Entry information : PtaPrx06(PTA00015062)
Entry ID 2040
Creation 2007-02-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-02-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx06(PTA00015062)
Name PtaPrx06(PTA00015062)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx065]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Needles
Roots
Somatic embryos
Stems
Inducer Drought
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx06
start..stop
S start..stop
PtaPrx59 592 0 1..360 1..363
PabPrx176 576 0 1..356 1..357
PabPrx185 492 5e-176 9..360 5..357
PabPrx166 481 1e-171 3..360 4..362
Literature and cross-references PtaPrx06(PTA00015062)
Literature Pratt,L. et al., An EST database from loblolly pine (Pinus taeda) roots recovering from drought stress, unpublished
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.12419
Protein sequence: PtaPrx06(PTA00015062)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   361
PWM (Da):   %s   38891.69 Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   5.81
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKYVIVSSI VCFFVFVSAC IISVNGLVVH EDDLSKPVHG LSWTFYKDSC PDLEAIVKSV LEPALDEDIT QAAGLLRLHF HDCFVQGCDG SVLLTGTKRN PSEQQAQPNL TLRARALQLI  DEIKTAVEAS CSGVVTCADI LALAARESVA QAGGPKFPVP LGRRDSLKFA SQSVVLANIP APTLNLTQLM NIFGSKGFSL ADLVALSGGH TIGIGHCNSF DNRLYNKATG KKIVDPSIAN  SLADDLYSLC PTVNNTVDFT NLDIQTPNAF DKKYYANVQK NQALFTSDQS LYTETDSAEI VDSFASSQTV FFKKFVHGMH KMGQLDVLTG KKGEIRTTCS VPNPTSSAFE EVIEPVTHSE 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 155 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGAAGT ACGTGATCGT TAGCTCCATT GTGTGTTTCT TTGTATTTGT TTCTGCGTGC ATAATTTCTG TCAATGGATT AGTTGTCCAT GAAGATGATC TGTCAAAGCC TGTGCATGGG  CTTTCGTGGA CATTTTATAA GGACAGTTGC CCCGACTTGG AGGCCATAGT GAAATCGGTA CTTGAGCCGG CGTTGGACGA AGATATCACT CAGGCCGCAG GCCTGCTGAG ACTTCATTTC  CATGACTGTT TTGTGCAGGT ATTATGGAAA TTATGCGTGT TTGATAAAAT TTTGGGATTT TTTATTTTCA TTGTAGATTT GGGGTATTTT TATTTAGCCT TCAGATTGTA GAAAAAATTT  AAAATTTAAT TAATAATATT TATAGAATTC CAAAATATTT CCAAAATTTG TAATATTAGT TGAATTCCAC TATATTTTCA AAATCTGCAG TTTTGATAAA GTGGGTAAAG AAATGTTTGT  TATCAACTAG ATGTTTCTTT TTAGGGAGAT GTTTGTAACT GTGTTGCAAG GTTTTCATTT ATATTTACAA GATTGGCAAA GTTTCCATTT ATGTTTAGCA AAATCTGTTG TATGATGATA  TGTATGTGAA GAAAAAAATA GGTTAATATT CTTTATTTTG AAAAGATATA CTTGTTAGAA TTTGGACGCC TCTTTCATAC AAATACAGAG TTTTATGATA TTTTCTTGAA AAAAATAGGT  TATTATTATT TATTTTGAAA AGAAGTACTT TAGAATTTGG ACGCCTCTTT AATACAAATA CAGAATTTTA TAACACAAAT ACAGAGTTTT ATGATATTTT CTTAATACAA ACAATATTTC  CATTACCAAC TCCATGTTCC AAAATTTTAG TATTTAGAAT AGATTTACAA GTATTCTCAT CCATATTTTA CACCCATAAA AATATTTTAA CATTCGTGAT GTTATATCTG GAAAGGGTTG  CGATGGGTCC GTGTTGCTAA CAGGAACTAA AAGAAACCCC AGTGAGCAAC AGGCTCAGCC AAACTTAACA CTGAGAGCCC GGGCCTTGCA GCTGATCGAC GAAATTAAAA CAGCTGTAGA  AGCTAGCTGC AGTGGGGTTG TAACTTGTGC AGACATTCTG GCTTTGGCTG CTCGTGAATC CGTCGCCCAG GTTGGTAGTA CCCTAATTTC CTTTAATTAT AATTTTTGGG TTTGTTGCTT  TGAATGGAAA TTTGCAGGAG TATTAATAGA AATCATCATT TTGAAGGCAG GAGGCCCAAA ATTTCCAGTA CCACTTGGAC GCAGAGATAG CCTAAAGTTC GCCAGTCAAT CCGTAGTTCT  CGCCAATATA CCAGCTCCAA CTTTAAATTT GACACAGCTG ATGAACATTT TTGGCTCCAA AGGATTCAGT TTGGCCGATC TGGTTGCTCT TTCAGGTCTG ATGCCCATTT TACCCTCTCA  ACTTTACCTT TGAATAATGT GATATTTTCA TTTCTAAATC TAGATATTTT ATTCCAGAAT ATGGTATATA AGAAATACAA CCCGATATAG ATATTTATGC GGGAATATGG TATATAAGAA  ATACAATCAG ATATAGTTTG AGTCGGCTTG ATGCGTTTTG AGTAGGCTTG GTTAAAAGTT TGTATGTATG TTTGATGGGT TTGACGAGTA GAAAGTATAT ATGTCTGGTA AACCTAGCAA  TCAAATAGCT AGGTGAAAAA GTTGAGTGTC TAACCTGAGG ATAACCTTAA AATAAATAAT AAGATGAAAT TTCAATAATT AAATTTCATT TCTCATATTT TAAAATATTC TTTAAGTCTA  CAAACTTGAC CTTGTGAACA ATAAAATAAG ACATCATATA AATAGCATCA ATTAGCTCTG GTTCGTTTTA GCATTAATTT AACTCCTTTC TTTTCTCATG ACCTGTTTCA GGTGGACACA  CAATCGGCAT TGGTCACTGT AACTCATTCG ATAACCGATT ATATAACAAG GCCACAGGAA AAAAAATTGT GGATCCAAGT ATAGCAAACA GTTTGGCAGA CGATCTTTAT TCATTATGCC  CCACTGTTAA TAACACCGTG GACTTCACAA ACTTGGATAT CCAGACTCCG AACGCTTTCG ACAAGAAATA CTACGCGAAT GTGCAGAAGA ACCAGGCGCT ATTCACCTCC GACCAGAGTC  TCTACACCGA GACCGATAGT GCAGAAATCG TTGACAGCTT TGCATCCAGC CAGACCGTGT TCTTCAAAAA GTTTGTACAT GGAATGCATA AAATGGGGCA GTTGGATGTT CTAACGGGCA 
AGAAGGGAGA GATCCGTACC ACATGCTCCG TTCCGAATCC GACTTCTTCA GCCTTTGAAG AAGTTATCGA GCCTGTCACC CACTCAGAGC TTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGAAGT ACGTGATCGT TAGCTCCATT GTGTGTTTCT TTGTATTTGT TTCTGCGTGC ATAATTTCTG TCAATGGATT AGTTGTCCAT GAAGATGATC TGTCAAAGCC TGTGCATGGG  CTTTCGTGGA CATTTTATAA GGACAGTTGC CCCGACTTGG AGGCCATAGT GAAATCGGTA CTTGAGCCGG CGTTGGACGA AGATATCACT CAGGCCGCAG GCCTGCTGAG ACTTCATTTC  CATGACTGTT TTGTGCAGGG TTGCGATGGG TCCGTGTTGC TAACAGGAAC TAAAAGAAAC CCCAGTGAGC AACAGGCTCA GCCAAACTTA ACACTGAGAG CCCGGGCCTT GCAGCTGATC  GACGAAATTA AAACAGCTGT AGAAGCTAGC TGCAGTGGGG TTGTAACTTG TGCAGACATT CTGGCTTTGG CTGCTCGTGA ATCCGTCGCC CAGGCAGGAG GCCCAAAATT TCCAGTACCA  CTTGGACGCA GAGATAGCCT AAAGTTCGCC AGTCAATCCG TAGTTCTCGC CAATATACCA GCTCCAACTT TAAATTTGAC ACAGCTGATG AACATTTTTG GCTCCAAAGG ATTCAGTTTG  GCCGATCTGG TTGCTCTTTC AGGTGGACAC ACAATCGGCA TTGGTCACTG TAACTCATTC GATAACCGAT TATATAACAA GGCCACAGGA AAAAAAATTG TGGATCCAAG TATAGCAAAC  AGTTTGGCAG ACGATCTTTA TTCATTATGC CCCACTGTTA ATAACACCGT GGACTTCACA AACTTGGATA TCCAGACTCC GAACGCTTTC GACAAGAAAT ACTACGCGAA TGTGCAGAAG  AACCAGGCGC TATTCACCTC CGACCAGAGT CTCTACACCG AGACCGATAG TGCAGAAATC GTTGACAGCT TTGCATCCAG CCAGACCGTG TTCTTCAAAA AGTTTGTACA TGGAATGCAT  AAAATGGGGC AGTTGGATGT TCTAACGGGC AAGAAGGGAG AGATCCGTAC CACATGCTCC GTTCCGAATC CGACTTCTTC AGCCTTTGAA GAAGTTATCG AGCCTGTCAC CCACTCAGAG 
CTTTAG 

Retrieve as FASTA