Entry information : ZmGPx01
| Entry ID | 2965 |
|---|---|
| Creation | 2006-04-18 (Marcia Pinheiro Margis) |
| Last sequence changes | 2006-04-18 (Marcia Pinheiro Margis) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | reviewer name not stored |
| Last annotation changes | 2010-12-23 (Marie Brette (Scipio)) |
Peroxidase information: ZmGPx01
| Name | ZmGPx01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Plant glutathione peroxidase [Orthogroup: Gpx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Zea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Zea mays [TaxId: 4577 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue types | Embryosac Flowers Mixed tissues Seedlings Seeds Stems |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '2965' 'complement(join(18615901..18615933,18616029..18616196,18616525..18616643,18616825..18616886,18618098..18618174,18618613..18618660))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references ZmGPx01
| Literature | REFERENCE 1 Lai J., Ma J., Swigonova Z., Ramakrishna W., Linton E., Llaca V., Tanyolac B., Park Y.J., Jeong O.Y., Bennetzen J.L., Messing J. Gene loss and movement in the maize genome. Genome Res. 14:1924-1931(2004).
REFERENCE 2 Swigonova Z., Bennetzen J.L., Messing J. Structure and evolution of the r/b chromosomal regions in rice, maize, and sorghum. Genetics 169:891-906(2005). REFERENCE 3 Swigonova Z., Lai J., Ma J., Ramakrishna W., Llaca V., Bennetzen J.L., Messing J. Close split of sorghum and maize genome progenitors. Genome Res. 14:1916-1923(2004). |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: Q6JAH6 B6TR92 [Mismatch] |
| DNA ref. | GenBank: 48374953 AY542310 (26223..28982) |
Protein sequence: ZmGPx01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (Chromosome 2, 5 introns), 6 cDNA and 157 mRNA. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
