The peroxidases and oxidases database
Entry information : GmRboh15 (Glyma19g42220)
Entry ID 3304
Creation 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-02-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh15 (Glyma19g42220)
Name (synonym) GmRboh15 (Glyma19g42220)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh15
start..stop		 S start..stop
GmRboh02 1777 0 1..871 1..885
CcajRboh03 1707 0 1..871 1..884
PauRboh04 1707 0 1..871 1..881
PvRboh02 1673 0 1..871 1..881
Literature and cross-references GmRboh15 (Glyma19g42220)
DNA ref. GenBank:   ACUP01011743.1 (108502..102067)
EST ref. GenBank:   GR837330.1 [3' end]   GR837331.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.52095
Protein sequence: GmRboh15 (Glyma19g42220)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   872
PWM (Da):   %s   99354.95 Transmb domain:   %s   o322-341i401-423o461-483i503-525o535-552i686-703o
PI (pH):   %s   9.19
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEIQLEQQQE SWSETSSTGS RSTRVGFSGP MSGPLDQEEE DFVEITLDVR DDTVSVQNIR GGDPETALLA SRLEKRPSSL SVRLRQVSQE LKRMTSSKKF DRVDRTKSGA ARALKGLKFM  TKNVGTEGWS QVEKRFHELA VEGKLPKTRF SQCIGMNESK EFAGELFDAL SRRRGITSAS ITKDQLREFW EQITDQSFDS RLQTFFDMVD KDADGRITQE EVQEIIALSA SANKLSKIQD  RAEEYAALII EELDPDNLGY IEIYNLEMLL LQAPAQSTNI TTDSRIMSQM LSQKLVPTKD YNPIKRGFRS LAYFVEDNWK RIWVILLWLS ICAALFTWKF IQYKHRAVFD VMGYCVTSAK  GAAETLKFNM ALILLPVCRN TITWLRSKTK LGMAVPFDDN INFHKVIAFG IAIGVGIHAI AHLTCDFPRL LHATDEEYEP MKPFFGEDRP NNYWWFVKGT EGWTGIAIVV LMAIAYTLAQ  PWFRRNRLNL PKPLKRLTGF NAFWYSHHLF VIVYGLFIVH GYYLYLSKEW YKKTTWMYLA IPMILYACER LLRAFRSGYK SVKILKVAVY PGNVLALHMS KPQGFKYSSG QYIFVNCPDV  SPFQWHPFSI TSAPGDDYVS VHIRTLGDWT SQLKAVFAKA CQPASSDQSG LLRADMLQGN NIPRMPKLVI DGPYGAPAQD YKNYEVILLV GLGIGATPLI SILKDVLNNM KQQKDIEEAM  VESGVKNNKR KPFATNRAYF YWVTREQGSF EWFKGVMDDV AEYDKDGIIE LHNYCTSVYE EGDARSALIT MLQSLHHAKS GVDIVSGTRV KTHFARPNWR SVFKHTALKH PGKRVGVFYC 
GAHTLVGELK RLSLDFSRKT NTKFDFHKEN F* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 19, 11 introns) and 3 ESTs. Unigene mix ESTs from GmRboh15 and 02. Position chromo Gm19:48239072..48245339
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGATTC AGTTAGAGCA GCAGCAGGAG TCATGGTCGG AGACGTCGAG CACGGGGAGC AGGAGCACGC GAGTGGGCTT CAGCGGGCCC ATGAGCGGCC CGCTGGTGAC GCCCAACAAC  AAGAAGAGCA GCAAGAAAAG CACGAGGTTC AAGGACCAAG AGGAGGAGGA CTTCGTGGAG ATAACGCTGG ACGTGCGCGA CGACACCGTG TCCGTCCAGA ACATCAGGGG CGGGGACCCC  GAGACGGCGC TGCTCGCCAG CCGCCTCGAG AAGCGTCCCT CCTCCCTGTC GGTGCGGCTC CGGCAGGTGT CGCAGGAGCT CAAACGCATG ACCTCGTCCA AGAAGTTCGA TAGGGTCGAC  AGGACCAAGT CTGGTGCTGC TCGCGCCCTC AAGGGACTCA AGTTCATGAC CAAAAACGTT GGAACCGAAG GCTGGTCCCA GGTCGAGAAG CGCTTTCATG AGTTGGCCGT TGAAGGGAAA  TTGCCCAAAA CGCGCTTCAG TCAGTGCATT GGTACGCACC AGTATTCTTT ATTGTTTTTG TTTTTACTTT ATACTACACC CCACTCACTG TGCATTTGGA ACAAACAATT TCTTTTTTTT  ATGAAATAAT TGTTTTTTTT TTAAATACAA AATATTCGAT CAAATATGCC CGATACTGAA AAAATTGCGT TTTGGACGCT AGATTGTGTG CTTGTTTGGA ACAAAATTAA CCAACGCAAA  TCCATAAACT CTTTCCACGT TCAATTGTCA AAATTTGCTG AAATGAGGCT TTGAAAAAAG TTTCCAAACT TGCAGACATT TTTATGATTT TATTAAACCT TTGTTAACAT TTCTAAATTC  TTTTACTGAT GTATGTATAT ATGATGAGTA TTATCAAATG AAATATAGGG TGGAGTAATA TTTTTTTTTT AATTTTTCTT ATACTTATTT TACACTTGAA TTGTTCTTTC TATTATTTCA  TCAAATGTTG CATCATTATC TACCATTATT AACCTATTCA AATTGGTGTA AGCAGATGAG TGTGTATATT ATAAAAAAAG TGTGAGAGTT ATTATCGTTT AGTGAAATTA AATAATTAAG  AATGGGTTAA AAAATATGGT AAATAAAAAA TGCGATTCGG TGGGACTGGT CAACATCGTA TATTTCTCCC TTCCTTTTTT ATAATAAGTC ATATCTAGAA GCTTATTACT TTATTACATA  AGTCACTTTA TAAATTATTA AATATTTTAA AATTTATCTT TAATCTCTAA TTATATCATG TTAAATTACT TTTACTTTTT TATAAACTCA AGATTATTAA CTAACTTTAA TAATTTTTAA  TCATTGTGAA TTAATTAATA AGAAAAATAG GAATTAAGTA AAAAAAAGCA ATCAGGGCAG AATAATCATT GGCATGGCCT ATGCTAGTTT TACTCCAATA ATTACCTTTC CTAAAACTAA  TTAATGTTGG ACGGAAATGA TATCTAGGCA TGAACGAGTC GAAGGAGTTT GCTGGCGAAT TATTTGATGC ATTATCTCGT CGCCGGGGCA TAACATCAGC TTCCATAACC AAGGATCAGT  TGCGCGAATT TTGGGAACAA ATTACAGACC AGAGCTTTGA TTCAAGGCTC CAGACCTTCT TTGATATGTA AGACTTCAAC TTCATCATCA TTTCCTTCGT GTTTTTTTTC ATTATCAATG  TCATAATTGA GAAATCTCCT CCGCTGCTCA TGATTAATTT TCTAAATCCT TATAAAGTAG TACTTTGTGG GACATTGCTT AGCAATTATT TCTCGCTATC AAACTGAGAA AAAAAAATAT  TAACAACGCC GCATTTCATG CATTTGCATG TGAAACATGC GTCATAATTA TTGACTCCAT AATATCATGA TACTAATTTA CAACGAAAGT TTCAGGTAGC AATAGGTATG AGAAAGTAAC  GTTTTTTGTA ATTAATGCAA ACGAGGAGTT CAAATAAAAA TATCTTTAAT TAATGAATGA AGTTTTGAGT GTAGTTCTTC GTTTATGCCA TAAGACTATA AGTATCACTA TCAATCATTT  TACGGTTAAT TATCCACTTT TTTGTTACAA AAAAAATTTG TATGTATATA AAAAAATAAA CACAGATACA TTTTTTATAT AATAAATAAT TTATTTGAGC TATGTCTTTC TTTGAGTATC  TGTTTAAAAT ATTGAAAAAT GATCTAAAAT AAAACTCTTT TAGAACTAGG TGATTCTACA ATTTTTTAGT GTGGAATTAA AGTTTTCACT AGGAGGTCAA CTTAATCCTA ACCACAATAT  TTATGGTGAA TTTTGGAACC CTATATTTTA ACTAAATAGT AAATTCCACG TGAATGTCAA ATCGCTAAAT GAGCTACACC TCCAGGCTAA AATAATGAAT TGGTCTAAAA CACTTACAGG  ACAAAAAAAG AAGCTTATTC TTTAAGGATG TGACTTGTTT TATTCGTTGT TCAAACCTTA GCATATTCTA TAGGATTAGG TGTTGAATAG TCGAGGGTAG AGTAGAAACT AAGAAGAAAT  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GATATTATTA ATTATTAAAT GATTTTTGAA TAGACGATTA CTATCTTCTC GATCAATCTT CACACATGTG TTTAATAATT ATGGATATTG ATTAAGATTA TGTATAGTGC TAATTGTTTA  ATAATTATTT TATGCAATAA TTTACTCTTA AAACTTTTTT TTATTTTTAA TTAATTAGCT AAATATGCAT GACTTTGGTT TCTATAGGTG ATAGCTTTTG GCATTGCAAT TGGGGTTGGG  ATACATGCAA TTGCACATTT AACGTGTGAC TTCCCAAGGT TGTTGCACGC AACGGACGAG GAATATGAGC CCATGAAGCC ATTTTTTGGA GAAGATAGGC CCAACAATTA TTGGTGGTTC  GTGAAGGGAA CCGAGGGTTG GACCGGAATA GCCATTGTGG TGCTTATGGC AATAGCCTAC ACTTTGGCTC AACCTTGGTT CCGACGAAAC AGGCTTAACC TCCCTAAACC TCTCAAAAGG  CTCACCGGGT TCAATGCCTT TTGGTACTCC CACCATCTTT TTGTCATCGT CTATGGGCTT TTCATCGTTC ACGGTTACTA CTTGTACCTC TCCAAGGAAT GGTACAAGAA AACGGTATGC  ATATGCATGC ACTATATATC TCCGTTTCCC TTTAATTTTG CTTTATATGA TTTTTTTTCT TCTTAATTTG GTCACACAAT TTATTGCCAC AGACTTGGAT GTATCTTGCA ATTCCTATGA  TACTATACGC ATGCGAGCGA TTACTTCGTG CTTTTAGGTC TGGCTACAAA AGTGTCAAGA TTTTGAAGGT ACATTAATTC TGAAGATTTT ACCTTCTCTT CTCTCTTTGA ATTAATTTCA  TTTTTGCTAT TAAATGGCCT TATACTAAAA TTTTAACGTT TTCTTCTTCT TAAAATTCAG GTTGCAGTGT ACCCGGGAAA TGTCTTGGCC TTGCACATGT CTAAACCACA AGGATTTAAG  TACTCTAGTG GACAGTATAT TTTTGTGAAC TGCCCAGATG TCTCTCCTTT TCAATGGTAA GTGAACATTC GTTTTCTTTA ATATTTTTAT AGCATATTAC CATTAAAATC AGGGGAGAGA  CGTTAACGAA AAAATTAACA ATTTTGTCGT GTGGCATCTG TAGGCATCCT TTCTCTATTA CATCAGCCCC AGGAGATGAC TATGTAAGCG TTCACATTAG GACTTTGGGT GATTGGACAT  CACAACTGAA GGCTGTTTTT GCTAAGGTGA ATTCTGCACT TGACAACCAC TTTTTCTTCA TTGGGAAAAA TATGCTAGTA CTTTTCCTCA AATATGTTTG CACAATATAA CTTACATTAT  TATTCAATTC ACGTCATTGA TGCAGGCATG TCAACCAGCA AGTAGTGACC AGAGTGGTCT TCTACGAGCT GATATGTTAC AAGGCAACAA CATACCAAGG TAACTTATGA ACTAGAGACA  ATGGTTTTAT AATTTAATTA AAACATCAAA TTGGTTCTTT ACTGACTCCA GTGAAACCGA AATTAATTGT AGGATGCCAA AGCTGGTGAT TGATGGTCCT TATGGAGCTC CAGCCCAAGA  CTACAAAAAC TACGAAGTAA TCCTTCTTGT GGGACTAGGA ATTGGTGCCA CCCCTTTGAT TAGTATACTC AAAGATGTGC TAAACAACAT GAAACAACAG AAAGACATAG AAGAAGCGAT  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Retrieve as FASTA