The peroxidases and oxidases database
Entry information : PtaPrx51(PTA00045979)
Entry ID 2113
Creation 2005-08-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2005-08-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx51(PTA00045979)
Name PtaPrx51(PTA00045979)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx027]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx51
start..stop		 S start..stop
PtaPrx11 593 0 1..326 1..326
PtaPrx49 561 0 1..327 1..327
PtaPrx09 510 0 1..326 1..324
PabPrx108 509 0 1..326 1..326
Literature and cross-references PtaPrx51(PTA00045979)
Literature Pratt,L. et al., An EST database from untreated loblolly pine (Pinus taeda) roots, unpublished
EST ref. GenBank:   CF671074
Protein sequence: PtaPrx51(PTA00045979)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326
PWM (Da):   %s   35834.22  
PI (pH):   %s   9.11
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
METITVKNLF IPLADLWVFL CVSADAVGGL SLNFYEKTCP RLNNVVKNFV GHYISKNPTL ATPLFRLHFH ECFVRGCDGS VLLNSTNSIK AEKDALPNQS LRGFQIIDTA KSAVEKMCPG  VVSCVDILAL VARDAVHMFG GPFWNVPTGC RDGVVSIKKE ALPKLPPPTA NFSQLTSIFS SNGLDVKDLV VLSGAHTIGI SQCSSFSNRL YNFTGKGDMD PSFNKHYAAK LKLQCKRGYK 
NKTVEMDPSS FRTFDTYYYT NLMKHKGLFQ SDAALLTNNK VQAFVNIESQ GSSFFSDFIV SMEKMGRIGV LTGTAGQIQR KCALTN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Very long intron 3
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGACAA TTACCGTTAA AAATCTCTTT ATTCCACTTG CGGATCTATG GGTATTTCTC TGTGTATCTG CAGATGCAGT TGGAGGACTG TCACTGAACT TCTATGAGAA AACATGTCCC  AGACTTAATA ATGTAGTAAA AAATTTTGTT GGACACTACA TATCCAAAAA CCCAACTCTG GCCACACCTC TATTCAGATT ACATTTTCAT GAATGCTTTG TCAGAGTGAG TATTATGCAT  TTATAAGTAT AGAGAGTTGT TAAATTCTGA TCTAAATTCT CCAGACACTT ACATTTTTTT GGGATTAATA ATTTGACATG TTTAACTGGC TGAAGGGTTG CGATGGATCG GTGCTCTTGA  ATTCAACAAA TTCAATTAAA GCAGAAAAGG ATGCGCTTCC AAATCAGAGT CTGAGAGGAT TCCAAATAAT TGACACAGCC AAATCTGCAG TGGAGAAAAT GTGCCCAGGT GTGGTGTCAT  GCGTCGATAT TCTTGCACTC GTCGCACGAG ATGCTGTCCA TATGGTAAAA CTCATGTTCA GCCTAATGAA TTTCTTAATT TCCGTTACCG TTCTGTTTTG CTCAACAGCC TCTAAGATAA  TATATAATTC ACGGAAATAC GAGTTTGGTG GACCATTCTG GAATGTTCCA ACAGGATGCA GAGATGGAGT GGTGTCTATC AAGAAAGAAG CTCTCCCTAA ACTTCCTCCC CCCACTGCGA  ATTTCTCCCA ACTCACATCA ATATTTTCCA GCAATGGTCT TGATGTTAAA GACCTTGTTG TCTTATCAGG TAATTAATTC TCTACATTGT TATTGTGAAT AGAGATCCAA AATTCCAGAA  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TGTGCTCTTA CAAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGACAA TTACCGTTAA AAATCTCTTT ATTCCACTTG CGGATCTATG GGTATTTCTC TGTGTATCTG CAGATGCAGT TGGAGGACTG TCACTGAACT TCTATGAGAA AACATGTCCC  AGACTTAATA ATGTAGTAAA AAATTTTGTT GGACACTACA TATCCAAAAA CCCAACTCTG GCCACACCTC TATTCAGATT ACATTTTCAT GAATGCTTTG TCAGAGGTTG CGATGGATCG  GTGCTCTTGA ATTCAACAAA TTCAATTAAA GCAGAAAAGG ATGCGCTTCC AAATCAGAGT CTGAGAGGAT TCCAAATAAT TGACACAGCC AAATCTGCAG TGGAGAAAAT GTGCCCAGGT  GTGGTGTCAT GCGTCGATAT TCTTGCACTC GTCGCACGAG ATGCTGTCCA TATGTTTGGT GGACCATTCT GGAATGTTCC AACAGGATGC AGAGATGGAG TGGTGTCTAT CAAGAAAGAA  GCTCTCCCTA AACTTCCTCC CCCCACTGCG AATTTCTCCC AACTCACATC AATATTTTCC AGCAATGGTC TTGATGTTAA AGACCTTGTT GTCTTATCAG GTGCCCACAC TATAGGGATA  TCCCAATGCA GCTCCTTTAG CAACCGGCTT TACAATTTTA CAGGAAAGGG AGATATGGAT CCGTCCTTCA ACAAGCATTA TGCAGCTAAA CTGAAGTTAC AATGCAAGCG AGGGTACAAA  AATAAAACGG TAGAGATGGA TCCCAGCAGC TTTCGAACGT TTGATACGTA TTACTACACC AATCTAATGA AGCACAAAGG CCTCTTTCAA TCCGATGCCG CACTTCTGAC CAACAACAAG  GTACAAGCGT TTGTCAATAT AGAATCGCAG GGCTCATCGT TCTTCTCAGA TTTTATAGTG TCTATGGAAA AGATGGGCAG AATCGGTGTG CTCACAGGCA CTGCAGGACA AATACAACGA 
AAGTGTGCTC TTACAAATTA A 

Retrieve as FASTA