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Entry information : StPrx54(Soltu.DM.07G017930)
Entry ID 1966
Creation 2006-08-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-25 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-10-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx54(Soltu.DM.07G017930)
Name StPrx54(Soltu.DM.07G017930)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx007]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx54
start..stop		 S start..stop
LePrx01 659 0 1..328 1..328
NtPrx20-1B 604 0 1..328 1..329
NtPrx20-1A 603 0 1..328 1..329
NtPrx48-1B 538 0 1..328 1..331
Literature and cross-references StPrx54(Soltu.DM.07G017930)
Literature Flinn,B., Rothwell,C., Sardana,R., Griffiths,R., Lague,M., De Koeyer,D., Audy,P., Goyer,C., Li,X.-Q., Wang-Pruski,G. and Regan,S. Generation of ESTs from in vitro root tissues of potato. Unpublished (2004).
EST ref. GenBank:   CK864144.1 [3' end]
Protein sequence: StPrx54(Soltu.DM.07G017930)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (306)
PWM (Da):   %s   35998.22 (33538.0) Transmb domain:   %s   i13-35o
PI (pH):   %s   7.66 (7.70) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-328
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFSYLMSV LVLCVIIGYA NAQLELNFYA KSCPKAEKII KDFVEQQVPK APNTAAAILR MHFHDCFVRG CDGSVLLNFT STNGNQTEKL ANPNLTVRGF SFIDAVKRLV EAECPEVVSC  ADIVALVARD AVVATGGPFW NVPTGRRDGT ISNVSEANAD IPAPTSNFTR LQQSFAKKGL DLNDLVLLSG AHTIGVSRCS SFTERLYNFT GVLGTQDPSL DSEYADNLKS RKCRSINDNT 
TIVEMDPGSF KTFDLSYFKL LLKRRGLFQS DAALTTRTST KSFIEQLVDG PLKEFFDEFG KSMEKMGRVE VKTGSAGEIR KHCAFVNN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence genomic and 22 ESTs (20 exons 1-3 and 2 last exon).
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TTAGCTATTT GATGAGTGTT TTGGTATTAT GTGTAATCAT AGGTTATGCA AATGCTCAAT TGGAGCTTAA TTTCTATGCT AAAAGCTGTC CAAAAGCTGA GAAAATTATT  AAAGATTTTG TTGAGCAACA AGTTCCTAAG GCTCCAAATA CTGCAGCAGC CATACTCAGA ATGCATTTCC ATGATTGCTT TGTCAGGGTA ATGTATTATT ACTTTCTCGT TTCAGACTAC  AAAATTCAGA AATCATTTTT ATTTTCTTGA ATTTCTTGTC CAGTCAAACT AAAACAGGTA AAATGAGATC CGGGAGTGTG ATTTTTGCAT ACAGAGTTTT TTTATGTTCT GATTCTTTGT  ATTTGATTTG ATCTTTGCAG GGTTGTGATG GATCTGTACT TCTTAATTTC ACTTCGACTA ACGGAAATCA GACGGAAAAA CTAGCTAATC CTAATCTGAC AGTAAGAGGT TTCTCATTCA  TTGATGCTGT GAAGAGATTA GTTGAAGCTG AATGCCCCGA AGTTGTTTCT TGTGCTGATA TTGTCGCGTT GGTTGCTAGA GACGCAGTTG TGGCTACAGT AAGTGAAAAT TTCTGATAAA  GCAAATTTAC GAAGTTTTTG AATAACCATG TTTAAGGGTT TAGTAGATCT GAATAAAATA CGTCAAGTTT AGAGGTGTTC TGCTTTTATG TATCTAATTA TCTTCGTGTT TCGGGTGATA  GGGAGGTCCT TTTTGGAATG TACCAACTGG TAGAAGAGAT GGAACGATAT CAAATGTCTC AGAAGCCAAT GCTGATATCC CAGCTCCAAC TAGTAACTTC ACTAGACTAC AACAATCTTT  CGCGAAGAAA GGTCTTGATC TGAATGATCT GGTCCTTCTA TCAGGTACGA GTTTAAGTTT AAGTTGTACG TACCGACAAT TTATACTATG TTAAAGTTAC TAAATATAAT ACTATTTTCT  TATAGGTGCC CATACTATTG GAGTGTCTCG TTGCTCATCA TTTACAGAGC GTCTATACAA TTTCACCGGG GTTCTAGGTA CACAAGATCC ATCTCTAGAC AGTGAATACG CGGATAATCT  CAAGTCAAGA AAATGCAGAT CAATCAACGA TAATACTACT ATAGTCGAGA TGGATCCAGG TAGTTTCAAG ACATTCGATC TTAGCTACTT CAAACTTTTG CTCAAAAGGA GAGGTCTATT  CCAATCAGAT GCAGCATTGA CAACACGTAC CTCAACGAAA TCATTTATCG AGCAGCTTGT CGATGGACCA CTCAAAGAAT TTTTCGATGA ATTTGGTAAA TCGATGGAGA AAATGGGAAG 
AGTTGAAGTT AAGACAGGGA GTGCTGGTGA AATCAGGAAG CATTGTGCAT TTGTGAATAA TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAT TTAGCTATTT GATGAGTGTT TTGGTATTAT GTGTAATCAT AGGTTATGCA AATGCTCAAT TGGAGCTTAA TTTCTATGCT AAAAGCTGTC CAAAAGCTGA GAAAATTATT  AAAGATTTTG TTGAGCAACA AGTTCCTAAG GCTCCAAATA CTGCAGCAGC CATACTCAGA ATGCATTTCC ATGATTGCTT TGTCAGGGGT TGTGATGGAT CTGTACTTCT TAATTTCACT  TCGACTAACG GAAATCAGAC GGAAAAACTA GCTAATCCTA ATCTGACAGT AAGAGGTTTC TCATTCATTG ATGCTGTGAA GAGATTAGTT GAAGCTGAAT GCCCCGAAGT TGTTTCTTGT  GCTGATATTG TCGCGTTGGT TGCTAGAGAC GCAGTTGTGG CTACAGGAGG TCCTTTTTGG AATGTACCAA CTGGTAGAAG AGATGGAACG ATATCAAATG TCTCAGAAGC CAATGCTGAT  ATCCCAGCTC CAACTAGTAA CTTCACTAGA CTACAACAAT CTTTCGCGAA GAAAGGTCTT GATCTGAATG ATCTGGTCCT TCTATCAGGT GCCCATACTA TTGGAGTGTC TCGTTGCTCA  TCATTTACAG AGCGTCTATA CAATTTCACC GGGGTTCTAG GTACACAAGA TCCATCTCTA GACAGTGAAT ACGCGGATAA TCTCAAGTCA AGAAAATGCA GATCAATCAA CGATAATACT  ACTATAGTCG AGATGGATCC AGGTAGTTTC AAGACATTCG ATCTTAGCTA CTTCAAACTT TTGCTCAAAA GGAGAGGTCT ATTCCAATCA GATGCAGCAT TGACAACACG TACCTCAACG  AAATCATTTA TCGAGCAGCT TGTCGATGGA CCACTCAAAG AATTTTTCGA TGAATTTGGT AAATCGATGG AGAAAATGGG AAGAGTTGAA GTTAAGACAG GGAGTGCTGG TGAAATCAGG 
AAGCATTGTG CATTTGTGAA TAATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCCCCTATA AATTCACTAT TATGCTAATA GAGTTGATAT GTGTGTAGTA CAAAAACATA TCAAAGAAAA ACAAAAGTTT CTTTGAGACA AAGCAAATAA CAAATGGCTT CATTTAGCTA  TTTGATGAGT GTTTTGGTAT TATGTGTAAT CATAGGTTAT GCAAATGCTC AATTGGAGCT TAATTTCTAT GCTAAAAGCT GTCCAAAAGC TGAGAAAATT ATTAAAGATT TTGTTGAGCA  ACAAGTTCCT AAGGCTCCAA ATACTGCAGC AGCCATACTC AGAATGCATT TCCATGATTG CTTTGTCAGG GGTTGTGATG GATCTGTACT TCTTAATTTC ACTTCGACTA ACGGAAATCA  GACGGAAAAA CTAGCTAATC CTAATCTGAC AGTAAGAGGT TTCTCATTCA TTGATGCTGT GAAGAGATTA GTTGAAGCTG AATGCCCCGA AGTTGTTTCT TGTGCTGATA TTGTCGCGTT  GGTTGCTAGA GACGCAGTTG TGGCTACAGG AGGTCCTTTT TGGAATGTAC CAACTGGTAG AAGAGATGGA ACGATATCAA ATGTCTCAGA AGCCAATGCT GATATCCCAG CTCCAACTAG  TAACTTCACT AGACTACAAC AATCTTTCGC GAAGAAAGGT CTTGATCTGA ATGATCTGGT CCTTCTATCA GGTGCCCATA CTATTGGAGT GTCTCGTTGC TCATCATTTA CAGAGCGTCT  ATACAATTTC ACCGGGGTTC TAGGTACACA AGATCCATCT CTAGACAGTG AATACGCGGA TAATCTCAAG TCAAGAAAAT GCAGATCAAT CAACGATAAT ACTACTATAG TCGAGATGGA  TCCAGGTAGT TTCAAGACAT TCGATCTTAG CTACTTCAAA CTTTTGCTCA AAAGGAGAGG TCTATTCCAA TCAGATGCAG CATTGACAAC ACGTACCTCA ACGAAATCAT TTATCGAGCA  GCTTGTCGAT GGACCACTCA AAGAATTTTT CGATGAATTT GGTAAATCGA TGGAGAAAAT GGGAAGAGTT GAAGTTAAGA CAGGGAGTGC TGGTGAAATC AGGAAGCATT GTGCATTTGT  GAATAATTGA AATTTAAGTT CTAATTAATG ATTTTGTGTT TTGTATTTAC TATAATTTAT GTGTACTGTT GAGTGAATTG TTTGGTGTAA TATGTATCAT GTGCTTTTAT ATTTATTTCA 
ATTGTAATTT TGCTGTTTGC TGGTGTTTTA GCAATAAAAG TAATGTGATC AAGAGCATTT CCATAAATTG AAAAAAAAAA GGAATCTTTT CCTA 

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