Entry information : PnodRboh09(Potnod000012g0192700.t1)
Entry ID 18769
Creation 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodRboh09(Potnod000012g0192700.t1)
Name PnodRboh09(Potnod000012g0192700.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodRboh09
start..stop
S start..stop
PnodRboh05 1696 0 1..917 1..914
CsRboh01 1471 0 6..949 9..946
CclRboh01 1471 0 6..949 9..946
AdurRboh07 1465 0 6..949 9..946
Literature and cross-references PnodRboh09(Potnod000012g0192700.t1)
Protein sequence: PnodRboh09(Potnod000012g0192700.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   949
PWM (Da):   %s   107063.77 Transmb domain:   %s   o388-407i526-548o568-590i747-764o
PI (pH):   %s   9.35
Sequence
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Remarks
Promoter
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GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG  GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG  TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGGGGG GGGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT  GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGTG GTGGTGGTGG TGGTGGTGGT  GGTGGTGGAT AATCCAAATC TGTACGTTGT AGATAGTAAA TCTGCTAATC GAATCTGCCA AATATTTCCA AATTCATATC CGAATCAAAA AAATTAATCC AAATTTGAAT ATTCGAACGG  ATATAGCCAA ATAAAGTCTG AGAAAACTTA TCCAGATATC CAAGAAAGCT TATTTGGATA TACGATAACC AACAAAAATT TAATATTAAA CATAACATAT TGGTTAATTA CAAAATTAGT  TTTTAATTTT TTTAATGTTT ATAATAGGAT TAATGTTAAT TACTTAATAA TAATATATAT ATATTATAAT AATATTAAAT TTAATCAGAT TAATTGGATA TCCACATATC CGTTAGATAG  CTAAATGAAT TTGGTTTGGA TTTTACCTAT ATCCAAATTC GAGCCGATTA TTCCTGGATT TGGAATATAA TATCATATTC AATTCGTCAG ATATCAGATT CGGATATTTT ACTCTTAAAA  GGATTTGGAT TCAGATTTCA ACACTTCAAC AAAGTTAGAA ATGATTTATC AGAGGTGTTT GAGAAAAAAG AAAGTTTAAA AGGAATATGT GGGCAAATAA TCTTATTAAT AAGTGTGACA  GTAGTTTTAA TACAAAGGAA AATAAAACTA AAATAAAAGT AAAAAACAGA ATAAAAATCT CTTCTTCAAT ATTATTAAAA TAGGAAAGTT ATCAGTTTGG TGAGGGTGTA AATTATTTAA  GTTGAGAGAA GTTTTGGTAG ACCATTAGAT TAAAATCTAA GTGTTTAGAT TTAGGAAGTT ATAAAACCGT TTTTTTTTTA ATATTTTCAA ATTTTGAATT TTTAAAAACG GTTTTATAAC  TTCATAAATC TACTCTATTA GATCTTAATT GAATAGTCCA CCACAATCTC TCTCAACTTA AATAATTTAC ACCCTCACCC AACTGATTAA GTTCCTATTA AAGTAATCTT ATTGAAGTCT  TCTTACTTTC GGCATGCATA ATTAAAAATA AATAATTTAA ATTTTGAAAT GATTTCTAAT TGCACGACTT CCCCTCCCTC TCAATTGACC GTTGTGGTGT CGCTTTCTAG TCACTTTGCA  TTATACGTCT TTGTTACCAT CTCTCCTCTT CTTTAGCATA GTTTTATATG ATAATATCAT ATAATCTGTA AGTTGATATT TATTTTGAAA TCTAAAATCA ATATTCACTT GAAGGTACTT  CTTATATTCA CTTAAAGGAG TCGAGATTCT TCCCTCTTAA TCAATCGACT TCTTCTTTTC TATTCTCCAG TATAATGATC ATTACAAAAT ACCAATTGAC CATAATTCTT AAAAATATTA  CTACATTTAA TCTTTATGTA ATATAATTAA CTCACGAAAA AAAAAGTAGC AATGCAAAAT GAGAATAACA AGGAAAGATA AAACTAAAAA TGGAAAAGAT ACTCAACTCC GTTACGGCAT 
TTTCTGTCTA TTGCCACGTC AAATAAAAGC ACCACCTCTC TCCTTCCTCT TCTCTCACAA TTCCACAAAC TCAAAAACTG 

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Terminator +
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GAGAAATAAA CTTGTTAATT TTTTTTTTCT AATTCTTTGT TTTCCAGAAA AGGAACCATT ATCCTGCAAT TGACTTGATG CGTTACATGA TTACAGGGGT ATTCTACTGT GGTGCTCCAG  TTTTGGCCCA GGAATTAAGC AAAATGTGCA AGGAATACAA TCAAAGAGGT GGTACGAAGT TTGAATTCCA CAAGGAACAT TTCTAAAACC ACTCTTGCAT ACGTAAATAA TGTATAGGTA  TATATACTTT GTTCACAATC ACAAAAAGGT AAGAAAGTGA ATCAAAGATA AAGTATACAT GAGATTTGTT CCCACATTCG TTTTCTTAAA GAAAACACAA TGTGTGTTCA TCCAGAAACA  GGTAGAAAGA TTTTGTATTT ATTTTGAATG TCATAAGCGA AACAAGAAGT TTTGTTTCTT TCTTGTTCTT TCTATGCAAG CCTTTTCGTC TATTATACTG AGAATAATGC AACTTATGAA  CTTGACATAT AAATGGTGAA AGGTAAAAAG AGGTAATTCT TATTAAAATC TTTTGCAGTA AAACTATTGT AGTATTTTTT TTTCACTTTC TAAAGTAATT CTTATTAAAA TCTAACTAAT  GCACACGATT TACATCTCTT TTGCACATGG AATTCGAAAA TATTTTTATA AATTCAAATT TTTTATTTTT AAAATTCTGA AGGAAAAAAA CTTGGCTTTA ACTACTATAA ATAATAATTA  TTTTGTAGGT TTTACAAATT ACAAGCAAGG AACATGTCCC CAAATGAATA AAGTTACAAC TGATGTTAAC TACAATCGTA TAAATAAAGC CATCGGAGCT TGTTCTACTA AACAGCATCA  CTTATAAGAC GAACATGTGG GCTGCAATGT CTCTCCATTA GAATCCTCGA ACTACCTTCA ATCGTCTTCT TCCATGTCTA TATCCCCCCC CCCCCAAAAA AAAGGAACAT TATCAATTTA  AAGCACAAAA TCGGTGACAA TTTGAAACAT AAATCTTAAT CAAGCAGGAA ATCAAATCGA ACCTTTTCCA ACTTTGCCAT CAGAAACCCA ACAGCATAGA TATCTCTCGC TCTGAACACC  GGTCTCGACA TCGATCCCGA CGCCGTTGCC AAAAGTGTCA TCTTCTCTGC CAGTTGGGTC CTACTCCGTC GGAATTCTCT GGCATTAGTA GTACATGAAG AAGAAGAAGT AATGCTTCTG  GTCATGACAC ATCTCCTGGT TTTCCTCTTC AGGCGAATGG GCCCTTGTAC GAGCTGCCGT TTGCTTAGAG TCGTCGACTT ATGAAGTGGG TCGTCTGCGA ATTTGGTCAA AAGTTTGTCC  GACGAGGTCT TGGTCACTTT CTGAACTACC GGAGTCATCT GATCAGTATC TATTAGACTG AGAAACGACA AGATTGATGT TGCTCGGAGA TGAGGTCGAT GTGTTCAGGA TTGAGAATTG  TGGTTGTGAT GTACACACAC ATATATGTGT GTGGGTTGGT CGAGCGGAAA GGAATATAGC CGTTGGTACA GGAATGGGGC CGTCAGACAT AAGAATCTGA CGAGCCACGT GATGTGATGG  TTCGGTGATT ACATTCACAC GCATCTCGTG AAAGTATTAC TTCTGGAAAA AAGATTTATA TTATATTCTG ATATTTTGGT CTTAATGGAT CAAGTCTACG GTCCAGATTT TATCGAGATG  ACTCCGATGA ACCGTCAAGA TTTACTTGGA TCTGGATATA GTGTACGATC TGATCTTGAT TCGTGGATTT CTCTATTGGG GAACCGAAGA ACGAGAGGAT GGAATCTTCT CTGCTTACTA  GTTTCCAAAA AGATGTACGT GATGTAATAT ACTGGACACT TTAGTTCAAG TCCTTTCACC TCCCTTCTCT AACTTTCTAG ACAAAAAAAC AAGCCCACCA ACAACGATTT ACTTTCGTAT 
ACTTGTTTCT AATTCATGCC ATTTTCGTGT GACTCCTGAA ACCCTTTTTC TATGAATTCT TTATGCAGGA AAACCCCTTT 

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DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGGT GTCTCCGGCG ATGTTCGTCG GACACAATTC CGACGACGTC ATTCCCGCTA AGCCTCAACA CTACTCCGGC TACGTCAGAC GGGGAAGAGG AGTTCCTCGA GGTGACTCTC  GATATCCAAG GCGACGACAC CATTGTTCTC CGTAGCATAG CTTCTGCTTC CTTCCCTCAC CCTCCACCTT CCCCGTCGGT GTGCGTTCAG ACATCGGAGT ACGTGACACC GAGTTCTTCC  CGATCACGGT CTCCGTCGGT GTTTGGGAGG AGCTCGTCGA ATCGGTTCCG GCAGTTCTCC CAGGAGTTGA AGGCAGAGGC GGTTGCGAAG GCCAGGCAGT TCTCTCACGA CCTTAGGGCG  GAGTTTAGGA GGTTCTCTTG GGGCTCGTCG AAGACGACGA GTGTTTCCGC CCCAATTGGA GTGGGGACTG GGAGTGGACA GAGTGGGAAT GCGATGGAGA TGGCGATGGC GGCTAGGGCG  ACGAGGAAGA GGAGGGCGGA GATGAATCGA GCACAAAGGG GTGCGGCGAA GGCGTTAAAG GGGTTACGAT TCATCAGCAG TACCAATACC AAAGGAATCG ATGCCTGGAA TGAGGTCCAA  GCGAACTTCG GCCGTCTCGC CCCCGACGGT TTTCTCCTCC GATCTGATTT CGCCGAGTGC ATTGGTACTT TTTGTTCGTT CGTGATTTGT GTGAAATTTT CTTCAGATGT CATTGTTGTT  GGTGATGTCT GGCGTTTTGT TCGATGGATT TAGGTATGAA GGACTCCAAC GAGTTTGCTT TGGAATTGTT CGATGCGCTC AGCCGTCGTC GGAGAATCAA GGCGGAGAAG ATTAGCAGAG  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CDS
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