The peroxidases and oxidases database
Entry information : AtDiOx01 (At3g01420 / ALPHA-DOX1 / DIOX1 / DOX1 / PADOX-1)
Entry ID 3377
Creation 2006-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-12 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AtDiOx01 (At3g01420 / ALPHA-DOX1 / DIOX1 / DOX1 / PADOX-1)
Name (synonym) AtDiOx01 (At3g01420 / ALPHA-DOX1 / DIOX1 / DOX1 / PADOX-1)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtDiOx01
start..stop		 S start..stop
AlyDiOx01 1212 0 1..639 1..639
NoffDiOx01 1173 0 1..639 1..639
TsDiOx01 1156 0 1..639 1..639
ThasDiOx01 1066 0 1..639 1..639
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 162619..162726 108 N° 2 162191..162454 264 N° 3 161872..162021 150 N° 4 161640..161773 134
N° 5 161208..161424 217 N° 6 160960..161105 146 N° 7 160637..160864 228 N° 8 160342..160544 203
N° 9 160020..160263 244 N° 10 159689..159914 226  
complement(join(159689..159914,160020..160263,160342..160544,160637..160864,1609 60..161105,161208..161424,161640..161773,161872..162021,162191..162454,162619..1 62726))


exon

Literature and cross-references AtDiOx01 (At3g01420 / ALPHA-DOX1 / DIOX1 / DOX1 / PADOX-1)
Literature Ponce de Leon,I., Sanz,A., Hamberg,M. and Castresana,C. Involvement of the Arabidopsis alpha-DOX1 fatty acid dioxygenase in protection against cell death. Unpublished
Protein ref. UniProtKB:   Q9SGH6
DNA ref. Phytozome 12:   Chr3 (162726..159689)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   19663301 UniGene:   At.23359
Omic ref. ePlant:   At3g01420 TAIR:   At3g01420
Protein sequence: AtDiOx01 (At3g01420 / ALPHA-DOX1 / DIOX1 / DOX1 / PADOX-1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   639 (1265)
PWM (Da):   %s   73024.31 (143875.9)  
PI (pH):   %s   6.24 (7.97) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-1285
Sequence 942
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Send to Peroxiscan
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Remarks Complete sequence from genomic (9 introns), 3 cDNA and 93 ESTs.
Promoter►
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CGCAACTCTA TTTAAACATT TATCTTGTGA CGTTTCACAT AACAAGATAT ATCTACAATA ACCCCAAGAA ATTTAACAGA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +►
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TTTGATCATT TTAATGTGAT CTATGGCACT TCGAATGATT TTTTTTCTTC CTTTTTTGGC ATTTGTTGGC TGTGAGCTGT GTTTCGACAT TGTAATGTAC TATACAGATA AATAAATGGG  TGATATACAT GTGATTCAAT AAGTTGTTTG TAATACTCTT TTGTTATAAT TAAAATAATG TATATGCATG ATATAATTTT TATACCATTT TAATTACTTG TTCATTATTA TTAAAACGGA  AAATTTATTC ACACGACGTC GAGAGACTCC CTAAATGAGC AAAGCGTTTT TGAGTTTGAC ATTGGCGACA TTCAACACAA AAATAGTTAT TTGAAAGAAA TCGAAAGTAA ATGACTATTT  TTTGTATAAA TAAGATAACT AAATATTGAT TTTTAAGGTT TTAATGTCTA TATATGTATG TACTTGATGC TAAATCCTTG GTTTTTATTT TATTAAATTT GTTGAATAGT GAGTTGAATA  GTAATTAAAT AATTATGTGT TAAATTGGTA AAATTTTTAT CAAACTCTGA TTGGATACAG ATTTGATCAA ATCTCTTTTT ATCACCTTTG AATTAGTATA AAAAGACTTA CACGCATTCT  GCATTCATCA TTTAGACATA TATAACATTT TAGCCTGTTT CTTCTCTGTA GTCTTGTGCG CCTCGTCGTA ATTAATCACA GAAAATGAGA GGCGAAAAGA GAGTTAAAGA AGTGACTTGT  CTTTATAGTC GTCTATTATA TTATTTCATT GCCTATTTGC CTTGAGAGTA TCATTACAAA TCTTTTTAGA AACTGAACCC CTAGTTGTAT GCCCGAATAC GTGTAAGGAA ATTGTTGTTG  TATATAGATT TGATTTGATG TAGTTATTTG GATGATTTTT AATTGTATTA TGTCTCATCA TGGCTAGATA CGCAACAACA CTGAGGGCTG CGAATACTCT GTACCTTGGT AATTAGGTGC 
TTGTTCAAAG ATGTTCCAAT CCCAAGATAT CGATTAGGAC 

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DNA ►
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ATGAAAGTAATTACTTCCCTAATCTCTTCTATTTTGCTTAAATTCATCCACAAAGACTTCCATGAGATTTATGCAAGAATGTCCCTCCTCGATCGGTTTCTTCTTCTTGTAAGTAATTGA
ACTTTCACACATATATGCACGTAGAAACACATCCACACTTTTTTTTTCTTCGGATCATTAACTGAATTAAGGAATTTAAATCGTTACCGATATGTTTTTTTGTTTACATAGTGGAAAAAG
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GCAGTCAAAATAGTTTTTTCGGGAGAAATTGTCCCCCCGTCGATCAGAAATCAAAGGTAATCATTTTTTACCTTCATATATATGTGTATGAAAGTGTCGAATATGATTTGACGACTAATA
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CCCATGGTGGTGGCGACAAAACTATTAGGAAGGAAAAAGTTTATCGACACGGGAAAACAATTCAACATGATTGCAGCTTCTTGGATTCAGTTCATGATCCATGATTGGATTGATCATCTT
GAAGACACTCACCAAGTTCGTCAATTCTATTATTTTTCTGTTTAATCCATCATTTACGCACATGCACTTATCATATATATGTTTTTAACGAAAAAATTGATTTGGTAACTTAGATCGAAC
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CTTGGTGGTAATTCTTTTATTCTAACCTATTATATAAATCATCAAAAATGTGTTACATATTACTATTTACATTTTTGTGGGATCGGTTACGATCAAAATTTGTCGCAAAGGAAAAATAAA
TAAATTATTCTATAGATGATGATATATATGGACGACGCAAACACACATCCATGCATACATTTAAGTATATATATGATGACCATAAATAATTTGATAAATTAGGGATTCGAGCGTCATCTA
TGGAAGCAACTCGAAAACATTGGATAGAGTAAGAACTTACAAAGACGGGAAACTAAAGATATCGGAGGAGACGGGTCTCCTTCTCCATGACGAAGACGGTTTAGCTATCTCCGGCGACAT
TCGTAACAGTTGGGCTGGTGTCTCCGCTTTGCAAGCTCTCTTCATCAAAGAGCACAACGCCGTATGCGACGCCCTCAAGGTTTTTTTTTTTTTAATAAATTTTTTAATGTACATTACGAA
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AGCCGTGGTAGCCAAGATTCACACCATAGATTGGACAGTCCAGCTTCTCAAAACCGACACTTTACTTGCTGGGATGCGAGCAAATTGGTCAATATATACCACTTTTTTTTTTTTTGAATC
TATAATGAATCACGTTACGTACAGACGTTGCATTCTAACACTTTTGAATATTGTGATTTTAGGTACGGACTACTAGGAAAGAAGTTTAAAGATTCTTTCGGACATGCAGGCAGTTCGATC
TTGGGAGGTGTCGTGGGAATGAAGAAACCGCAAAATCATGGGGTCCCTTACTCTCTAACTGAAGATTTCACCAGCGTCTATCGAATGCATTCTCTCTTACCTGATCAACTCCATATACTT
GACATTGATGATGTACCAGGAACTAATAAATCACTACCGTTGATTCAAGAGTATAACTCGACATTTATATATATACATCTCTCTCCTATTTTGAAGTTTCCAAATTGTAAAAAAATTTAG
GGTTTTATTTCATTGGATTTAGGATTTCTATGAGAGATTTGATTGGTCGCAAGGGAGAAGAAACCATGTCTCACATTGGATTCACTAAGCTAATGGTCTCAATGGGTCACCAAGCAAGTG
GTGCCCTTGAACTGATGAATTATCCGATGTGGTTAAGAGACATTGTTCCCCACGACCCCAACGGCCAAGCTCGTCCAGACCACGTCGACTTAGCTGCTTTAGAGAGTAAGTCAACCTGAT
CTCAGCCGTTCATTGTTGTTTGACTTGATTCTCACGTGAATTCGGTTTTTTCGGTTATTTTAGTCTACAGGGACAGGGAGAGGAGCGTCCCACGGTACAACGAGTTCAGGAGATCTATGT
TTATGATTCCGATAACCAAGTGGGAAGATCTAACGGAGGATGAGGAAGCTATTGAAGTGTTGGATGACGTGTACGATGGTGATGTGGAGGAGCTTGATCTTCTCGTGGGACTTATGGCAG
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AATGGGTGAATACTACAGAGAGTCTCAAGGATGTGATTGATCGTCATTATCCTGATATGACAGACAAATGGATGAACTCTGAAAGTGCATTTTCAGTATGGGATTCACCTCCACTTACCA
AAAATCCAATCCCTCTCTATCTCCGAATTCCCTCTTAA

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CDS►
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GTGGATAAGATGGTTCCATGGCATAAGCTTCCAGTATTCTTGGGGTTAACCTATCTTGAAGTACGAAGACATCTTCACCAACAATACAATCTTCTCAACGTCGGTCAAACTCCGACTGGG
ATCCGGTTTGATCCTGCTAATTATCCGTACCGGACTGCTGACGGAAAATTCAATGATCCCTTTAATGAAGGCGTCGGCAGTCAAAATAGTTTTTTCGGGAGAAATTGTCCCCCCGTCGAT
CAGAAATCAAAGTTACGGAGGCCAGACCCCATGGTGGTGGCGACAAAACTATTAGGAAGGAAAAAGTTTATCGACACGGGAAAACAATTCAACATGATTGCAGCTTCTTGGATTCAGTTC
ATGATCCATGATTGGATTGATCATCTTGAAGACACTCACCAAATCGAACTTGTCGCTCCAAAAGAAGTAGCGAGCAAGTGTCCCTTAAGCTCCTTTAGGTTCTTAAAGACCAAGGAAGTC
CCTACCGGTTTCTTCGAAATCAAGACTGGCTCGCAAAATATCCGTACACCTTGGTGGGATTCGAGCGTCATCTATGGAAGCAACTCGAAAACATTGGATAGAGTAAGAACTTACAAAGAC
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AAAGAGCACAACGCCGTATGCGACGCCCTCAAGGATGAGGATGATGATTTGGAAGACGAAGATTTGTACCGGTACGCTAGGCTAGTGACCTCAGCCGTGGTAGCCAAGATTCACACCATA
GATTGGACAGTCCAGCTTCTCAAAACCGACACTTTACTTGCTGGGATGCGAGCAAATTGGTACGGACTACTAGGAAAGAAGTTTAAAGATTCTTTCGGACATGCAGGCAGTTCGATCTTG
GGAGGTGTCGTGGGAATGAAGAAACCGCAAAATCATGGGGTCCCTTACTCTCTAACTGAAGATTTCACCAGCGTCTATCGAATGCATTCTCTCTTACCTGATCAACTCCATATACTTGAC
ATTGATGATGTACCAGGAACTAATAAATCACTACCGTTGATTCAAGAGATTTCTATGAGAGATTTGATTGGTCGCAAGGGAGAAGAAACCATGTCTCACATTGGATTCACTAAGCTAATG
GTCTCAATGGGTCACCAAGCAAGTGGTGCCCTTGAACTGATGAATTATCCGATGTGGTTAAGAGACATTGTTCCCCACGACCCCAACGGCCAAGCTCGTCCAGACCACGTCGACTTAGCT
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GAAGTGTTGGATGACGTGTACGATGGTGATGTGGAGGAGCTTGATCTTCTCGTGGGACTTATGGCAGAGAAGAAAATCAAAGGTTTTGCTATCAGTGAGACTGCTTTTTACATTTTCCTC
ATCATGGCCACAAGGCGATTAGAAGCGGATAGGTTTTTCACGAGTGATTTCAATGAAACGATTTACACGAAGAAGGGGCTTGAATGGGTGAATACTACAGAGAGTCTCAAGGATGTGATT
GATCGTCATTATCCTGATATGACAGACAAATGGATGAACTCTGAAAGTGCATTTTCAGTATGGGATTCACCTCCACTTACCAAAAATCCAATCCCTCTCTATCTCCGAATTCCCTCTTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
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AACTAACACA CTAAGGTTTT CTTACAACCC TCGCAACTCT ATTTAAACAT TTATCTTGTG ACGTTTCACA TAACAAGATA TATCTACAAT AACCCCAAGA AATTTAACAG AATGAAAGTA  ATTACTTCCC TAATCTCTTC TATTTTGCTT AAATTCATCC ACAAAGACTT CCATGAGATT TATGCAAGAA TGTCCCTCCT CGATCGGTTT CTTCTTCTTA TCGTGCATGG AGTGGATAAG  ATGGTTCCAT GGCATAAGCT TCCAGTATTC TTGGGGTTAA CCTATCTTGA AGTACGAAGA CATCTTCACC AACAATACAA TCTTCTCAAC GTCGGTCAAA CTCCGACTGG GATCCGGTTT  GATCCTGCTA ATTATCCGTA CCGGACTGCT GACGGAAAAT TCAATGATCC CTTTAATGAA GGCGTCGGCA GTCAAAATAG TTTTTTCGGG AGAAATTGTC CCCCCGTCGA TCAGAAATCA  AAGTTACGGA GGCCAGACCC CATGGTGGTG GCGACAAAAC TATTAGGAAG GAAAAAGTTT ATCGACACGG GAAAACAATT CAACATGATT GCAGCTTCTT GGATTCAGTT CATGATCCAT  GATTGGATTG ATCATCTTGA AGACACTCAC CAAATCGAAC TTGTCGCTCC AAAAGAAGTA GCGAGCAAGT GTCCCTTAAG CTCCTTTAGG TTCTTAAAGA CCAAGGAAGT CCCTACCGGT  TTCTTCGAAA TCAAGACTGG CTCGCAAAAT ATCCGTACAC CTTGGTGGGA TTCGAGCGTC ATCTATGGAA GCAACTCGAA AACATTGGAT AGAGTAAGAA CTTACAAAGA CGGGAAACTA  AAGATATCGG AGGAGACGGG TCTCCTTCTC CATGACGAAG ACGGTTTAGC TATCTCCGGC GACATTCGTA ACAGTTGGGC TGGTGTCTCC GCTTTGCAAG CTCTCTTCAT CAAAGAGCAC  AACGCCGTAT GCGACGCCCT CAAGGATGAG GATGATGATT TGGAAGACGA AGATTTGTAC CGGTACGCTA GGCTAGTGAC CTCAGCCGTG GTAGCCAAGA TTCACACCAT AGATTGGACA  GTCCAGCTTC TCAAAACCGA CACTTTACTT GCTGGGATGC GAGCAAATTG GTACGGACTA CTAGGAAAGA AGTTTAAAGA TTCTTTCGGA CATGCAGGCA GTTCGATCTT GGGAGGTGTC  GTGGGAATGA AGAAACCGCA AAATCATGGG GTCCCTTACT CTCTAACTGA AGATTTCACC AGCGTCTATC GAATGCATTC TCTCTTACCT GATCAACTCC ATATACTTGA CATTGATGAT  GTACCAGGAA CTAATAAATC ACTACCGTTG ATTCAAGAGA TTTCTATGAG AGATTTGATT GGTCGCAAGG GAGAAGAAAC CATGTCTCAC ATTGGATTCA CTAAGCTAAT GGTCTCAATG  GGTCACCAAG CAAGTGGTGC CCTTGAACTG ATGAATTATC CGATGTGGTT AAGAGACATT GTTCCCCACG ACCCCAACGG CCAAGCTCGT CCAGACCACG TCGACTTAGC TGCTTTAGAG  ATCTACAGGG ACAGGGAGAG GAGCGTCCCA CGGTACAACG AGTTCAGGAG ATCTATGTTT ATGATTCCGA TAACCAAGTG GGAAGATCTA ACGGAGGATG AGGAAGCTAT TGAAGTGTTG  GATGACGTGT ACGATGGTGA TGTGGAGGAG CTTGATCTTC TCGTGGGACT TATGGCAGAG AAGAAAATCA AAGGTTTTGC TATCAGTGAG ACTGCTTTTT ACATTTTCCT CATCATGGCC  ACAAGGCGAT TAGAAGCGGA TAGGTTTTTC ACGAGTGATT TCAATGAAAC GATTTACACG AAGAAGGGGC TTGAATGGGT GAATACTACA GAGAGTCTCA AGGATGTGAT TGATCGTCAT  TATCCTGATA TGACAGACAA ATGGATGAAC TCTGAAAGTG CATTTTCAGT ATGGGATTCA CCTCCACTTA CCAAAAATCC AATCCCTCTC TATCTCCGAA TTCCCTCTTA ATTTGATCAT  TTTAATGTGA TCTATGGCAC TTCGAATGAT TTTTTTTCTT CCTTTTTTGG CATTTGTTGG CTGTGAGCTG TGTTTCGACA TTGTAATGTA CTATACAGAT AAATAAATGG GTGATATACA 
TGTGATTCAA TAAGTTGTTT GTAATACTCT TTTGTTATAA TTAAAATAAT GTATATGCAT GATATAATTT TTATACCATT TTAATTACTT GTTC 

Retrieve as FASTA