Entry information : AtrAPx01(AmTr_v1.0_scaffold00023.236)
Entry ID 2454
Creation 2007-11-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2007-11-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-11 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtrAPx01(AmTr_v1.0_scaffold00023.236)
Name AtrAPx01(AmTr_v1.0_scaffold00023.236)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Amborellaceae Amborella
Organism Amborella trichopoda    [TaxId: 13333 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Flower buds
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtrAPx01
start..stop
S start..stop
LeAPx04 448 3e-162 4..252 2..249
NtAPx03-1A_unknown 445 3e-161 5..252 3..250
NtAPx03-1A 444 7e-161 5..252 3..250
NtAPx03-1B 444 7e-161 4..252 2..250
Literature and cross-references AtrAPx01(AmTr_v1.0_scaffold00023.236)
Literature L.Landherr, RNA, Stratagene Amplified Library
Cluster/Prediction ref. PGN unigene:   196602
Protein sequence: AtrAPx01(AmTr_v1.0_scaffold00023.236)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   252
PWM (Da):   %s   27826.94  
PI (pH):   %s   5.62
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSKCKCYPEV CEEYQKAVEK CKRKLRGFIA EKNCAPLMVR TAWHSAGTFD VCTKTGGPFG TMKYPEELAH GANAGLDIAV RLLEPIKEQF LILTYADFYQ LAGIVAVEVT GGPEIPFHPG  RQDKTEPPVE GRLPDATKGP DHLRQVFIKQ MGLTDKDIVA LSGAHTLGRC HKERSGFEGA WTSNPLIFDN SYFKELLSGE KEGLLQLPSD KALIEDPAFH PYVEKYAADE DAFFADYAEA 
HLKLSELGFA DC 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGCAAGT GCAAGTGCTA CCCGGAAGTC TGTGAGGAAT ATCAGAAGGC TGTTGAGAAA TGTAAGAGAA AGCTCAGGGG CTTCATTGCG GAGAAGAACT GTGCACCGTT GATGGTCCGT  ACTGCGTAAG TATTCCTCAC TCGAAGATTT GATCAACAAA AGCATTGCCT GTATGACTAC TTTTCTACAT TGGATCTTGT ATGCTGTTCA CATCAGTTAT TGTGTATGGA AGTTGTATTG  GATTGGAAAT AACAAAATGC AGAGTATTAG ACTTAATGCT TCTCCACCCC AGGCCCCCCT AAAACAAGGT GTGCAAAAGA GTTGCAAATT GCTCCAAATC ATGATCCCTG AATATGAATT  TGAGCTTCAT ATCACTGAGT GCCATTACCT GTTCCAATGG ACCGTGCATG TTTGATTTGG AGGCAGTAGA TTCAGAGCAT TTTTGGAGCC TCAAATCATT TGTTTTCTTT CTTTGGCATT  GGTGAGACTG AAATGGAACT TTTTTGGACC TCTTACTGGC CTTGAAAACG GCTTTGGATG TGGGAAGTGT TAAGTCTGAT GCATTCTAGG GATGTACATA AGGTTTTGTG CCTTAGTAGT  GTGCATAATA AAGATATAAG AGGCTATTTA ATGCGATGAA AAACTACTGC GATCAAAAAC TTAAGAGACT GTGAGGCTAT TTTTCGTAGG CCAGCATTTC AATATAATAT TCAGTTACAT  TAGGAGATTC CTTATGATTT TGGGAAAAAC TTTTTCATTT AATTTATCGA GCTTTTCTTT ATTATTGAAC TCCGTTGGAT TTGAATTTTG TCGACTCTGA TGGGAAACTC TTTGTTGCAG  TTGGCATTCT GCAGGAACTT TTGATGTCTG TACTAAAACT GGGGGTCCCT TTGGGACAAT GAAGTACCCA GAAGAACTTG CCCATGGTGC TAATGCTGGG CTTGATATTG CTGTTAGGCT  ATTGGAGCCT ATTAAGGAGC AATTTCTGAT ATTGACTTAT GCTGATTTCT ATCAGGTTCA AGATTCTTTG GCATCTCTTT GCTTATTATC CTATGCATAA TTTTCTTTTT TGGCATCTCT  TTGCTTATTA TCCTATGCAT AATTTTCTTT ATTCATATCA TAAGTTAGTT AATTGTTTTA TATCTGAACT AAATGTCGAA TTTTTGTTGT AGCTTGCTGG AATTGTTGCT GTGGAAGTTA  CAGGAGGACC GGAGATTCCT TTCCATCCAG GAAGACAGGT AATAATTTTT ATTTTATATG TGATAACAAG TTCTTCCTCT CTAAATATGG ACAACCGCCC TCTTGACATC CTTGGGGAAA  AAACATTCCT CTTCTGCCAT CCTACAACTA CATCCGTGTG CATATTTTTT TATGTTATGG TTGATGGGCT TTGATGCACA TTGTCAGATG TGTATGCATA GTGTTATGAT TGGAAGTTTC  ATGAAATTGG GCTGTGAATT AACCTGTTTT TTATGACATT TTTGTATGGG GTATAGGAAA TTTATCTAGC TATGAATGTT ACACTTGTGT TGCTTAATAC TTACAGTTAA CATAATCAAT  ATTTTCACCA GCACAGGATT AGAATATGTA TGTATGAAAA CTGAATGGTA GAAATACTTT TAGGGAAAAT TTCGTATGGA ACCCTAATTC CCTGTCTTAT TTCATGGTAG ACCTTCTTTT  CATTTTTCTT TCAAGCGGCA TAAAAAAATC CCTTAGGATT TCACCGTACC CCCTCATCTC TTATCTCCCT CATTATTCAC TTTTGACCAT AAAAATTAAG CCCCAACAAA CTTTTCTATA  TCATTTCAAC CCCAAAACGT TTCAAAAACC TTTTTAACCT TAAAAATTTT TTAACCCACC CCATTATATC TCCAACCCCA TTATATCTTT TAACCCAAAA ACGCTTCAAA AATATTTTTT  TATTATATTT TTTGCCTTTT CAGCCCCTCA ATTCTATGTT GAGGGCTCCT TACCTCTCTC TCACATTGGG TTAAAATGAT ATAAAAGGGT TTGTTGGGGC TAATTTTTAT GGTAAAAAAT  GAATAAATGA GGGAGATAAG AGATAAAGGG GTACGGTAAA ATCCTTAGGG ATTTTTTTAT GCTGTTTGAA AAAAAATGGA AGGAGAGTTT ACCATGAAAT AAGATGGGGA ATTAAGGTTC  TGTACGAAAT TTTCCCATGA TGAGTCGGCT GTAGGGCTAT GCTGTTAAAG GATAACAATA TCCATGTTCT ATTTAATGAT CAGTAAATAT CTTGGTTGAG TTCATACGTG TCTTCTTAAA  TCAAGAACGA TGTATATCGA TGATGTAGTC AGTGGTCAGT AAACAAGAAG AAGAATCCAT CCAAAGAACC TGTGTTGTCA TACTTGTTTG AGAGGGTATG GCTAAACCGA AGAATCCTCC  TAATGTAGAT CCAACTATAA AATTGGTGCC TTATGCATTA AATTTTGTGT ATAGTCAATG GTTACCAGCA CTGCCACTTA GATAGATTTG TATTTCAAAA TGTACATGTG GTAATGATTG  AGTGATCTGT ACCTTTGCAT TTAAATATTG GGACCACCAA TGCTATGTGT GGGCTATAGA GGACCAACAT ATGTGGCTCC ATATTGACTT TCATTTATTT AAGATTGTCT GTGATACATT  AAAGATAATG TTCATTTTCT ACTTTTGAAT GATGATTGTA CCTTTGTATT TGTAGAATCA TAGGAACTTG AATGGATGGA TATTATCCTT GAAGGGTTAT TACTTTTGAT AACTGTATGT  TTATTAGTCT TAAAGTGCTG ATATTTTGTA TCTGGCCATG TCAAGGATAC TTGCATCATC TTGGTCATAG AATCTGTTTC TAGTCACTCA CTGACATTTG GCTGCTATGT CGTGTTCCTA  CTTAATAGGA TAAGACCGAG CCACCAGTTG AAGGCCGCCT CCCTGATGCC ACGAAAGGTT TGACTTTAAA GTCTCCTTTC ATGATAGCAA GAATGACGTT TTCATGAATG ATGCCCTCTA  AATATTTCAA GGTGCCTGAC GATTTAGGTC CTTTTGGCAG GTCCTGACCA TCTGAGACAA GTCTTCATCA AGCAAATGGG CCTTACTGAC AAGGACATTG TTGCTCTATC TGGTGCACAC  ACCCTGGTAT GGTTGGTTTA TGAATCACAT TTTTTTTATG AAAACCATTG GGCACTACTA TGAGGACTAC TCCTCACTTT GCTTGGAACG TGAAAGTTTG CCTTCTTGGA TCCTATCTTT  TACAACTGGC ACATTTTGCG GGCACACTTG ATGGAAGATA CAATGAAATT CCTCTGTAAA GCGTAAATAA TTAGAGAGAG CCATGTGGCT TCTTCTGTCC TGCAAAATAA ACTTGCAGAG  CTTACTATTT TCTGATTTCT TAAGTAACAA AATAAAATAT TTTATTCGCC ACCAATAATT GATAGCACCA TAGTGTGTCT GTAACTTTAT ATTTCATCCA TTTAAGAAAA AAATCAAATC  ATGAAATCCC ATGAATTTGT TTCCAAACAC AAAAGCTAAC TCAATTACTT TTGCTCTGCT GGAGCTTTGG TTATTGAGAT TCTATACGAA GCATGCCTAC TGATCGAAGA AAAATATGAC  ACGTCACTCT TTTGTACAGG GAAGGTGCCA CAAGGAGCGT TCAGGATTTG AGGGAGCTTG GACTTCCAAC CCTCTCATCT TTGATAACTC CTACTTCAAG TAAACACTTT ATGTTATTGC  ATATTGTTTA AACATGGGAT CATTGTGTGC TGAATGTGGT TATGGTTACA AGACATATAC ATGCACATAC ATACTGTGTA TGAAAAAACT TGACTGGTTA ATGGACCTTA GGCTTCAATT  AATCACTTGA ACAGGCCAGT CCATGTGCTC CTAAACACCT GCTGGGCTGG TTGGTTAATT TTCTTGTGTG GGATTTAGAC TTGAAGCTTC ATTTTAATAG TTAAAAGGTA TAGGGGGAAA  CCGGAATGCA TAGACTGTGA CTAAATTATT GCTCTAGCTT TTGTAGAATA CACTGAGGTT TAATTTCATA ATAATGAGGT TTCTGCATTC TTGTATATCA ATTCTGATTA ATGACCAAAA  AAAACCTGAT CCGAGAATGC ATAAAATAAA AGTTGATCAT ACTATCATGT TGACCATAAG GACATCTGGT ATTTAAATGA GAATATTTTA AACATGCTCA TAAACCAAAA TTTGTAACCT  TCATGCTGTA AAAAATGTGC GGTGTTTGGT AATAGGGGTG GTGTTCTTTA TGTTCCTGAA GGAAGTTTTG TTTGTGAAGC CTCTTGTTCG GTTTTATCGT TATTAGTGTA TGCAATTTTC  TCTCTTCCTT GGATGCCTAT GGATGTTGGT GTGATATGAT AGGAATAAGT CTTCCAGGAA GAATTTTGCC CTTGGGTAAA CCAAGAGGGG AATAGTATAC TTTAAATGGG AGACTAGATA  GTGGCTTCGT AGTCACGTAC TTTTTAAGGT CATTGCATGT GTTATGGTTC CATATTGTTT ATATGTGAAG CAGTTGGCCT ACCAATTGTT TTTGTGAATA AGATTGGTTG GTTTCAAACT  GTTCAGGGAG CTTTTGAGTG GAGAGAAGGA AGGCTTGCTT CAGTTGCCAT CTGACAAGGC CCTGATTGAG GATCCTGCTT TCCACCCGTA TGTGGAGAAG TATGCAGCGG TATGTGCTCA  CCCTATGCAT TATGTTTATT ATCTCTAGTA TCTGTTAGTA GTAAGAGAAG TGACTTCCCA ATTTGCTGGG AAGAGTTTTC AGCTGGGATG TGATGTATGT TGTTTCATTG CAATTCACTG  AATTGTAATG CGAGTGGTTG CATAGTAATG CTTGGTGTTG GGGCCCATGA TAATCTTCAC CAGGAGACAT TGGGTATCTT TTCTCAATAT GTCAAATGCT ATGGTTTTGC TAGCTGCTCT  GAAGCAAATT GTGGGAGTCT TCATCTGGTG TGGGAGTTCG TCTGATATGA AATGTGATTT TTACAGGATG AGGATGCCTT CTTTGCTGAC TATGCTGAAG CCCACTTGAA GCTTTCGGAG  CTTGGGTAAG AAATCCTTTT GGCTTCTTTT CATTTTTCTC TTTCCCCCTT CCTCTAGTGA ATGCTGAGAT AGGCTCACAT TAAAATGATA TAATGCTTTT TACTAATGAT CATAAAAGAC 
GACTAAAATA GCTCTTCCTG GTTTTGTCCT GTTGCGTTTT AATTAATTGA GTTCAATGCT CTTTGTGTTG CAGATTTGCT GATTGCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGCAAGT GCAAGTGCTA CCCGGAAGTC TGTGAGGAAT ATCAGAAGGC TGTTGAGAAA TGTAAGAGAA AGCTCAGGGG CTTCATTGCG GAGAAGAACT GTGCACCGTT GATGGTCCGT  ACTGCTTGGC ATTCTGCAGG AACTTTTGAT GTCTGTACTA AAACTGGGGG TCCCTTTGGG ACAATGAAGT ACCCAGAAGA ACTTGCCCAT GGTGCTAATG CTGGGCTTGA TATTGCTGTT  AGGCTATTGG AGCCTATTAA GGAGCAATTT CTGATATTGA CTTATGCTGA TTTCTATCAG CTTGCTGGAA TTGTTGCTGT GGAAGTTACA GGAGGACCGG AGATTCCTTT CCATCCAGGA  AGACAGGATA AGACCGAGCC ACCAGTTGAA GGCCGCCTCC CTGATGCCAC GAAAGGTCCT GACCATCTGA GACAAGTCTT CATCAAGCAA ATGGGCCTTA CTGACAAGGA CATTGTTGCT  CTATCTGGTG CACACACCCT GGGAAGGTGC CACAAGGAGC GTTCAGGATT TGAGGGAGCT TGGACTTCCA ACCCTCTCAT CTTTGATAAC TCCTACTTCA AGGAGCTTTT GAGTGGAGAG  AAGGAAGGCT TGCTTCAGTT GCCATCTGAC AAGGCCCTGA TTGAGGATCC TGCTTTCCAC CCGTATGTGG AGAAGTATGC AGCGGATGAG GATGCCTTCT TTGCTGACTA TGCTGAAGCC 
CACTTGAAGC TTTCGGAGCT TGGATTTGCT GATTGCTGA 

Retrieve as FASTA