Entry information : PtAPx02 (POPTR_0016s08580 / Potri.016G084800)
| Entry ID | 2873 |
|---|---|
| Creation | 2006-04-04 (Felipe Teixeira) |
| Last sequence changes | 2006-04-04 (Felipe Teixeira) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Qiang Li |
| Last annotation changes | 2012-03-07 (Qiang Li) |
Peroxidase information: PtAPx02 (POPTR_0016s08580 / Potri.016G084800)
| Name (synonym) | PtAPx02 (POPTR_0016s08580 / Potri.016G084800) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Salicaceae Populus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Populus trichocarpa (Western balsam poplar) [TaxId: 3694 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | Cytosolic |
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| Tissue types | Buds Leaves Stems |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2873' 'join(6654838..6654956,6655075..6655249,6655354..6655419,6656600..6656648,6656737..6656819,6656953..6657032,6657243..6657345,6657501..6657559,6657679..6657697)' |
Exons►
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Literature and cross-references PtAPx02 (POPTR_0016s08580 / Potri.016G084800)
| Literature | Ralph,S.G., Chun,H.J.E., Cooper,D., Kirkpatrick,R., Palmquist,D., Wynhoven,B., Kolosova,N., Oddy,C., Jancsik,S., Douglas,C.J., Liu,J., Butterfield,Y.S.N., Stott,J., Yang,G., Holt,R.A., Siddiqui,A., Jones,S.J.M., Marra,M.A., Ritland,K. and Bohlmann,J. The poplar transcriptome: Analysis of ca. 4,700 sequence-verified full-length cDNAs
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|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: Chr16 (6654838..6657697) |
| Cluster/Prediction ref. | JGI gene: 576642 UniGene: Pth.2200 |
| Omic ref. | ePlant: Potri.016G084800 |
Protein sequence: PtAPx02 (POPTR_0016s08580 / Potri.016G084800)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (8 introns), 1 mRNA and 36 ESTs. Very short last exons (FAEAY). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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