG TCGTTCACGG CTGGTTCCTG TACTTGTCCA AGGACTGGTA CAAGAAGACA  ACTTGGATGT ACCTGGCCGT GCCTGTTCTG TTGTACGCCA CCGAGAGGTT GATCAGGGCT TTCAGGTCGA GCATTGAACC GGTGAAGATC CTCAAGGTTG CTGTTTACCC TGGGAATGTC  TTGGCTCTTC ATGTTTCCAA GCCACAAGGG TTCAAGTACA AGAGTGGACA GTTCATGTTC GTTAATTGTG CTGCTGTCTC CCCCTTCGAA TGGTACGTGA GTTCTTATTT GCTTGTATTA  ATTAATGGGG AATTTAACAT TATCAGATTA TATAATTGTA AGATAATAAG AGTATTAGTT GATCTTACAT TCTCAATTGT TGATTATTAA TTAGGCATCC ATTCTCGATC ACATCGGCAC  CGGGAGAGGA TTACCTTAGT GTTCACATAA GGACACTTGG GGACTGGACA AGGCAGCTCA AGACTGTTTT CTCTGAGGTG ATTTTATTAC CAGACTTCTA TTTTTTAACG TGCAATTTTG  TTAAAATAAA TAAATATCTA AAAAATAAAA TTAATAGTCA TAAAAGAGTA GGTTAATTTT GTAATCGAGA AAAAATCTTC AAATTCAGTT TAAAAAGAAG AGGAAATTTG ATTTTACTTG  GTGATAATAC ATGTACGTGA AAGAAATCAT TTATAAAATT TAAATCATGG GGTATTTGAA AGGAAAAAAA TCAATCATAG TCTTGATTAT TTTAAGAAAC CAAAACAATT GGTTACGTTG  GTATTTAACT ACTTTCTTTT GTTTTGTGGG TGCTAAATGT TTTTTGAAAT GACTAATATT AAGTCTATGA AATATGACGT CACTTTTTGT TTTGGCTACT TGATATATCT CCGTGTTGAA  TTTTTGTTGG TTTTGTTTGA ATGGTTCATG TAGGTCTGCC AACCACCACC TGCTGGCAAA AGTGGGTTGT TGAGAGCAGA CTTTAACAGA GGAGGCGAAG GACCAAATCC AAAGTAAGTT  CCTCTCTCTT TGACCGACCG ACCTATCTAT CTCTGACTCC AACATCTACA TTATTATTGA CTTAGAGCCG TAATAATTGG GGAACATTAA CAAATGCAAT TGCTGGTTAA TTTCTTTTCA  GGATAAATGA ATCAAATAAA TGTCAGTAAT CAAGATTTTA ACAGTACTGT TGTTAATTTG TTGTTAGTTT CCCCAAGGTT CTTATCGACG GACCATACGG TGCACCAGCA CAAGACTACA  AGAACTACGA CGTTGTGCTT CTGATAGGAC TCGGCATCGG AGCAACACCC TTCATCAGCA TCTTGAAAGA CATAGTCCAC AACATGAAGA AGATGGAGGA GGAAGAGGGC AACATCGAGA  GCGGCAACAG AAAGAGCTCG TCGTCATACA CGCCGTTCAA GGTGACCAGA GCTTACTTCT ACTGGGTGAC AAGGGAACAA GGTTCGTTTG ACTGGTTCAA GGGAGTCATG AACGAAGTGG  CCGAGAGTGA CAAGAGGGGT GTCATCGAGC TACACAACTA CTGTACCAGC GTGTACGAGG AAGGTGATGC TCGATCCGCT CTCATTGCCA TGCTCCAGTC ACTCAACCAC GCCAAGAACG  GCGTCGATGT TGTCTCCGGC ACTCGTGTGA AGTCTCACTT TGCTAAGCCC AACTGGCGCA ATGTCTACAA ACGCATCGCT GTGAACCACC GTGACCAACG CATTGGTACG TGACAACTGA  CAAGAACACT ACTGATGAGT CTTTTTGAGT TATTGTTGTT TTTATTGCTT TATTGATTTT TGGGAAATGA AACAGGAGTG TTCTACTGTG GAGCGCCAGT GGTGACGAAA GAGCTGCGTA 
ATCTAGCACA GGATTTCTCG AGGAGGACGA CCACGAAGTT CGACTTCCAC AAGGAAAATT TCTAA 

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CDS
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AAGGAAAATT TCTAA 

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