Entry information : StPrx31(Soltu.DM.11G006140)
Entry ID 1934
Creation 2006-08-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-11-04 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx31(Soltu.DM.11G006140)
Name StPrx31(Soltu.DM.11G006140)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx099]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx31
start..stop
S start..stop
LePrx111 642 0 1..335 1..332
LePrx86 636 0 1..335 1..332
NtPrx57-1B 582 0 1..335 1..336
NtPrx57-1A 577 0 1..333 1..334
Literature and cross-references StPrx31(Soltu.DM.11G006140)
Protein sequence: StPrx31(Soltu.DM.11G006140)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   335 (263)
PWM (Da):   %s   36537.53 (28465.3) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.31 (7.43) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-287
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDSKGINLSA LALFVCLILS FSSSILAYRT PYWPSIKVGY YRYTCPYAEH IVQNVVNRAV SLNPGIAAGL IRLHFHDCFV RGCDASVLLD GPNSEKEGIP NKNSLRGFEV IDAAKAALEA  ACPGVVSCAD IVAFAARDSS YKVGRIYYDV QAGRRDGRVS IDSETLTNLP SPFVNATELI KNFARKGMSV DEMVTLSGAH SIGIAHCGVF ASRLYPQNNQ QNLPIDPEYA DFLKSICPPE 
ALTNGTGAAN PANLDALTPN RLDNRYYLAL KSQKGLMISD QALLANPTTA KLVNYNARFG SIWSRKFESA MIHMGTLDVL TGRNGEIRRN CHFVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and .5 ESTs. Belong to a cluster of 5 duplicated genes (Soltu.DM.11G006140 to Soltu.DM.11G006180).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATTCCA AAGGCATCAA TCTTTCAGCT CTTGCACTTT TTGTTTGCCT CATTTTATCA TTTTCATCCT CCATTCTTGC CTATCGAACC CCATATTGGC CATCGATTAA AGTAGGTTAC  TATAGATATA CTTGCCCCTA TGCCGAACAC ATTGTTCAAA ATGTTGTAAA CAGAGCTGTC TCTCTTAATC CAGGCATTGC TGCTGGCCTT ATCAGATTAC ATTTCCACGA TTGCTTTGTC  AGGGTACGTA CTAATAATTT AATGCTAATA TTTTTATTTT GTTAAAATGA TTATTAGATT ATCTTATAAC GGTTAACGTG TCCTGTACTT TAATTAGGGG TGTGATGCAT CTGTGTTATT  GGATGGACCG AACTCCGAGA AGGAAGGTAT TCCCAACAAG AACAGTTTAA GAGGCTTTGA GGTAATTGAT GCTGCAAAAG CTGCACTTGA AGCTGCATGC CCTGGAGTCG TTTCGTGCGC  AGATATAGTT GCATTTGCTG CTCGGGACAG TTCTTACAAA GTTGGGAGAA TATACTATGA TGTCCAAGCT GGACGTCGTG ATGGTCGTGT TTCTATTGAC TCTGAAACAT TGACTAATCT  TCCTTCTCCT TTCGTCAATG CCACGGAACT CATCAAGAAT TTTGCAAGGA AAGGTATGTC GGTTGATGAA ATGGTGACTC TCTCTGGCGC GCATTCCATT GGTATTGCAC ATTGCGGTGT  TTTTGCTAGC CGTTTGTACC CTCAAAACAA TCAACAAAAT CTTCCAATTG ATCCTGAATA CGCGGACTTC TTGAAGTCCA TTTGTCCACC AGAAGCACTT ACAAATGGGA CGGGAGCTGC  TAATCCCGCG AACCTTGATG CCCTGACACC AAACAGATTG GATAACAGAT ATTACTTGGC TTTAAAGAGT CAAAAGGGAC TTATGATTTC TGATCAGGCA TTGTTGGCAA ACCCGACAAC  AGCTAAATTG GTGAACTATA ATGCTAGATT TGGTTCAATT TGGTCAAGGA AGTTTGAATC TGCAATGATT CACATGGGAA CTTTGGATGT CCTCACAGGT CGAAACGGGG AGATCAGAAG 
GAACTGTCAT TTCGTGAACT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATTCCA AAGGCATCAA TCTTTCAGCT CTTGCACTTT TTGTTTGCCT CATTTTATCA TTTTCATCCT CCATTCTTGC CTATCGAACC CCATATTGGC CATCGATTAA AGTAGGTTAC  TATAGATATA CTTGCCCCTA TGCCGAACAC ATTGTTCAAA ATGTTGTAAA CAGAGCTGTC TCTCTTAATC CAGGCATTGC TGCTGGCCTT ATCAGATTAC ATTTCCACGA TTGCTTTGTC  AGGGGGTGTG ATGCATCTGT GTTATTGGAT GGACCGAACT CCGAGAAGGA AGGTATTCCC AACAAGAACA GTTTAAGAGG CTTTGAGGTA ATTGATGCTG CAAAAGCTGC ACTTGAAGCT  GCATGCCCTG GAGTCGTTTC GTGCGCAGAT ATAGTTGCAT TTGCTGCTCG GGACAGTTCT TACAAAGTTG GGAGAATATA CTATGATGTC CAAGCTGGAC GTCGTGATGG TCGTGTTTCT  ATTGACTCTG AAACATTGAC TAATCTTCCT TCTCCTTTCG TCAATGCCAC GGAACTCATC AAGAATTTTG CAAGGAAAGG TATGTCGGTT GATGAAATGG TGACTCTCTC TGGCGCGCAT  TCCATTGGTA TTGCACATTG CGGTGTTTTT GCTAGCCGTT TGTACCCTCA AAACAATCAA CAAAATCTTC CAATTGATCC TGAATACGCG GACTTCTTGA AGTCCATTTG TCCACCAGAA  GCACTTACAA ATGGGACGGG AGCTGCTAAT CCCGCGAACC TTGATGCCCT GACACCAAAC AGATTGGATA ACAGATATTA CTTGGCTTTA AAGAGTCAAA AGGGACTTAT GATTTCTGAT  CAGGCATTGT TGGCAAACCC GACAACAGCT AAATTGGTGA ACTATAATGC TAGATTTGGT TCAATTTGGT CAAGGAAGTT TGAATCTGCA ATGATTCACA TGGGAACTTT GGATGTCCTC 
ACAGGTCGAA ACGGGGAGAT CAGAAGGAAC TGTCATTTCG TGAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACTTGAGGA AAAGCATAGT GTCTTTTGAG TCTCAAAAAA TTAAAAATGG ATTCCAAAGG CATCAATCTT TCAGCTCTTG CACTTTTTGT TTGCCTCATT TTATCATTTT CATCCTCCAT  TCTTGCCTAT CGAACCCCAT ATTGGCCATC GATTAAAGTA GGTTACTATA GATATACTTG CCCCTATGCC GAACACATTG TTCAAAATGT TGTAAACAGA GCTGTCTCTC TTAATCCAGG  CATTGCTGCT GGCCTTATCA GATTACATTT CCACGATTGC TTTGTCAGGG GGTGTGATGC ATCTGTGTTA TTGGATGGAC CGAACTCCGA GAAGGAAGGT ATTCCCAACA AGAACAGTTT  AAGAGGCTTT GAGGTAATTG ATGCTGCAAA AGCTGCACTT GAAGCTGCAT GCCCTGGAGT CGTTTCGTGC GCAGATATAG TTGCATTTGC TGCTCGGGAC AGTTCTTACA AAGTTGGGAG  AATATACTAT GATGTCCAAG CTGGACGTCG TGATGGTCGT GTTTCTATTG ACTCTGAAAC ATTGACTAAT CTTCCTTCTC CTTTCGTCAA TGCCACGGAA CTCATCAAGA ATTTTGCAAG  GAAAGGTATG TCGGTTGATG AAATGGTGAC TCTCTCTGGC GCGCATTCCA TTGGTATTGC ACATTGCGGT GTTTTTGCTA GCCGTTTGTA CCCTCAAAAC AATCAACAAA ATCTTCCAAT  TGATCCTGAA TACGCGGACT TCTTGAAGTC CATTTGTCCA CCAGAAGCAC TTACAAATGG GACGGGAGCT GCTAATCCCG CGAACCTTGA TGCCCTGACA CCAAACAGAT TGGATAACAG  ATATTACTTG GCTTTAAAGA GTCAAAAGGG ACTTATGATT TCTGATCAGG CATTGTTGGC AAACCCGACA ACAGCTAAAT TGGTGAACTA TAATGCTAGA TTTGGTTCAA TTTGGTCAAG  GAAGTTTGAA TCTGCAATGA TTCACATGGG AACTTTGGAT GTCCTCACAG GTCGAAACGG GGAGATCAGA AGGAACTGTC ATTTCGTGAA CTAACATCTC TATCATTACC TCATTATTTC  AATTTCTCCA TCCTATTCAA GGTGCAAGGA TGGTTCAATG CGTGTCCAAT TGTTATTAAT TTTTTCTTTT CATTGTTTGT TCAATTTAAT TGTATTTCAT TTTCCCCCAA TGTTTGTCCA  ATTGATTGGA ATTTTTTTCC TTATGTTTGT ATAAGTGATT TACTTGATGG CCTCTTTTTC TTCTATTATC GAATCTGATA TGGAGCCGCA TGTGTAACAA TTGATATTCT ATTGTTATTA  AAATGACACC AGATGACAAA TGGTGGACGA CTAAACTCAT CATTCAGACT CCGCCTATTA TTATTTACTG GAACCTCTGA AAGAATATAT GTAATGTCAA GTATGGGAAC AAGAGATCTT  CTATGGCCAA AATTACTACT TAGTTCTCAC ATTGGAAGTA ATCAAGCAAA AAGGGTCTTT TGTCTCTCTC AAGAAGACCA CAAGCTTTCA AGAACTGCAA GGGACCTGAT AGAGTTATCA  AGTGCGTCTT TACTTGTTGA TTGTGAGTTT GTGTCTTGCG TGTTTCATCT TGTTTGTGAT TGAAGTCTAT ATTAACTAGA CTTAGTTGAT ATAGTACGTA ATAGAGCTAT TGCTTTGGCT  CAATCCTGTA ATAGAGTTGT TACAGGTTGT AGGATTAGGA GTTTAATCCT TATGTGATTA TTGGAATTTG TTATCATTTG TTGCTTAAAG ATAGTGAAGA ACAGTTAGAA ATCTTGTGGA 

Retrieve as FASTA