Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
346 (324) |
PWM (Da): |
37930.29 (35528.9) |
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PI (pH): |
7.72 (7.24) |
Peptide Signal: |
cut: 23 range:23-346 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MHSSLIKLGFLLLLLQVSLSHAQLSPSFYDKTCPQVFDIVTNTIV NALRSDPRIAASILRLHFHDCFVNGCDASILLDNTTSFRTEKDAFGNANSARGFDVIDKMKAAIEKACPRTVSCADMLAIAAKESIVLAGGPSWMVPNGRRDSLRGFMDLANDNLPGPSSTLKQLKDRFKNVGLDRSSDLVALSGGHTFGKSQCQFIMDRLYNFGETGLPDPTLDKSYLATLRKQCPRNGNQSVLVDFDLRTPTLFDNKYYVNLKENKGLIQSDQELFSSPDAADTLPLVRAYADGQGTFFDAFVKAIIRMSSL SPLTGKQGEIRLNCRVVNSKSKIMDVVDDALEFASFM |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (chromo 4, 3 introns) and 3 ESTs. |
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
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Terminator +►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2 |
GGAAATGTTT TTCTCTAACA ATAAATAAAT CATCAATGTT GTCAAGATGT TTCTTTAACG TTACTTATTT ATAATCTATT AAATGTTGTG TACAAATACT ACCAAAGAAC AACGTGCAAC
TAAAAGTATA GGTGACAAGC TACTGTCTAA AGCTCAATGA TCATCTACAC CTAACCAATG ATGAAACAAT ACACCGAAGC AAACAGAGAA TGTAGAATTC AAATAAGGTG ATATGTTTCT
ACGCTTGTAA CTATATTGGC AACATTTCAC AACACCAATG GTTTCATCAG AGATCTATTG AGACTCGTTG CTGCAAAACA AAGAAGATGG ATATATAAGA CTTCTTTTGA TTAACCGTTT
GGTCCAACAG AAAAACAAGT TTGTGAAGTC TGTATTTTTA CCTTATCTAT TGGCATTTTT GTTCTCACTG AGTCAATCAA TGAAAAATCA ATATCTGCCA CGACAATGCC GGTCGAAACA
CGATCTGCAA CAGCAACAGA ATCAATCATT TCATTTTGGT AAGAAGAGAC TTTTGTGTTT CATAGATCAA GATATAGATG ATGCCTTTGA TCATTTCAGG ATTCTCACCA GGTAACCTTC
CAACTACAGT TCCCCACGGA TCAATGATCA GTGTGTCACC ATAACTTTCT CTTTTCTCAT TATGCTTTCC TGCTTGAGCA GCAGCTATGA CCTGACGATA AACCAAGCAC GGAAATCGAA
CAGAGACTGT TAATCACAAA TGCAATGAGA AGTTAAAGAG GGAGATAAGT GTATAATGAC ATACATAACA TTGAGTTTCA ATTGCTCGGG CTCGAAGAAG AATCTCCCAG TGTGCCTCCC
CAGTGACCTT GGTGAAAGCT GATGGTACTA GTAAAACCTG CAGAGCATTA AGACAGACAT TTTATACTCA AGTCTGTGCT TTTTTTCTGT AGGAACTCAG TTTTATCACA TTTTTGTTTC
GTCGTTTTTT CGCAGAGTTT CGAAGCGCAC GTAATTTAGA
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Retrieve as FASTA
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DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGCATTCCTCTTTGATAAAATTGGGATTTCTTCTTCTCCTTCTTCAGGTCTCATTGTCTCATGCTCAACTAAGCCCTTCCTTTTACGATAAAACATGTCCGCAAGTCTTTGATATTGTA ACCAATACCATTGTCAATGCGCTGAGATCAGACCCTCGCATCGCTGCAAGCATCCTTCGTCTTCATTTCCACGACTGCTTTGTTAATATGTAAGATACCACCAGATTCGATATATTCATG TATATATTAAGTACTCTTTTGGTTCTTTGATGGTTTTATCCTAAAAAGTGAGAATGCTTTACGGATATAATCATATATATGAAAGTTGGCCAACTCTCTCCATTTGGGTGACACATCATC ACACAAGAAAATGACATGTGTCATTTTACATTAATTATAAAAAAAAAATTAGTACAACTAATTGAGGAAAAATCAAAAGTCTTTTGTTGTGTAAATTCTCTATTAATCTCACTCTTAAAT GAATTTTCTAAAAACACTCAATAAATAAAAAATCATAACAATGTATAAAGTACTACTTTCATTCTATTCTAATTATTTTTTTAATTTTTTTTATCAATAGTTATTAATCCATAATGGCTA AAATTTACTTATGTTGTAGTTTAGATGTTTGCTACCTAACCTCATATTAATTTAGTAATTTTAGTTGGATATTTTCTTATTATTACGTTATGTGATTATGATTTATCATATGACCTTCTT TCTGTTTATTTTTGTGCGTTCTAATAACTTCGTAACATTGATATACAATTTTTTCACGTAGTGGTCATCTGAGACATTAGACATACCCACACAAAAACACGAGACTCTATATGGCTATAT GAAAGGGAAGAGAATTAAAGTGTTGACTTAATTTACTAGCATATCATGATGTGGTTGGTGTAGTAGATGACAAAAGAATATATGGAATAAAAAATTGTTTGTTACAATTAAGTTAGGCAA GTTTCAAAATACATAAGTAATATAACTACATATTAATATATCATATAATGTTGTTGTGTGTGTTCATGATAGTGAAATATTTGAATAATAGGTATATAAATATTTATATTATAATAAAAT TGATATTTCGAATTATAGATAAATTTAATCATAGAAAATTATAACTATATAAAATATATATGAATTTATTAATTACACATTAACATACACACACAAATGAACATCAAAATCAACAAAAGA CTATAATCATATATTCCGACAATTTTAAAAACAAAAACCCATGCGTAGCATGAGTGTTCATTTAGAATAACGAATTAACTAATAATAACAAATACGCAGGTAATATTATAAACATTGTAT ATATAAAGATCATAAGTTTATATATTATCTATATGTGGTGTAATCATATGTATAAAAGTTGGTCAACTCTCTTCATATGAATGACACATCATCACTTAGTTTTTGCCTAATGTCCACTTA ATAATTAATGTAAGTTAATGGTTTATGGTGATTTATTATTTAATTGTATATATTATAAAATTTTACATAATTAATTGTATCAAGAATAATTTTCTTTTATTTTGTATATCTTTTTCTTAA ATTAAATTATTTAATTGATTTTCTCATACTCTTGGATATTTTTCCCTAATTTTTATAATTTTAAGTCAAAATATGATTAAATAATTGTATAGTGGATTAGCTCATAGTTTTTGTAGTTTG TTCTTTTTCTATATAATATATGAAAAATGGTGAGAAGTACTTGAGAATTCTATCATCAAATTCTTGGACTCAAATCCTCTACCATTTTGTCTTATTGTTTTGGTTTAAGGTTAACACAGA TGAAAAAAAATTCTGAAAATAATGTTTACTGAGAAAAGATTTTGTAAGGAATCTAAATGCAAAATGCAAAAACAAATGTTGATTTATGGAGCTTAGTATCAAATAGGATTTTTGTCTTCT TGCCTATTAAAAAACTAACCTAAAATCTTACATTTAAATACTTTTAAATTACGAAATATAAAGTGAAAGCCCGCACGTATTGCGGGTACTCATCTAGTTAACTTGAAATAAGGATAGACA TTTCGGTTAGTTCATTTAATGTCTAATTAATTAATTAACTTGAAATAAAGATAGATTAATTATATAATAAAAAAACTGAATATTGATACAGTTATTATCGTCACAATAAAACAATATTCA GTCACAATAATTTTTTTATGACGAAAGTGAAACGTATTTTAGAATGTCACAATAAAATCGTCACAAATCCATAAAGGTCTTAAAAAGATCACAAGACGATTAACAACAGTAACAATTCGT CATTGATTGTGACGACGTTAATATAGTCGAATAAACAGACACAGTTCGTGACGCACGATACTGTCATAATTTTTGTCACAATTTTTTCGTAAAAATATTTGATTTCTTTTTGTCTTAATA AGATACTTAAAACTATAGATTTCTTTTGATTGTTTGGTTTTGAAATTTTGGCTTTCTTTTGGTTGATTAAAACAATAGGAAAAAAAAAACAGAAGTTAAATAAAAATTCAAAGTAACAAA AAAAGTTATTTCTACATCTGAAAATTTATGCGTTTTTGGATAAATTATCTTTTTGGAAGTTTGATTTTGTTTGTTTTGACTATTTTTTGGTTCAATTTGGAGTGGCTATTATTTTCTATG GACCAACCAAACCACTTCTTACGGAAATTGAGATGACTATTTTATTATTACAACTCTATATAGATATTCCAGTGCTGTCTTATCTCAAGTGTCAGATTTTGTCGTCAAAGTAAAGTCAAA GATAAAATTCTCTTCGATTATTAGATAATAATTAGTGAACTCGTATCACAAAAAACAAATAGTGAACTCATATTTTTCTTTTTTGGATTATTAGATTACATAGATGTCTTTGATCAACAA AAAAAAAATTACGTAGATGTTGTGGCGTAGTATAGTAGCGCATTAATAACTAGATTTACTATTTTTCTTGCGGTAAAAAGAGAAAAACAAATCAGTAGATGCAGGTAAAATATATCTATG TGGAAGTATTAACTTGATCTAACACTAATTGACAATAAAAATATTTTGTTTGGATAAAGGGATGTGATGCATCGATATTGTTAGACAACACAACATCGTTTAGGACGGAGAAAGATGCGT TTGGGAACGCTAATTCAGCTCGAGGTTTCGATGTAATCGACAAAATGAAGGCTGCCATCGAGAAAGCATGTCCTAGAACCGTTTCATGTGCTGATATGCTCGCCATCGCAGCTAAAGAAT CTATCGTTTTGTGGTATGCATCTTCTACTATGCTATCCAAATGGTTTTTGTAGACCATTTTGTTAATGTTTAACCAAATATGTTTACTTTAGGCGGGAGGTCCTTCATGGATGGTTCCAA ATGGAAGAAGAGACAGCTTAAGAGGTTTTATGGATCTTGCTAATGATAACCTTCCAGGTCCATCTTCTACACTTAAACAACTTAAGGATAGATTCAAAAATGTCGGACTCGACCGTTCTT CTGATCTAGTTGCTCTTTCCGCGGTATGTTATTATCTCATTTGAAACATTTTCATCTTTATAGTTGTAATCACTAATAACTCTATATGACTATATTGGTTTAGGTGGTCACACTTTTGGC AAAAGCCAATGTCAGTTCATAATGGATCGTCTTTACAACTTCGGTGAAACCGGTTTACCCGACCCAACCCTTGATAAATCTTACCTAGCCACACTAAGAAAACAATGTCCACGTAATGGA AACCAGAGTGTCTTGGTAGATTTTGATTTACGTACACCAACACTCTTTGACAACAAATACTATGTGAATCTCAAGGAGAACAAAGGACTTATCCAAAGTGACCAAGAGTTGTTCTCTAGC CCTGATGCTGCAGACACTCTCCCTTTAGTTCGAGCATACGCTGATGGTCAAGGGACATTTTTCGATGCGTTCGTGAAAGCAATAATAAGGATGAGTAGTCTTTCACCTTTAACAGGGAAA CAAGGAGAAATAAGATTGAACTGTAGAGTGGTGAATTCGAAATCTAAAATCATGGATGTGGTAGATGATGCTCTTGAATTTGCCAGCTTTATGTGA |
Retrieve as FASTA
|
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CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGCATTCCTCTTTGATAAAATTGGGATTTCTTCTTCTCCTTCTTCAGGTCTCATTGTCTCATGCTCAACTAAGCCCTTCCTTTTACGATAAAACATGTCCGCAAGTCTTTGATATTGTA ACCAATACCATTGTCAATGCGCTGAGATCAGACCCTCGCATCGCTGCAAGCATCCTTCGTCTTCATTTCCACGACTGCTTTGTTAATGGATGTGATGCATCGATATTGTTAGACAACACA ACATCGTTTAGGACGGAGAAAGATGCGTTTGGGAACGCTAATTCAGCTCGAGGTTTCGATGTAATCGACAAAATGAAGGCTGCCATCGAGAAAGCATGTCCTAGAACCGTTTCATGTGCT GATATGCTCGCCATCGCAGCTAAAGAATCTATCGTTTTGGCGGGAGGTCCTTCATGGATGGTTCCAAATGGAAGAAGAGACAGCTTAAGAGGTTTTATGGATCTTGCTAATGATAACCTT CCAGGTCCATCTTCTACACTTAAACAACTTAAGGATAGATTCAAAAATGTCGGACTCGACCGTTCTTCTGATCTAGTTGCTCTTTCCGGTGGTCACACTTTTGGCAAAAGCCAATGTCAG TTCATAATGGATCGTCTTTACAACTTCGGTGAAACCGGTTTACCCGACCCAACCCTTGATAAATCTTACCTAGCCACACTAAGAAAACAATGTCCACGTAATGGAAACCAGAGTGTCTTG GTAGATTTTGATTTACGTACACCAACACTCTTTGACAACAAATACTATGTGAATCTCAAGGAGAACAAAGGACTTATCCAAAGTGACCAAGAGTTGTTCTCTAGCCCTGATGCTGCAGAC ACTCTCCCTTTAGTTCGAGCATACGCTGATGGTCAAGGGACATTTTTCGATGCGTTCGTGAAAGCAATAATAAGGATGAGTAGTCTTTCACCTTTAACAGGGAAACAAGGAGAAATAAGA TTGAACTGTAGAGTGGTGAATTCGAAATCTAAAATCATGGATGTGGTAGATGATGCTCTTGAATTTGCCAGCTTTATGTGA |
Retrieve as FASTA
|
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGCATTCCT CTTTGATAAA ATTGGGATTT CTTCTTCTCC TTCTTCAGGT CTCATTGTCT CATGCTCAAC TAAGCCCTTC CTTTTACGAT AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGATATTGTA
ACCAATACCA TTGTCAATGC GCTGAGATCA GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCAT CGATATTGTT AGACAACACA
ACATCGTTTA GGACGGAGAA AGATGCGTTT GGGAACGCTA ATTCAGCTCG AGGTTTCGAT GTAATCGACA AAATGAAGGC TGCCATCGAG AAAGCATGTC CTAGAACCGT TTCATGTGCT
GATATGCTCG CCATCGCAGC TAAAGAATCT ATCGTTTTGG CGGGAGGTCC TTCATGGATG GTTCCAAATG GAAGAAGAGA CAGCTTAAGA GGTTTTATGG ATCTTGCTAA TGATAACCTT
CCAGGTCCAT CTTCTACACT TAAACAACTT AAGGATAGAT TCAAAAATGT CGGACTCGAC CGTTCTTCTG ATCTAGTTGC TCTTTCCGGT GGTCACACTT TTGGCAAAAG CCAATGTCAG
TTCATAATGG ATCGTCTTTA CAACTTCGGT GAAACCGGTT TACCCGACCC AACCCTTGAT AAATCTTACC TAGCCACACT AAGAAAACAA TGTCCACGTA ATGGAAACCA GAGTGTCTTG
GTAGATTTTG ATTTACGTAC ACCAACACTC TTTGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAG GAGAACAAAG GACTTATCCA AAGTGACCAA GAGTTGTTCT CTAGCCCTGA TGCTGCAGAC
ACTCTCCCTT TAGTTCGAGC ATACGCTGAT GGTCAAGGGA CATTTTTCGA TGCGTTCGTG AAAGCAATAA TAAGGATGAG TAGTCTTTCA CCTTTAACAG GGAAACAAGG AGAAATAAGA
TTGAACTGTA GAGTGGTGAA TTCGAAATCT AAAATCATGG ATGTGGTAGA TGATGCTCTT GAATTTGCCA GCTTTATGTG A
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Retrieve as FASTA
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