Entry information : PtaPrx03(PTA00009692)
Entry ID 2036
Creation 2007-09-04 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-09-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx03(PTA00009692)
Name PtaPrx03(PTA00009692)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx018]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Roots
Xylem
Inducer Drought
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx03
start..stop
S start..stop
PabPrx42 618 0 1..334 1..335
PgPrx04 615 0 1..334 1..335
GbPrx39 530 0 8..335 36..366
CmichPrx05 505 0 23..335 27..340
Literature and cross-references PtaPrx03(PTA00009692)
Literature Pratt,L. et al., An EST database from loblolly pine (Pinus taeda) roots recovering from drought stress
, unpublished.
EST ref. GenBank:   CO365925 [5' end]   CO366003.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.7318
Protein sequence: PtaPrx03(PTA00009692)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336
PWM (Da):   %s   35813.27  
PI (pH):   %s   7.93
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMIGIGKGST ALGFMVVVAT LCELVPVNTQ GTVVGFYKQT CPNAERLVQL RVQKKFSTDK TIVPALLRMH FHDCFVRGCD ASLLVDSTAA NQAEKEAGPN QTVRGFEFID EVKKVLEAVC  ANTVSCADII ALATRDAVAL AGGPRYDVPT GRRDGTVSKV DDANKLPDPN DSAIQSSSAF ASKGLSVLDL VTLLGAHTVG ITHCSFFNDR LYNFLGTGKP DPTMDPALVT KLKITCPDPA 
SGSSADPPIN LDQGTPSVFD NSFFKQIAAR RGILQIDQQL FEDASTTNFV RSFAGSSPKP LNFSQQFVQS IVKMGNLGVL TGNQGTIRKN CRVVNP 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from 25 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGATTG GCATTGGGAA AGGTAGTACA GCTCTGGGTT TCATGGTGGT AGTGGCAACA TTATGTGAGC TGGTGCCAGT CAATACGCAA GGTACTGTGG TGGGGTTTTA CAAACAGACT  TGCCCAAACG CAGAGAGACT TGTGCAGCTG AGGGTACAGA AAAAGTTCAG CACTGATAAG ACCATTGTGC CTGCACTTCT TCGAATGCAT TTTCACGATT GCTTTGTCAG AGTAAGAAAA  AAATAGATTT AGCAGATGTT GTTCCTTCTT ACCTGCAAAA ACAATTTGCT TAATAATGTA TTCAGCAATG GGCTTTCTGT TCATGTTTTT GTGCTGAGTT TCTGAATTTG TGATTCAGGG  GTGTGATGCA TCCCTGCTTG TAGATTCTAC TGCTGCAAAT CAAGCAGAGA AGGAGGCAGG GCCCAATCAG ACTGTGAGAG GATTTGAATT CATTGATGAG GTCAAGAAGG TCCTGGAAGC  TGTATGTGCC AACACAGTAT CCTGTGCTGA CATTATTGCA CTGGCTACAA GAGATGCCGT GGCCCTGGTA ATTACGTTCA GGCTCAGGGT CGAATCTCGT TAAGAACCTT CACAAATATA  TCTGATTAAC AATCAGGTTT TTTGGGTTGG GTCAAAGTAT AATAGCTAGA GTTGTAGTCT GAGAGTTCTA GATAATGGAT TTAATATTGT TTTTCATGGT TTTATTTTCC CGAGACATGT  TAGCTGTAGA GTTGTAGCTA ATGGGTTTAA TTTTTTCCTT GTGGTTTTAT TTTTTTCGAC ATGTTAGTTC ATGGTTGTTA GTTCATGGTT GTGGAGTTGT AGCTAATGAG TTTAATTTTC  TTTCCTGTTA ACTTTATAAT AGTAGCTAAT GAGTTTAATT TTTTTTTCCA TGGTTTTATT TTCGAGAAAC ATATTAGCGT GATAATTGTA ACTAATGAGT TCAATTTTCT TCTTTATGAT  TTTATTTTGG GGAAACATGT TAACCTTGGA AAAATTTGAA CATGTTAAAA ATCATGATGA ATAATCCTTT GGCACTTCCA AGTACGAATT CCCCAATTAC CATTAAATAA AATTGTATTA  CTGATGAGCT GATTGTATTA CTGATGAGCT GATATGGTGT GAAATGTGCA GGCTGGTGGA CCACGATATG ATGTTCCAAC TGGAAGAAGA GATGGTACAG TGTCCAAAGT AGATGATGCA  AATAAACTTC CTGATCCCAA CGATAGTGCC ATACAGTCCT CTTCAGCATT TGCTTCCAAG GGTCTCTCTG TTCTAGATCT TGTTACCCTG TTAGGTCTGA CTCCCCACTC TACACAAACA  AATCACATGG AATGCTAACT TTTTTTCACA GAAATCATGT GTACCATTCA TTCATTATGG CGGTTCTTAT CACTGATGCA GGTGCACACA CCGTGGGCAT TACACATTGC AGTTTCTTTA  ACGACAGGCT GTACAACTTT TTGGGCACGG GCAAACCAGA CCCAACCATG GATCCAGCCC TTGTAACCAA GTTGAAGATC ACATGCCCAG ATCCTGCCTC GGGCAGCTCT GCAGACCCCC  CTATAAATCT GGATCAGGGA ACCCCCTCTG TTTTCGATAA CAGTTTCTTC AAACAGATTG CTGCCAGGAG AGGTATCTTG CAAATTGATC AGCAGTTGTT CGAGGATGCA AGCACCACTA  ACTTTGTTAG GAGTTTCGCA GGATCGTCAC CAAAACCTTT GAATTTCAGC CAGCAGTTCG TTCAGTCCAT TGTTAAGATG GGTAACTTGG GAGTGCTCAC TGGTAATCAA GGAACCATCA 
GGAAAAACTG TAGAGTTGTC AATACCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGATTG GCATTGGGAA AGGTAGTACA GCTCTGGGTT TCATGGTGGT AGTGGCAACA TTATGTGAGC TGGTGCCAGT CAATACGCAA GGTACTGTGG TGGGGTTTTA CAAACAGACT  TGCCCAAACG CAGAGAGACT TGTGCAGCTG AGGGTACAGA AAAAGTTCAG CACTGATAAG ACCATTGTGC CTGCACTTCT TCGAATGCAT TTTCACGATT GCTTTGTCAG AGGGTGTGAT  GCATCCCTGC TTGTAGATTC TACTGCTGCA AATCAAGCAG AGAAGGAGGC AGGGCCCAAT CAGACTGTGA GAGGATTTGA ATTCATTGAT GAGGTCAAGA AGGTCCTGGA AGCTGTATGT  GCCAACACAG TATCCTGTGC TGACATTATT GCACTGGCTA CAAGAGATGC CGTGGCCCTG GCTGGTGGAC CACGATATGA TGTTCCAACT GGAAGAAGAG ATGGTACAGT GTCCAAAGTA  GATGATGCAA ATAAACTTCC TGATCCCAAC GATAGTGCCA TACAGTCCTC TTCAGCATTT GCTTCCAAGG GTCTCTCTGT TCTAGATCTT GTTACCCTGT TAGGTGCACA CACCGTGGGC  ATTACACATT GCAGTTTCTT TAACGACAGG CTGTACAACT TTTTGGGCAC GGGCAAACCA GACCCAACCA TGGATCCAGC CCTTGTAACC AAGTTGAAGA TCACATGCCC AGATCCTGCC  TCGGGCAGCT CTGCAGACCC CCCTATAAAT CTGGATCAGG GAACCCCCTC TGTTTTCGAT AACAGTTTCT TCAAACAGAT TGCTGCCAGG AGAGGTATCT TGCAAATTGA TCAGCAGTTG  TTCGAGGATG CAAGCACCAC TAACTTTGTT AGGAGTTTCG CAGGATCGTC ACCAAAACCT TTGAATTTCA GCCAGCAGTT CGTTCAGTCC ATTGTTAAGA TGGGTAACTT GGGAGTGCTC 
ACTGGTAATC AAGGAACCAT CAGGAAAAAC TGTAGAGTTG TCAATACCTG A 

Retrieve as FASTA