Entry information : CnCcP02_JEC21
| Entry ID | 2329 |
|---|---|
| Creation | 2006-08-30 (Nenad Bakalovic) |
| Last sequence changes | 2012-05-22 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-05-22 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: CnCcP02_JEC21
| Name | CnCcP02_JEC21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Cytochrome C peroxidase [Orthogroup: CcP002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Tremellomycetes Tremellaceae Filobasidiella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Cryptococcus neoformans (Filobasidiella neoformans) [TaxId: 5207 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2329' 'join(1107477..1107507,1107563..1107638,1107692..1107731,1107789..1107808,1107865..1107889,1107952..1108048,1108110..1108334,1108386..1108419,1108472..1108567,1108621..1108669,1108728..1108833,1108896..1109101)' |
Exons►
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Literature and cross-references CnCcP02_JEC21
| Literature | Loftus,B.J et al., The genome and transcriptome of Cryptococcus neoformans, a basidiomycete fungal pathogen of humans
Science (2005) |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: P0CP56 |
| DNA ref. | JGI genome: NC_006687 (1107477..1109101) |
| mRNA ref. | GenBank: XM_571012 |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 4566 [Incorrect prediction] UniGene: Fne.5152 |
Protein sequence: CnCcP02_JEC21
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 5, 11 introns). Incorrect prediction from JGI. Strain="JEC21". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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