Entry information : StPrx30(Soltu.DM.01G022860)
Entry ID 1933
Creation 2006-08-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-11-04 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx30(Soltu.DM.01G022860)
Name StPrx30(Soltu.DM.01G022860)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx012]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx30
start..stop
S start..stop
LePrx92 685 0 1..391 1..377
LePrx64 567 0 88..391 25..328
StPrx76 561 0 88..391 25..328
StPrx[P]77 560 0 88..391 1..305
Literature and cross-references StPrx30(Soltu.DM.01G022860)
Protein sequence: StPrx30(Soltu.DM.01G022860)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   391
PWM (Da):   %s   43236.23  
PI (pH):   %s   5.18
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTTQFVLTCL VFMCLVLGGV AWDTRNEDYS RNEDGARNED YSRNAWGARN KDGERNAWGA RNEDGEKNED GASNAWDAIK NVWGARNSNA PRKNYYQSTH CPNVEQLIRD ITWSKVAKDA  TLGAKLLRIH YHDCFVRGCD ASILLDKVGT DDSEKEARPN LSLGGFEVID DIKREVEAKC PGIVSCADIL ALVARDAVSY PFKTLMWEVE TGRKDGFVSL ASDVNGNLPS PFSDFATLKQ  IFANKGLNVD DLVALSGAHT IGVAHCGAFS RRLFNFTGKG DMDPSLNATY AKDLKDFCPN PANPNTTVEM DPMSSTSFDS NYFNILINQN KGLFQSDAAL LNDKDSVIVI KKLQEDETFF 
SQFAKSMQKM GAIELLTGNA GEIRKNCRVK N* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 6 ESTs (3' part)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAACTC AATTTGTACT AACTTGTCTT GTTTTTATGT GTCTTGTTCT TGGTGGAGTT GCTTGGGATA CAAGGAATGA AGACTATTCA AGAAATGAAG ACGGTGCAAG GAACGAAGAC  TATTCAAGAA ATGCTTGGGG TGCAAGGAAC AAAGACGGTG AAAGGAATGC TTGGGGTGCA AGGAACGAAG ACGGTGAAAA GAATGAAGAC GGTGCAAGCA ATGCTTGGGA TGCAATTAAG  AATGTTTGGG GTGCAAGGAA CTCAAATGCA CCACGAAAGA ACTACTATCA AAGCACTCAT TGTCCAAATG TTGAACAACT TATTAGAGAT ATCACTTGGA GCAAAGTTGC AAAAGACGCT  ACCTTGGGTG CTAAGTTGCT TCGAATCCAC TACCATGATT GTTTCGTTAG GGTATGTACC AATTAGAATT ACAATACCAT GCACACATAC ATTATTTCGT AATAGAATTT AAGTTATGTA  CACTGACTAA TTAAAAAATA TATTTACTAG AGTAGTCATG ACATGATGTT GCTTTAATTT ATGTCTTGAC ATTATGAAAA TTTATAAATA GGGTTGTGAC GCATCCATAT TGCTGGACAA  AGTGGGAACA GATGATTCAG AGAAGGAGGC TAGGCCAAAT CTCTCATTGG GTGGTTTCGA GGTGATTGAT GATATCAAGC GAGAAGTTGA GGCTAAATGC CCTGGCATTG TTTCTTGCGC  AGACATTTTA GCTTTGGTTG CTCGTGATGC TGTTTCTTAT CCCGTAAGTA ATTACATCTC CATATATGTT CAAAGGATAG TCTATTCTTG AAGTTATGAG TTCAGTAGAA TTCAATAGCT  ACTTTTATTA AGAAAATCCA CTTAATAATA TATATATATA AATAATTATT GCTACTCTAA TAATTAAGTC TTTTCATGCA GTTTAAAACT TTAATGTGGG AAGTGGAGAC CGGAAGAAAA  GATGGGTTTG TTTCCCTTGC AAGTGATGTG AACGGAAACT TACCTTCACC ATTCTCAGAT TTTGCAACCC TTAAGCAAAT CTTTGCAAAC AAAGGCCTAA ATGTCGATGA TCTCGTTGCA  TTATCAGGTA AATATTATGT GTCTTACAAA GCGAGCAATA TCATGAATCA ATTTATATAA ACTGTCAGTG TATAAAAGTT AAATCAATGA GTAATATAAT AAACTTGTTC CATGCATACT  TGTAGGTGCT CACACAATTG GTGTTGCTCA TTGTGGAGCA TTCTCAAGGA GACTCTTCAA TTTCACTGGC AAAGGTGACA TGGATCCATC TCTCAATGCT ACTTATGCTA AAGATTTGAA  GGATTTTTGT CCAAATCCAG CCAATCCAAA TACTACTGTG GAAATGGACC CTATGAGCTC AACTTCATTT GATAGCAATT ATTTCAACAT TCTTATTAAT CAGAACAAAG GGTTGTTCCA  ATCTGATGCT GCCCTTCTCA ATGATAAAGA CTCAGTAATT GTCATCAAGA AATTGCAAGA AGATGAGACT TTCTTTTCCC AGTTTGCGAA ATCCATGCAG AAAATGGGAG CCATTGAACT 
TCTTACAGGA AATGCTGGAG AAATCAGGAA GAATTGTCGC GTCAAAAACT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAACTC AATTTGTACT AACTTGTCTT GTTTTTATGT GTCTTGTTCT TGGTGGAGTT GCTTGGGATA CAAGGAATGA AGACTATTCA AGAAATGAAG ACGGTGCAAG GAACGAAGAC  TATTCAAGAA ATGCTTGGGG TGCAAGGAAC AAAGACGGTG AAAGGAATGC TTGGGGTGCA AGGAACGAAG ACGGTGAAAA GAATGAAGAC GGTGCAAGCA ATGCTTGGGA TGCAATTAAG  AATGTTTGGG GTGCAAGGAA CTCAAATGCA CCACGAAAGA ACTACTATCA AAGCACTCAT TGTCCAAATG TTGAACAACT TATTAGAGAT ATCACTTGGA GCAAAGTTGC AAAAGACGCT  ACCTTGGGTG CTAAGTTGCT TCGAATCCAC TACCATGATT GTTTCGTTAG GGGTTGTGAC GCATCCATAT TGCTGGACAA AGTGGGAACA GATGATTCAG AGAAGGAGGC TAGGCCAAAT  CTCTCATTGG GTGGTTTCGA GGTGATTGAT GATATCAAGC GAGAAGTTGA GGCTAAATGC CCTGGCATTG TTTCTTGCGC AGACATTTTA GCTTTGGTTG CTCGTGATGC TGTTTCTTAT  CCCTTTAAAA CTTTAATGTG GGAAGTGGAG ACCGGAAGAA AAGATGGGTT TGTTTCCCTT GCAAGTGATG TGAACGGAAA CTTACCTTCA CCATTCTCAG ATTTTGCAAC CCTTAAGCAA  ATCTTTGCAA ACAAAGGCCT AAATGTCGAT GATCTCGTTG CATTATCAGG TGCTCACACA ATTGGTGTTG CTCATTGTGG AGCATTCTCA AGGAGACTCT TCAATTTCAC TGGCAAAGGT  GACATGGATC CATCTCTCAA TGCTACTTAT GCTAAAGATT TGAAGGATTT TTGTCCAAAT CCAGCCAATC CAAATACTAC TGTGGAAATG GACCCTATGA GCTCAACTTC ATTTGATAGC  AATTATTTCA ACATTCTTAT TAATCAGAAC AAAGGGTTGT TCCAATCTGA TGCTGCCCTT CTCAATGATA AAGACTCAGT AATTGTCATC AAGAAATTGC AAGAAGATGA GACTTTCTTT 
TCCCAGTTTG CGAAATCCAT GCAGAAAATG GGAGCCATTG AACTTCTTAC AGGAAATGCT GGAGAAATCA GGAAGAATTG TCGCGTCAAA AACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTGTGCCTT AAGCAATTTG CTTTTTTCAT CATCTTCATT GTTATTCTTA GGCTTAAGTC CTTCACATTC CTAGCTAAGA AAAGAAAATG ACAACTCAAT TTGTACTAAC TTGTCTTGTT  TTTATGTGTC TTGTTCTTGG TGGAGTTGCT TGGGATACAA GGAATGAAGA CTATTCAAGA AATGAAGACG GTGCAAGGAA CGAAGACTAT TCAAGAAATG CTTGGGGTGC AAGGAACAAA  GACGGTGAAA GGAATGCTTG GGGTGCAAGG AACGAAGACG GTGAAAAGAA TGAAGACGGT GCAAGCAATG CTTGGGATGC AATTAAGAAT GTTTGGGGTG CAAGGAACTC AAATGCACCA  CGAAAGAACT ACTATCAAAG CACTCATTGT CCAAATGTTG AACAACTTAT TAGAGATATC ACTTGGAGCA AAGTTGCAAA AGACGCTACC TTGGGTGCTA AGTTGCTTCG AATCCACTAC  CATGATTGTT TCGTTAGGGG TTGTGACGCA TCCATATTGC TGGACAAAGT GGGAACAGAT GATTCAGAGA AGGAGGCTAG GCCAAATCTC TCATTGGGTG GTTTCGAGGT GATTGATGAT  ATCAAGCGAG AAGTTGAGGC TAAATGCCCT GGCATTGTTT CTTGCGCAGA CATTTTAGCT TTGGTTGCTC GTGATGCTGT TTCTTATCCC TTTAAAACTT TAATGTGGGA AGTGGAGACC  GGAAGAAAAG ATGGGTTTGT TTCCCTTGCA AGTGATGTGA ACGGAAACTT ACCTTCACCA TTCTCAGATT TTGCAACCCT TAAGCAAATC TTTGCAAACA AAGGCCTAAA TGTCGATGAT  CTCGTTGCAT TATCAGGTGC TCACACAATT GGTGTTGCTC ATTGTGGAGC ATTCTCAAGG AGACTCTTCA ATTTCACTGG CAAAGGTGAC ATGGATCCAT CTCTCAATGC TACTTATGCT  AAAGATTTGA AGGATTTTTG TCCAAATCCA GCCAATCCAA ATACTACTGT GGAAATGGAC CCTATGAGCT CAACTTCATT TGATAGCAAT TATTTCAACA TTCTTATTAA TCAGAACAAA  GGGTTGTTCC AATCTGATGC TGCCCTTCTC AATGATAAAG ACTCAGTAAT TGTCATCAAG AAATTGCAAG AAGATGAGAC TTTCTTTTCC CAGTTTGCGA AATCCATGCA GAAAATGGGA  GCCATTGAAC TTCTTACAGG AAATGCTGGA GAAATCAGGA AGAATTGTCG CGTCAAAAAC TAATTCAACC TATTATTATT ATTATTATAT CATATGTATA TGTTGTCGCA AAAGTGTACA  ACATGAGTCT CTTTTATTTA TTCATTTTGT TCTTTAATCT CCCGTAATTT TGTGTGGTGA TTCCAAATTA ACTAACTTTA TGTAAGTTAA TTTATATGGT TATTGTTTGA AAAAGAAAAT 
TGTGGCAATT AATGTTTAAC TATTTGATGT AGTGTATTGT TTAA 

Retrieve as FASTA