Entry information : StPrx06(Soltu.DM.11G011740)
Entry ID 1909
Creation 2006-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-10-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx06(Soltu.DM.11G011740)
Name StPrx06(Soltu.DM.11G011740)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx009]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Leaves
Roots
Sprouting eyes
Inducer Pathogen interaction
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx06
start..stop
S start..stop
StPrx01 650 0 1..319 1..319
LePrx26 623 0 1..319 1..319
CanPrx02_hanbyul 615 0 1..319 1..322
NtPrx01-1A 601 0 4..319 5..324
Literature and cross-references StPrx06(Soltu.DM.11G011740)
Protein sequence: StPrx06(Soltu.DM.11G011740)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   319
PWM (Da):   %s   34333.32  
PI (pH):   %s   7.34
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTSSNNSFVA IFSLLLLSTM QCHAQLSSTF YDRTCPNALT TIRTSIRQAI SRERRMAASL IRLHFHDCFV QGCDASLLLD ETPTIVSEKT ALPNLGSVRG FGIIEDAKRE VEKTCPGIVS  CADILAVAAR DASTLVGGPS WTVKLGRRDS TTASHTLAET DLPGPFDPLS RLISGFANKG LSTRDMVALS GSHSIGQAQC FLFRDRIYGN GTDIDAGFAS TRRRQCPQED QNGNLAPLDL 
VTPNQLDNNY FKNLRQRKGL LQSDQVLLSG GSTDDIVLEY SNSPRAFASD FAAAMIKMGD ISPLTGQNGI IRTVCGAIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from Phytozme, 19 first AA were not predicted.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAGTT CAAACAACTC TTTTGTTGCT ATATTTTCTC TTCTTCTACT CTCTACCATG CAATGCCATG CACAACTTTC TTCCACATTC TACGACCGAA CTTGCCCTAA TGCTCTCACC  ACTATTCGTA CAAGTATAAG ACAAGCAATT TCAAGGGAAC GTCGTATGGC TGCATCCCTC ATTCGTCTTC ATTTCCATGA TTGTTTTGTT CAGGTTAGAT ATATACATTA ATCTATATGT  TTATTTATCT AAGTACTTCT ATTGGTTTGA TGACATGCAT AATATATACT AATTAGTTAT AAATAATTTG CGGCTTTAAC TTTTATAGGG TTGTGATGCT TCTCTCTTGC TTGATGAAAC  TCCAACGATT GTCAGCGAGA AGACTGCGCT GCCAAATCTT GGATCAGTTA GAGGCTTTGG TATTATAGAA GATGCAAAAA GAGAGGTTGA GAAAACATGT CCTGGAATTG TATCGTGTGC  TGACATACTT GCAGTTGCTG CTAGGGATGC ATCAACTCTC GTAAGTGAAT TTCACTTTTT CACACTACGA AAAGAAGAAA CTTTTTTATG CTCATAACTA TAGTTAGTAT TTTTTTTATT  CTAACCAATC AATGTTACGT TAATAACAAT CAGGTTGGCG GTCCATCATG GACAGTGAAA CTGGGAAGAA GAGACTCAAC CACTGCAAGT CATACTCTTG CAGAAACTGA TCTTCCCGGT  CCTTTCGATC CTCTTAGTAG GCTTATTTCT GGCTTTGCCA ACAAAGGCCT TAGCACAAGG GATATGGTTG CTTTATCAGG TAAGACTCGA TCTAATTATT GATATCGATT ATATATAGAT  TTGTACATAT TTATAACAAG TTCTAACTTT TTTAATTTTC CGATTAATTC TAGGATCACA TTCAATTGGA CAAGCACAAT GCTTCCTTTT CCGTGATAGA ATTTATGGAA ATGGAACAGA  CATCGATGCT GGATTTGCTA GCACTAGAAG ACGTCAATGT CCTCAAGAAG ATCAAAATGG AAACCTAGCT CCACTTGATT TGGTAACACC TAATCAATTG GATAACAACT ACTTCAAGAA  TTTGAGGCAA AGAAAAGGTC TTCTTCAATC AGATCAAGTT CTTTTGAGTG GAGGATCTAC CGATGATATT GTTTTAGAAT ATAGCAATAG CCCTCGGGCA TTTGCCTCTG ATTTTGCTGC 
AGCCATGATT AAAATGGGAG ATATTAGTCC TCTAACTGGT CAAAATGGGA TCATAAGAAC TGTTTGTGGA GCTATAAATT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAGTT CAAACAACTC TTTTGTTGCT ATATTTTCTC TTCTTCTACT CTCTACCATG CAATGCCATG CACAACTTTC TTCCACATTC TACGACCGAA CTTGCCCTAA TGCTCTCACC  ACTATTCGTA CAAGTATAAG ACAAGCAATT TCAAGGGAAC GTCGTATGGC TGCATCCCTC ATTCGTCTTC ATTTCCATGA TTGTTTTGTT CAGGGTTGTG ATGCTTCTCT CTTGCTTGAT  GAAACTCCAA CGATTGTCAG CGAGAAGACT GCGCTGCCAA ATCTTGGATC AGTTAGAGGC TTTGGTATTA TAGAAGATGC AAAAAGAGAG GTTGAGAAAA CATGTCCTGG AATTGTATCG  TGTGCTGACA TACTTGCAGT TGCTGCTAGG GATGCATCAA CTCTCGTTGG CGGTCCATCA TGGACAGTGA AACTGGGAAG AAGAGACTCA ACCACTGCAA GTCATACTCT TGCAGAAACT  GATCTTCCCG GTCCTTTCGA TCCTCTTAGT AGGCTTATTT CTGGCTTTGC CAACAAAGGC CTTAGCACAA GGGATATGGT TGCTTTATCA GGATCACATT CAATTGGACA AGCACAATGC  TTCCTTTTCC GTGATAGAAT TTATGGAAAT GGAACAGACA TCGATGCTGG ATTTGCTAGC ACTAGAAGAC GTCAATGTCC TCAAGAAGAT CAAAATGGAA ACCTAGCTCC ACTTGATTTG  GTAACACCTA ATCAATTGGA TAACAACTAC TTCAAGAATT TGAGGCAAAG AAAAGGTCTT CTTCAATCAG ATCAAGTTCT TTTGAGTGGA GGATCTACCG ATGATATTGT TTTAGAATAT  AGCAATAGCC CTCGGGCATT TGCCTCTGAT TTTGCTGCAG CCATGATTAA AATGGGAGAT ATTAGTCCTC TAACTGGTCA AAATGGGATC ATAAGAACTG TTTGTGGAGC TATAAATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAGTT CAAACAACTC TTTTGTTGCT ATATTTTCTC TTCTTCTACT CTCTACCATG CAATGCCATG CACAACTTTC TTCCACATTC TACGACCGAA CTTGCCCTAA TGCTCTCACC  ACTATTCGTA CAAGTATAAG ACAAGCAATT TCAAGGGAAC GTCGTATGGC TGCATCCCTC ATTCGTCTTC ATTTCCATGA TTGTTTTGTT CAGGGTTGTG ATGCTTCTCT CTTGCTTGAT  GAAACTCCAA CGATTGTCAG CGAGAAGACT GCGCTGCCAA ATCTTGGATC AGTTAGAGGC TTTGGTATTA TAGAAGATGC AAAAAGAGAG GTTGAGAAAA CATGTCCTGG AATTGTATCG  TGTGCTGACA TACTTGCAGT TGCTGCTAGG GATGCATCAA CTCTCGTTGG CGGTCCATCA TGGACAGTGA AACTGGGAAG AAGAGACTCA ACCACTGCAA GTCATACTCT TGCAGAAACT  GATCTTCCCG GTCCTTTCGA TCCTCTTAGT AGGCTTATTT CTGGCTTTGC CAACAAAGGC CTTAGCACAA GGGATATGGT TGCTTTATCA GGATCACATT CAATTGGACA AGCACAATGC  TTCCTTTTCC GTGATAGAAT TTATGGAAAT GGAACAGACA TCGATGCTGG ATTTGCTAGC ACTAGAAGAC GTCAATGTCC TCAAGAAGAT CAAAATGGAA ACCTAGCTCC ACTTGATTTG  GTAACACCTA ATCAATTGGA TAACAACTAC TTCAAGAATT TGAGGCAAAG AAAAGGTCTT CTTCAATCAG ATCAAGTTCT TTTGAGTGGA GGATCTACCG ATGATATTGT TTTAGAATAT  AGCAATAGCC CTCGGGCATT TGCCTCTGAT TTTGCTGCAG CCATGATTAA AATGGGAGAT ATTAGTCCTC TAACTGGTCA AAATGGGATC ATAAGAACTG TTTGTGGAGC TATAAATTGA 

Retrieve as FASTA