Entry information : PtaPrx24(PTA00032197)
Entry ID 2063
Creation 2007-02-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-02-14 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-04 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx24(PTA00032197)
Name PtaPrx24(PTA00032197)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx115]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer Drought
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx24
start..stop
S start..stop
PabPrx227 598 0 1..327 49..375
GbPrx35 459 6e-164 11..327 19..331
AtrPrx41 398 3e-140 1..327 3..325
EferPrx85 394 3e-138 9..327 16..335
Literature and cross-references PtaPrx24(PTA00032197)
Literature Pratt,L. et al., An EST database from loblolly pine (Pinus taeda) roots recovering from drought stress, unpublished
EST ref. GenBank:   DR014964.1 [5' end]   CO369083.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.12474   Pta.31127
Protein sequence: PtaPrx24(PTA00032197)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (299)
PWM (Da):   %s   34982.18 (31882.6)  
PI (pH):   %s   5.15 (4.82) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-327
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTRTHSHIVH TLLILVSLIW CTGESAEAAT RLGFYSSTCP DVESLVQSSV QFFLSSDISF APSLLRMFFH DCFVQGCDAS VLLDGPSSER TASANTGLRG FEVIMDAKSR VEAECPGIVS  CADILALATR DAVVMTNGPS WDVPLGRMDG RRSLASDVAV NFPSPRDSIN ALKQKFSARG LSTDDLVALS GGHTIGQADC GFFTDRLYNY KSTGMPDPSI NRNSLRQLQS ICPANGNGNS 
RVALDKGSKN TWDASYFQNL LAGNAVLESD VDLVSDPDTE RLVETFANSV DSFNSAFTKS MVKLGNVGVK TASQGGEIRR MCTVANF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 37 + 22 ESTs (two unigenes).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTCTTC TTGGCCTTTT TCTATGGATT TCTGTCTATA AAACTCAATT CTATATCCTA ATTCCATCGC TGGCCAAGAA GATTTTTGAG CTTAAAATTG CCCAAAAGAT GACCAGAACT  CACTCACATA TTGTTCACAC ACTACTTATA CTTGTGAGTT TGATATGGTG CACAGGGGAG TCCGCAGAAG CAGCCACCAG GCTGGGATTC TACTCTTCCA CCTGCCCGGA CGTGGAATCT  CTGGTGCAAT CCAGCGTGCA GTTCTTCCTC TCATCTGATA TCAGTTTTGC TCCATCTCTG TTGCGCATGT TCTTTCACGA CTGCTTTGTT CAAGTAATTT CAGGACAGCT TTGCTAATTA  TAAGTTTTTT TTTTGCAGTT TTAGATGGTT GAACTTATTT TAATTATAAA TTTTAAGAAT ATTTTAATGA CAGCTAAGTT AAATTATTGA TCTTGCTGTG AAAGATAACA ATAAAGATGA  AAAAATGATT TGCTGTAATG TCAGTAACAA ACAATGTTCC CAAATCTACA ATGGAGATAA AAATATCCAT TTTAGAATTG CTTTTAATGA AAAAAATTGA TATCAATTGA TGAGATCGTA  AATTGCTAAT TCAGGGCTGC GATGCATCTG TATTGCTGGA CGGTCCTTCG TCGGAGAGAA CCGCTTCTGC TAATACAGGA TTACGTGGTT TTGAGGTGAT AATGGACGCG AAATCCCGTG  TAGAAGCAGA ATGCCCAGGA ATCGTCTCGT GTGCCGATAT ACTTGCACTT GCAACACGCG ATGCCGTTGT TATGGTATGA ACATAAAATA TCCTTAAGCT AATCTGATGT ATGTTATTAT  TATGAGATTA TTATTTTTTT GGGCTTAAAG TTGTTATATT TTTTAAGATA ATATTAGTGA ATATATTTTA AGAGTATGTG TTTTCTCTTC ATAGATTTAA ATTTATTTGA GAATAGAGTA  TGTTTTTATA GATTTTAGTA TTCAAATCAT TAAATAAAAG AGAATCTTTT AATTTACAAA TAAAAAAATA TTGTGTACTA ATTTTCTCTC ACAAACAAAA GAATTTCATA TACTAATTAA  TTCGACTTTA GTAGTAACTT TAAAATAAAT TACTATTATA ATTTTTACAA ACCCAATATC ACCCAATATC TTGTTACTTT GCTTAATAAA TTTTAAAAAT AGATTATTAT TTCTATTATT  ACAAACCCAA TATTTTGTTG TTCACCTCAT TTACAAGTAA ACAAAAGAGT AATCGTACAT CAATTTTCTC TCTCATTTGG TTGCAAACTT AAAAATGAAT AATAATAATT ATTATTATTA  TTATATTAAC TAACnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnATAATA ATAATTATTA TTATTATTAT ATTAACCTAA TATTTAGTTG  ATTGTATAAT AAACACAAAT CCAAACACAC ATACACCAGT TTATTCTGTA ACTTAATAGT AATCTTGAAA TAATATTTTA TTTTCAAAAT TACTACTAGC TCAATATCTT GCTGCTTTAG  CTAATTTACA CAAACTCAAT CACCTCACTT TTTGTAACTA AACTACATAA TTGTAAGCCA TGATTCTGGT TTAAAATTGC TAATGTTACT TAAGGATACC ATATCTATAA AATATTATTA  TTACTAACTC AATATCTTAT TGCTTTATGT AATGAACACA AACCCAATCA CCTCAGTGCT GATAGCTAAA CCACATAACT GTAAGCTGTG ATTCTGCTTT GAGGTTGCTA ATGTTGCCTA  ATGATGCAAT ATCTATGCCT CTTTACAACA GACCAATGGA CCTTCATGGG ACGTGCCATT AGGAAGAATG GATGGACGAA GATCGCTTGC ATCTGACGTG GCAGTGAACT TTCCATCTCC  CAGAGACTCC ATCAACGCCC TCAAACAAAA GTTCTCTGCT AGGGGTCTCT CTACCGACGA CCTTGTTGCT CTTTCAGGTG AATTAATTAT CAAATCCTTT TATGAAAACT CCATTTCATG  CCTGATCTTC AGTCTTACAT ATTGCAAATT AATTATCAAA TCCTTTTATG AAAACTCCAT TCCATGCCTG ATCTCCAGTC TTATATGTTT ATCAGATTAA TTAAAGGTTG GAAATTGTAA  TTATTCTAGC ATGTTGCTTA AAATCATAGA GTTATTCAGT AAAATTGAGT CTAGTTTAGT GATATTTTAA GTAAAATTAA ATTTAATGTA TAATGGTAGG TTAAATTATT TTAAACCAAT  TACTAATTGT ACTTTTTAAA GGTTAGTTTC TAGGGTTAGT TTAACTAATA GAGTCCTATT GTTAAGTGCC TTACGAAAAG GTCAAAAAAA TCAATACTAG TCTGACCTAC GACCTTTAAG  AGATTTTCCC GTAATCCTTC AAGTTGTATG TAATGAATAA AAATGCTAAA TTTTAAATTT TGGGTTTCAT TTAGGAGGTC ACACAATTGG GCAGGCCGAC TGTGGATTCT TCACCGACCG  TTTATACAAC TACAAGTCCA CGGGAATGCC GGACCCAAGC ATAAATCGAA ACTCACTGAG GCAACTCCAG AGCATTTGCC CTGCGAATGG AAACGGGAAC AGTAGAGTGG CTCTTGACAA  AGGGAGTAAA AATACGTGGG ACGCAAGCTA CTTCCAGAAC CTTCTCGCAG GAAATGCAGT GCTAGAATCT GATGTAGACC TCGTCTCTGA CCCTGATACC GAGCGCCTTG TAGAGACTTT  TGCAAACTCA GTCGACTCTT TCAACTCCGC CTTCACGAAA TCCATGGTGA AGCTCGGTAA CGTTGGTGTG AAGACAGCAT CCCAAGGAGG AGAGATCAGG AGAATGTGTA CAGTCGCCAA 
CTTTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACCAGAA CTCACTCACA TATTGTTCAC ACACTACTTA TACTTGTGAG TTTGATATGG TGCACAGGGG AGTCCGCAGA AGCAGCCACC AGGCTGGGAT TCTACTCTTC CACCTGCCCG  GACGTGGAAT CTCTGGTGCA ATCCAGCGTG CAGTTCTTCC TCTCATCTGA TATCAGTTTT GCTCCATCTC TGTTGCGCAT GTTCTTTCAC GACTGCTTTG TTCAAGGCTG CGATGCATCT  GTATTGCTGG ACGGTCCTTC GTCGGAGAGA ACCGCTTCTG CTAATACAGG ATTACGTGGT TTTGAGGTGA TAATGGACGC GAAATCCCGT GTAGAAGCAG AATGCCCAGG AATCGTCTCG  TGTGCCGATA TACTTGCACT TGCAACACGC GATGCCGTTG TTATGACCAA TGGACCTTCA TGGGACGTGC CATTAGGAAG AATGGATGGA CGAAGATCGC TTGCATCTGA CGTGGCAGTG  AACTTTCCAT CTCCCAGAGA CTCCATCAAC GCCCTCAAAC AAAAGTTCTC TGCTAGGGGT CTCTCTACCG ACGACCTTGT TGCTCTTTCA GGAGGTCACA CAATTGGGCA GGCCGACTGT  GGATTCTTCA CCGACCGTTT ATACAACTAC AAGTCCACGG GAATGCCGGA CCCAAGCATA AATCGAAACT CACTGAGGCA ACTCCAGAGC ATTTGCCCTG CGAATGGAAA CGGGAACAGT  AGAGTGGCTC TTGACAAAGG GAGTAAAAAT ACGTGGGACG CAAGCTACTT CCAGAACCTT CTCGCAGGAA ATGCAGTGCT AGAATCTGAT GTAGACCTCG TCTCTGACCC TGATACCGAG  CGCCTTGTAG AGACTTTTGC AAACTCAGTC GACTCTTTCA ACTCCGCCTT CACGAAATCC ATGGTGAAGC TCGGTAACGT TGGTGTGAAG ACAGCATCCC AAGGAGGAGA GATCAGGAGA 
ATGTGTACAG TCGCCAACTT TTAA 

Retrieve as FASTA