Entry information : StPrx05(Soltu.DM.02G020130)
Entry ID 1908
Creation 2006-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-10-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx05(Soltu.DM.02G020130)
Name StPrx05(Soltu.DM.02G020130)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Callus
Leaves
Petioles
Roots
Tubers
Inducers Cold stress
Drought
Heat shock stress
Pathogen interaction
Phytophthora infection
Salt stress
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx05
start..stop
S start..stop
LePrx17 675 0 1..326 1..326
CanPrx17 655 0 1..326 1..327
NtPrx60-1B 649 0 1..326 1..326
NtPrx60-1A 623 0 15..326 15..326
Literature and cross-references StPrx05(Soltu.DM.02G020130)
Protein sequence: StPrx05(Soltu.DM.02G020130)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326
PWM (Da):   %s   37220.09  
PI (pH):   %s   8.86
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASKHIFFFA ILFFSAVSVF AEENPSLVMD YYKDTCPQAE EIIKEQVKLL YKRHKNTAFS WLRNIFHDCF VESCDASLLL DSTRRMLSEK ETDRSFGMRN FRYIETIKEA VERECPGVVS  CADILVLSGR DGIVALGGPH IPLKTGRRDG RKSRADILEQ HLPDHNESMS VVLERFANIG INTPGVVALL GSHSVGRTHC VKLVHRLYPE VDPQLNPEHV PHMLKKCPDP IPDPKAVQYV 
RNDRGTPMVL DNNYYRNILD NKGLMLVDHQ LAMDKRTKPY VKKMAKSQNY FFKEFARAIT ILSENNPLTG TKGEIRKQCN LSNKLH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 148 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCA AACATATTTT TTTCTTTGCT ATTCTCTTTT TTTCAGCTGT CTCTGTTTTT GCAGAGGAGA ATCCTAGCCT TGTAATGGAC TATTACAAGG ACACTTGCCC TCAAGCTGAA  GAAATCATCA AAGAACAAGT CAAACTTCTC TACAAACGCC ACAAGAATAC TGCATTTTCT TGGCTAAGAA ACATCTTCCA TGACTGCTTT GTTGAGGTAC TTAAAAAAAA ATGATTTTTT  TAGACACCCT TTTTGAAGAA ATGATAATTG AACCTTTTGT TTTTTGCAGT CATGTGATGC TTCCTTGTTG CTGGACTCAA CAAGGAGGAT GCTGTCTGAG AAAGAGACAG ACAGGAGTTT  TGGTATGAGA AATTTCAGAT ACATTGAGAC TATTAAAGAA GCTGTAGAAA GGGAGTGCCC TGGTGTTGTT TCTTGTGCTG ATATTCTTGT TTTGTCTGGT AGAGATGGCA TTGTTGCTGT  AAGTTTTTAC TACTTACTTT CATTTTAAGT TCCAAGAAAT TTTCTTTCTT GAAATGTTTG TTTCTATGTG TACTTATAGT ACTAGATCTG GACTTAGTAG TTCATTAAGT TTCAGTTACT  CTTGTACTAA TAGTAGACTT ACTTATGTAT TTTTGACAAT TCTCAGATAT TTGGTTCAGT TAAATATACT TGTACTAATA TGTTATAATG GACTTGTACA CAGCTAGGAG GGCCACACAT  CCCACTCAAA ACTGGAAGAA GAGATGGAAG AAAAAGCAGA GCAGACATTC TTGAACAACA CCTCCCAGAT CACAATGAAA GCATGAGTGT TGTTCTTGAG AGATTTGCTA ACATTGGAAT  CAACACCCCT GGAGTTGTTG CCTTGCTAGG TACTATAAAA AATGCTCTCT CAGTTAATAG TTTGGTCTAA AAACTGTATA CTTAATGTGT GATTTGAACA GGGTCACACA GTGTGGGTCG  AACACACTGT GTGAAGTTGG TACACCGTTT ATATCCAGAA GTAGACCCTC AATTGAACCC AGAGCATGTA CCACACATGC TCAAGAAGTG TCCAGATCCA ATTCCAGACC CAAAGGCTGT  GCAGTATGTG AGAAATGACA GAGGCACACC CATGGTTCTA GACAACAACT ACTACAGGAA CATATTGGAC AACAAGGGAT TAATGTTAGT TGATCATCAA CTAGCAATGG ACAAGAGGAC  TAAGCCTTAT GTAAAGAAAA TGGCAAAAAG CCAAAATTAT TTCTTCAAGG AATTTGCAAG AGCCATCACT ATTCTTTCTG AGAATAATCC ACTTACTGGG ACAAAAGGTG AGATCAGAAA 
GCAGTGCAAT CTCTCCAACA AGCTCCACTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCA AACATATTTT TTTCTTTGCT ATTCTCTTTT TTTCAGCTGT CTCTGTTTTT GCAGAGGAGA ATCCTAGCCT TGTAATGGAC TATTACAAGG ACACTTGCCC TCAAGCTGAA  GAAATCATCA AAGAACAAGT CAAACTTCTC TACAAACGCC ACAAGAATAC TGCATTTTCT TGGCTAAGAA ACATCTTCCA TGACTGCTTT GTTGAGTCAT GTGATGCTTC CTTGTTGCTG  GACTCAACAA GGAGGATGCT GTCTGAGAAA GAGACAGACA GGAGTTTTGG TATGAGAAAT TTCAGATACA TTGAGACTAT TAAAGAAGCT GTAGAAAGGG AGTGCCCTGG TGTTGTTTCT  TGTGCTGATA TTCTTGTTTT GTCTGGTAGA GATGGCATTG TTGCTCTAGG AGGGCCACAC ATCCCACTCA AAACTGGAAG AAGAGATGGA AGAAAAAGCA GAGCAGACAT TCTTGAACAA  CACCTCCCAG ATCACAATGA AAGCATGAGT GTTGTTCTTG AGAGATTTGC TAACATTGGA ATCAACACCC CTGGAGTTGT TGCCTTGCTA GGGTCACACA GTGTGGGTCG AACACACTGT  GTGAAGTTGG TACACCGTTT ATATCCAGAA GTAGACCCTC AATTGAACCC AGAGCATGTA CCACACATGC TCAAGAAGTG TCCAGATCCA ATTCCAGACC CAAAGGCTGT GCAGTATGTG  AGAAATGACA GAGGCACACC CATGGTTCTA GACAACAACT ACTACAGGAA CATATTGGAC AACAAGGGAT TAATGTTAGT TGATCATCAA CTAGCAATGG ACAAGAGGAC TAAGCCTTAT  GTAAAGAAAA TGGCAAAAAG CCAAAATTAT TTCTTCAAGG AATTTGCAAG AGCCATCACT ATTCTTTCTG AGAATAATCC ACTTACTGGG ACAAAAGGTG AGATCAGAAA GCAGTGCAAT 
CTCTCCAACA AGCTCCACTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAAATGTA TTTTCTTTGT GGGCAGTTTA GGCACTCTCT TCCCCTATTT AAGAAGGTAC CTAAGTGATC ATCCAAAGAA CAAGCTCTAC CGACCATTTT GCAAAGAAAA ATGGCTTCCA  AACATATTTT TTTCTTTGCT ATTCTCTTTT TTTCAGCTGT CTCTGTTTTT GCAGAGGAGA ATCCTAGCCT TGTAATGGAC TATTACAAGG ACACTTGCCC TCAAGCTGAA GAAATCATCA  AAGAACAAGT CAAACTTCTC TACAAACGCC ACAAGAATAC TGCATTTTCT TGGCTAAGAA ACATCTTCCA TGACTGCTTT GTTGAGTCAT GTGATGCTTC CTTGTTGCTG GACTCAACAA  GGAGGATGCT GTCTGAGAAA GAGACAGACA GGAGTTTTGG TATGAGAAAT TTCAGATACA TTGAGACTAT TAAAGAAGCT GTAGAAAGGG AGTGCCCTGG TGTTGTTTCT TGTGCTGATA  TTCTTGTTTT GTCTGGTAGA GATGGCATTG TTGCTCTAGG AGGGCCACAC ATCCCACTCA AAACTGGAAG AAGAGATGGA AGAAAAAGCA GAGCAGACAT TCTTGAACAA CACCTCCCAG  ATCACAATGA AAGCATGAGT GTTGTTCTTG AGAGATTTGC TAACATTGGA ATCAACACCC CTGGAGTTGT TGCCTTGCTA GGGTCACACA GTGTGGGTCG AACACACTGT GTGAAGTTGG  TACACCGTTT ATATCCAGAA GTAGACCCTC AATTGAACCC AGAGCATGTA CCACACATGC TCAAGAAGTG TCCAGATCCA ATTCCAGACC CAAAGGCTGT GCAGTATGTG AGAAATGACA  GAGGCACACC CATGGTTCTA GACAACAACT ACTACAGGAA CATATTGGAC AACAAGGGAT TAATGTTAGT TGATCATCAA CTAGCAATGG ACAAGAGGAC TAAGCCTTAT GTAAAGAAAA  TGGCAAAAAG CCAAAATTAT TTCTTCAAGG AATTTGCAAG AGCCATCACT ATTCTTTCTG AGAATAATCC ACTTACTGGG ACAAAAGGTG AGATCAGAAA GCAGTGCAAT CTCTCCAACA  AGCTCCACTA ATTTGCTTAT GTGCTTGTAC TCATTATCAC TTTTCCCCCC TTCCTTTGTG TATGTATGTA TGTATGTGTG AGGGAGGTAG TGGACAGTGA AATAGGAATA AGATTGTTTT  AATTTCTTCA TGTTGTAAGT TTGTGTAGTG GACATGACCA TGTTCATTAC ATTCCATGTT CTGTTTACCC TCTTAAGTTA TGAAAGGAGG TGTTAATTTG ATATTGTTTA CTATGCAAGA 
GTGTGCTCAT TTTGATGGTT CTTTGAACAC TATATATTCG TTAT 

Retrieve as FASTA