Entry information : PtaPrx43(PTA00082981)
Entry ID 2103
Creation 2007-09-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-09-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx43(PTA00082981)
Name PtaPrx43(PTA00082981)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx43
start..stop
S start..stop
PabPrx125 583 0 1..318 1..318
PabPrx79 566 0 1..318 1..318
PtaPrx64 563 0 1..318 1..318
PtaPrx65 560 0 1..318 1..318
Literature and cross-references PtaPrx43(PTA00082981)
Literature Whetten,R.W. et al., The Pine Gene Discovery Project, unpublished.
EST ref. GenBank:   DR098772 [5' end]   DR094440 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.1426
Protein sequence: PtaPrx43(PTA00082981)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318 (294)
PWM (Da):   %s   33812.68 (31277.6)  
PI (pH):   %s   8.14 (8.73) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-318
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFTAMRSL AFTALLMCST VAYAQLSATF YNTSCPKLLS TVQAAVKQAV ANEKRMGASL LRLHFHDCFV NGCDGSVLLD DSSTLTGEKT AVPNNNSARG FDVIDTIKSQ VEAVCSGVVS  CADILAIAAR DSVVELGGPT WTVQLGRRDS RSASLSGANN NIPPPTSNLS ALISLFQAQG LSTKDMVVLA GAHTIGQARC TSFRARIYNE SNINAAYATS LKTNCPSTGS DNNLSPLDLV 
TPTTFDINYY SNLRSQKGLL HSDQQLYNGG STDSMITTYS NNKNTFFSDF PTSMINMGNI NPLTGTSGEI RKNCRKPN 

Retrieve as FASTA  
Remarks complete sequence from genomic (incorrect prediction, PTA00082981 contains 3 ORFs) and 4 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCGT TTACAGCAAT GCGATCTCTG GCCTTTACCG CCTTGTTGAT GTGTTCGACC GTTGCGTACG CGCAGCTTAG CGCAACGTTT TATAATACAT CATGTCCCAA ACTACTCTCA  ACGGTGCAGG CCGCGGTGAA GCAAGCGGTG GCCAACGAGA AGCGCATGGG GGCATCGCTC CTCCGCCTTC ACTTTCACGA CTGCTTCGTT AATGTAATCT AATCTTTTTC TTTCTTCGTT  CCTCGTCTTA AAATACATTC GCTGTATTTT CCAGACCGGT AGAATTGGAT TTCTTTATTT ACGTGATTAT GAAAAACAAG AGTGCTTTTG CAGGGTTGCG ATGGGTCTGT GCTGCTGGAT  GACTCTTCGA CTCTAACTGG AGAAAAGACC GCCGTTCCCA ACAACAATTC GGCAAGGGGT TTCGATGTGA TAGACACCAT CAAGTCTCAA GTGGAAGCAG TTTGCAGTGG AGTTGTGTCG  TGCGCAGACA TTTTGGCTAT TGCTGCTAGA GATTCTGTTG TCGAGGTAAT TAGTTACTCA AATATTAAGC ATTATGTACT AGGCTACTCT TTGGTTGTTG CAATTAAGCC AATACTAAGC  ACTATGTATT AAGCAATTGA TTCTCTCAGT ATTTAAGCTA TTGATTCTCT CAGTGTTTAG GTGATTGGTT ACCTAAATAT TAAGCTCTAT ATAGTGATTT TTTTGTGTTT GTTTTTTTAT  GATGTTAGTT AAATGAAAAT AAAATAATAT TCAGTAAATG AAATAGAAAA ATATCGAACC AATCATTAAC TTAATGTATG ATGTTTAGTA CTCTTCACCA TTGAGTTTGT TTCGATGTCT  GATTTGCGAA TGATTTGCTA ATAATTCGGC AATCAGATAA ACATAATCAC GGTCAATTAT TTGTCTAATT GCTTAATATT CAACAAATCA ACAATAAAGA TAAAAATGCT CATTTTTCAC  TCAAGTTATA CAATATTTTA ACATCATTTT TTAAGCAATA AAAAACTTAG GCCCAATCAA TTATTTAACC ATACCCATAT CCTTTTAATT GCTTAACATT CCGCAAATCA ACAATAAAAA  TAAAAATACT CCGTTTTCAT TACAATTATA CATTTTTTAA ACATCATTCA TATTTATATC CATGATATTC ATCATCTAAT TAAGTGTTCC CTACTTTATC ATTCATATAA ACATATTGAT  ATGCGTATTG AATTTATTTA TCTAGATATC CTATTTGGTG ATCGATTTTC TATATATATG GATTTTTCTA TAAATGGTAG ATTTTGATAT ACAATACATT TATCATTCAT ATAAACATAT  TCATATGCAT ATTGAAATTA TTTATCTAGG TATCCTATTT GGTGATCAAT TTTCTATATA TGGATTTTTC CATATACAAA TTGTAGATTT TGATATACAA TACATTTAGT TAAATTCGCT  TCACTTCTAT TTATCAAATT TCAAACTATT ACTCGAATAT ATAGTGAAAT TAAATTCATA AAGATAGAAA TCGATAATCA AATTAATTCA ATAACACGGC ATTGACAATA TTTTTGTCTT  TTTTGTTGAT CGCAGTTGGG AGGCCCAACA TGGACAGTGC AGCTTGGGAG GAGAGACTCC AGGAGTGCCA GCCTAAGTGG TGCAAACAAC AACATTCCGC CTCCTACTTC TAATCTCAGT  GCTCTCATCT CATTATTTCA AGCTCAGGGT CTTTCCACGA AGGACATGGT TGTCCTAGCA GGTATAGAAT ATTTATACTG TGAATCACAA TCAATATTAA AAAATATCAT GGAGAATTAA  TACGATAACC CGCCATTTGA TCTGAAGATT TTTTCTCTGG TATTTAATTA GGTGCGCACA CCATAGGCCA AGCGCGGTGC ACAAGCTTCA GGGCCCGCAT CTACAATGAA TCCAACATTA  ACGCAGCATA CGCAACTTCC CTGAAGACAA ACTGTCCGAG TACAGGAAGC GACAACAACC TGTCACCATT GGATCTTGTT ACTCCCACCA CGTTTGACAT CAACTACTAC TCAAATCTGA  GAAGCCAAAA GGGACTTCTC CACTCCGACC AGCAGCTGTA TAACGGAGGT TCTACAGACT CCATGATTAC TACCTACAGT AATAACAAGA ACACCTTCTT TTCGGACTTC CCCACGTCCA  TGATTAATAT GGGAAACATT AATCCTCTCA CCGGTACAAG CGGAGAGATT CGCAAGAACT GTAGGAAGCC TAATTAACGT GTATGGCAGA CTCAGTCTGC GTGAAGACTC CGACATAGTT  CCTCCTTTTA GGTTTCGTTG TGGCCTAGCA ACATATATTA TATTATCTTG TGTGCCCGTG GTCCTTTTTT TAACCACTGT TTTATAATAG AAATGTTCAA TTTCATTCAG AATTGAATAA  TATAATTTCA TTTATAATTA TAATATTGAT GTGGATGTTT CATTAGGACA GCAAAACCAT ATGATATAGA GTCGTTGATT TTATTTTTAT TTTTTATTAA CATGGTAGTG CTTTTTAATA  GAAATGTGTA TATGTATGTA TTAAAATTnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnTC CAATATGCAA CAAGAAAGGA TGGTAATCTC TCCTCACAAG TTAACAATGG AAGTCCTAAT TCCAGCAGCA  TCTACCCTTT GGAATGTTCA GCTTTCAACC TCCCCTCCTC TGGCCCAAGG CCTGTATTTG TAGCGTTCTA GAGGAAGTTA TTCAGTTCCA ACATCAATGG GATACTTCCT CTTTTGGATG  GGGTAGCTCC TCTCTTGATG GGATAAGTTC CTCTATCATA GGGATGCATG AACCATCTGG AGGCGCTCAA TACACATCAA ACACTCTTCT AGAAGGCTCT AGAAGTGACC ACAAGTAACT  TTTTAAAGAT GAAACTCACG CCTTTTGACC TTTCCAGGGG TACGCACCCA TCCTTTGGCT TACATAGTGT ACAAGTATGC ACGTACAGTG TGTTTGGGAT GCGTACATGC CGGCAAGGTA  GAGAGAACCT ACGTACCCAG AGATAAACAT GTTTTTAAGT GACTTTCTCT CTTTTTGAAG TTTGACATGA AGAGCAGAGG TATGAGGCTT GACAAGGAGG ATAATATGAC TATTGATGGA  GCCATATTAA CTGCAGATAG TCATGGTAAA AAATTTCAGT GTAACACCGT GAATATGGAC ATTTATTCAA GGAATGCCGA CTGAACCTTG AGGAGGTGGA GAAAAAGGAC AAGCAACAGA  AGAACCCACA AGATGGCAAG GAAGGGTTCC AAGAATTTCA AACCAAGAGG AGCCAATTGA AGGAACCCCA TAATCTAGAA AAATAACACT AAGCCCAGTT GAGTAGTAAA AACAGATTTG  AATTATTCCA AGTGGAAGAA GAAGCAGAAA ACGGGACCCA ACCCATGGAT TATCAGGAAA AAGGAAAAGA GAGAAGCTCT AGTCAAGCAA AACCAACACC CAAGTGGGAA GCCCAAAGAG  AACTCACAAA GAAATAAGAC AAAGAAGAAC AAGTAGGGAT GGAAACCATC AGAACGGAAG TCAACCCAAG CAAGGGGGAG GAGTTTAGTA TGGAAAAAGT AATCTTGAAG AAATTTTTGA  ATGAATGGAG ACACCTAGAT GAAACATTCA TTTCAGAAGA CAAAAAGAGA CTATACAGAG AGACTTTTCA ACAATATCAA GCCAAGCAAG GACAGGGATA TTTTGAGATT GCGGAACAAT  TGGGGATGCA CTAGGAAAAC TCCCATGAGT ATCAAATTGA AGCAAAAAGG GGGAAGAAAA TGGGTGGGAG AAACCTACAG GAATCAATAC AAATAATGGG AGAAGTGTTG GTGAACACCA  GAAGGGTGGT ACTATTGTCA ACGATATACC AACAACTAAA TAAAGTTTCC CAATGATAGT AATATCTTGG AACATAACAG GCCTAAATAG CAGAGGAAAA TAGAGATACT TAGTTGAGCG 
ACTAAGAAAA GAGAAGCCAC AACTCATGCT TCTTCAAGAA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCGT TTACAGCAAT GCGATCTCTG GCCTTTACCG CCTTGTTGAT GTGTTCGACC GTTGCGTACG CGCAGCTTAG CGCAACGTTT TATAATACAT CATGTCCCAA ACTACTCTCA  ACGGTGCAGG CCGCGGTGAA GCAAGCGGTG GCCAACGAGA AGCGCATGGG GGCATCGCTC CTCCGCCTTC ACTTTCACGA CTGCTTCGTT AATGGTTGCG ATGGGTCTGT GCTGCTGGAT  GACTCTTCGA CTCTAACTGG AGAAAAGACC GCCGTTCCCA ACAACAATTC GGCAAGGGGT TTCGATGTGA TAGACACCAT CAAGTCTCAA GTGGAAGCAG TTTGCAGTGG AGTTGTGTCG  TGCGCAGACA TTTTGGCTAT TGCTGCTAGA GATTCTGTTG TCGAGTTGGG AGGCCCAACA TGGACAGTGC AGCTTGGGAG GAGAGACTCC AGGAGTGCCA GCCTAAGTGG TGCAAACAAC  AACATTCCGC CTCCTACTTC TAATCTCAGT GCTCTCATCT CATTATTTCA AGCTCAGGGT CTTTCCACGA AGGACATGGT TGTCCTAGCA GGTGCGCACA CCATAGGCCA AGCGCGGTGC  ACAAGCTTCA GGGCCCGCAT CTACAATGAA TCCAACATTA ACGCAGCATA CGCAACTTCC CTGAAGACAA ACTGTCCGAG TACAGGAAGC GACAACAACC TGTCACCATT GGATCTTGTT  ACTCCCACCA CGTTTGACAT CAACTACTAC TCAAATCTGA GAAGCCAAAA GGGACTTCTC CACTCCGACC AGCAGCTGTA TAACGGAGGT TCTACAGACT CCATGATTAC TACCTACAGT 
AATAACAAGA ACACCTTCTT TTCGGACTTC CCCACGTCCA TGATTAATAT GGGAAACATT AATCCTCTCA CCGGTACAAG CGGAGAGATT CGCAAGAACT GTAGGAAGCC TAATTAA 

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