Entry information : LePrx63 (Solyc01g104860.2.1[2.3])
Entry ID 2788
Creation 2006-01-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx63 (Solyc01g104860.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx63 (Solyc01g104860.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx015]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Seeds
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx63
start..stop
S start..stop
NtPrx81-1A 539 0 1..320 1..320
LePrx99 479 4e-172 1..320 3..322
GhPrx05 463 8e-166 6..320 8..322
CcampPrx36 461 3e-165 1..320 2..322
Literature and cross-references LePrx63 (Solyc01g104860.2.1[2.3])
EST ref. GenBank:   GO374118.1
Protein sequence: LePrx63 (Solyc01g104860.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (301)
PWM (Da):   %s   34658.4 (32417.2)  
PI (pH):   %s   4.91 (4.72) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-320
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALIFFILIL SHLVGMSHAQ LKVGFYGKTC PEAENIVTNV VRQVAASTQN IAPVLLRLHF HDCFVQGCDG SILLENGEIG ERHAFGHQGV QGFDVIERAK QEIEKVCPGI VSCADIVALA  ARDAVVVANG PSYEVETGRR DGLISNLTLA ANMPDVSESI QILKAKFSQK GLSEKDLVVL SAAHTIGTTA CFFMTQRLYD FVPGGGSDPS IDPSFLPELM AACPRNGDVN ARLSMDRGSS 
EEFDNNILQN VRSGFAVLRS DASLYEDVDT RNIVDSYFGI FSPFLGTSFE DDFANAMVKM GRIDVLTGKQ GKIRSVCSTF * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 1, 3 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACTCA TATTTTTCAT TCTAATTTTA AGCCATCTAG TAGGGATGTC ACATGCCCAA CTAAAAGTTG GTTTTTATGG CAAAACATGT CCTGAAGCTG AGAATATTGT TACCAATGTT  GTACGTCAAG TTGCTGCCTC CACCCAAAAT ATTGCTCCTG TTTTGCTTAG GCTTCATTTC CATGATTGTT TCGTTCAGGT TAGTTTTCTC TTAAATTTAC TAGTCAAACA CAAATTCAGA  ATTTAGAGTC AGTGCGCGCA CTAAACACTT CTTTCCTTGA AATTTATATA TGTAAAAATG ATTCGAGTTA AATTGATCAG GGGTGTGATG GATCAATTTT GTTAGAAAAT GGGGAAATTG  GAGAAAGACA TGCATTTGGA CATCAAGGAG TTCAAGGATT TGATGTAATT GAAAGAGCCA AGCAAGAAAT AGAAAAAGTG TGCCCTGGCA TTGTGTCTTG TGCTGATATT GTTGCTTTGG  CCGCTAGAGA TGCTGTTGTT GTGGTTATTT TTTTTTTTCA CTACACTGTT GAATTTTTTT TCATTGTGAC AAATTTATTG TTTTATTAAT GTATATATAA TAAATGTTCA ACAGGCTAAT  GGACCTTCCT ATGAGGTGGA AACAGGAAGA AGAGATGGAT TGATATCAAA TTTAACATTA GCAGCTAACA TGCCGGATGT TAGCGAGTCT ATTCAGATAC TCAAAGCTAA ATTTTCCCAA  AAAGGTCTTT CGGAGAAAGA CCTCGTCGTC CTAAGTGGTA ATTTATCTAT TACAATAGAT AACTCGATGT TATAATAACC TTACTATATA TAGTCAATTA AAGCTGATAT AGCGTATGTT  TCACCCTTAA TTAGAGATCT CGAGTTTAAG GTCTTGGTAT ATGAAAAATC CTATTGGGAG CGTCGCTTTC GAATACGCCC TACAGAGCAC GATCCAAATT TAATCGAAAT TTCTATGTGG  GCTTTGAATA ACGAGTGAAA AATCAAAAAA AAAACTTAGG ATAAAACTTT TTGTTATATA AGTTTACTAC CCTACACCCA CCACCCAAAA AAAAAAAAAC TCACAAACTT TGTGGGTTTT  TCTAGGTTTG GTAGACATTG AAGGGAATGT GAACATTGTC ATTAGCTATG ACACGATTTT GGACCTTTCT GTTTTTTAAT AGTACTTTTT TTTCTTCTAA TTAGATCCTT AATTAATCAT  ATTTTAAGAT AATTAGGACT TTCACTTTTA ATGGTACATT TTTTTTGAGA ATCTGACACG GAGGAAACAA TAAGAGTCTA AGTAGTAACC GCAGATCACG AGATAATTAC TCAATTAGGA  AATGGACCAC CTAAAAAACC ATATCCATAT TACTTAATGC AATCACCAAT TTACACATGA TTCTTGTGTT ATCTATCGAC TATTAATAAG CTAAGACATG TTAAATTTAA TTAATATTTT  TTATACTGTC AGTGATAGGT TTTTTTTTGC AGCTGCACAT ACAATTGGTA CCACAGCATG TTTCTTCATG ACACAAAGGT TATACGATTT TGTGCCTGGA GGAGGTTCTG ATCCATCCAT  TGATCCAAGT TTTCTCCCTG AACTAATGGC AGCTTGTCCA CGAAACGGAG ATGTTAATGC TCGATTATCG ATGGATCGGG GAAGCAGTGA GGAGTTTGAT AACAATATTT TACAAAATGT  AAGGAGTGGG TTCGCTGTGT TACGATCTGA TGCTAGTTTA TACGAAGATG TGGACACAAG GAATATTGTG GATTCTTATT TTGGGATTTT TAGCCCATTT TTGGGGACGT CTTTTGAGGA 
TGATTTTGCT AATGCAATGG TCAAAATGGG CAGAATTGAT GTGCTAACTG GAAAACAAGG CAAAATTAGA AGTGTATGTT CCACATTTTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACTCA TATTTTTCAT TCTAATTTTA AGCCATCTAG TAGGGATGTC ACATGCCCAA CTAAAAGTTG GTTTTTATGG CAAAACATGT CCTGAAGCTG AGAATATTGT TACCAATGTT  GTACGTCAAG TTGCTGCCTC CACCCAAAAT ATTGCTCCTG TTTTGCTTAG GCTTCATTTC CATGATTGTT TCGTTCAGGG GTGTGATGGA TCAATTTTGT TAGAAAATGG GGAAATTGGA  GAAAGACATG CATTTGGACA TCAAGGAGTT CAAGGATTTG ATGTAATTGA AAGAGCCAAG CAAGAAATAG AAAAAGTGTG CCCTGGCATT GTGTCTTGTG CTGATATTGT TGCTTTGGCC  GCTAGAGATG CTGTTGTTGT GGCTAATGGA CCTTCCTATG AGGTGGAAAC AGGAAGAAGA GATGGATTGA TATCAAATTT AACATTAGCA GCTAACATGC CGGATGTTAG CGAGTCTATT  CAGATACTCA AAGCTAAATT TTCCCAAAAA GGTCTTTCGG AGAAAGACCT CGTCGTCCTA AGTGCTGCAC ATACAATTGG TACCACAGCA TGTTTCTTCA TGACACAAAG GTTATACGAT  TTTGTGCCTG GAGGAGGTTC TGATCCATCC ATTGATCCAA GTTTTCTCCC TGAACTAATG GCAGCTTGTC CACGAAACGG AGATGTTAAT GCTCGATTAT CGATGGATCG GGGAAGCAGT  GAGGAGTTTG ATAACAATAT TTTACAAAAT GTAAGGAGTG GGTTCGCTGT GTTACGATCT GATGCTAGTT TATACGAAGA TGTGGACACA AGGAATATTG TGGATTCTTA TTTTGGGATT  TTTAGCCCAT TTTTGGGGAC GTCTTTTGAG GATGATTTTG CTAATGCAAT GGTCAAAATG GGCAGAATTG ATGTGCTAAC TGGAAAACAA GGCAAAATTA GAAGTGTATG TTCCACATTT 
TGA 

Retrieve as FASTA