Entry information : PcLiP06 (GLG6 / PcLiPF)
| Entry ID | 2415 |
|---|---|
| Creation | 2006-08-30 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2012-03-29 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-03-29 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PcLiP06 (GLG6 / PcLiPF)
| Name (synonym) | PcLiP06 (GLG6 / PcLiPF) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Lignin peroxidase [Orthogroup: LiP001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Phanerochaete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phanerochaete chrysosporium [TaxId: 5306 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2415' 'join(318..378,429..582,633..689,740..954,1005..1046,1098..1176,1229..1470,1528..1709,1763..1827,1888..1906)' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references PcLiP06 (GLG6 / PcLiPF)
| Literature | Naidu P.S., Zhang Y.Z., Reddy C.A. Characterization of a new lignin peroxidase gene (GLG6) from Phanerochaete chrysosporium. Biochem. Biophys. Res. Commun. 173:994-1000(1990). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: P50622 |
| DNA ref. | GenBank: M77508 |
| mRNA ref. | GenBank: M80213 |
Protein sequence: PcLiP06 (GLG6 / PcLiPF)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from Genomic (9 introns). Slightly different sequence found with genomic DNA (QRIQPPPGA --> QRIPPPGA): NCBI M77508, SwissProt Q01787. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
