Entry information : PtaPrx29(PTA00033861)
Entry ID 2074
Creation 2007-09-04 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-09-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx29(PTA00033861)
Name PtaPrx29(PTA00033861)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx017]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx29
start..stop
S start..stop
WnoPrx03 491 7e-177 11..328 6..322
GbPrx16 468 7e-168 11..328 6..323
GbPrx26 443 5e-158 1..328 3..327
AtrPrx53 419 2e-148 17..328 10..321
Literature and cross-references PtaPrx29(PTA00033861)
Literature Pratt,L. et al., An EST database from well-watered loblolly pine (Pinus taeda) roots, unpublished.
EST ref. GenBank:   CO165622 [3' end]   CF402571.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.12617
Protein sequence: PtaPrx29(PTA00033861)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328
PWM (Da):   %s   34607.01  
PI (pH):   %s   4.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGTSRFGIIE LGVVISIGLV LGSNLSEGNL QTGFYSSSCP TAESVVRSTV QQSVQADPTL AAGLLRLHYH DCFVQGCDGS ILITGPNAEQ TAPGHSGLRG FDVIENAKKQ LERICPRVVS  CADIVALAAR DAVALSNGPN YDVPTGRRDG MRSFAGDASN MPDPTDSVDV LKRKFAAKGL SASDLVVLNG AHTIGTTACF FIEDRLYDFA GAGDADPSMN PGYLTELRSI CPQGGDVNAR 
VALDRGSEFQ FDNEFLENVR EGNGALQSDA SMYQDSSTRG YIDSYFGLLG GLLGPSFESD FADAIVKMGQ VDVKTGSNGK IRSVCSVL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 17 ESTs (.5' is missing).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAACAA GTAGGTTTGG GATTATAGAG CTTGGGGTCG TGATTAGTAT TGGCTTGGTC TTGGGTTCGA ATCTCAGTGA GGGTAACTTA CAAACGGGAT TTTACTCTTC GAGTTGTCCC  ACAGCAGAGT CCGTAGTGCG CTCGACAGTG CAACAGAGCG TCCAAGCCGA TCCAACTCTT GCAGCAGGGC TTTTGCGTTT ACACTATCAT GACTGTTTCG TCCAGGTATC CCCATTTGCT  GTTAATTATA TATACTTATA CTTGTTTTGT GAAAGACAAC ATTTTGGGGC ATTTCCAAAA AAAAAAATCG AACTTCCCCG GAATTGATCA CGCTACCTGT CGTGACAATT TATGCCTTAA  ATGGTACTAC TGGGCTTAAT GTGTTTGGGT GTTTTATTTA AACATTTCAG GGCTGCGATG GATCAATCCT TATTACCGGG CCCAATGCTG AACAGACGGC GCCAGGCCAT TCCGGATTGC  GGGGCTTTGA TGTCATAGAA AATGCCAAGA AACAGCTCGA AAGAATCTGT CCGAGAGTCG TTTCCTGTGC TGACATCGTT GCATTGGCAG CCAGAGATGC CGTGGCACTG GTACTTTAAA  GCCCTGAATC TCTCTCATCA TATTTCTGTA CCTTTGGCAG GCACATTGCA TTTAACACAG TAATTATCTG GTGAAAAAAT TGTTAGAGTA ATGGACCCAA TTATGATGTA CCCACTGGAC  GAAGAGATGG AATGAGATCC TTTGCAGGGG ATGCTTCGAA CATGCCAGAC CCTACGGATT CAGTCGATGT ACTCAAACGC AAATTTGCTG CAAAGGGTTT ATCTGCATCA GATCTTGTTG  TTCTCAATGG TAGGTCCATA TCATCATGCC ATTCAGCTAA ATAGATTAAT GGCTAAACAG CCGCCAGATC TGTTATACAT TTCGTAAAAT GTGCTTTAGA TTGTTAGCAT AATAACGATT  ATATATTTAA TAAAATGGAA GTAAAAAATT ATGTTAGGTG CATATCTTTT ATGATATATA GGGCAGAGTG ATCCTCAATC AGAGGACTGT TAAAAGTGGT TGGAATCAAT TTTTTTTTAT  AGATGTAGGT TTTGAAGGGT GGAAATGGAT TCAGCACCAA AATTTTTTAG AGCATCTAAA ATTATAAAGT TCAATAGTTT TTACTTGGAT TTACAAAAAT CCCTACCAGA TTTTTTAAAA  TATGAGTTAA ATTTCTATAA CTTTCAAAGA AAAAAACATA ATTGTTAGAC TACAGCAATA CTATCCGCCC TGAATCTTGA AAGACAACTA TCTGTTCCTT CAAGATTTTG GGTTTTGGGT  CTGACCAGTA AGGCTAGGGT ATGGGGTGAC AGACAGGTTT GAACTGTTCC AGTATGTGTT ACCCGTCACT TCAAGGTTTT GGGTTTTGGG TCTGACCAGT GAGGCTAGGG TATGGGGTGA  CAGACAGGTT TGAACTGTTC CAGTATGTGT TACCTGTCAC TTTGAGGTCG TGGGCAGAAT TACCTTGTGT GGAAAGCTAT AATTCACACA AATCTATAAG TACCCAGCAA TACTGCATTT  GTTGCAGGTT TTAAGTAACA GGTACTGCAG GTTGGAACAA TTCTTTAAGC TTATGGGTAT AGAACAATAG CAGGATTTTG GTAGGCAGAT TGAAAAGTTA TCCACCGTGC AAATTCTGGT  CAAATTGTGA TCACTTCAAG GTTTTGGGCA GAATTTCCTT ATGTGGAAGT TAGTCAAACA ATAGATAAGC TCCAAAACAA TGCTGTATTG ATCGCAATGC ACACTGATAT ATATATTGGT  CCTAGTCTGA GATGCTTCAT ATATTATGGT GGTGCGTATT CTGGTGTATA TTGCATTTAA TGCAACATTG TTGGATCTAT GTAGTTTACG TATAATCCAC TTGTATAATC TAAAGCTGAA  AATAACCGAA AAGTTGTTGG AATCTAGGTA AAATAATTTA ATAAATTTGG TATAAACAAT GTTTAAATCA TGTTTTTATA GTGGAAATAG TGGAAATAGA TTTAGCCTTA TCAAAAACTT  GTGTAGCATC TTAAATCTTG AAGTTTGGCA GCTCTATCTT ATATCTTAAA TTTACAAAAA TCTTTGCAAA AATTTATCAA AATATTGCTA AAATTCCCAT GATTTTCCGG GCAAAAAAAC  AGTCAGTACT ATGGCTTGGC CTACCAATGG GCATGGGCTG TATATGCACA CTGTTGGATT TTGACAGGCC AGTAATCCAA AAATAAACAT ATACAAACCC CACTCATCTA CCTTTATTGT  CAGGGTTGAC TTTTTTTTGC TTACATCAAT ATTCTATCTA TCTGTATTTT TCAACCATTT AATTTATATA ATTAAATTAA TTATTTATTG ATATTTCAAA TAACATAAAT TTAATTTTTT  ACTTATATCA ATATTCTACC CATATATGTT TATCCACCAT TTAATTTTTA TAATTAAATT AATTATTTAT TGATATTTTA AATAGCCTAA ACTTACTAAA CAAGCTAGCA TGCGATGGCT  CTCATGCAAG AAGAAATGCT CTCAGATTCA TTCTTGATAT TCTTGATTAT CTCGGTGGAT GAGAGTTTAG CTTGAATGAC TATTTCCTTA GTTTCTCTTT CCATGTTTGA TTTCACACTG  ATGACTCTTC CATTTTCTTT AATTTGTTTA TTATTATTAG GATATTTTAA GATTTAACTG TGTTTATATT AATATTTTTG AATGTTAAAT ATTTAGAGTA AACATTACAC CCATCCTTAT  AAAGAATTTC ACCTACTTCC TTCTACCGGA TGAGGGTGGA AGAATCGGTG GATCTTCCAG ATGAAAAATT AGATATTCAA AAACATGAAA ACAATTCTGA CAAAAATTAA AAAAAAATCT  GACAATATGA TAGATTACGA AAATGAAATA TGTAAGCTCT GACAGGTTAG ATTATGTAAA GCGATTCTAT ACTTTGATTC CTCGATAGTT ATCGTTTATA GATTTGTTGT GGTACCAAAT  TGATACAGTA AACCACATTA AGAACAAAAA AAAAAAATCT ACATGCTCTG AAGGTTTATT ATTATTTTAC CGAAATCTTA ACAGGCTAAT GGATTACAAA TATGAACAGA ATGTAGTGTT  TTTTTACCTG GCAGGAGCAC ACACGATCGG AACGACTGCA TGTTTCTTCA TCGAGGACCG TCTGTACGAC TTCGCAGGCG CTGGCGACGC AGACCCCTCT ATGAATCCTG GATACTTGAC  GGAACTGAGG TCAATTTGCC CCCAGGGCGG TGATGTTAAT GCGAGGGTGG CTCTGGACAG GGGTTCCGAA TTCCAATTTG ACAACGAATT CCTAGAAAAC GTGAGGGAGG GCAACGGAGC  GCTACAATCT GATGCGAGCA TGTACCAAGA CAGTTCCACC CGCGGCTACA TCGACTCCTA TTTTGGGCTC CTCGGTGGCC TTCTGGGGCC TTCGTTTGAA TCCGACTTTG CAGATGCAAT 
TGTAAAGATG GGGCAGGTCG ACGTCAAAAC CGGTTCCAAT GGAAAGATTC GTAGCGTCTG TTCAGTCCTA TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAACAA GTAGGTTTGG GATTATAGAG CTTGGGGTCG TGATTAGTAT TGGCTTGGTC TTGGGTTCGA ATCTCAGTGA GGGTAACTTA CAAACGGGAT TTTACTCTTC GAGTTGTCCC  ACAGCAGAGT CCGTAGTGCG CTCGACAGTG CAACAGAGCG TCCAAGCCGA TCCAACTCTT GCAGCAGGGC TTTTGCGTTT ACACTATCAT GACTGTTTCG TCCAGGGCTG CGATGGATCA  ATCCTTATTA CCGGGCCCAA TGCTGAACAG ACGGCGCCAG GCCATTCCGG ATTGCGGGGC TTTGATGTCA TAGAAAATGC CAAGAAACAG CTCGAAAGAA TCTGTCCGAG AGTCGTTTCC  TGTGCTGACA TCGTTGCATT GGCAGCCAGA GATGCCGTGG CACTGAGTAA TGGACCCAAT TATGATGTAC CCACTGGACG AAGAGATGGA ATGAGATCCT TTGCAGGGGA TGCTTCGAAC  ATGCCAGACC CTACGGATTC AGTCGATGTA CTCAAACGCA AATTTGCTGC AAAGGGTTTA TCTGCATCAG ATCTTGTTGT TCTCAATGGA GCACACACGA TCGGAACGAC TGCATGTTTC  TTCATCGAGG ACCGTCTGTA CGACTTCGCA GGCGCTGGCG ACGCAGACCC CTCTATGAAT CCTGGATACT TGACGGAACT GAGGTCAATT TGCCCCCAGG GCGGTGATGT TAATGCGAGG  GTGGCTCTGG ACAGGGGTTC CGAATTCCAA TTTGACAACG AATTCCTAGA AAACGTGAGG GAGGGCAACG GAGCGCTACA ATCTGATGCG AGCATGTACC AAGACAGTTC CACCCGCGGC  TACATCGACT CCTATTTTGG GCTCCTCGGT GGCCTTCTGG GGCCTTCGTT TGAATCCGAC TTTGCAGATG CAATTGTAAA GATGGGGCAG GTCGACGTCA AAACCGGTTC CAATGGAAAG 
ATTCGTAGCG TCTGTTCAGT CCTATAA 

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