Entry information : PtaPrx51(PTA00045979)
Entry ID 2113
Creation 2005-08-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2005-08-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx51(PTA00045979)
Name PtaPrx51(PTA00045979)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx009]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx51
start..stop
S start..stop
PtaPrx11 593 0 1..326 1..326
PtaPrx49 561 0 1..326 1..326
PtaPrx09 510 0 1..326 1..324
PabPrx108 509 0 1..326 1..326
Literature and cross-references PtaPrx51(PTA00045979)
Literature Pratt,L. et al., An EST database from untreated loblolly pine (Pinus taeda) roots, unpublished
EST ref. GenBank:   CF671074
Protein sequence: PtaPrx51(PTA00045979)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326
PWM (Da):   %s   35834.22  
PI (pH):   %s   9.11
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
METITVKNLF IPLADLWVFL CVSADAVGGL SLNFYEKTCP RLNNVVKNFV GHYISKNPTL ATPLFRLHFH ECFVRGCDGS VLLNSTNSIK AEKDALPNQS LRGFQIIDTA KSAVEKMCPG  VVSCVDILAL VARDAVHMFG GPFWNVPTGC RDGVVSIKKE ALPKLPPPTA NFSQLTSIFS SNGLDVKDLV VLSGAHTIGI SQCSSFSNRL YNFTGKGDMD PSFNKHYAAK LKLQCKRGYK 
NKTVEMDPSS FRTFDTYYYT NLMKHKGLFQ SDAALLTNNK VQAFVNIESQ GSSFFSDFIV SMEKMGRIGV LTGTAGQIQR KCALTN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Very long intron 3
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGACAA TTACCGTTAA AAATCTCTTT ATTCCACTTG CGGATCTATG GGTATTTCTC TGTGTATCTG CAGATGCAGT TGGAGGACTG TCACTGAACT TCTATGAGAA AACATGTCCC  AGACTTAATA ATGTAGTAAA AAATTTTGTT GGACACTACA TATCCAAAAA CCCAACTCTG GCCACACCTC TATTCAGATT ACATTTTCAT GAATGCTTTG TCAGAGTGAG TATTATGCAT  TTATAAGTAT AGAGAGTTGT TAAATTCTGA TCTAAATTCT CCAGACACTT ACATTTTTTT GGGATTAATA ATTTGACATG TTTAACTGGC TGAAGGGTTG CGATGGATCG GTGCTCTTGA  ATTCAACAAA TTCAATTAAA GCAGAAAAGG ATGCGCTTCC AAATCAGAGT CTGAGAGGAT TCCAAATAAT TGACACAGCC AAATCTGCAG TGGAGAAAAT GTGCCCAGGT GTGGTGTCAT  GCGTCGATAT TCTTGCACTC GTCGCACGAG ATGCTGTCCA TATGGTAAAA CTCATGTTCA GCCTAATGAA TTTCTTAATT TCCGTTACCG TTCTGTTTTG CTCAACAGCC TCTAAGATAA  TATATAATTC ACGGAAATAC GAGTTTGGTG GACCATTCTG GAATGTTCCA ACAGGATGCA GAGATGGAGT GGTGTCTATC AAGAAAGAAG CTCTCCCTAA ACTTCCTCCC CCCACTGCGA  ATTTCTCCCA ACTCACATCA ATATTTTCCA GCAATGGTCT TGATGTTAAA GACCTTGTTG TCTTATCAGG TAATTAATTC TCTACATTGT TATTGTGAAT AGAGATCCAA AATTCCAGAA  GAACAAACCA TTTAACATCA TGAGCACCAC GCCCACTCAA ACCACTTAGG TTCACATTAT GGCATCATAA GCTGATTAGT TGTATTGTTA GAATTTTCTG CTAAATTCCA TAACAGACAG  ACAAAAATAA AATGCTCTGT TTTTTACTCT GTTTCTGCCC AGAAAACTGA AAAAATCGTT TTCTGGAAAT GGTGTTGCAG CAATGCTAAA TAACACTCTG TTTTTTTTTA ACACAGTAAA  TAGAAAATTT CTTACTAGAA ACGATGTTGC AACAACACAG TTTGGTGTTG TAACAACGTA GATTTGGTGT TGCAGCAACG TAGACTTGGT GTTGCAGCAA CAGAAAAATT TATGATAATT  TAAAATAAAA CTGAAAACAG AACAATACTC AGCAACACCG AAACTAGTGT AACATCAGTG TGCAAGTGGT GAAACGGCAA TAGAAATTTA ACTTGTATTC ATAAACAGTA AACAAGCTGA  TACAAATTCT TCTTCCTCTT GACAGAGGGA TAACAACAGG AACACTTTAG CTCCAGAAAC GAATTTTCTC TATCTCAGAA AATTGTAGGT TCAACACTGT TGCGCGTTTA CAGAAGAGAC  TCTTTATTCA GTCTTCTAAC CTTCTCTCTT TAAAAACAGA ACTGTTGTTC ATTCTCTTAA AAACATAGTT ATTCTCTTAA AAATAGAGTC ATTCTCTTAA AAACAGAATT GTTGTTCATT  ACATTTATAG AGAAAAAAAA TATCTGAGTT TAAACAATAA AATAACCAAA ATATCCTATA ACGTTTATCT GTGTATTAAA TGCAGCAAGC GGTGATGCCT TTCTCAGTGA AAACAAGTCA  GTGGTTGCAG GGGAATTAAA TTCTATGAAT TTAATGCACA TTAATGTGCA AAATATCAGC AGCGACTTTG CGGCATCGAG CAACCTAAAA TATCTTTGGA AATCAGATTT TTCTTCAGCA  TTTATTGTGT TGTAGTTTGA ATTAAATTCC AACACTCCCC CTTAATTTCA ACTGTTGTAT ACCCAGGCGT TTTCTGAAAT GATCAAAACT TTTCTTTGCT AATGGTTTTG TCAAGATGAC  AGCTAGCCGA TCCTCTGTTC TGCAGTGCTG CAAAACAATC TCACCATTGT TAACCAATTC ACGTATGAAG TGAAATTTGG TATCTATGTG CTTTGTTATT TTATGAAAAA CAGAGTTTCT  AGACAATGCT ATTACTCAGT TATTGTCACA GTGAATGGTT GTGTCATTTT CTTGTTCATG TCACAAATCT CTGAGAACTC TTCTCAGCTA CACTGCTTGG CATGTTGTTG CTGTCGCTGC  CACATACTCT ACCTCTGCTG TTGACAAAGA CACAACTGAT TGCTTCTTGG AAGCCAATGA GATGGCTCTC GATCCCATAT GAAACACATA TCCTGATGTG CTTTTCCTAT CATCAACACT  TCCAGCCCAA TCACTATCCG TGTAACCTGT CAACATGAAA CTTTCAGAAG AGGAGTATAA AATACCAAAC CCCTTCGTTC CATTTACATA CCTTAGAATC CTCTTGGCTG CCTGCCAATG  AGTCTCTTTC AGTATTTCCA TAAATTTGGA GATTAAACTC ACAACGTGCA TAATGTCCAG CCTAGTTGCA GTCAAGTACG TAAGGCTGCC AACTATGCTT TTGTACAATT TTGGATCAAA  ATCCTTGCTG TTGTCTTCTT TGGTCAATTT CAACCCCACT ACAGTTGGAG TCACAGTCGC ATTGCTGTTC TACATGTTAA ATCTCTTCAA CACTGCTTCT ACAAATTTAT CTTGAGAAAT  GAAAACACCA TTTTCACTTT GGTCTACTTC AATTCCAAGA AAATATCTTA AGAAGCCCAA GTCAGTCATT TCAAATTCAT TTTTCATGAC TGTTTTAAAA TCAACAATGA GAGAAGCATC  ATTGCTAGTA AAAATCAAAT CATCTACATA TAAAACAACA ATAATAATCT TACCGTCATT CTCCTTTATG TAGAGTGTGG GTTCACCATC ACACTTATCA AACCCATTCC CAATAAGATA  AGCATCTATT CTGTTGTACC ATGCTCTTAG AGCTTGCTTC AGCTCATAAA GAGCCTTCTT CAGTTTGCAA ACTTTATGCT CTTGGCCATC AACTTCATAA CCTGGAGGTT GTTCAACATA  AACCTCTTCT TTTAATACTC CATTCAGGAA TGAAGATTTA ACATCCATCT GATAAATCTT CCATTTGTGT TGTGCTCTAA TAGACAACAC TGTTCTGACT ATTTCCATCA TTGCTACTGG  TGCAAAGGTT TCATCATAGT CTTTGCCTTG TTGTTGCTTG TAGCCTTTCA CAACAAGTCT TGCTTTGTGC ATGTCAATCT TGCCTTCAAC ATTGCTTTTG GTCTTATAGA CCCACTTAAC  TCCAATGGCA TCTTTGCCTT CAGGGAAGTC CACTAACTCC CATGTTTTAC TCTTTTCAAT TGCACTAATT TCTTCATTCA TTGCTTCAAT CAATTTATCT TCATTTATAG CATCTTCAAA  ATGAACTGGG TCATCAACAT GACAATACAA AGCGAATAAT GAATTCAGGC CGGTATTGTT ACTTACCTCT CCTTGTTTAT AAATCTCATT TAGATTTCTG AATCTTCATC TTCTTGGTGT  GCTTGGAGCT CCATCCGAAC TTGAGGGTAT TTCAGATCCC TGTGGTGTGC TTGAAGAAGC ACTTCCTTAA CTTCTTAAGG TTGTTCGAAT TCCAGCTTGT GGTGTGGATT GTTGAATTTG  CTGTGGTGGA GGAGGAACCA CCAAGGAAGG ATTATTTGTT GCTGTCCCTT CTTCTTCTTC TTCATTAGAC ACAATTGTCT TCACATTCAC TGTTTTTTCT AAGCTTCCAT CCCAAACTTT  ATCTTCAATG AACTGCATAT CCCTGCTTAC TATCAATTTT TTAGTGGATG GATTATAGAA TTTGTATGCT TTTGACTCAT CACAATAGCC AACAAATACA CACTTCTCCC CCTTACTATC  AAGCTTTTTC CTTAGCTGAT CTGGTACATG TGCATAAGAT ACACAACCAA ATACTCTCAT GTGAGTGATT GTTTTCTTTT GACCACTCCA TGCTTCTTCT GGTATTTTGT TCATGACAGC  TTTAGTTGGG CATCTATTCA AGATGTAAAC TGCACAAATG ACAGCTTCTG CCCCATACTC ATGATGCAAT TTTTTTGCCT TCAGCATACA TCTAACCATG TCAAGAATGG TCCTATTCTT  TCTTTCGGCA ACACCGTTTT GCTCAGGTGT ATACCTCGCC GTGAACTGCT TTTGTATGCC ATTCTCTCTG CAAAAACGCA GAAAGTCTTG GGAGATGTAT TCTCCTCCTC TATCTATTCT  GAGAACTTTG ATATAATGCC TACACTGCTT CTCAACAAGA GTTTTGAAGT GGCGGAATTT CTCAAACACT TCACTCTTCT GTTTCAGCAT ATACACCCAT GTCTTTCTGG TGTAATCATA  AATGAAAGTT AAAACATATC TATTTCCGGC AAATGATGGT ATTTGCATCG GTCCACACAC ATCAGAGTGA AAAATTTCTA AGGGTGATTT TGCCCTTATA CTCTTTCCTG TTGGAAAGCT  TTATTTGTGT TGATTACTCA AGATGCAGCG TTCACAAAGA CTGTCTGGTT TCTCAATCAA CGACAATCCT CTTACCATTC CCTTTCTATG CAACAGATTC AAGCCTCTGA AATTGAGATG  TCCAAATCTC AAGTGCCACA ACCAATTCTC ATCTCTCACT TGTTCTTGAA AAACTTCTTG TGTTACAGCC GCAATAGTTC TTCCTTCCTT CAAATCTACC CTGAGTTTGA GAGGAAACAT  TCTATTTTTG GTCATCTGCA CTTGTGCAAT GATCTTCTTA CTTGGAGGTA TATCTCTGAT TGTACACATA TCATCTTTGA AGAACACGTT GTAACCTTTG TCAATGAGCT GTCCAATGCT  CAAAAGATTA CATTTAAGAC CAGGTACATA GTATACCTCT GGCACAATCA TCTGTTCTCC ATTTCTTGCT CAGATACTGA CTCTACCCTT ACCCTTGACA AATATTTTAC TATCAGTTCC  TGTTGTTACC TTAGCTTTCA CATTTTCTTC CAGATTGGAA AATATTTCAA TATTGCCAGT CATGTGATTA CTACAACCTG AGTCTGAGAA CCAAAAAACT TCTTGTTTGT CTTGTGCAAT  GTTACATATT AACAACACAT TCTTTGGATT CTTATTTTCT TCGTTTACAA AATTAACATT CTGCCGACTA TTCATGTCAT TTTGTATTTT TCTACATTCA TTGGCGTAGT GCCCATATTT  TTTACAATAA TGACATTGGA CTTGGGATTT GTCATACCTT TGTCCATAAG CTTGTTGTTT GCTTGAACCT TCATCTTGGT TCTGATTGCA GCTTCTTCCG CTTGTGCTTG CAGGATAATA  TCTGCCTCTG TTTTGGCTTC TTCCACGACC TTTGTTATTT TCTCTGCCTC GACCTTTTCC TTGGCTGAAA GACATTTGAG TCTTGAATGC TTGCTCAAAA GAGGAATATG TTGCTCTACT  CAGTCGGTGT TCATGAGACA TAAGAGAAGC ACTCAGTTCA TCTACCGTGA ACTGTGAGAG ATCTTTTGTT TCTTCTATTA CTACCACAAC AACTTCAAAC CTTGAGGGTA AACATCTCAA  GATCTTCTCT ACGATCCTTC TTTCTTTAAG AATTTCACCA TGAGATCTTA TCTGAGTTAT CAACCCAATA ACCTGAGTGA AGAATGAATC TATTGTATCA CATTCCTTCA TGTTGAGTGT  TTCAAAGTCT CTCCTCAACA TTTGCAACTT TGCAGTCTTC ACCTTCTCTA TGCCTTAGGC AGTTTTGAGA ATATCCCATG CCTCTTTGGA TTTTGTTGTT ACGGAAATCC GTGGAAAAAC  ACTTTGATCT ACTAATTGGA AGAAGAAAAA GAGGGCTTCG GCATCCTTCT TCTTGTCACT CTTCAACTGG TCTCTTTCTA CTACTGTCAA AGCAGCCAAT GTTATTGCAT CTGCAGGTTC  AGCATAGCCA GTTTCAACTA GCTCCCATAT TCATTATTAT GGACCAATAA CTATGATTTT TCCCATTAAA CTGTGGCAGT TGGAAATTTG TCAAACCTGT TACAGCATCT TCCATCTTAA  CTCTATATAG GTAAAGAAGA GATACTGACT GTAAAATTAA AAACAAGCAA AAACTTTATC TGCTAGAAAA AATGTGCTCA ATAAGATTCT TACAGCTCCT ACAGTGAAAA AAAAACTCTG  TTTTTGACTC ACTGAGTGCC TAGACCAGCT CTGATACCAT GTTACAATTT TCTGCTAAAT TCCATAACAG ACAAAAAAAA ATCTCTGTTT TTTACTCTTT TTCTGCACAG AAAACTGAAA  AAAAAAAACG TTTTCTTGAA ATGGTGTTGC AGCAACACAT TTTGGTGTTG CAGCAACGCT GAATAACACA CTGTTTTTTT TTAACACAGT AAATAGAAAA TTGCTTACTG GAAACAGTGT  TGCAGCAACA CAGTTTGGTG TTGCAGCAAC GCAGATTTGG TGTTGCAGCA ACGCAGATTT GGTGTTGCAG CAACAAAAAA AAATTCTGAT AATTTAAAAT AAAACTAAAA ACAGAACAAT  ACTCAGCAAC ACTCGAACTA GTGTTAAAAT TTAACTTGTA TTCATAAACA GTAAACAAGC TTATACAAAT TTGTCTTCCT CTCGACAGAG GGATAACAAA AGAAACACTT CAGTTCCAGA  AACGAATTTT CTCTATCTCA GAAAATTGCA GGTTCAGCAC TGTTGTGCGT TTACAGAAGA GACTCTATAT TCAGTCTTCT AACATTCTCT CTTTAAAAAC AGAACTGTTG TTCATTCTCT  TAAAAGCAGA GTCATTCTCT TAAAAACAGA ACTGTTGTTC ATTACATTTA TAGAGAAAAA AATATCTGAG TTTAAACAAT AAAGTAACCA ATATATGTTG TAACGCTTAT CTGAGTATTA  AATACAGCAA GCGGTAATGC CTTTCTTAGT GAAAACAAGT CGGAAGTTAA AGGGGAATTA AATTCTGTGA ATTTAATGCA CATTAATATG CAAAATATCA GCAGCGACTT TGCGGCATCG  AACAACCTGA AATATCTTCG GAAATCAGAT TTCTGTTCAA CATTTATTGT GTTGAAGTTG GAATTAAATT CCAACATGTA TAACAATGCT GCTGCAGGTG CCCACACTAT AGGGATATCC  CAATGCAGCT CCTTTAGCAA CCGGCTTTAC AATTTTACAG GAAAGGGAGA TATGGATCCG TCCTTCAACA AGCATTATGC AGCTAAACTG AAGTTACAAT GCAAGCGAGG GTACAAAAAT  AAAACGGTAG AGATGGATCC CAGCAGCTTT CGAACGTTTG ATACGTATTA CTACACCAAT CTAATGAAGC ACAAAGGCCT CTTTCAATCC GATGCCGCAC TTCTGACCAA CAACAAGGTA  CAAGCGTTTG TCAATATAGA ATCGCAGGGC TCATCGTTCT TCTCAGATTT TATAGTGTCT ATGGAAAAGA TGGGCAGAAT CGGTGTGCTC ACAGGCACTG CAGGACAAAT ACAACGAAAG 
TGTGCTCTTA CAAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGACAA TTACCGTTAA AAATCTCTTT ATTCCACTTG CGGATCTATG GGTATTTCTC TGTGTATCTG CAGATGCAGT TGGAGGACTG TCACTGAACT TCTATGAGAA AACATGTCCC  AGACTTAATA ATGTAGTAAA AAATTTTGTT GGACACTACA TATCCAAAAA CCCAACTCTG GCCACACCTC TATTCAGATT ACATTTTCAT GAATGCTTTG TCAGAGGTTG CGATGGATCG  GTGCTCTTGA ATTCAACAAA TTCAATTAAA GCAGAAAAGG ATGCGCTTCC AAATCAGAGT CTGAGAGGAT TCCAAATAAT TGACACAGCC AAATCTGCAG TGGAGAAAAT GTGCCCAGGT  GTGGTGTCAT GCGTCGATAT TCTTGCACTC GTCGCACGAG ATGCTGTCCA TATGTTTGGT GGACCATTCT GGAATGTTCC AACAGGATGC AGAGATGGAG TGGTGTCTAT CAAGAAAGAA  GCTCTCCCTA AACTTCCTCC CCCCACTGCG AATTTCTCCC AACTCACATC AATATTTTCC AGCAATGGTC TTGATGTTAA AGACCTTGTT GTCTTATCAG GTGCCCACAC TATAGGGATA  TCCCAATGCA GCTCCTTTAG CAACCGGCTT TACAATTTTA CAGGAAAGGG AGATATGGAT CCGTCCTTCA ACAAGCATTA TGCAGCTAAA CTGAAGTTAC AATGCAAGCG AGGGTACAAA  AATAAAACGG TAGAGATGGA TCCCAGCAGC TTTCGAACGT TTGATACGTA TTACTACACC AATCTAATGA AGCACAAAGG CCTCTTTCAA TCCGATGCCG CACTTCTGAC CAACAACAAG  GTACAAGCGT TTGTCAATAT AGAATCGCAG GGCTCATCGT TCTTCTCAGA TTTTATAGTG TCTATGGAAA AGATGGGCAG AATCGGTGTG CTCACAGGCA CTGCAGGACA AATACAACGA 
AAGTGTGCTC TTACAAATTA A 

Retrieve as FASTA