Entry information : LminPrx01(Lemmin1g0008400.t1)
Entry ID 18799
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx01(Lemmin1g0008400.t1)
Name LminPrx01(Lemmin1g0008400.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx01
start..stop
S start..stop
LminPrx28 649 0 1..327 1..327
SpolPrx25 501 1.5e-180 21..325 22..327
CescPrx37 498 2.19e-179 4..324 12..333
SpolPrx16 473 1.94e-169 21..325 28..329
Literature and cross-references LminPrx01(Lemmin1g0008400.t1)
Protein sequence: LminPrx01(Lemmin1g0008400.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (305)
PWM (Da):   %s   35199.81 (33230.8)  
PI (pH):   %s   7.74 (8.00) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-327
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAGAAAAVLA LAAIAMLMAA EGKLTLDYYA RTCPQMAKIV SDTVTSKQIS SPTTAAGALR LFFHDCFLNG CDGSILISST AFNRAERDSD INLSLPGDAF DVIVRAKTAI ELSCPGIVSC  SDILALAARD LVTMLGGPFY AVRLGRKDSF VSRSQGVDER LPRSNATISD LISLFAERGF SIQELVALSG AHTVGFAHCK EFAARFGIGG GAADPVADHR YADGIRSACQ DYHRRPTVAV 
FNDIMTPNKF DNMYFRNLKR GLGLLATDQA MAEDPRTRPF VELYAADEAA FFRDFSRAIE KLSVHGVKIG RQGEVRRRCD QVNSFGA 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TACCAGACCC AACCCATGTC TCATAAGGTC TAATGAATCA AATGCACGAG TAAAAAATTT AGATTTATTC ATTCAAATTA GTGTTTTTGG CTGACGGTCA TGTCTCTCCC CCCTCTCTCT  CTTGTCTCAG TCTCCACTAT GCTCAGTCTC CGGTTGCCCT TGCTACCTTG CTACAGTTGC TGACATTGAA CTCGCCACCT CCACTTCTAC AATCGTGAAG AATCCCCATT GTTCGCGTAG  GTAAGAATAG GCATTTCTAT GAATTGTTCA TTTAGATTTT GTTTTTAATT TCTGCTTAGT TTGTGGATTT CTATTACAAT TTATCTTCTC TCTATTTTTT TAATTTCTCA AATTTTTGAT  ACATTGATAG ATGGACACAT AGATCCATAG ATAGATAGGA TGTGATGAGT ATAAGTAAAT GCATGACATA AAAATATGAT TTAGTTTGTG GATTTCTATT ATAGTCTGTC TTTCTCTCTA  TTTTTCTAAT TTCTAAATTT TTTTATAGAT AGATAGATAG ATAGATAAAT AGAAAGATAG ATGATAGATA CACATAACAT GTGATGAGTA TAAGTAAATG CATGAGATAA AAATATGATT  TAGTTTGTGG ATTTCTATTA CAATCTGTCT TTCTCTCTAT TTTCTAATTT CTAAAATTGT TTGATACATA GATAGATGGA CAAATAGATA GATAGTTAGC TAGAGTTGAC TAGATAGATA  GATAGATACA TACATACATA CATACATACA TACATACATA CATACATACA TACATACATA CATACATACA TACATACATA CATAGCATGT GATGAGTATA AGTAAATGCA CGAGATAAAA  TATGATTTAG TTTGTGGATT TCTATTACAA TAATTAGATG AACATATAAA TAGATAAATA GACTAATTTC AATTTACTTT CTTAATTCAA TTGAATTGTA AATTTTGGTT TCAGTTTATA  TAGGCAAATT TTGACAGGGA TGGTATTACT TCTTTTAGCA TGACGAATTT TTCAGAATCA TTATATGACG TTCATGCGAT TGATGAGGTA CCCGGATGTA AACATCGTAC TCCAACATTG  TTGGCCATCT TTTAGTTCAC CCAAGTCGGG AAGTGGAAGT TCTCATGCAA CGAGAAAAAT TCGGGGACAG AAGTTGTTAA AAAAAGGACA TGGTAGCACC AATGTCTTTT AACAACATCT  TGGGAAACAT CATTGTACTC TCTATGCCAA TTCAAAGGGT ATGAACTCTA ATCAGAAAAC ATTTGGCAAC ATGTTTGATA GTGGCCCATC AACCAAACCA GACTACTACG TTGCTAGAGG  CGTAAATAAA GAGCGTACTG AACATGAATT TGTGAGGTTT ATATGCCTCG CTGAGCATCG TTGAAATGGG CCTTCATCTG GACATTAAAA TTCTTAACGA ATCTCGGAAG ATTTTGCGGA  TTACATTTAT GCAGGCCCAT TGGGTTTAGT GGGCCGGCCT GGTCAGAAAA ACCCGGCCCA ACCCACCGTC CCACCCTGAC CCACCCTGCG GGCAGCCCCA TGGGACGGGT CGTGTCAGGT  AGATATGGGT CGGGTGAGCC CGACCTGACT GGCCCGTCCA TCCGGTCCTC TGTGTGGGAC CCAGAAGACG TGGGCAAGTC CTACCCAATA TGAATAATAC GTTAATAAAA ATATTTTATT  AATTTAATGG GGAGGAGAGC ATTTTGGCCG TTAGCTTTCC CTTCCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTTT CTCTCTCCTA TCTCGCAAGC TTTGTCTCAC CTCTCTTGCT TTCTCTCTCT  AGTCTCCTAT CTCTCTCTCT CTCTGCTCTT TGTCTATTTG TTCTCTATCC GCCTCTTCCT CCTGAACACG GATCCTCTGC AATCCCGCCC TCCGCGACTG CGAAACCCTC GCTACGGGCA 
TTCTGCAGCC GCAAGATCTC GGCGTTTCTC TCTCTAAAGG GGGAGAGGGA AAAAGGTCGA AAGCTTCTCG GCCGGTGGAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCCTGGTAC GCTTCTTCTC ATCGCATCCC ATTTCTGCCA GATGTCTGTT TTTTGCCCCC ACAGAATAAC TTTAGAGAGA GAGAGAGATG GTGATAGAGA GAGAGAGAGA GATGGGAACA  TGGGTTTTGC CGTGTTGCTT TGCCGTGTGA TTTTGAGATG TCCAAGGTCT GTTGATGTGA AGGAGACTCA ACCTTCTGGT TGGGGTTGAG AGAGACGGGA ACAGCAAAAA AAATTGTCCT  TACCCCTCTC GCTCTCTGTA CCTCTCGTTG TCCATTCCTT GAACATTTCC ACTTCTATGC GTCCATCATT ATATCAAGAA CTGTTGTGTT TTTATTGGCG ATGCAATGTA TTCTGTTGGG  TGGGTCCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CCCCACCTCT CTCTCTACAA CTACTCCATC TCTGTCAGCC TCTCTCTAAA ATTTGAAGCC CACTTTCGAG TAAGGTGCCT CGGCAACGCC  TGACACTCCA AATACTTTCC AAGATTGCAT CAATGCAAAC CAGTAATTAG GCGCCGCATT CGCTCAAACC TTATTATTTT CATATTTGGG AAATGTTTAC CACAAAAGGG TAAGAATTAG  TGGATTATGT AAGTTTAGTA TTCATGTATG GCCGGTAAGG AATGTTGAAG ATGCCAGCTG AGGGCATTAA AGGCAGCGTC CTTTGGCAAT AAACAGCCGT CCATGGTCGC TCAGATTCAC  ATGAACTCTA TGAGACAATT AATGTGAACA ACTTCATCCA GATACACACT CATCCCCGCC CGTTTAGCTA GAAGAATGCA ACATGCAAAT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT  CTCTCTCTCT CTCTCTACTT TAAGGATGTA GAGCAATTAA TATGGTATAA ATGTGCAATG AAACATTAAA TTGAATATGG TGTTCAAGCC TCAACTCTCT TCCTCTCTCT ACTTTGGGGT  TATCTTCACC CCAAGGAATG AAAAAAAGCT CAAAAATAGT ATGAAACATT GAGAGTCTAA CGTTAAAGCG ATCGTGTAAG TAGTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTAATCAA  ATGACATTAG GGAATGTGAG ATTAGTGGAA AGTCAAGTAA CCTCTGGTCA TTTTGTGCGC AAGAGAGAGA ACAAAGATGA ATTCTAGAAA GCTTGTCTAT AAATATATCC TACACTCTTG  GAGTGCTCAG GGATGTGAAT CCTAAAGCTT TAGTGAGAGA AAAAGATAGA AATGAGTCTT AAAATAGTTC ATTTCATAGG GAGCATTGAA TGGAAAAATG TAGATGCTCT AAAAATATGT  CATCATTTAA ATGTAATATT AATTTTGGGT TTTTCCAGTA TTTTTCAAAA AAAATTTGCA GAGAAACTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTAA ATTTTGTTAA TGGTGATAGG GATTTTCTAT  AATAAACCCA ATCAACCAAT CATGAAAATG GAATTATCTT TTCTTACCAT TCTTACTTCC TTATTTTTTA AGGACATTTT GAGGAAACAT ACATAGTAGG ATGATCGGCT CAACAAAGGA  GACATTCCAA AAATCTTGTT TTTATTAGCA AAATGTAACT CTTTAAGACG TGTGCACAAA ATCTTCTTCA TAGTACGATA AAAGGAGGTT CTATTTAGAT TTTTGTGGTG GAATAAGTTC  TATAGTCCTT TGAGGAATTT GTTGATTTAT TCGACTTTGA GGATTAAAAC TATTTTAATG GGAAAGAATA TATTGCCTCA AGTTTAATTA CTACGGCAGA CTTATCATGA GTTTTGACCA  ATCATTTAAT TTTAGAATGC GATAAGATTA AGATCTTACC TATATACACT AAGTGGTTCT TTAAGTCAAT TTGTAAAATG AATTTATGGC CAAGCAACCT CAATCTTTAT TGTTCATTGC 
TTGAATATTT AGTCCTATTA ACTCAATTGA GTCCATTTAT GAAAAATGAA GTAATGATCA ATCGACTCAA GATATATAAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGGCG CAGCGGCGGC GGTGCTCGCA TTGGCGGCGA TAGCAATGTT GATGGCGGCA GAGGGGAAGC TAACCCTAGA CTACTACGCC CGAACCTGCC CTCAAATGGC GAAAATCGTC  TCCGACACAG TGACGAGCAA GCAGATCTCG AGCCCTACGA CAGCCGCAGG AGCTCTCCGC CTCTTCTTCC ACGACTGCTT CCTCAATGGC TGCGACGGAT CCATCCTCAT CTCCTCTACC  GCATTCAACC GCGCAGAACG CGATTCCGAC ATCAATCTCT CTCTTCCCGG CGACGCATTC GACGTAATCG TCCGCGCCAA GACCGCGATC GAGCTCTCCT GCCCCGGCAT CGTCTCCTGC  TCTGACATTC TAGCCCTCGC CGCTCGAGAT CTGGTCACAA TGCTCGGCGG CCCCTTCTAC GCCGTCCGCC TCGGCCGCAA GGACAGCTTC GTCTCCAGAT CCCAAGGCGT GGACGAGCGC  CTTCCTCGCT CCAACGCCAC CATCTCAGAT CTCATCTCTC TATTCGCCGA GCGAGGATTC TCGATCCAGG AGCTCGTAGC TCTCTCCGGC GCGCACACCG TGGGATTCGC GCACTGCAAG  GAGTTCGCCG CGCGCTTCGG CATCGGCGGC GGCGCCGCCG ACCCGGTGGC GGATCACCGC TACGCCGACG GAATTCGCAG CGCCTGCCAA GACTACCACC GTCGCCCCAC CGTCGCCGTC  TTCAACGACA TCATGACTCC GAACAAATTC GACAACATGT ACTTCAGGAA TTTGAAGAGA GGATTGGGGC TGCTAGCGAC GGATCAGGCT ATGGCGGAGG ATCCTCGTAC CCGGCCGTTC  GTGGAGCTCT ATGCGGCCGA CGAAGCGGCT TTCTTCAGGG ATTTCAGTCG CGCCATCGAG AAGCTTAGTG TCCATGGAGT GAAGATTGGA AGGCAAGGGG AGGTTAGGCG GCGCTGCGAT 
CAGGTCAACT CCTTCGGAGC TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGGCG CAGCGGCGGC GGTGCTCGCA TTGGCGGCGA TAGCAATGTT GATGGCGGCA GAGGGGAAGC TAACCCTAGA CTACTACGCC CGAACCTGCC CTCAAATGGC GAAAATCGTC  TCCGACACAG TGACGAGCAA GCAGATCTCG AGCCCTACGA CAGCCGCAGG AGCTCTCCGC CTCTTCTTCC ACGACTGCTT CCTCAATGGC TGCGACGGAT CCATCCTCAT CTCCTCTACC  GCATTCAACC GCGCAGAACG CGATTCCGAC ATCAATCTCT CTCTTCCCGG CGACGCATTC GACGTAATCG TCCGCGCCAA GACCGCGATC GAGCTCTCCT GCCCCGGCAT CGTCTCCTGC  TCTGACATTC TAGCCCTCGC CGCTCGAGAT CTGGTCACAA TGCTCGGCGG CCCCTTCTAC GCCGTCCGCC TCGGCCGCAA GGACAGCTTC GTCTCCAGAT CCCAAGGCGT GGACGAGCGC  CTTCCTCGCT CCAACGCCAC CATCTCAGAT CTCATCTCTC TATTCGCCGA GCGAGGATTC TCGATCCAGG AGCTCGTAGC TCTCTCCGGC GCGCACACCG TGGGATTCGC GCACTGCAAG  GAGTTCGCCG CGCGCTTCGG CATCGGCGGC GGCGCCGCCG ACCCGGTGGC GGATCACCGC TACGCCGACG GAATTCGCAG CGCCTGCCAA GACTACCACC GTCGCCCCAC CGTCGCCGTC  TTCAACGACA TCATGACTCC GAACAAATTC GACAACATGT ACTTCAGGAA TTTGAAGAGA GGATTGGGGC TGCTAGCGAC GGATCAGGCT ATGGCGGAGG ATCCTCGTAC CCGGCCGTTC  GTGGAGCTCT ATGCGGCCGA CGAAGCGGCT TTCTTCAGGG ATTTCAGTCG CGCCATCGAG AAGCTTAGTG TCCATGGAGT GAAGATTGGA AGGCAAGGGG AGGTTAGGCG GCGCTGCGAT 
CAGGTCAACT CCTTCGGAGC TTGA 

Retrieve as FASTA