Entry information : StPrx03(Soltu.DM.10G023940)
Entry ID 1906
Creation 2006-08-31 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-10-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx03(Soltu.DM.10G023940)
Name StPrx03(Soltu.DM.10G023940)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Leaves
Roots
Inducers Cold stress
Drought
Heat shock stress
Salt stress
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx03
start..stop
S start..stop
LePrx82 634 0 1..308 1..308
NtPrx19-1A 556 0 28..329 6..307
InPrx43 496 8e-179 24..328 20..326
IaquPrx27 495 3e-178 24..328 20..326
Literature and cross-references StPrx03(Soltu.DM.10G023940)
Literature Buell,C.R., Hart,A., Zismann,V., Karamycheva,S.A. and Baker,B. Generation of ESTs from abiotic stressed potato tissue. Unpublished (2003)
Protein sequence: StPrx03(Soltu.DM.10G023940)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (299)
PWM (Da):   %s   37224.72 (33740.8) Transmb domain:   %s   i7-28o
PI (pH):   %s   6.94 (6.42) Peptide Signal:   %s   cut: 31 range:31-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATKTQHFGP SSTFITLFLV LLLHIHYAKS DLKLNYYSES CPRAEEIIKE QVNKLYHKHG NTAVSWIRNL FHDCMVKSCD ASILLDKTKE QTSEKTSQRN FGMRNFKYIE TIKEALENEC  PNIVSCADIV ALSARDGIVM LGGPQIEIKT GRWDSKDSYL AEVESFLPNH NDSMSLVLSR FNSVGVDTQG TVALLGAHTV GRVHCVNIVH RLYPTVDPTL DPDFANYLKT RCPSPQPDPK 
AVEYARNDHI NPMVWDNLYY KNIMSNKGLL IVDQQLVSDP TTYPFVEKFA ANNSYFNDQF AKSLIILSEN NPLSGDQGEI RKVCRHVNK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Sequence complete from genomic and 4 ESTs
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCACAA AAACCCAACA TTTTGGTCCC TCATCAACAT TCATCACTCT ATTTTTAGTG TTACTCCTCC ACATTCATTA TGGTACTTCT TCCCTTATAT TTATCTATTA TTCTTTGGCT  TAAATTATAT ACATTCATAG TATAATGAAG TTATCAAAAT ATATGCGCTC TGTTTTAATT TATGTGAATG TGTTACTGAG ATTTGGTGTT AAACAATTCG TTTTTACTAT AATTTTTTAA  ACTTAGTAAA AAATATTTTA TAACATTAGT TATGGTCGAA CTTTAGTGTT TTGACCCCGT ATTCCGAACC CCTTCACATA AATTAGGACA CATAAAAGAA AGAGTAACTT GCTATAGGTT  AGTTACCATT TATTTCATAT TATCAATTAA TGCTATTAAA TAGATTTACT TATTGAAGTG GCATGATATT ATGTAAATAT TCCGAGTTTT TTCTAAAGCT TTATTTTCAT TTATATAACT  TCAATTTTAT TTTTTTACTT AGAAGTAAAA CGACCTTTTT GTCCAAGTAT ATTTATTTTT TTCCTTTTTC TAGTTGTAAT TATGAATTAT TAACAATATA TATGTGGTAA TTGTTGATTT  TATTTCAGCA AAAAGTGATC TCAAGTTAAA TTACTACTCA GAGAGTTGCC CAAGAGCTGA AGAAATCATA AAAGAACAAG TCAACAAGTT GTACCACAAG CATGGGAATA CTGCCGTTTC  TTGGATCAGA AATCTATTTC ATGATTGCAT GGTTAAGGTA ATATATATTT TATACGACTA TGTTTGACTG GACGTAAAAT TTAAAAGATA TTTTTAAAAA AAAAATAATT TAGTGCATAT  AACAAAAGTA CCTTAAAGAA TTTGTGATAT TTATACATGT CATGTCATGT CATTTTTATG GCTAGCTCAT GTTATTAAGG GGTCATTTGA TCCGGAATAA GGTTATTCTA CGATTGTAAT  CTCACATCGA ATATGAAATA AATAGACATA CCAAGATATT GGTATATAAT TTGTTTCAAT ATTATAGCTA ATACCAATAT CAAACACGGG AAAAATATAC ATAATATAAT TCAAATAATT  TTATATCTAG ATTCATATCC CAAGCCCAAT AACCAAATGA CCCCAGTTTA TCAAATATAG AAATGTGACA TTTTTGTTCC TGATTATATT AAATGGTGAA TATTGTTGGT GAAGTCATGT  GATGCATCAA TACTGTTGGA CAAAACAAAG GAACAAACAT CAGAGAAGAC ATCTCAAAGA AACTTTGGGA TGAGAAATTT CAAGTATATT GAAACTATCA AAGAGGCTCT TGAGAATGAA  TGTCCCAATA TTGTTTCTTG TGCTGATATT GTTGCTCTTT CTGCTAGGGA TGGTATTGTT ATGGTAAGTT AAATGTATTT AGCCTCCTCT CATCAACTTT ATTTTTTTTC TTATAAAATT  AAGTATATAT ATATGGTTTA CATATTAGGA ATGACAAATA GGTCGTCTAG ATTGAATTTG AACAGATTAA AATAAATTGA ATCAATGAAT GAGTCATTCA AAAAATTACA TCGAACGACT  TTGAAAATTG GTGATTTTAA AATTTTGAAT CCCACTTACC ACATGAGCAA TTAAGCATTC AAAGTTCAAA GTCAAACTCT GTTGAGCGTG AAGTTTTGCT CATGAGACAA GCAAGGTAAA  AAGTTTAAGA CCACCAAGAG TAATTTTGCC CAATTATGTC CAAAAATTAG TTGGGCCAGC TGAAAATAGA TTTAACAATG GGTTATAGCC TAATTTGTCT ATTTCTTTTT ACCAAATTTA  ATTTGTTCAC TTACCAAAAA CAAAAATTAA TAGTAATTTT TTTTCTACTT CTTTATTTAA GCATAACATC TCAAACCCTA AAGAAAGATT ATTTTTAAAA AAAATTAGAT TTATTGACCC  TAACTTTTAT TATTAACTTA TCCAAATTTA AAAGTATTTA ACGAATCATA TTTTCACAAG CTAATTTTAT TCTGCGTGTT TGACATAGTT AGGAGGGCCA CAAATTGAAA TTAAAACAGG  CAGATGGGAC AGCAAAGATA GCTACTTAGC AGAAGTTGAG AGTTTCCTTC CAAATCACAA TGATTCAATG TCTTTAGTTC TTTCTCGATT CAATTCTGTT GGTGTCGATA CTCAAGGAAC  TGTTGCTCTA CTTGGTAAAC CACCCTCTCT TATACTATTT TTTCCGTCTC AATTTATGTG ATACCTTTTG CTTCTCGAGA GTCAGTCTGA CTAATCTTTG AAGCAATCGG ATTCTATATA  TCAACTTAAT GTTCTAAAAC TAAAATATTC AAAAACTATA CAAAGCATTT CTCACGTCAA TACTTTACAA TTTTACATAA TCTAAATTTT GAAAAATGAA AAGTGTCACA TAAAGTGAGA  TGACAGAGGA ATTGTATGAC TAGTATAAGT CAATATAGTT ATTAATTCGA TTTATTTTTT TAAAAAGAAA AACTCAGTTG ACTTTTCGAA ATATAATGGT GATCGATTGA TGATGCAGGG  GCGCACACGG TCGGACGAGT TCATTGTGTA AACATAGTAC ACAGACTCTA CCCGACGGTT GACCCGACTC TTGACCCGGA CTTTGCAAAC TACCTCAAAA CCCGATGCCC ATCACCACAA  CCCGACCCGA AAGCAGTTGA ATATGCTAGA AATGACCATA TAAATCCAAT GGTGTGGGAT AATTTGTATT ACAAAAACAT TATGAGCAAC AAAGGGTTAT TAATTGTGGA CCAACAATTA  GTGTCTGATC CAACAACTTA TCCATTTGTG GAGAAATTTG CTGCTAATAA TTCTTATTTT AATGATCAAT TTGCTAAATC TTTGATTATT TTGTCGGAAA ATAATCCACT AAGTGGTGAT 
CAAGGGGAGA TTAGGAAAGT CTGTCGTCAT GTCAACAAGT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCACAA AAACCCAACA TTTTGGTCCC TCATCAACAT TCATCACTCT ATTTTTAGTG TTACTCCTCC ACATTCATTA TGCAAAAAGT GATCTCAAGT TAAATTACTA CTCAGAGAGT  TGCCCAAGAG CTGAAGAAAT CATAAAAGAA CAAGTCAACA AGTTGTACCA CAAGCATGGG AATACTGCCG TTTCTTGGAT CAGAAATCTA TTTCATGATT GCATGGTTAA GTCATGTGAT  GCATCAATAC TGTTGGACAA AACAAAGGAA CAAACATCAG AGAAGACATC TCAAAGAAAC TTTGGGATGA GAAATTTCAA GTATATTGAA ACTATCAAAG AGGCTCTTGA GAATGAATGT  CCCAATATTG TTTCTTGTGC TGATATTGTT GCTCTTTCTG CTAGGGATGG TATTGTTATG TTAGGAGGGC CACAAATTGA AATTAAAACA GGCAGATGGG ACAGCAAAGA TAGCTACTTA  GCAGAAGTTG AGAGTTTCCT TCCAAATCAC AATGATTCAA TGTCTTTAGT TCTTTCTCGA TTCAATTCTG TTGGTGTCGA TACTCAAGGA ACTGTTGCTC TACTTGGGGC GCACACGGTC  GGACGAGTTC ATTGTGTAAA CATAGTACAC AGACTCTACC CGACGGTTGA CCCGACTCTT GACCCGGACT TTGCAAACTA CCTCAAAACC CGATGCCCAT CACCACAACC CGACCCGAAA  GCAGTTGAAT ATGCTAGAAA TGACCATATA AATCCAATGG TGTGGGATAA TTTGTATTAC AAAAACATTA TGAGCAACAA AGGGTTATTA ATTGTGGACC AACAATTAGT GTCTGATCCA  ACAACTTATC CATTTGTGGA GAAATTTGCT GCTAATAATT CTTATTTTAA TGATCAATTT GCTAAATCTT TGATTATTTT GTCGGAAAAT AATCCACTAA GTGGTGATCA AGGGGAGATT 
AGGAAAGTCT GTCGTCATGT CAACAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGAGGAAAA TTACAAGACT AGAGATATGG CCACAAAAAC CCAACATTTT GGTCCCTCAT CAACATTCAT CACTCTATTT TTAGTGTTAC TCCTCCACAT TCATTATGCA AAAAGTGATC  TCAAGTTAAA TTACTACTCA GAGAGTTGCC CAAGAGCTGA AGAAATCATA AAAGAACAAG TCAACAAGTT GTACCACAAG CATGGGAATA CTGCCGTTTC TTGGATCAGA AATCTATTTC  ATGATTGCAT GGTTAAGTCA TGTGATGCAT CAATACTGTT GGACAAAACA AAGGAACAAA CATCAGAGAA GACATCTCAA AGAAACTTTG GGATGAGAAA TTTCAAGTAT ATTGAAACTA  TCAAAGAGGC TCTTGAGAAT GAATGTCCCA ATATTGTTTC TTGTGCTGAT ATTGTTGCTC TTTCTGCTAG GGATGGTATT GTTATGTTAG GAGGGCCACA AATTGAAATT AAAACAGGCA  GATGGGACAG CAAAGATAGC TACTTAGCAG AAGTTGAGAG TTTCCTTCCA AATCACAATG ATTCAATGTC TTTAGTTCTT TCTCGATTCA ATTCTGTTGG TGTCGATACT CAAGGAACTG  TTGCTCTACT TGGGGCGCAC ACGGTCGGAC GAGTTCATTG TGTAAACATA GTACACAGAC TCTACCCGAC GGTTGACCCG ACTCTTGACC CGGACTTTGC AAACTACCTC AAAACCCGAT  GCCCATCACC ACAACCCGAC CCGAAAGCAG TTGAATATGC TAGAAATGAC CATATAAATC CAATGGTGTG GGATAATTTG TATTACAAAA ACATTATGAG CAACAAAGGG TTATTAATTG  TGGACCAACA ATTAGTGTCT GATCCAACAA CTTATCCATT TGTGGAGAAA TTTGCTGCTA ATAATTCTTA TTTTAATGAT CAATTTGCTA AATCTTTGAT TATTTTGTCG GAAAATAATC  CACTAAGTGG TGATCAAGGG GAGATTAGGA AAGTCTGTCG TCATGTCAAC AAGTGATTAA TTAGTGTTTT AGTTAATTAA AAGTACTTTT ATTTGTCTTG TTGGTATGTC AACAACACTA  GTAAAATTAA TCAAGTGTAC CAAAAATGTG CCTACGTTGT AATGTATGTG CACATAATTG CTAATTTTCT CTGTTTTTCG TGATGTATAA TATATCAATA TATAAAAGAT CTACGATTAT 
GCTTAAAAGA TGTCAAATGG AGTTGGGATT GTACTGAATT AAGAGGGGTC AAAACGAACG AGTTAATAGG ATTCTTACAT AA 

Retrieve as FASTA