Entry information : PcLiP07_RF78 (PcLiPG_RF78)
| Entry ID | 2481 |
|---|---|
| Creation | 2009-05-28 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-09-22 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-11-24 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: PcLiP07_RF78 (PcLiPG_RF78)
| Name (synonym) | PcLiP07_RF78 (PcLiPG_RF78) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Lignin peroxidase [Orthogroup: LiP001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Phanerochaete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phanerochaete chrysosporium [TaxId: 5306 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichier |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references PcLiP07_RF78 (PcLiPG_RF78)
| Literature | Stewart,P. and Cullen,D., Organization and differential regulation of a cluster of lignin peroxidase genes of Phanerochaete chrysosporium, J. Bacteriol. 181 (11), 3427-3432 (1999) |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: A7U4T0 [Fragment] |
| DNA ref. | GenBank: AF140063 JGI genome: scaffold_19 (448641..450192) |
| mRNA ref. | JGI transcript: 8895 |
Protein sequence: PcLiP07_RF78 (PcLiPG_RF78)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence 651 Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic DNA (7 introns). Strain="BKM1767" and "RF78". Adjacent to LipI in the genome. Wrong splicing prediction in the NCBI accession AF140063 (7 introns instead of 8 (Stewart et al.)). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
