Entry information : LminPrx22(Lemmin4g0098340.t1)
Entry ID 18820
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx22(Lemmin4g0098340.t1)
Name LminPrx22(Lemmin4g0098340.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx050]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx22
start..stop
S start..stop
LminPrx07 615 0 1..325 1..325
LminPrx09 550 0 1..325 1..326
LminPrx08 506 0 1..325 1..326
SpolPrx09 418 4.76e-149 68..325 1..258
Literature and cross-references LminPrx22(Lemmin4g0098340.t1)
Protein sequence: LminPrx22(Lemmin4g0098340.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325 (306)
PWM (Da):   %s   34539.65 (32535.7) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   6.04 (5.70) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-325
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKWVAVAVVM AVMPAMCVSA GLSIGFYDKT CPTAEELVRQ AVASSFNADP GVAAGLIRTH FHDCFVRGCD ASVLLDSTPG NPSEKEAVPN RTLRGLEVVD AAKAAIEETC PGVVSCADIL  AFAARDSASL AGDISYQVPA GRRDGVISNI SEVVLPSPLE DAASLIRDFA RKNLTADDLV TLSGAHSIGV AHCGTFRNRI FQNTSTQIDP TLSLSYGELL EAKCTRTPSP TTTVRMDLIT 
ADLLDNKYYV GLQNNLGLFT SDHALTTLPE LSKAVDENAK SLAKWVKKYK RASVKMGAIE VLTGEQGEIR KNCRVINSLQ SLAVE 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTGAATATAT GTTGGATATG TCATAGAAAA CTAGTCTTAT GATTTGAAAA TTTGAGATCA GCATAGTTAA GTCACGACCC AATTTTTAGG GATAGTGAGA ATGTTGACAT ATGTAAAATG  AGCTCCGAAA CGATGTGGTG TATGAACGAG GTGGGTACTT TTAGATTAAA ACTTAGATTT TGGATATGTT CATGAAAAAG AAGTTAAAAA ATCTATAAAT AGTTACTGCT ATTGGGAGGA  ATCCCATTAC ATGGCGTAGA AAGAAGCAAA TTGTAGTCTC TCACTCCAAA ATCGAAGTTG AGAATAGAGC TATGACAAAT ATTGCAATGA GATGATGTGG ATACACTTGC TACTTCTTGA  GTTCAAGGTA CGCACATCAA TGAACATATA CTACGACAAT TAGGCGGCCA TCTTCTTGCA AGCAACCCAA CTTTTCAAGT AAAGTAGAAT GGGCATCAAG GTGGAATGTC ACTATATCCT  TAATGATGTA CTTAATGGAA ACTACACACG TCACAATCTC ATAACAACCG GTGGATATCT TTACTAAGAG TCTTAGTGGA ACGCCCTATA ATACTCTCTA TAGTAAGTTA GAAATTTTTG  ACATCTACTC TCTAGCTTGC GAGGGAGTGT GAGTAGCCCA ATAGGCTAAT ATATCTAATG AGCCTAACTC TCTATCTCTC TCGTGTATAT CCCTCCTAAT CTATAAGGTA GATGCTTCTC  CATTATTAGT ACTCTCTCAT TTCTACCCTA AGATACAGCA CTAGCCTCTT TGGAGTACTT TAAATTGATG AACCTCACTT TCTCTCTCAT TCATCTCCCT AGTTTTTCCC CTTTATCCCT  CTCTAGTTTT ATCATTTTCC TTTTCACTTT CTCGCCTTTA TTCCTCGCCG CCTCCGGCGC TCCCTCCATC TCTCTTTTCT CTCCCCTCAA CCTTTTCCCA TCCTCTCACT TCCCTCTCTC  TCTCTCTCAT CCCATCTCCA TCCTCCACGC TCTCTCTTGT CCCCTCTCCC TCTTTTCTCT CTTTCTCTCC TCCCTCTTAT CCTCTTCTCA TTTCCCCTCC CCTTCTCCCC CTTGTCATTT  TCCCTCTCTC TAGATCCTCT CTCCCTCTCA TTTTCGATCC TAGGTTGGGC TCAAGAAACG AGGTCAAGCG AATAACGTAC TGGTCAAAGA TGTCCACATT CTCGGACTAA CTTTTGGTTC  CCGGGGTCTC AAGAAAAGGG TCTGCATCTC GAACACCACA CGTCAAAGTG CGAATCTTGA ACCACGATTC GTCAAACCTA CGATGGACTT GAGATTCTTC CAGTCTGAAC GTCGAACCGC  GTGTCGAGGA AGAAAAGGGC AACAAATCAT ACCCCCCCCA TTCCTCCCCT CCCTCTCTTC TCTCTCTCTC TCTCCCTCCC TCACCGTCTC CCATGACCAT GACACAGCCG CGTTAGTCCA  AGATCTGGTT TCTCTCTCTT CCCACACTTG CCCTTTACAC CCACCGTATC GAATTTTCTT CTCTCGAAGA CGACAGCCCT CGTTGTCCGT GATTGAGACA GTTTTGGAAT AATCCATCCC  GAGGATAATC CTACCCTACC CACCACCCTT GAGACTCATC ACTACTTCAT TTATGAGTCC ATAGATAGAT TTTTCGTCTA AGTAGGTTTT TCTGAAGGAA GAAGAGATAG GTTTAGAAAC  CCTAAAATCG GAAGTTAGAG ACCAGGGGAA AAGGATAAGA GTCAGCTGTT TCTCAGCAGC TTTCCTGACC CCCTATTGGC GCTTCTTTAT TTTCTAGGGT TGGCCATGAA GATCAAAGCC  GTTGAAGGAA GACAGCCTAG TCTCTATCTG TAGCTCTGTC TCTCTCTACA CCTCTCTCTC CCTCTCTCTC TCTCTCTTCC ATATATTGAT GGCGTGGTGG ACTAGACTGA ACCAGAGAAA 
CCCTCTATTT AATCGCATCC CCGTCTTCCT ACAGTTCAAG AAAACTCAAA TATCCGAGGC TCTCTATCTC TGATAGGAGG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCTTCTCTG CTCATGTTTC TACTTGACCT AATAAATGTC ATGTGGGTTC ATCATGTGAC TAGGCCAGCC ACCAATTTAC ATCAAATCCG TCTAGCTCTC ACACACACAC ACACACACAC  ACACACACAC ATACATACAT ACATACATAC ATAGATACAT ACATACATAC ATACACATAG AATAGAGGAT CGGGTCAGAT CTAGTAGATT TGGCCCGGAT CTAGATCCTC TCAAAAGGAT  CGAGTGATCG ATCATGTGGT CGATAATGAT GACTTAATAG GCAATAATGT ACACATTTAG ACATAAAAGT GTCAAAAGAA GGTTAACATG TACTTTCATC TATTTTGAAC ATAGAAAAAT  GAGTGGTAAG CATGAGAGAT TGGGTGGATT ACGTTAATGA TCATGAAATC TAGAAGGATG CTGATGATTT TAGTTTTTCT AATAATGGTG ATCACAAGTG TTTATAACTT ACATGATGGT  GAGCATGATA ATGTCTATGA GATACTTCTT TGTCAATGAT GAAAACCATT AAGAAAGATA ACTATTAGAT TCTCACTAAG TAACATGTAT GAATATTCAT TGCTATTATA AAAATAATGA  TTAATGAGGA AATTGAGTAA GCGAAAAGTA CAAATTATTG TAAATAAAGT GAAAAAGCTC ATACTAGCTC AAAAAAGTCA AATTCATAGG TCAAAAGTCA TCCTATGCTG TCCACATCTC  ATTCTTCTCC CTCCTTGTCT CTTACATCTC ATTCTTCCAA AAGGTCAGAG AATATGACAT CATGATGTTC GAGATCAATA GTGCTCAAGA AAAATAGATA CGATAAAAAA TGCATGGTTG  CGCTTGATGG ACCATTCGTA TTTAAGAATA TTTTGTTCAT CCATATTCTT GTCGTGTTTG GCATGATCAA ATCTTTTCAT TCGACCACAT ATTTGGACAA TCGCCCAAAC AAGACAAATA  AGTTGTCTAA ATCGAACAGA AACCTTCGTC AGCGAGTTTG AGATTCTTCA CGACAACATT TCGTTAGTAG AGGTGATGAC CGATACATTT GTACCTTTTG TGGCCTAAGG TTCTGGTGAG  ATATTATTTT CTTCAGGCCC TCCTGTAAAA CCTTATTAAA AATCTTAGCA AGTCATGACA AGTCTTATGA TTTGGTGAAA CTAGGGTTCT TGTCCTTCAG TGTGCTTACT AAATGTGTCA  ATGTGAGGGT CAACTTTCTC ATGCTTTAGA ATTGGAATGT TCAGAAATTT TCTAGAAGCT CACAATCCTA CCAGATGTTC TATAAAGGTT GACATCTATT AGAATGGAGG TCTCTAGAAG  CTTCCAATGA TTTCTATTAA AGGAGGAGCT CACCTCAAGC TCGGTAGAAC TTTGAGAGTT GAATCTCAGT GACTTGGAGA GTTGGAGAAT GGTGGGCAAC ATAGCATCGT TAAAAAGACA  CTTTGTGAAG AAGTGACACC ATGTGTGGCT CTTCTTGGTT ACAGTCCCTT TGGTGAACTT TTTCTTTTTT CTTTGTTTGT CCTTACCACC TTTTAGACCT CTACTGCGAA CATTTTGCAT  CCCATCCAAG AAGGCTGTTT TTCTTCTTTC TATTGTGGGA TTTGGTTAAT CTCATCCCTG GTTGCTGGGT GGATATTTGA GTTCAGTTAG ATACATACTT TGGAATCCCT TAAGTCCATA  TCCTCAATAA TAGAGGTCCA AAAACTGGTA TGTACAAAAG GAGAAAAGAG AATAAGTCCA CCAAAGGGAC CATTAACCAA AAAGAGTTGC ACATGGTGTC ACCTCTTCAC AAAACTTCTT  TTTATAGATC AAATGTTGCC CCCATCTTTT CTCAAACTCT CCAAGTAGCT TAGATTCAAC TCTTAAATTT CTACCAAGTT TGGGATGAGC TCCTCATTTA ATAAATCTCC TTGAAAGCTT 
CTAGAGACCC TCACTATAGA AGATGTCCAC GGCTTTCTAG AATGTGTGCT CAAGCTTCTA GAAGAATCTA GAAGAGTCTA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTGGG TAGCGGTGGC TGTAGTGATG GCCGTGATGC CAGCTATGTG CGTCAGCGCT GGACTGAGCA TAGGTTTCTA CGATAAAACC TGCCCGACGG CGGAAGAACT GGTGCGGCAG  GCTGTCGCCT CTTCCTTCAA CGCCGATCCC GGCGTCGCCG CTGGACTCAT CCGCACGCAC TTTCATGACT GTTTCGTCAG GGTAATCTTT CTCTCTCTCT CTCTATCTAT CTATCTATCT  ATCTATCTAT CTATCCATCC ATCTATTTAT CTCTATCTAT CTGTTTGTCT GTCTATTCAT CTATCCATCA GTCCAGCTAC CATATGTATA CATACCCATC TATCCATTCA TCTTTTTAGC  AACCATCTAT CCATAATCCA TCCATCTATC TAGTCAGGAA TCATCTATCT ATCTTTTTAG CAACCATCTA TCCATGTATC CATTTATCCT TGCTCCCATC CATCTATCTA CTTACATCTA  TCAATCAATC TCTCTCTCAC AACCATCAAC CCGTTTCTCT CCCTCAAGAG TCAAGTGGGC GAATCTAAAG ACCTAAATTG CAGGGCTGCG ATGCCTCCGT GCTTCTCGAC TCCACACCAG  GAAACCCATC AGAGAAGGAG GCGGTCCCCA ACCGGACCCT TCGCGGGCTA GAAGTCGTCG ACGCCGCCAA AGCAGCCATC GAGGAAACTT GCCCGGGCGT CGTCTCCTGC GCCGACATCC  TCGCCTTCGC CGCCCGCGAC AGCGCCTCCC TCGCCGGCGA CATCAGCTAC CAAGTCCCCG CCGGCCGCCG CGACGGTGTC ATCTCCAACA TCTCCGAAGT AGTCCTCCCC TCCCCTTTAG  AAGATGCTGC TTCTCTCATC AGAGACTTCG CTCGGAAGAA CCTCACGGCC GACGACCTCG TCACCCTCTC CGGCGCGCAC TCCATTGGAG TCGCCCACTG CGGGACCTTC AGGAACCGCA  TCTTCCAGAA CACCAGCACG CAGATCGATC CCACGCTGAG CCTCTCCTAC GGCGAGCTGC TGGAGGCGAA GTGTACACGT ACCCCCTCGC CGACGACGAC GGTGAGGATG GACTTAATCA  CGGCAGATCT TCTCGACAAC AAGTACTACG TGGGACTTCA GAACAACCTC GGGCTGTTCA CCTCCGACCA TGCGCTGACC ACGCTGCCTG AGCTTAGCAA GGCGGTGGAT GAAAACGCTA  AGTCCTTGGC CAAGTGGGTG AAGAAGTACA AACGCGCCTC AGTCAAAATG GGAGCAATTG AGGTGCTGAC AGGCGAGCAG GGAGAGATTA GGAAGAACTG TAGGGTCATT AACAGCCTGC 
AATCGCTGGC TGTGGAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTGGG TAGCGGTGGC TGTAGTGATG GCCGTGATGC CAGCTATGTG CGTCAGCGCT GGACTGAGCA TAGGTTTCTA CGATAAAACC TGCCCGACGG CGGAAGAACT GGTGCGGCAG  GCTGTCGCCT CTTCCTTCAA CGCCGATCCC GGCGTCGCCG CTGGACTCAT CCGCACGCAC TTTCATGACT GTTTCGTCAG GGGCTGCGAT GCCTCCGTGC TTCTCGACTC CACACCAGGA  AACCCATCAG AGAAGGAGGC GGTCCCCAAC CGGACCCTTC GCGGGCTAGA AGTCGTCGAC GCCGCCAAAG CAGCCATCGA GGAAACTTGC CCGGGCGTCG TCTCCTGCGC CGACATCCTC  GCCTTCGCCG CCCGCGACAG CGCCTCCCTC GCCGGCGACA TCAGCTACCA AGTCCCCGCC GGCCGCCGCG ACGGTGTCAT CTCCAACATC TCCGAAGTAG TCCTCCCCTC CCCTTTAGAA  GATGCTGCTT CTCTCATCAG AGACTTCGCT CGGAAGAACC TCACGGCCGA CGACCTCGTC ACCCTCTCCG GCGCGCACTC CATTGGAGTC GCCCACTGCG GGACCTTCAG GAACCGCATC  TTCCAGAACA CCAGCACGCA GATCGATCCC ACGCTGAGCC TCTCCTACGG CGAGCTGCTG GAGGCGAAGT GTACACGTAC CCCCTCGCCG ACGACGACGG TGAGGATGGA CTTAATCACG  GCAGATCTTC TCGACAACAA GTACTACGTG GGACTTCAGA ACAACCTCGG GCTGTTCACC TCCGACCATG CGCTGACCAC GCTGCCTGAG CTTAGCAAGG CGGTGGATGA AAACGCTAAG  TCCTTGGCCA AGTGGGTGAA GAAGTACAAA CGCGCCTCAG TCAAAATGGG AGCAATTGAG GTGCTGACAG GCGAGCAGGG AGAGATTAGG AAGAACTGTA GGGTCATTAA CAGCCTGCAA 
TCGCTGGCTG TGGAGTGA 

Retrieve as FASTA