Entry information : PtaPrx41(PTA00032778)
Entry ID 2102
Creation 2007-09-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-09-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx41(PTA00032778)
Name PtaPrx41(PTA00032778)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Xylem
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx41
start..stop
S start..stop
PabPrx64 641 0 1..331 1..331
CmichPrx14 545 0 29..331 41..343
CruPrx08 527 0 29..331 37..339
GbPrx13 518 0 29..331 25..327
Literature and cross-references PtaPrx41(PTA00032778)
Literature Sederoff,R., Molecular Basis of Wood Formation in the Pine Megagenome, unpublished.
EST ref. GenBank:   DR070964 [5' end]   DR070887 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.11334
Protein sequence: PtaPrx41(PTA00032778)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (309)
PWM (Da):   %s   36001.1 (33809.0)  
PI (pH):   %s   8.2 (8.31) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-331
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSPSANCSV VAVAVLFLLC SALRIECEQL SVDYYQKTCP QVENIVRAEM IRKQAANPTT AAGTLRLFFH DCFVEGCDAS VLISSTPDNK AEKDAEINLS LPGDGFDAIA RAKTAIEAKC  PGIVSCADIL SMATRDLISL IGGPYYPVKK GRKDGRISKS WRVAGNLPLP SMNVDSLTSL FGSKGLTEAE MITLSGAHTV GFTHCKEFLH RIYTYNRTTH IDPTMNFQYA MGLRRACPRT 
NLDPTIAVFN DVNSPKTFDN GFYRNLPQGL GLLASDQILY TDPRSRVLAQ RYASDQATFF SAFVAAMDKL GSVGVKTGTQ GEVRRRCDAF N 

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Remarks Complete sequence from genomic and 18 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGCAGCC CAAGTGCGAA CTGTTCAGTC GTTGCAGTGG CGGTTCTGTT CTTATTGTGC TCAGCCTTGA GAATCGAATG TGAGCAGCTC TCGGTGGACT ACTACCAGAA AACATGTCCA  CAGGTGGAGA ACATCGTTCG AGCGGAAATG ATACGAAAAC AGGCTGCCAA TCCCACCACT GCTGCAGGAA CATTGCGCCT CTTCTTTCAC GATTGTTTTG TAGAGGTAAA TATCATATTT  ACTGATTATG GAGGAGTGTA TAAATTAAAT TTTTAAACAT AAATTTTTTC AAACATTTAT CGTCTTTTTC GAAACCACTG AATATTTATC TGAATATCTT TATTTTGTAG CTTTCTATAA  TGAAAATTTT CCCCTAATTT TGTTTTTTCT CTTTTTTTGT TTCCTTAGTG TAATGTTTTT TTCCTAGTGC AATGTATGAA AAACATAACC CATCATAACC CGATAAGTGT TCTATTAGAG  AATCTCGACT CCAGTTTTAG GTGATCTCCA GATGTCCCTT ACTAAGCTGA ACTATAAATT CCTGATATAT GTAAGTTGCA AAATCTTGCA GAAAAAGTTG CTAATCCTCA TCATTTAGAA  AAAAACAAGG ATGACAATGG ACTGATATCA TTTGCAGGGC TGCGATGCTT CAGTGCTCAT CAGCTCCACG CCCGATAACA AGGCGGAGAA AGACGCAGAA ATAAATCTGT CATTGCCTGG  CGATGGCTTC GATGCCATTG CTCGAGCAAA GACTGCCATT GAAGCCAAAT GTCCAGGCAT TGTTTCCTGC GCGGATATAC TATCCATGGC AACTAGAGAT CTTATATCAC TTGTAAGATA  ATGCAAATTG TACAAGCTTT CTGCAATTTT TTAACTTTAT TTTGATGATG GGATAATCGA ATCAATCTTT GAGGAACATC CGTCTTGAAT CAGTTATATG ATAAATTCAA ATGCTTCTGT  TCTGAAAAAT TATTATCAGA TAAAATCATT CGTTTGAATG GACTTGCAGA TAGGTGGGCC TTACTATCCC GTTAAGAAGG GGCGGAAAGA TGGGCGGATC TCGAAGTCAT GGAGAGTAGC  AGGGAACCTG CCACTGCCAT CCATGAATGT GGACAGTCTC ACATCTCTCT TTGGCTCTAA AGGCCTAACT GAGGCAGAAA TGATCACTCT CTCTGGTACG GTCACTTACT TTAACATCTG  TGGAGGGAGA TAATATTCTA GGGGAACGGT TTGGGCGATT GGGTGGATGG CTTGTTTTTG TTTAATTTCG ATAGATATAT TTTCGGGTTG TGTGAAATTC TACTTGGAAT CCAGCTGTAA  CCAGAATTTT CAAATTTTCC TGTTGGATTT TTCCAAAATT TTATGGAAAT TTCCATGGTT TTCTGGATGA AATTGTGGTC TGGTAACCCT ACAACTATAT TTCGTTTTGT TTAATTTCCA  CAAATAACCT ATTAACTTGT AATACTATAA TCACAATGTA TTAGTATATC TAATTTGCGA AAATGGTTAT ATATACTTCT TAAGTTACAG TGGCAGCCTA ACCTAGATCA CACTGTATTT  GTATTTTTAT GTTTAGTGAT ACATTTAATT TACAAAATAT GAGTATTCTT CTATTTAACT TATTAACAAT TTACATTAAA AATATATATG ATATTATTAA ATTTAAACTT CTGTAATTTA  TATTTGGACT ATTAAAAGTA AACATTACAT TATATTTATT GAGTCTATTT TTTAGAACCA CTCAACCAAA ATGTCAAGAC AAAAAACCAG ATATTAAGTC TATTCTTTTA GAACCAGTTA  ACAAAGATGT CCAAACAAAA AACCAACTTG AGATATTGCT ATATTTGACT TACAAGTTAT TAGATATATT TTTGGATATA ATTCTGACCT GACCCTAACC TACCTTAATA ATGGAATAAG  TATTTTTGTT TGAGAGTCCT GAGAATGTGG TGCAACTGTT AGTGGGAAGT TAATAAGTAT TTTTGTTTGG GAGTCCTGCG AATGTGGAGC AACCGTTAGT GGGGAGGTTT GGTCACGAGA  AATCTCCTCT CTTCTTTTCA TTGTTTAATA AATAGTGTCT ATTAATTTGT GCAGGAGCCC ACACAGTGGG ATTCACCCAC TGCAAGGAGT TCCTGCACCG CATATACACC TACAACAGGA  CCACTCACAT CGATCCGACC ATGAATTTCC AGTACGCAAT GGGTTTGAGA AGAGCATGCC CTCGCACAAA TCTAGACCCC ACCATTGCCG TCTTCAACGA TGTTAATTCT CCCAAGACAT  TTGACAATGG CTTCTACAGA AACTTGCCAC AGGGTTTGGG TTTGCTTGCC TCGGATCAGA TACTTTACAC GGATCCCCGT TCCAGGGTTC TTGCCCAACG CTATGCATCT GACCAGGCAA 
CTTTCTTCAG TGCATTTGTG GCGGCCATGG ATAAATTGGG CAGTGTGGGT GTTAAGACTG GCACACAGGG GGAGGTGAGG AGGAGATGTG ATGCGTTCAA TTGA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGCAGCC CAAGTGCGAA CTGTTCAGTC GTTGCAGTGG CGGTTCTGTT CTTATTGTGC TCAGCCTTGA GAATCGAATG TGAGCAGCTC TCGGTGGACT ACTACCAGAA AACATGTCCA  CAGGTGGAGA ACATCGTTCG AGCGGAAATG ATACGAAAAC AGGCTGCCAA TCCCACCACT GCTGCAGGAA CATTGCGCCT CTTCTTTCAC GATTGTTTTG TAGAGGGCTG CGATGCTTCA  GTGCTCATCA GCTCCACGCC CGATAACAAG GCGGAGAAAG ACGCAGAAAT AAATCTGTCA TTGCCTGGCG ATGGCTTCGA TGCCATTGCT CGAGCAAAGA CTGCCATTGA AGCCAAATGT  CCAGGCATTG TTTCCTGCGC GGATATACTA TCCATGGCAA CTAGAGATCT TATATCACTT ATAGGTGGGC CTTACTATCC CGTTAAGAAG GGGCGGAAAG ATGGGCGGAT CTCGAAGTCA  TGGAGAGTAG CAGGGAACCT GCCACTGCCA TCCATGAATG TGGACAGTCT CACATCTCTC TTTGGCTCTA AAGGCCTAAC TGAGGCAGAA ATGATCACTC TCTCTGGAGC CCACACAGTG  GGATTCACCC ACTGCAAGGA GTTCCTGCAC CGCATATACA CCTACAACAG GACCACTCAC ATCGATCCGA CCATGAATTT CCAGTACGCA ATGGGTTTGA GAAGAGCATG CCCTCGCACA  AATCTAGACC CCACCATTGC CGTCTTCAAC GATGTTAATT CTCCCAAGAC ATTTGACAAT GGCTTCTACA GAAACTTGCC ACAGGGTTTG GGTTTGCTTG CCTCGGATCA GATACTTTAC  ACGGATCCCC GTTCCAGGGT TCTTGCCCAA CGCTATGCAT CTGACCAGGC AACTTTCTTC AGTGCATTTG TGGCGGCCAT GGATAAATTG GGCAGTGTGG GTGTTAAGAC TGGCACACAG 
GGGGAGGTGA GGAGGAGATG TGATGCGTTC AATTGA 

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