Entry information : LminPrx90(Lemmin39g0758670.t2)
Entry ID 18888
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx90(Lemmin39g0758670.t2)
Name LminPrx90(Lemmin39g0758670.t2)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx231]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx90
start..stop
S start..stop
LminPrx95 604 0 1..323 1..327
LminPrx91 599 0 1..323 1..327
LminPrx94 583 0 1..323 1..327
SpolPrx38 455 1.67e-162 1..321 1..328
Literature and cross-references LminPrx90(Lemmin39g0758670.t2)
Protein sequence: LminPrx90(Lemmin39g0758670.t2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (300)
PWM (Da):   %s   35121.55 (32653.2)  
PI (pH):   %s   5.76 (5.76) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
METNRFPFAI VLLLPLLALS ASADSLQFGF YKQTCPEAED IIENLVSRAV ENNPGIAAGL IRLHFHDCFV RGCDASVLLD SIPGSPAEKQ HPANHPSLRG FELIDEAKAA LEYRCPNTVS  CADVLAFAAR DAARFTGGFY YGLPGGRRDG TVSRESEILY ILHNAEELRD EFAKKGLSLE DMVALSGAHS IGVSHCSSFS SRLYDFNSTH SQDPSLHADL ADYLKKRCPP PGTEGDTVDL 
DVATPKILDV HYYRNLKKGK GLLTSDQTLW ASSLTADMVA SFSKNPEVWF HKYAGAMERM GAIDVLTGKE GEIRVKCSVV NGY 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGAGCGCGC GGAGAGCGAG GCAGCGGGGC GCTCTAGAGC CCGCACGGAG GGGGAGAGAG AGAGGGCTGA GAAAGAGAGA ATTTTGAGGA GAGATATATG GCCGAGAAAG AGAGTAATAG  AAATCGAGTA CAGCGGGAGA GAGATCGTGG ATCAGAGGGA GGGTGGGGAG AGAGGAAGGC AACGCTGTAT GATAAAAGAA GGAGATGGAC AATGCGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG  AGAGAGAGAG AGAATTCATA CTCTTTTTGC ACTGTTTTCC AGTCTTCCTC TACGGATAGT TTATCTTTGC ATTCTCTATA TCCAGGTGAT CCTTCTCTCC GACACACACT CTTTCTCCGC  ATCCGTCTGC CCCTCTCTGA CTCTCGTTAT CTCTCTCTCC CTCTCCCGGT TATGCTCTCT TTCTCAGTCT CTCTCCTTGT ACTCTCCCTC TCTATGTCTC TCTTCGTTTC TCTCTCTTGG  ATCATAGACA CGACCTCACC TGCCTCAAGC TCTTTCTCTC GCACAATACA TCTTGTACAT GACCTCACTC CCTGTCATTG CCTCTGTAGT GGATAGAGAG GAATGGGAGA GAGAGAGATA  TTGGTGTTGT GCGCGCTGAT GTTCCGGCGG GGGACCGTAG CGAGCCTCTC GGTGAGGAGA GAAGGAGAAA CCAGATAGAG AGTGCACGGG AGAGAGATAG AGTTGAGAGA CGAGAAATCG  TAGAGAGTTC CAAGTTGGAA GAGGGCAGAA ATCAGAGGTA CAGCACGCGC GGGTAGAGAA AAAGCTGAAA CAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GCAGGTAGAT AGCAAAGATC  TGAGAGAGAA AGATATTATT CTAGCGAGAG AGTGAACGCG GGGAGAGAGA AGATATCTAT ACCTACATAT CGGTTGCAAC TCCCGGCGGG ACAAATTTAC ATACCGACAG AACTCTCTCT  CTCCCCCTCT CTCTCTAACC TCCCTCCCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTGTCTCTG TCTCTCTCTG TCTCTCACTC TGTCTCTCCC CGTTCAGAGT  GCCGCTGATT TTTCTCTGTC GAACACTCTT CCTAGCGGGG AGAGTGTGAG GATGGAGAAA ACACGCAGGG TAAGAAAGAG TACACGGAGA AATAGAGCGG GAAGAGAGAG AACAAGAAGT  CCATGTTAAA CTTAATTTAG TACATAGAGA AACAGCTCAT CGGAGTTCTT CTGTGTGGGT CGTCTCCAAG TCTAACCTGA CTGCCTTGCC CTCTTTTATT GTCCCAGTCT TGAACGTGAA  GGTTAAGAAC TTCTTAGTGG GAGCTGACGA ATCAACTTTC AAAGGAAATA GGCGAAGGCG TCCCAGAATG ACGCGAGCTG TGGATGACTT AACAAGTCTC CACGTATATA TTATTTCTAT  AAACTAGCTC ATCTCTCTCT CCTCTCCTCT CTCTCTATCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCCTCTCCT CTCTCTCTCT CTGTCTCTCT GTCTCTCTCT CTGTCTCTCT  GTCTCTCTCT GTCTCTCTCT GTCTCTGTCT CTCTCTCTCT CTCTCTGTAT AATATTTGGG ATCCCATCTG GAGTCTACAA ATATTCCCCC CCGCCCCCTC TATCCGGCTG TATTTTCTGA  TAAGAAAATT GACCGGCGCA AACGAATGTA CCTCGATATA GAGGACGTGG TCAGGCCGGA AGACTGTGTC TCCTCCATTT AGAGAATAGG TCAATAATCA CCCTCCCTTA TTCTATCATC  TACCGCACGA AGGGAATAAG AACATCCACC TACCCAAGGA GGAACGGCAT TCTATAAATA TTGCCCCAAA TGAACGCGGA AGCTTCATCA AACCTCCTCG CGACTCTCCT ACATCCATCT 
CGGCAGGCAG CTTTCTACAC CCAGCGCGCT CAGTCCGGAT TCCATAGCAG GCGAGGACAC GAATAGCAAG ACCGCGCCGA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCTTTGTCC AGCCCTCTGC CGCGCCATTT ATTCCCCCCT ATTCTCTTAT TCTTCTTCTA TTTTACCCTA AATGAACGCC TCTCGGTGCT TAGCAAGAGG AGTGCCTTGG GTGTCATCTT  CCCCTCTATT TCTCTCTCCC ATCTCTTCAA TTCTTTGAGT GTGTGAGTGG GTGGTTTGTA AGCACCCTCT TCGTGTTTTG TGAGATCCTC TTCTCCTTCA TTCTGTCAAA AGTGATACAG  AGCTTGGTTC GAGAAGATTA CTTTAGGGAG TTTTGCTGTG GGGTGTTTTT CTTCTGAAGT CGGATTTGTT TTTGGGAGAA CTTGGTAGGT TTTTAAAGTT TAGTTTTGAA TGGCAACTAA  AGTTAGTTAA TAATTTTCTC AACTAGCTAT AACTCCGTTT AGTGGAGAGA AGGTTGAGAT TTGGAGTAAG AGAATGAAGG AGTTTTTAGT TGCACTGGAG GTCTGGGATG TTGTTAATAA  TGGTTATGTT GAAGATGAGA CCAGAAGAAA CGAGTTAGGA GAACTTAAGA AGAAGGATGC AAAGGCTGTC TTTGTTTTGA GTCAATCATT ACTGATTGAG TCAATCAGGT AGTGGAAGAC  ATGGAATTTA TCCAATAGAT GGAGGCCAAT TTGGTCAAGG AGGTCAACAA GGACGTGGAG GACAACGTGG ACGTGGAAGA AGGTTTCAAA GACAACTTTG GACGAAACAG GCAAGCTAAA  GGTGAAGGTA GTAGTCAAAG AAGAATTTAT CGAGCGATAC AGTGCCATTA TTGGAAGAGA TTTCAAAATA TTGAATCTTA TTATTGGAAA AAGTTGAATC AACAAGCAAA TATATCTGAA  GTTGAGCGAA CCAATTTGTT CCTTTTAAGC ACAAATTTGG TTGATGGCAA TAATAGTTCT TAGATTGTGC ATGTAGAAAT CACATGTAGC CATGGACGTA GGATCTCACA AAAAATGTTA  AGACAATGAA TGTGGCCTTA ACATGTAGAT TCTCTGACTA GGATCAGAAT AAATTTGATA AAGAAAATCC TGAAAATCCT CATAATTTCT GAAAGTCTCA TTCAGATGTT CTTGACTAAA  AAAACATCCA TAAACCTTCA ATTCTTCAAT GAGAGTAGGA AGAAGATGAA TAAATCATGG TGGCAATCTG GAAGATCTCC ACTTCTCAAA CTCCTTGAAT CATTGGTGAG TCACCAGGTC  GCAAACTGTG CAAATGGGGA AAAAAGTAGG GCACAAATGC GAGAAGAAAT CTTATTCATG GGATCCTCAA ATTTGCCTTT TAATGGATTC ATACATCTAC TTGACATTGA TAATATCGGG  TAAATTGGAC CCTTCCCAAT TAAGGCCAAG TGAAGATTAT AACGGTAAGA TAAATCTAAT CTGAGCTAAC CACTTATTGA AAATATATCC TTATTACTAA TTGGAAAAAG AAAAATGAAA  TATATTAAAA GTTTATTTAC CAGACTATGA AATACCCCTC CCTTCAAGTT GTGGAATGAA CACCTTAAGT GAAATTATTA GAACATTGAG GTTTTGTGAA TCTTAAGCTG CAAGAAACCT  TTCGCCTTTG ATGAAAGGTG TTCATATAAT TTAAAGTTTT AATTTATCTT TGATTACGAG CCTATCCACA TCCACATACT TTATCTTTGA GTATTAGTAG CAACATACGT ATTATCGTTA  ATAATTGAAT AGCAAGGAGC TTCCACATTT AAATCATCAA GGATTTTTTT AATCCGGATG AGATCGCTAA TTCTTGTGAA ACGGCCCAAA ATTCAGCTTC ATCACCTGAT ATCTAGACAT  CTTCATTACT TGATTCAGCT TCTTTAATTT TAGTCATCTA TGCAATAGGA TTTCCTCCTA AGAATGAACA TAAAATACAT AAACCACCTA TCATAAAATG TGAGGTCTAA TTTGAGATTG 
ATAGATTAAT CTACTCGTTA CTATTTTTAA GACTTTTCAT ATGCACACTC AACATCATCA TCTCCAGTTA ACTTATAATT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGACTA ATCGATTTCC CTTCGCAATC GTGCTCCTCC TTCCTCTGTT GGCTCTCAGC GCATCTGCAG ATTCTCTTCA ATTCGGGTTC TACAAGCAGA CCTGCCCCGA GGCGGAGGAT  ATCATCGAGA ACTTGGTTTC TCGAGCGGTG GAGAATAACC CCGGAATCGC CGCAGGTCTC ATTCGATTGC ACTTCCACGA CTGCTTCGTC AGGGTAAGCT GCGTTTCTTG AGAGGAGCGG  GGGACTGTAC GATTGTCGCG TACTGATGAT CTTTCGCTTG TTTTACAGGG ATGCGATGCT TCCGTTTTGT TGGATTCTAT CCCCGGATCC CCTGCAGAGA AGCAGCATCC CGCGAACCAC  CCCAGTCTGC GAGGTTTTGA GCTGATAGAC GAAGCCAAGG CTGCCCTCGA GTACCGCTGC CCCAACACTG TGTCCTGCGC CGACGTACTG GCCTTCGCAG CTCGCGACGC CGCGCGCTTC  ACCGGAGGCT TCTACTACGG CCTTCCGGGA GGAAGGAGAG ACGGGACGGT CTCTAGAGAG TCGGAGGTCG GAGAAAACCT ACCGGGTTTT AATAGCAATG TGTTGGAGAT AAGCACGCGC  CATCAAGTCC CGAAGACGTG CGTTCGACGA AATGCCTCAA TGAAGAGGCA GTTTCTGTTT TCTCTCTACT CTCCTTCTTT AATCCTGACC GTCCATCTGT GGTGTTATAA CGGTCAGGAG  TTAACGCTAG TGGCTTACTG GGACCCACTA GCCAGTAACT GCCTTACCGG CAGTTACTTG AAATGTGTTC GACGTATGCC TATAAAAGGG CCGAACACGA AGAACAATGT AGCTTTTCGT  TTCTTGTTTT TCTTGAATGA AAGTTTGCAT TTCTTTTCTC CACAATCTTC TTGAGTTTCT CCGTGTTATT TCCTAAAGAA TCGTAACGTA GATTCTTTAC ATTCTTCACA ATGCCGAGGA  ACTAAGAGAC GAGTTTGCAA AGAAGGGCTT GTCCCTGGAG GATATGGTGG CGCTCTCGGG CGCGCACTCC ATCGGCGTCT CCCATTGCTC TTCCTTCTCT TCCAGGCTTT ACGACTTCAA  TTCCACGCAT TCCCAGGATC CTTCCTTGCA CGCCGATCTC GCCGACTACC TCAAGAAGCG CTGCCCGCCT CCGGGGACGG AGGGCGACAC CGTGGATTTG GACGTGGCCA CGCCCAAAAT  CTTGGACGTG CACTACTACA GAAATCTCAA GAAAGGGAAG GGCCTACTCA CCTCCGATCA GACGCTCTGG GCCAGCTCCC TCACGGCCGA CATGGTGGCC TCCTTTTCGA AGAATCCCGA 
AGTCTGGTTT CACAAGTACG CCGGAGCGAT GGAGCGAATG GGTGCCATCG ATGTCCTCAC CGGGAAGGAG GGGGAGATCA GGGTCAAATG CTCTGTCGTC AACGGCTACT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGACTA ATCGATTTCC CTTCGCAATC GTGCTCCTCC TTCCTCTGTT GGCTCTCAGC GCATCTGCAG ATTCTCTTCA ATTCGGGTTC TACAAGCAGA CCTGCCCCGA GGCGGAGGAT  ATCATCGAGA ACTTGGTTTC TCGAGCGGTG GAGAATAACC CCGGAATCGC CGCAGGTCTC ATTCGATTGC ACTTCCACGA CTGCTTCGTC AGGGGATGCG ATGCTTCCGT TTTGTTGGAT  TCTATCCCCG GATCCCCTGC AGAGAAGCAG CATCCCGCGA ACCACCCCAG TCTGCGAGGT TTTGAGCTGA TAGACGAAGC CAAGGCTGCC CTCGAGTACC GCTGCCCCAA CACTGTGTCC  TGCGCCGACG TACTGGCCTT CGCAGCTCGC GACGCCGCGC GCTTCACCGG AGGCTTCTAC TACGGCCTTC CGGGAGGAAG GAGAGACGGG ACGGTCTCTA GAGAGTCGGA GATTCTTTAC  ATTCTTCACA ATGCCGAGGA ACTAAGAGAC GAGTTTGCAA AGAAGGGCTT GTCCCTGGAG GATATGGTGG CGCTCTCGGG CGCGCACTCC ATCGGCGTCT CCCATTGCTC TTCCTTCTCT  TCCAGGCTTT ACGACTTCAA TTCCACGCAT TCCCAGGATC CTTCCTTGCA CGCCGATCTC GCCGACTACC TCAAGAAGCG CTGCCCGCCT CCGGGGACGG AGGGCGACAC CGTGGATTTG  GACGTGGCCA CGCCCAAAAT CTTGGACGTG CACTACTACA GAAATCTCAA GAAAGGGAAG GGCCTACTCA CCTCCGATCA GACGCTCTGG GCCAGCTCCC TCACGGCCGA CATGGTGGCC  TCCTTTTCGA AGAATCCCGA AGTCTGGTTT CACAAGTACG CCGGAGCGAT GGAGCGAATG GGTGCCATCG ATGTCCTCAC CGGGAAGGAG GGGGAGATCA GGGTCAAATG CTCTGTCGTC 
AACGGCTACT GA 

Retrieve as FASTA