Entry information : BnaAPx01
| Entry ID | 2512 |
|---|---|
| Creation | 2006-07-05 (Nenad Bakalovic) |
| Last sequence changes | 2012-01-17 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-06-04 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: BnaAPx01
| Name | BnaAPx01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Bigelowiella | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Bigelowiella natans [TaxId: 227086 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Chloroplastic |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2512' 'complement(join(200014..200058,200169..200246,200365..200418,200507..200577,200719..200756,200862..200932,201010..201058,201170..201313,201369..201421,201503..201547,201639..201698)) ' |
Exons►
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Literature and cross-references BnaAPx01
| Literature | Archibald,J.M. et al., Lateral gene transfer and the evolution of plastid-targeted proteins in the secondary plastid-containing alga Bigelowiella natans, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (13), 7678-7683 (2003) |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: Q7XYM2 |
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_1 (201698..200014) |
| EST ref. | GenBank: 32307533 |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 51415 |
Protein sequence: BnaAPx01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (10 introns) and 1 EST. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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