Entry information : PtaPrx18(PTA00070375)
Entry ID 2054
Creation 2008-08-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2008-08-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx18(PTA00070375)
Name PtaPrx18(PTA00070375)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx012]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Roots
Stems
Inducer Drought
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx18
start..stop
S start..stop
PabPrx111 595 0 1..318 1..315
PabPrx79 558 0 1..318 1..318
PabPrx125 558 0 1..318 1..318
PtaPrx64 555 0 5..318 5..318
Literature and cross-references PtaPrx18(PTA00070375)
Literature Pratt,L. et al., An EST database from loblolly pine (Pinus taeda) roots recovering from drought stress, unpublished.
EST ref. GenBank:   CF390722
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.31894
Protein sequence: PtaPrx18(PTA00070375)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318 (294)
PWM (Da):   %s   33713.71 (31062.5)  
PI (pH):   %s   6.97 (7.72) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-312
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTSFTAMASV VCIALLFFST VAFAQLNSTY YDTSCPKLLA TVKAAVKTAV ANEKRMGASL LRLHFHDCFV NGCDGSVLLD DSSTLTGEKT ALPNNNSLRG FDVIDTIKSQ VEAVCSGIVS  CADILAITAR DSVVELGGPT WTVLLGRRDS ATASLSAANT NIPAPTSNLS GLISSFQAQG LSTKDMIVLS GAHTIGQARC TVFRTHIYNE SNINAAFATS LKTNCPSTGG DNNLSPLDLL 
TPTTFDNNYY TDLKSQKGLL HSDQQLFNGG SADSQVTTYS TTQSTFFTDF AASMLNMGNI NPLTGTSGQI RKNCRKPN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 14 ESTs. 5' is missing.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTTCCT TTACAGCAAT GGCGTCAGTC GTGTGCATCG CTCTGCTCTT TTTCTCGACC GTTGCTTTCG CTCAGCTCAA CTCAACGTAT TATGATACGT CGTGTCCCAA ACTCCTGGCA  ACGGTGAAGG CTGCAGTGAA GACGGCGGTG GCCAATGAGA AACGCATGGG GGCATCATTG CTCCGTCTTC ACTTTCATGA TTGTTTCGTC AATGTAAATT TGTGTTTCCT TATGTTTTTT  TCAGCTATTG ATATTGATTT TAGGGTTTAG TTTTTTTTCC AGATGAAAAA AGCAATTATA TATTCATTTA TGGAGTAGTT TTTTACATGT CTTCGGATAC AGAGACTGCA TATAGAGTTT  TCTATCATTA TATAAAAATA CTGTTGATAT AACTTACTAA GCTGTTCAAG TGTTCGGGCA GAATTCACTA AAAAGATATA ATTCGGAAAA AAATTGTTCA TTTTCCTATC TTCAAAAAGA  GACTTGTTTA AACATTACGT AGCAAATTAA TAATTGGTTT AATATTTTTT TAGAAATTTG AGTTGGGCGT AGATTCTTAA ATTTATTGGA TTTTAGAATA TTCAAAGAAT CTACATTAAG  CTTATCAAAT ATTATTTTGT AGATATCAGT CTTTTGGATT ATTCACATCT TTAAGATTTG GTTGAAGTTT CGAACCAATC AATGTACTCT TGAAGATGAA CCACATTAAT TGGTTCTAAA  TCTGAACCAA ATCTTAAAGA TGTAATTAAT CTGAAAGACT AATAATGAAT TACAAACATT TTAAATCTAA AACCATTATT TTATTTTTTC TTAAAAAATA ATACAGTATT GATTAGATAA  AAAATAATAA ACTAATCATT AAATTATTTC ATAGTGTTTA ATATTTAACT TTGTTTTAAT TCAGTCAGCG ATCTTCTTTA TTTTCTTTAT TGTTAAATGC AAACTTGCCT TTACAGGGTT  GCGACGGGTC AGTGTTGTTG GATGACTCTT CGACTCTAAC TGGGGAAAAG ACTGCTCTTC CCAACAACAA TTCGTTGAGG GGTTTCGACG TCATAGACAC CATCAAATCA CAAGTGGAAG  CAGTTTGCAG CGGAATCGTA TCGTGCGCTG ACATTTTGGC TATTACGGCT AGAGATTCTG TCGTCGAAGT AATTGCCTAC CATCCTACTT TTTCCCATCA TCATTCATAT TTATATCCAC  AGTTTCATTT TATAGGCGTA ATTGTCTGCT CTTTTATCAT TCATAAGAGC CATTAACATG GCGATAGAGT ATAGATTTAA GTTATATTCA AAAGTGTTTA TTTCGATTGT AAATTTAGGA  AATTTGATGT CCAGGAGTGA ACATAAACTA TCAATTTAAC ATATATGAAA TAGGTTATGG GATACAGTAT TGATTAAGTT ATATTCAAAA GTGTTTATTT CGATATGTAG TTAGAACTCT  GATTGATGTC AATGTCATAG ATTTTTAGAA CTCTGATTGA TGTCAATGTC ATAGATTTTT CGAAATCTTC TTTTGACTTA ATGTGTATTG TCCATCGCCC ACCCTGCATA ACATTGACAG  TGGTGGTTTT AGTGTTTATT AGCTTTAATC TTGGATTTTA CTGATCGCAG TTGGGAGGAC CAACATGGAC AGTGCTACTT GGAAGGAGAG ACTCAGCAAC TGCCAGCCTA AGCGCCGCAA  ACACCAACAT TCCCGCTCCC ACTTCCAATC TCAGTGGTCT CATCTCATCT TTTCAAGCAC AGGGCCTTTC AACCAAGGAT ATGATTGTCC TATCAGGTAT AAATATTTAT ATTGTCTTGC  TGAACTAAAG TCTGTTGAAT TTAATTTGAT GGTAGATTTC TGAAATCTAA CCAACGAAAA CAAGTCACAA TTGTTTAAAC TTTTTTCTCT TCATCAAATT TTGAAATATT TAAAAAAAAA  TATCTACCTA TCCTTAATAT TGCATTGTGA ATTTCTACTA CATTCCCACC ATATAATCTA GAATCCTAAT TCCTTTTTTC TGTTATTTAA TTAGGTGCAC ATACCATTGG CCAAGCTCGA  TGCACAGTTT TCAGGACTCA CATCTACAAC GAATCCAACA TTAACGCGGC ATTTGCCACT TCCCTGAAGA CAAACTGCCC AAGTACAGGA GGCGACAATA ACCTCTCACC GTTGGATCTA  CTGACTCCAA CAACGTTCGA CAATAACTAC TACACAGATC TGAAGAGCCA AAAGGGTCTT CTCCACTCAG ACCAGCAGCT GTTTAATGGC GGCTCTGCAG ATTCCCAGGT TACTACCTAC  AGCACCACTC AGAGCACCTT CTTTACCGAC TTCGCAGCTT CCATGTTGAA TATGGGTAAT ATCAATCCCC TCACTGGCAC CAGCGGACAA ATCCGCAAAA ACTGCAGAAA ACCTAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTTCCT TTACAGCAAT GGCGTCAGTC GTGTGCATCG CTCTGCTCTT TTTCTCGACC GTTGCTTTCG CTCAGCTCAA CTCAACGTAT TATGATACGT CGTGTCCCAA ACTCCTGGCA  ACGGTGAAGG CTGCAGTGAA GACGGCGGTG GCCAATGAGA AACGCATGGG GGCATCATTG CTCCGTCTTC ACTTTCATGA TTGTTTCGTC AATGGTTGCG ACGGGTCAGT GTTGTTGGAT  GACTCTTCGA CTCTAACTGG GGAAAAGACT GCTCTTCCCA ACAACAATTC GTTGAGGGGT TTCGACGTCA TAGACACCAT CAAATCACAA GTGGAAGCAG TTTGCAGCGG AATCGTATCG  TGCGCTGACA TTTTGGCTAT TACGGCTAGA GATTCTGTCG TCGAATTGGG AGGACCAACA TGGACAGTGC TACTTGGAAG GAGAGACTCA GCAACTGCCA GCCTAAGCGC CGCAAACACC  AACATTCCCG CTCCCACTTC CAATCTCAGT GGTCTCATCT CATCTTTTCA AGCACAGGGC CTTTCAACCA AGGATATGAT TGTCCTATCA GGTGCACATA CCATTGGCCA AGCTCGATGC  ACAGTTTTCA GGACTCACAT CTACAACGAA TCCAACATTA ACGCGGCATT TGCCACTTCC CTGAAGACAA ACTGCCCAAG TACAGGAGGC GACAATAACC TCTCACCGTT GGATCTACTG  ACTCCAACAA CGTTCGACAA TAACTACTAC ACAGATCTGA AGAGCCAAAA GGGTCTTCTC CACTCAGACC AGCAGCTGTT TAATGGCGGC TCTGCAGATT CCCAGGTTAC TACCTACAGC 
ACCACTCAGA GCACCTTCTT TACCGACTTC GCAGCTTCCA TGTTGAATAT GGGTAATATC AATCCCCTCA CTGGCACCAG CGGACAAATC CGCAAAAACT GCAGAAAACC TAATTGA 

Retrieve as FASTA