1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : PtaPrx49(PTA00045480)
Entry ID 2111
Creation 2005-08-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2005-08-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx49(PTA00045480)
Name PtaPrx49(PTA00045480)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx027]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Xylem
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx49
start..stop		 S start..stop
PtaPrx11 585 0 1..326 1..326
PtaPrx51 561 0 1..327 1..327
PabPrx152 544 0 1..326 1..326
PtaPrx09 541 0 1..326 1..324
Literature and cross-references PtaPrx49(PTA00045480)
Literature Sederoff,R., Molecular Basis of Wood Formation in the Pine Megagenome, unpublished
Protein sequence: PtaPrx49(PTA00045480)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (302)
PWM (Da):   %s   35089.59 (32311.1) Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   7.03 (6.84) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKTITVRDLF IAVASLWVFL CVSADAGEGL APNFYNNTCP GVYNAVENVV GEYISKHPTM NGPLLRLHFH DCFVRGCDGS VLLNSTNSTK AEKDASPNQT LRGFQIIDTA KAAVEKLCPG  VVSCADILAL VARDAVHLSG GPFWNVPTGR RDGVVSIENE ALTKLPPPTG NLAQLTSIFA SNGLDVKDLV VLSGGHTIGI SHCSSFSNRL YNFTGKGDMD PSLNRHYAAK LKLQCKPGDE 
NTAVEMDPGS FRTFDTHYYT NLMKHKGLLQ SDAALLTNNE VQALVNIEAQ GSSFFSDFAV SMEKMGRIGV LTGTAGQIRR HCALTN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks PTA00006784 (tscaffold2707) 97 percent
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGACAA TTACCGTTAG AGATCTGTTT ATTGCAGTTG CGAGTTTATG GGTATTTCTC TGTGTATCTG CAGACGCAGG TGAAGGACTC GCACCGAACT TCTATAACAA TACCTGCCCC  GGAGTTTATA ATGCAGTAGA AAATGTTGTT GGAGAGTACA TATCCAAACA CCCAACAATG AACGGACCTC TGCTCAGATT ACATTTTCAT GATTGCTTTG TCAGAGTGAG TATTATGTAT  TTATAAGTAT AGAGACCCGT TAACTTCCGA TTTGATTTCT TGAGGTACTT ACATATTTTT GGGATTAATA ATTTGACATG TTTAACTGGC TGAAGGGTTG CGATGGATCG GTGCTCTTGA  ATTCAACAAA TTCAACCAAA GCGGAAAAGG ATGCATCTCC CAATCAGACT CTGAGAGGAT TCCAAATAAT TGACACAGCC AAAGCTGCAG TGGAGAAATT ATGCCCGGGA GTGGTGTCAT  GCGCCGATAT TCTTGCACTC GTCGCACGAG ATGCTGTCCA TCTGGTAAAA CTCATTTCAG CCCTAATGCA TTTCTTGATT TCCTTTACTG TTCTGTTTTG CTCAACAGCC TGTAAGATGA  TATATAATTC ATGGAAATAC CAGTCGGGTG GACCATTCTG GAATGTTCCA ACAGGACGCA GAGATGGAGT GGTGTCTATC GAGAACGAAG CTCTCACTAA ACTTCCTCCC CCCACTGGGA  ATCTCGCCCA ACTCACATCA ATATTTGCCA GCAATGGTCT TGATGTTAAA GACCTTGTTG TCTTATCAGG TAATTAATTC TCTACATTAT AATTGTGAAT AGAGATCCAT AATTCCAGAA  GAGAAAACCA TTTAACATCA TGAGGACCGT GCCCACTCAA ACCACTTAGG TCTGATCCAT TATGTTATAC AAGGATTGGT TCACATTATG GCAGCATAAG CTGATCAGTT GTCTAATACT  GCCTGCAGGT GGCCACACTA TAGGAATCTC CCACTGCAGC TCCTTTAGCA ACAGGCTTTA CAATTTTACA GGAAAGGGAG ATATGGATCC CTCCTTGAAC AGGCATTATG CAGCTAAACT  GAAGTTACAA TGCAAGCCAG GGGACGAAAA TACAGCGGTA GAGATGGATC CCGGCAGCTT TCGAACATTT GATACGCATT ACTACACCAA TCTAATGAAG CACAAAGGCC TCCTTCAATC  CGATGCCGCA CTTCTGACCA ACAACGAGGT ACAAGCATTA GTCAATATAG AAGCGCAGGG CTCGTCGTTC TTCTCTGATT TTGCAGTGTC TATGGAGAAG ATGGGCAGAA TCGGTGTGCT 
CACAGGCACT GCAGGACAAA TACGACGACA CTGTGCTCTT ACAAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGACAA TTACCGTTAG AGATCTGTTT ATTGCAGTTG CGAGTTTATG GGTATTTCTC TGTGTATCTG CAGACGCAGG TGAAGGACTC GCACCGAACT TCTATAACAA TACCTGCCCC  GGAGTTTATA ATGCAGTAGA AAATGTTGTT GGAGAGTACA TATCCAAACA CCCAACAATG AACGGACCTC TGCTCAGATT ACATTTTCAT GATTGCTTTG TCAGAGGTTG CGATGGATCG  GTGCTCTTGA ATTCAACAAA TTCAACCAAA GCGGAAAAGG ATGCATCTCC CAATCAGACT CTGAGAGGAT TCCAAATAAT TGACACAGCC AAAGCTGCAG TGGAGAAATT ATGCCCGGGA  GTGGTGTCAT GCGCCGATAT TCTTGCACTC GTCGCACGAG ATGCTGTCCA TCTGTCGGGT GGACCATTCT GGAATGTTCC AACAGGACGC AGAGATGGAG TGGTGTCTAT CGAGAACGAA  GCTCTCACTA AACTTCCTCC CCCCACTGGG AATCTCGCCC AACTCACATC AATATTTGCC AGCAATGGTC TTGATGTTAA AGACCTTGTT GTCTTATCAG GTGGCCACAC TATAGGAATC  TCCCACTGCA GCTCCTTTAG CAACAGGCTT TACAATTTTA CAGGAAAGGG AGATATGGAT CCCTCCTTGA ACAGGCATTA TGCAGCTAAA CTGAAGTTAC AATGCAAGCC AGGGGACGAA  AATACAGCGG TAGAGATGGA TCCCGGCAGC TTTCGAACAT TTGATACGCA TTACTACACC AATCTAATGA AGCACAAAGG CCTCCTTCAA TCCGATGCCG CACTTCTGAC CAACAACGAG  GTACAAGCAT TAGTCAATAT AGAAGCGCAG GGCTCGTCGT TCTTCTCTGA TTTTGCAGTG TCTATGGAGA AGATGGGCAG AATCGGTGTG CTCACAGGCA CTGCAGGACA AATACGACGA 
CACTGTGCTC TTACAAATTA A 

Retrieve as FASTA