Entry information : CcinCIIBA
| Entry ID | 2403 |
|---|---|
| Creation | 2007-02-07 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2013-01-28 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2014-03-26 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: CcinCIIBA
| Name | CcinCIIBA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Other class II peroxidase type A [Orthogroup: CIIBA001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Psathyrellaceae Coprinopsis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Coprinopsis cinerea (Coprinus cinereus) [TaxId: 5346 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2403' 'join(1..123,196..240,312..330,409..425,486..494,558..616,685..698,764..804,873..951,1020..1260,1313..1364,1421..1565,1628..1800,1854..1975)' |
Exons►
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Literature and cross-references CcinCIIBA
| Literature | REFERENCE 1 Baunsgaard,L., Dalboge,H., Houen,G., Rasmussen,E.M. and Welinder,K.G. Amino acid sequence of Coprinus macrorhizus peroxidase and cDNA sequence encoding Coprinus cinereus peroxidase. A new family of fungal peroxidases Eur. J. Biochem. 213 (1), 605-611 (1993).
REFERENCE 2 Baunsgaard,L., Vind,J. and Dalboge,H. Unpublished |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: A8NK72 P28314 [Other strain] |
| DNA ref. | JGI genome: Chr_10 (1662393..1664366) |
| mRNA ref. | GenBank: X69457 JGI transcript: 20812 |
Protein sequence: CcinCIIBA
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (Chromo 10, 14 introns). No EST. Strain="Okayama-7 / 130 / FGSC 9003" and "IFO 8371" |
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| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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