Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
285 (262) |
PWM (Da): |
31302.16 (28022.1) |
Transmb domain: |
o256-278i |
PI (pH): |
6.64 (6.62) |
Peptide Signal: |
cut: 20 range:20-281 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MAMPIVDTEYLKQIDKARRELRAFIANKNCAPIMLRLAWHDAGTYDVNTKTGGPNGSIRTEEEYSHGSNNGLKIAIDFEEIKSKHPRITYADLYLAGVVAVEVTGGPTVDFVPGRQDSTVSPKEGRLPNATKGAPHLRDIFYRMGLSDKDIVALSGG HTGRAHPERSGFEGPWTREPLKFDNSYFIELLKGESEGLLKLPTDIALLDDPAFRPYVDLYADEDAFFNDYALSHKKLSELGFTPSSKTVIKDGVVLAQSAVGVLVTAAVVILSYLYEAR KKTK* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic and 10 ESTs. |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCGATGCCTATTGTAGACACCGAATACCTTAAACAGATTGATAAAGCTCGTCGGGAGCTTCGTGCTTTTATCGCCAACAAGAATTGCGCACCAATCATGCTTCGATTAGCGCGTAAG TCTTAAACATACATACATGCATGTATGACTGTATTGAAATTGATTATGATGATGTTGTTGTAGGTGGCATGATGCTGGAACATACGATGTGAATACGAAAACCGGAGGTCCCAACGGTTC GATTAGAACAGAGGAGGAGTATAGTCATGGCTCTAACAATGGATTGAAGATTGCTATCGATTTTTGCGCGGTCAATTTTTCTTTCTTATTAGGTCTTTGTGTGTCAAGTCGGGAGTACTT TAGTTTTTTCAACTGCAGGAATTAGTAACGTTGATATTGTTTGGCTGTTGTTGCTAGATATATAATATCACCACACTTACAGGATATGCTTAGTATTTTTGCAAGTAGGTTTAGGATTTG GAGGATATCCCTCCGGGCTTAAGCTTAAGGGGGCGTTTGGTTCGCGGGATGATTTGGAATTGGAATTGGAATTTGTATAGGAATTAGAATTTGAAGGAATTGGATTTGGAATTTAAACAT TCCAATTGGAATTGGAATCTCAATTCCATTTTTGTTGTGTTTGGTTGTCAAATGAATTGGAATCCATCACCCCGGCACCCACAACCACCAGTTCGGGTCGAAACGGTATGTGTCGAAACG GTTCGATTCGAAACGGTACAAGTCAAAACGGTACGGGTCGAAACGGTTCGCGTCGAAACGGTTCGATTCGAAATGGTACGGGTCGAAACTGTTCTCGTCGAAACGTTACGGGTCGAAACG GTACGGATTGAAACGGTGCGGGTCGAAACGTTCGAAGATTCCAATGAATTTACTTTAATTCCTTCACATATAGGAAGGATTTTGAATTACTTTAGTTAAAGGAATTTGAAGGAATTCAAG CCTAATTCCAATTCCAATTCCATTGTCAACCAAACACATGAAGATTGGAATTGAGATTCCAATTCCATCAAATTCTGTGAACCAAACATCTTAAGAGATGGAATTCAAATTCCAATTCCA TTGAATTCCAGCGAACCAAGCATTGTTGTTCATGCTGCAAACTTAAAATGAGTTCACATGCGCCAATTTAAGTAAATAAAATGACAGTGTCCCACTGGGTGAACCTATGTTATCAAAGGC GTGCACCTACAGGGCAGCCCAGCGCAGCATTTGCGCTATGCTCTCAAAGGTGCGGTCGCAAGTTCAAAGCATTTTCTGATTCTGGCCCAAAATGTTTAAAAAGGCTGGAATTATAACCTA AATAAGCATGAAATCGACCCAAGACAGCCCTAAACAAGCCTAAAACATGTTTAAAACCCCCAAAAATGGCATTTTATACTATGCACCTGGCTTAAAAAAGCCCTCCGCTTTTTAAGTGCC TGGCGCTTAGGGTCCAGGCCAGGCCTATGCACCTTGAGTGTGCCTTTACGCCATGACAACATAGGGGTGGACAAGGGGCTTCATAGCTTATTGGTCTATAGTGAAGAACTTAAAGTTACT AGAACATTGGTTTGATGATTTTAGGCTGACTTGTATTGGAACTGGTCAACTGGATATTGATGAGTTATCTTAAAAGTGCACACCCCTATCCGAAACCGTCTTGTGTAGGTGATAAAAGGT TTAGTTAAAGGACTTGAGCTCAAAACTTAAAAGCATTTTGTTTACTGTCAAGATTGAAATTGAACTCCTTAAACTGAGGCTTGTTGTGTTTCCACTTTCAATCTTTACAGCATTCTTGAT AGATTTGCTGTGTTATCTATAAAGAGAAAAGATATATACTTGAATAAACTACTTCTCCTGTTTGTTGCTTTAATGTGTATCCTCTTTCTTACCGCAGAGGAAATAAAGTCCAAACATCCA AGGATTACTTATGCAGATCTATATCAGAGGTGCATTCATTGATGCTAAAGAAGTTTGTATTGATACATTTAGACATAGGGGTTTCTAGTTTATTGTTTTGTGGTAACTTAACTCCTATTG TAACATATACACAAGCGCACACGGTATATAAAATGTGAAATGTAACTTACGGCTCACCACGAAAGGATCTCTGTTTGTAGCTTGCGGGAGTTGTTGCTGTGGAGGTTACTGGTGGCCCTA CTGTTGACTTTGTTCCTGGTAGACAGAGGTATCATGATTTATCACATTAGTTTTTCAAGTTTTTCTGTCAAGGTTCATTTCTTTTATTTTTCTTGCTTCTCTCCTGCACGACTGGTCACA TATCGTATCGTTTTATGCTTAATTTCTTTTTGAAATGTTACTCTCTAGACGACGCACATATATAAGAACGCGATGGGAATTATTCTTTCAGTAAATCTACTCTTCATTAACAAACTCTTA TCTTTTTTTCTAGGACTCAACGGTCTCTCCCAAGGAAGGCAGACTCCCAAATGCTACCAAAGAGGTTTTTGATCCTTATTTTATTCTTAATAAAATCTTTTATAAGAACTGAGGCCTATT TTAAATAGTGTCTCGGTAGTTACAAGATGATTCTTCGATCAGCGTCTCGTTCCTGATCTGAAACAGTTATATCGTTGACACGATTAATGAGTTTATAATTATAACTGTAATGACATCACT ACAGTTGAAGGGTGGTTTTTGTTCATCACCCACCAATGCAAGACTTGCCAATCAGTCATTGGCTAATTGCATGGTACCCTAATCTCACTCGGATGACAGATGATATGATTAAACGAATTC AAAGAACTGAAGGGAATCCTGAAATGGGTATTCTTTAATATTTCATAAACTCAAAACAAACTAACATAATGATCCCGATTGGCTGAAAGACGCCTTACATCCTTTGGATTGACGATGCGA ATTTTGTTAAATACAGACACCGGAAATGTTGAGAGAAAATTTGTAAGATGGTTGTTTGTGATTGCATTATAAAGATCTCTTGCTGATCCTACTGTACAGTTCAGCATCTGTTGTTTTCCC ACTTCTGTATTAATTGATTTTAACCGTCCTTGTATATAAGCAATAGTTGTCTAGTAATAAACAAGCTATTCACTAGACATATCAGTATCATAATAACACACATATATACTTTGTTAACTT TGATGAGGTAATATTGGTTAAAACCCCAATGCCTCTCAGGAAAGCATCGCCTCTTGTGTTGAGCAATTTATCCGTTTCCCCTTGATCAACAAGGGTGTTTTGGACATTTTGCTATGGTAC TAATTTCTGATATTGTTGAAAGTAGTCTATTTTCTCAACAAACAAGATTTTATCGATATCTTCATGAATGCGTATATCCAAAGGATTATATGAACACACGCCAAAATTTTTTGGACCTTC TACTTTATCTTCTAGAAGCAATTGTATTTTGCAAAACTCATGCCAACATAATCAAGTGAAACAATTGAAATACCTATGAATCTATGATGAATATTGACATGAACACTTGTTATATGCTAA AGTCAAACAAATACTGTTACTTATTTACCAACAATCATTTTCATTTCGTATTACTTTCTACAAAGCTCAACTTGTCTGTGAAGGATTTCACAAGGTCAAGTGTCCACTGGGAACTTTGTG TTATTGTTTACGTATTAATGTATTATACTCGTTACTTTCATCAATATGATAGGTTTTTAATTTTTCTAACATGTACTGATTTAGGTGCACCACACTTGCGGGACATATTTTACCGCATGG GTTTATCTGACAAGGATATTGTAGCCCTATCTGGAGGACACACCCTTTTGTACGTTGCTAGTTTCTTGTTAGACGAATACCTTAATAATACTCTTTTTTCCATTCATGTTAATGTTTTTC TTGTTTCTTGCTGAATTTTTGACGTTGCAGGGAAGAGCACATCCTGAAAGATCGGGCTTCGAAGGCCCTTGGACTAGGGAGCCACTGAAATTCGATAACTCATACTTCATATGTAAAACT GGATGAAGCTTCACTATCATTCTCATTTATACTAAAATAATCATTTTCTATATACTAATACGACACTAATACTGTGAAACCAGTGAACTTCTGAAAGGCGAATCAGAGGGGCTACTAAAA CTTCCTACAGACATCGCATTGCTGGATGATCCTGCGTTCCGTCCTTACGTTGACCTGTACGCCAAGAGGTATACCGTTTTCTTGTGTGGACGAGTTTGACTCAGTTAACAACACAATTTT CGACTCAATAAGTTGCGACAACAATGGCGGATATGTAAACCTAACTAGAAACTTTTACTATTTAACCATAATAACTTTAAAGTTTAAAGTTTAAACAACCAGCCCCCACACGCACCACCC CAACAGACATCCTTTAATAGGGTAGGAACCTACCTTAACGACTAAAATGGGAACCTATAACCAAACAAACATTAAAGCCAAATACAGTTGTGTGTTTGGTTTTGCCTAGATTGACAGTTG GGACCCTCTCTGGACTCTGACTAATGGTCTGCTCCCATTATCTGTCCCCACCCACCCTAACCTCCATTTCAACTTGCAAATAATAATAAAACACACTCACCTGTTGCCAACAACCTTTGC ACAGATTGTGCTCTTATTCAGGTACATTGTAAGTCATATGAAACTAAATCCTCCTGGCTGCAACATGACTTAGGTTCCTTCCTTCTTACACTAATTTTAAACTAATACTTGTACAGTACA TTCTCTTAATGCCACAATTAATCTCATTTGACTTTTTTATTTGATTGGTTGTTAACACATCTTTTTCCAAATTTATACCTTATTATTATATGGGATGACTAAAATGGTATTTTATGAGTT GGTAGGCGTCCTTTTCATTATATATTAAATATATTGATTTAACTGTACGTTTTTTCCATGTTCTGCTTAATTATTGAACATTATTTATTTATTTTTTTATATTTTATTTTCAGGATGAAG ATGCATTCTTTAATGACTATGCATTATCACACAAGAAACTCTCTGAATTAGGATTTACACCAAGCTCTAAAACAGTAATTAAGGACGGAGTCGTATTGGCGCAAAGCGCTGTTGGTGTTT TGGTTACTGCTGCTGTGGTGATTCTGAGCTACCTCTATGAAGCCCGCAAAAAGACCAAGTGA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCGATGCCTATTGTAGACACCGAATACCTTAAACAGATTGATAAAGCTCGTCGGGAGCTTCGTGCTTTTATCGCCAACAAGAATTGCGCACCAATCATGCTTCGATTAGCGTGGCAT GATGCTGGAACATACGATGTGAATACGAAAACCGGAGGTCCCAACGGTTCGATTAGAACAGAGGAGGAGTATAGTCATGGCTCTAACAATGGATTGAAGATTGCTATCGATTTTTGCGAG GAAATAAAGTCCAAACATCCAAGGATTACTTATGCAGATCTATATCAGCTTGCGGGAGTTGTTGCTGTGGAGGTTACTGGTGGCCCTACTGTTGACTTTGTTCCTGGTAGACAGGACTCA ACGGTCTCTCCCAAGGAAGGCAGACTCCCAAATGCTACCAAAGGTGCACCACACTTGCGGGACATATTTTACCGCATGGGTTTATCTGACAAGGATATTGTAGCCCTATCTGGAGGACAC ACCCTTGGAAGAGCACATCCTGAAAGATCGGGCTTCGAAGGCCCTTGGACTAGGGAGCCACTGAAATTCGATAACTCATACTTCATTGAACTTCTGAAAGGCGAATCAGAGGGGCTACTA AAACTTCCTACAGACATCGCATTGCTGGATGATCCTGCGTTCCGTCCTTACGTTGACCTGTACGCCAAGGATGAAGATGCATTCTTTAATGACTATGCATTATCACACAAGAAACTCTCT GAATTAGGATTTACACCAAGCTCTAAAACAGTAATTAAGGACGGAGTCGTATTGGCGCAAAGCGCTGTTGGTGTTTTGGTTACTGCTGCTGTGGTGATTCTGAGCTACCTCTATGAAGCC CGCAAAAAGACCAAGTGA |
Retrieve as FASTA
|
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
CTGTGGAGAT GAAGGTCAAA CACACAAACC AATGAACTCG ACCACAGAAG ATCACTTCTT CTGTTTTTAG CCTATCCATC TATAATATCT TCAGTGGTGT GTGTGCTCTT CCCAAGACTC
CACAGACACT CGCACTTTCA CCTTCACTGT GTGCATAATC AATGGCGATG CCTATTGTAG ACACCGAATA CCTTAAACAG ATTGATAAAG CTCGTCGGGA GCTTCGTGCT TTTATCGCCA
ACAAGAATTG CGCACCAATC ATGCTTCGAT TAGCGTGGCA TGATGCTGGA ACATACGATG TGAATACGAA AACCGGAGGT CCCAACGGTT CGATTAGAAC AGAGGAGGAG TATAGTCATG
GCTCTAACAA TGGATTGAAG ATTGCTATCG ATTTTTGCGA GGAAATAAAG TCCAAACATC CAAGGATTAC TTATGCAGAT CTATATCAGC TTGCGGGAGT TGTTGCTGTG GAGGTTACTG
GTGGCCCTAC TGTTGACTTT GTTCCTGGTA GACAGGACTC AACGGTCTCT CCCAAGGAAG GCAGACTCCC AAATGCTACC AAAGGTGCAC CACACTTGCG GGACATATTT TACCGCATGG
GTTTATCTGA CAAGGATATT GTAGCCCTAT CTGGAGGACA CACCCTTGGA AGAGCACATC CTGAAAGATC GGGCTTCGAA GGCCCTTGGA CTAGGGAGCC ACTGAAATTC GATAACTCAT
ACTTCATTGA ACTTCTGAAA GGCGAATCAG AGGGGCTACT AAAACTTCCT ACAGACATCG CATTGCTGGA TGATCCTGCG TTCCGTCCTT ACGTTGACCT GTACGCCAAG GATGAAGATG
CATTCTTTAA TGACTATGCA TTATCACACA AGAAACTCTC TGAATTAGGA TTTACACCAA GCTCTAAAAC AGTAATTAAG GACGGAGTCG TATTGGCGCA AAGCGCTGTT GGTGTTTTGG
TTACTGCTGC TGTGGTGATT CTGAGCTACC TCTATGAAGC CCGCAAAAAG ACCAAGTGAT TAAAATGTCA AACATGAAAC AAGGTACAAC TTTCTATGCA GGGGATACAG GTTACTGTGC
TATTATTGTT ATGTTCTAAA CTCCAGACAA CTTGACTTTG GGTTTGATTA GTTAATGGAC TCATACACAA TATACTAATG TGTACGTACT TAAATTCCTT TGTGTTGGGT TTATTAATAT
AACCTAGTTT TAAATCTGGC AAAAAAAA
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Retrieve as FASTA
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