Entry information : StPrx49(Soltu.DM.05G018820)
Entry ID 1961
Creation 2006-08-16 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-10-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx49(Soltu.DM.05G018820)
Name StPrx49(Soltu.DM.05G018820)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx010]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Leaves
Petioles
Roots
Sprouting eyes
Stolons
Tubers
Inducer Pathogen interaction
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx49
start..stop
S start..stop
StPrx29 664 0 1..327 1..327
LePrx100 642 0 1..327 1..327
LePrx33 640 0 1..327 1..327
LePrx12 621 0 1..327 1..327
Literature and cross-references StPrx49(Soltu.DM.05G018820)
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Stu.7112
Protein sequence: StPrx49(Soltu.DM.05G018820)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (306)
PWM (Da):   %s   35713.96 (33399.8)  
PI (pH):   %s   7.67 (7.75) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-327
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATFGYLCPL ILMCILVSSN AQLQQNFYAK SCPKAEKIIL DYVHKHIPNA PSLAAALIRM HFHDCFVRGC DASVLLNFTS STGNQTEKFG IPNLTLRGFS FIDNVKKIIE DECPGVVSCA  DIVALVARDS VVVTGGPSWS VPTGRRDGRI SNASETLTDI PAPTSNFSTL QNDFAKKGLD LKDLVLLSGA HTIGVSHCSS FSTRLYNFTG TFGTQDPSLD SEYATNLKAN KCKSINDNTT 
IVEMDPGSFR TFDLSYYKLL LKRRGLFQSD AALTTSTTTK SYIDQLVAGS LKEFYAEFAQ SMEKMGRIEV KTGSDGEIRK HCAVVNS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 22 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACAT TTGGGTATTT GTGTCCTCTA ATATTGATGT GTATCTTAGT GTCTAGCAAT GCTCAATTAC AACAAAACTT CTATGCCAAG AGTTGTCCAA AAGCAGAGAA GATCATTTTA  GACTATGTCC ATAAACACAT TCCAAATGCT CCATCTCTTG CTGCTGCCTT AATCAGAATG CATTTCCATG ATTGCTTTGT CAGGGTACGT AATTATTAAT TACTTTTGTC GTTTCAATTT  ATATGTCTTA CTTTTTCAGG ATGAGAATCA ATTAGTTGTT TTTTTGGTGA TTGTAGGGAT GTGATGCATC TGTGTTGTTG AATTTCACTT CAAGTACAGG AAACCAAACT GAAAAATTTG  GTATCCCAAA TCTAACACTT AGAGGTTTCT CATTCATTGA CAATGTGAAG AAAATAATTG AAGATGAATG CCCTGGAGTT GTCTCTTGTG CTGATATTGT TGCCTTAGTT GCTAGAGACT  CTGTTGTGGT CACAGTAAGC CAATTCAACT TGAACTTTAC AATTTATTTT ATTTGTTATG TATGACCATT ATAATTTATA TATTTTTGGG CATGATATAT AGGGAGGTCC TTCATGGAGT  GTACCAACAG GAAGAAGAGA TGGAAGAATC TCTAATGCTT CAGAAACCTT AACAGACATT CCAGCACCAA CTAGTAACTT TTCCACTCTC CAGAATGATT TTGCTAAGAA GGGTCTTGAC  CTCAAAGACT TGGTCTTGTT ATCTGGTTAG TCAAAGTTTT ACTTTTTCTT CTGTTTCAGT TTATGTGACA AATTTAATCG AGTACGAAAT TTAGGAAATG AAAAGACTAC TTGCAAGTTG  ATAAAAGAAT TCCAAATATT AGAATTTAAA AAAAAAGTTC ACTTATATTT TGGTCCTACC TTGCCACATA GGTATTGAAT ATAATGTTAA GGACCAATCA TACTTACAAG TCAAAAATTG  TGACTATAAT CCTATATGCA CCACTCTATG GGTCTTAACA ATAATTACCA TGGACAAAAT GTTTCAGGTG CTCACACTAT TGGAGTCTCT CATTGCTCGT CATTCTCAAC TCGTCTATAT  AATTTTACTG GAACTTTTGG TACTCAAGAT CCATCTCTAG ACAGTGAATA CGCAACTAAC CTTAAGGCTA ATAAATGCAA ATCAATTAAT GATAACACAA CGATAGTGGA AATGGACCCA  GGGAGTTTCA GGACATTTGA TCTTAGCTAT TACAAGCTTT TACTCAAAAG GAGAGGACTC TTCCAGTCCG ATGCAGCCCT AACAACAAGT ACAACAACGA AGTCATACAT CGACCAACTT  GTCGCGGGAT CACTTAAAGA GTTTTATGCT GAATTTGCTC AATCAATGGA GAAAATGGGA AGGATTGAAG TTAAAACAGG TTCTGATGGT GAAATTAGAA AGCATTGTGC GGTTGTGAAT 
AGTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTACAT TTGGGTATTT GTGTCCTCTA ATATTGATGT GTATCTTAGT GTCTAGCAAT GCTCAATTAC AACAAAACTT CTATGCCAAG AGTTGTCCAA AAGCAGAGAA GATCATTTTA  GACTATGTCC ATAAACACAT TCCAAATGCT CCATCTCTTG CTGCTGCCTT AATCAGAATG CATTTCCATG ATTGCTTTGT CAGGGGATGT GATGCATCTG TGTTGTTGAA TTTCACTTCA  AGTACAGGAA ACCAAACTGA AAAATTTGGT ATCCCAAATC TAACACTTAG AGGTTTCTCA TTCATTGACA ATGTGAAGAA AATAATTGAA GATGAATGCC CTGGAGTTGT CTCTTGTGCT  GATATTGTTG CCTTAGTTGC TAGAGACTCT GTTGTGGTCA CAGGAGGTCC TTCATGGAGT GTACCAACAG GAAGAAGAGA TGGAAGAATC TCTAATGCTT CAGAAACCTT AACAGACATT  CCAGCACCAA CTAGTAACTT TTCCACTCTC CAGAATGATT TTGCTAAGAA GGGTCTTGAC CTCAAAGACT TGGTCTTGTT ATCTGGTGCT CACACTATTG GAGTCTCTCA TTGCTCGTCA  TTCTCAACTC GTCTATATAA TTTTACTGGA ACTTTTGGTA CTCAAGATCC ATCTCTAGAC AGTGAATACG CAACTAACCT TAAGGCTAAT AAATGCAAAT CAATTAATGA TAACACAACG  ATAGTGGAAA TGGACCCAGG GAGTTTCAGG ACATTTGATC TTAGCTATTA CAAGCTTTTA CTCAAAAGGA GAGGACTCTT CCAGTCCGAT GCAGCCCTAA CAACAAGTAC AACAACGAAG  TCATACATCG ACCAACTTGT CGCGGGATCA CTTAAAGAGT TTTATGCTGA ATTTGCTCAA TCAATGGAGA AAATGGGAAG GATTGAAGTT AAAACAGGTT CTGATGGTGA AATTAGAAAG 
CATTGTGCGG TTGTGAATAG TTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAACACAAA CACAACATAG AATTTTTTTT TAGTTTCTAT CTATTTTGAA GATAAGAAAC AAAATGGCTA CATTTGGGTA TTTGTGTCCT CTAATATTGA TGTGTATCTT AGTGTCTAGC  AATGCTCAAT TACAACAAAA CTTCTATGCC AAGAGTTGTC CAAAAGCAGA GAAGATCATT TTAGACTATG TCCATAAACA CATTCCAAAT GCTCCATCTC TTGCTGCTGC CTTAATCAGA  ATGCATTTCC ATGATTGCTT TGTCAGGGGA TGTGATGCAT CTGTGTTGTT GAATTTCACT TCAAGTACAG GAAACCAAAC TGAAAAATTT GGTATCCCAA ATCTAACACT TAGAGGTTTC  TCATTCATTG ACAATGTGAA GAAAATAATT GAAGATGAAT GCCCTGGAGT TGTCTCTTGT GCTGATATTG TTGCCTTAGT TGCTAGAGAC TCTGTTGTGG TCACAGGAGG TCCTTCATGG  AGTGTACCAA CAGGAAGAAG AGATGGAAGA ATCTCTAATG CTTCAGAAAC CTTAACAGAC ATTCCAGCAC CAACTAGTAA CTTTTCCACT CTCCAGAATG ATTTTGCTAA GAAGGGTCTT  GACCTCAAAG ACTTGGTCTT GTTATCTGGT GCTCACACTA TTGGAGTCTC TCATTGCTCG TCATTCTCAA CTCGTCTATA TAATTTTACT GGAACTTTTG GTACTCAAGA TCCATCTCTA  GACAGTGAAT ACGCAACTAA CCTTAAGGCT AATAAATGCA AATCAATTAA TGATAACACA ACGATAGTGG AAATGGACCC AGGGAGTTTC AGGACATTTG ATCTTAGCTA TTACAAGCTT  TTACTCAAAA GGAGAGGACT CTTCCAGTCC GATGCAGCCC TAACAACAAG TACAACAACG AAGTCATACA TCGACCAACT TGTCGCGGGA TCACTTAAAG AGTTTTATGC TGAATTTGCT  CAATCAATGG AGAAAATGGG AAGGATTGAA GTTAAAACAG GTTCTGATGG TGAAATTAGA AAGCATTGTG CGGTTGTGAA TAGTTAAGAG GAGTCTTTGG TTCTTTCGGT TTGGGGCCAT  ATGTAACATT AATGATACAT ATTGTTCCTT TTGCATTTTT TTCTTCATCA TGTTCCTTTT GTTATCATTC CGATTTTTGT TCTACTGCGT GACTTGATGA TTGTTTAAAT AAATGTTGAA 
TGTATATGCA ATTCCTTCTT CTTCTTATCA AGGCATAAAA GGCTCTTCTT CTTTTTAAAA ACAAAA 

Retrieve as FASTA