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Entry information : PtaPrx02(PTA00039566)
Entry ID 2070
Creation 2007-08-31 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-08-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx02(PTA00039566)
Name PtaPrx02(PTA00039566)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx028]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Roots
Xylem
Inducer Drought
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx02
start..stop		 S start..stop
PabPrx221 608 0 1..324 1..324
GbPrx21 531 0 6..324 7..323
AtrPrx37 441 6.15e-157 6..324 10..320
NnPrx100 430 6.83e-153 11..322 15..320
Literature and cross-references PtaPrx02(PTA00039566)
Literature Sederoff,R., Molecular Basis of Wood Formation in the Pine Megagenome, unpublished
EST ref. GenBank:   DR110447.1 [5' end]  DR050470.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.8110
Protein sequence: PtaPrx02(PTA00039566)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (302)
PWM (Da):   %s   35336.42 (32987.2)  
PI (pH):   %s   4.93 (5.02) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEARDLLFTV LILIGAHVGE GLSLDYYAFT CPFAEAIIGD TVNRAVQRDI TISAALLRMH FHDCFVEGCD GSILIDSTSD NKAEKDSPAN LSLRGFEVID EAKARIEDSC PGVVSCADII  AIAARDAVVM SGGPMYAVPK GRKDGSRSRI EDTRNLPFAT FNVSQLIKTF AQHGLSSQEM VVLSGGHTLG VSRCSSFKNR LIHFDSTHDV DPSINPQFLA TLKRTCIKSS SSNDFDDNAN 
VAFDTTKSVF DNVYFSMLQS GAGLLTSDDT LMSSPRTRAL VNTYAMNQAT FFFDFSQAMV RMGLVEVKED DEGDIRLNCR RLN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 10 ESTs.(3 mismatches)
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCCA GGGATCTGCT GTTTACAGTC CTGATCTTAA TTGGTGCCCA TGTTGGTGAG GGTTTAAGCT TAGATTATTA TGCTTTTACA TGCCCTTTTG CAGAAGCTAT TATTGGGGAT  ACTGTCAACC GCGCTGTGCA ACGAGATATT ACCATTTCAG CAGCACTTCT TAGAATGCAT TTTCATGACT GCTTCGTAGA GGTACCCATG TTATCTATCA ATTATTCTTC TGGTTCACTA  AAAATTCAAA CAGAGGTTTT GTCAATGGCT GTTTTTAACT TTTGCAGGGA TGCGATGGAT CTATTCTCAT AGATTCCACT AGTGATAATA AGGCTGAAAA AGACTCTCCC GCCAATCTGA  GCTTGCGTGG GTTCGAGGTA ATCGACGAGG CAAAAGCAAG AATTGAAGAT AGCTGCCCTG GTGTTGTGTC TTGTGCTGAC ATTATTGCAA TAGCAGCTCG AGATGCAGTT GTCATGGTAT  ATCAAAATTC TTTGAACATG CATTTCATAT GATTAATTAC CCGTTACCAC AGTTTGCGTA GGCATTTTTG AATTTTGAGA TGGTTATCAT GAGTTTAATA GTTTTAGTAT TTACAATAAT  AATCAACTAG AATTCTCTTT CACTCACTTC ACTTATTGCG AAGCAGCAAA ATTTTGTAAT TTAGGTTTTT AATTCAAGTA GATTACAGCT TTTAGTAAAT TTTTGAACAC CCATAGAGAA  GAGTGAAGTG AAATTTTTTA GTAAAATATT GAAATTAAAA TTACAAATTT TAATATATTT TTGGAATCTT GACAAATGGT AAATCAATGA TTTAATTGCC TAAAATCTAA TCAAGATAAA  GATAACTAAT CAATCAAAGT CGAAATAATC CACCCATTGG TAATCATGCA TGCTTAGTTG TCATTAAAGT TGACAGCAAT TTATTACCTA ATTCTGACCA CAGAGAGTTT AGCATTCTTA  ATCATGCATG CTTAATGCTT AATTGTCATT AAGTTTGATA ATACTTAATT GTCATTTAAT ACCCAATTTT GATTATAGAG AGTTTAGCAT TTTTCATGAT TTGTTTTTAG TGCAATTTTT  TGGAAGCTTT TCTGATGGAT TTTTGTGTTT AATTTCTCTA AGATTTGGCA GTAATTTATT GAAATCCCAA GCTTGATGGG TAACCTCACA GAATCTAAGT GCCCTAGGGG TTTTTGAGGG  TGTTGAATCC ATATATACAG TGAAAAAACC AGTGTGAATA ACACAAATCA AGATTTTACC TCAAATTTTT CCACTAGATT GAAGCATCCA AAAGTACAAA AAGTACAAAA CGTGGAACTA  AAGACAACTT CTCCTTAATC ATACATAATT GTCATTAAAA TTGACCACAC TTAACTGTCA TTTATTACCC AAATTTGACT AGTTCAGTGG AAAGTTAGCT AAGTCTAAGC ACCCTTGAGA  GTAATATATA CTAGGAAGTG TGACGATGTT AAGTCAATAA TACTTTTATA GAGGTTATAA GTTTTAGAAT ATTCTGTTTA CCCAAATCTG ACTAGTTCAG TGGAAAGTTA GCTAAGTCTA  AGCACCCTTG GGAGTAATAT ATACTAGGAA GTGTGAAATG TTGAGTCAAT AATAATTTTA TAGAGGTTAT AAGTTTTAGA ATATTCTATA AATTCGATAT ATGGAAGTGA AGTTAAATAT  ATGATTTTAT TTTTATTTTT CAAATTTTCT AATATTCTAA ATCTACACTC AATTGTAATA AATTGTAATC ATAATTTAGA ATATATAATG CTCACTTAAA TTTTTAGGTC AAGCTTTATG  ATTTTTATAT GACACTTAAC TATTATTTnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnT AAAAATATTC CAAAATTTAT GATAATTTTA TTAAAAACTA AAAACATGCA ATAAAATTAT AAATTTTTAT  CTTAAGCTTG ATGATTTTTA TGTTATATTC AATGATTGTT TACTATAACT TTTTTTCAAA AATGTACTAG TAAAACCCTT TATTAATATT TTTCCAATAT TTTTTAGGTT TTTGGGTATT  TTTTAATGAC TGAGAGAATT TTATATTTCA TAGAATTATT GTTAAAATTT ATAGTAAATT TCCCATTTTA AAAATATGCA AAAATAAATC AATATTAATT TCACTCTTAT CAATTAAATT  TCCAAAAATT TATGTGCTAG CCAATCTTAT CAATTAAATT TCCAAAAATT TATGTGCTAG CCAATCTAAG TAGTGACTAA GTCAGTAGAA CCATTTCATT ATATTATAAT GAGTGCTGAG  GATGTAGTTC ATTAATCTTT AGGTGAAAAA AATTAATACT TCTATTCCAA TAAAATATAA AAATACCAAT TTTACTTTTA CTTATATTTT TAAATGCAAT TTAGCCTTAT TATTATTGTA  CTTGTTAATT ATGATCTGAT TACAATGTGG CAAAAAATAC TCAGCAAGCT ATAGGGTATT AATTGGGCCA CCCTATATGC CCATAGTTGG ATTTTACCAA AGCCAAAATG GAAGGATGGG  CATATACAGC TGCAGCCGAA TTAATACCCT ATAACATGTT ATTTATTTAT TTTCAGCCTT ACAATGTCAC TGATTTTGTA ATGGGAGGCT CCTTATACAT AATTGGATTT TATCAAAATC  AAAATAGAAT GATGAGCATA TACAGCCGCC ACCCAATTAA TACCATTATT TATTTTTAAC CTTACAATGT CACTGATTTG ATTTTGTGGC GCGTGTAAAG TCGGGAGGCC CCATGTACGC  TGTGCCCAAG GGACGAAAGG ACGGAAGCAG ATCCAGAATA GAAGATACCA GGAACTTGCC CTTTGCCACT TTCAACGTTT CTCAACTTAT AAAAACCTTC GCACAGCACG GCTTGTCTTC  CCAAGAAATG GTCGTTCTAT CAGGTTATAT ATATATATAT ATATCAAGTT CAAGATTATA TTCACAGTGA TTTCTATTGC AGATTAAATT TAAATTATTC AGAGCAAGTA TTAATTTCAG  AATTTTGAGT TTGAGGTTGA TGTTAATGTT GTGCAGGAGG GCATACACTG GGTGTATCAC GGTGCTCTTC ATTCAAAAAC CGGCTGATCC ACTTCGATTC CACGCACGAC GTGGACCCAT  CCATCAACCC CCAATTCTTG GCGACCCTGA AAAGGACATG CATCAAGTCG AGCAGCAGCA ATGACTTCGA CGACAATGCC AACGTGGCAT TCGACACCAC CAAGTCTGTG TTCGACAATG  TGTATTTCTC GATGCTGCAA TCTGGAGCAG GATTGCTGAC GTCGGATGAC ACGTTGATGT CGAGCCCTAG AACGAGAGCC CTGGTGAACA CTTATGCCAT GAATCAGGCT ACCTTCTTCT 
TCGACTTCTC GCAGGCCATG GTCAGGATGG GACTCGTCGA AGTCAAGGAG GACGATGAGG GTGATATTCG TCTGAATTGT CGCAGATTAA ACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCCA GGGATCTGCT GTTTACAGTC CTGATCTTAA TTGGTGCCCA TGTTGGTGAG GGTTTAAGCT TAGATTATTA TGCTTTTACA TGCCCTTTTG CAGAAGCTAT TATTGGGGAT  ACTGTCAACC GCGCTGTGCA ACGAGATATT ACCATTTCAG CAGCACTTCT TAGAATGCAT TTTCATGACT GCTTCGTAGA GGGATGCGAT GGATCTATTC TCATAGATTC CACTAGTGAT  AATAAGGCTG AAAAAGACTC TCCCGCCAAT CTGAGCTTGC GTGGGTTCGA GGTAATCGAC GAGGCAAAAG CAAGAATTGA AGATAGCTGC CCTGGTGTTG TGTCTTGTGC TGACATTATT  GCAATAGCAG CTCGAGATGC AGTTGTCATG TCGGGAGGCC CCATGTACGC TGTGCCCAAG GGACGAAAGG ACGGAAGCAG ATCCAGAATA GAAGATACCA GGAACTTGCC CTTTGCCACT  TTCAACGTTT CTCAACTTAT AAAAACCTTC GCACAGCACG GCTTGTCTTC CCAAGAAATG GTCGTTCTAT CAGGAGGGCA TACACTGGGT GTATCACGGT GCTCTTCATT CAAAAACCGG  CTGATCCACT TCGATTCCAC GCACGACGTG GACCCATCCA TCAACCCCCA ATTCTTGGCG ACCCTGAAAA GGACATGCAT CAAGTCGAGC AGCAGCAATG ACTTCGACGA CAATGCCAAC  GTGGCATTCG ACACCACCAA GTCTGTGTTC GACAATGTGT ATTTCTCGAT GCTGCAATCT GGAGCAGGAT TGCTGACGTC GGATGACACG TTGATGTCGA GCCCTAGAAC GAGAGCCCTG  GTGAACACTT ATGCCATGAA TCAGGCTACC TTCTTCTTCG ACTTCTCGCA GGCCATGGTC AGGATGGGAC TCGTCGAAGT CAAGGAGGAC GATGAGGGTG ATATTCGTCT GAATTGTCGC 
AGATTAAACT AA 

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