Entry information : PtaAPx01(PTA00010022)
Entry ID 3497
Creation 2006-08-15 (Felipe Teixeira)
Last sequence changes 2006-08-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-04 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaAPx01(PTA00010022)
Name PtaAPx01(PTA00010022)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Roots
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaAPx01
start..stop
S start..stop
PabAPx01 458 2e-166 1..245 1..245
GbAPx06 421 2e-151 1..245 6..250
CroAPx02 403 1e-144 1..245 1..245
CpapAPx02 400 2e-143 1..245 1..245
Literature and cross-references PtaAPx01(PTA00010022)
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.18545
Protein sequence: PtaAPx01(PTA00010022)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   245
PWM (Da):   %s   27027.83  
PI (pH):   %s   6.24
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALVYPQVSE EYRLAVESCR RKLRGLIQEK HCAPLILRLA WHSAGTYDAN TKTGGPFGTI RNKGELSHAA NAGLDNAVKL LQPIKEQFSI LSYADFYQLA GVVAVEVTGG PSVTFHPGRI  DSDEIPEEGR LPDATGGSDH LRKVFNRMGL EDKDIVALSG GHTLGRCHKE RSGYEGPWTK TPLIFDNSYF KELLIGEQEG LIQLPSDKAL LQDPIFSKYV HLYAKDENAF FADYAEAHLK 
LSELG 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 4 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTTAG TATATCCTCA GGTAAGCGAG GAGTACAGAT TGGCTGTTGA AAGCTGTCGC AGAAAGCTGC GAGGATTAAT CCAAGGTACG CTTCATTAAA CATTAGTCTG GAACTTGCAG  GTATGGACAC TTGTGAATCA CGTTACAATT CGAACATGAT CGTGATTTTT TTTGTTGTTT ATTGGTAGGT ATGTATATTT GTAAGTGAGT TATGATTTCG AACATGATTT TGATCTAGTG  CGGTTTAAAA TGTATTAGCA CTCTGAAAAA CCATTGCTCT ACTCTAATTT TATAAATTAA ACAAAATTTT TAAAATTCTT TCCTAGATTT TAAACAAATT TAACTTTAAG CACTTAAAAA  AAGTAATGTT ATCTATTAAT TAGACTAAGT TGTGAGTTAT TAGACTACGT TGTGAGTTAT CAGTAAATCT TTTGTATGTT TTGTGGACAG AAAAACACTG CGCTCCACTC ATTCTGCGAT  TAGCGTGAGT CTGCATCTCT CAATGACTTT GTTTAGTTTC TTGCTATGGT GATATTTGGA TCTGCGAGAG AAATTATACA CTAATGTTTG CTAATTGATT CATCAGATGG CATTCCGCCG  GGACGTATGA TGCAAACACT AAAACTGGAG GACCTTTTGG AACCATCAGG AATAAGGGGG AACTCTCTCA TGCTGCCAAC GCAGGACTTG ACAATGCTGT GAAGCTCCTT CAACCCATTA  AAGAACAGTT CTCCATTCTT AGCTATGCAG ACTTTTATCA GGTAATGAAA CCAGTTGTTG CAACTTTCAT ATAACCCTAT GTATGGGATT CCAGAAATGT CTGTATATTG CCAAGGATTT  TTATGGAAAC TTCTGACACC TCCTAAGTAT GGGATTCCAG AAATGTCTGT ATATTACCAA GGATTTTATT GAAATCCGTG AATTGTTGGC TGAAACTTCT GACACCTGCC AAGTATGGGA  TTCCACAAAT GTCTGTCTAT TACCAAGGAT TTTATGGAAA TCGGTGAAGC GTTGGCTGAA ACTTCTGACA CCTCCTAAGT ATGGGATTCC AGAAATGTCT GTATATTACC AAGGATTTTA  TGGAAATCGG TGAAATGTTG GCTAAAACTT CTGACACCTT CCAAGTATGG GATTCCAGAA ATGTCTGTAT ATTACCAAGG ATATTATGGA AATCGGTGAA GTGTTGGTTG AAACTTCTGA  CACTTCCTAA CTATGGGATT CCAGAATTGT CTTTATATTA CCAAGGATTT TATGGAAATC GGTGAAGTGT TGGCTGAAAC TTCTGACACT TCCAAGATAC TACACAGTAT TTCAGAAGAA  TATCAACATA ATTATACTTA TGCTTGTGAA AATTAACATG CTGAAATTTT ATGGAATTTA TTTTGATTTA TAACTTCTAA TTGTATTCAT TTTTTTTCAC TAGACGATTA GCTTCTCTAG  CAATCATACA TAGAAGAAAT GCTACTGTTT AAAATTCACG AATCCTTAAT TGAATTATAT TGTCACCATA AATACTACAG CTTGCAGGGG TTGTAGCCGT TGAGGTTACA GGGGGGCCCT  CAGTAACTTT CCATCCAGGA AGGATAGTAA GTCTTCTGCT ACCAAAACAT AAATATATAG ATAGATAGAT TTTGATGTGT TTGGTGTAGC AGTTATAATG ACTTTCAAAT CTACTGAATC  CTGCAGGATA GCGATGAGAT CCCTGAAGAA GGCAGGCTAC CTGATGCCAC TGGAGGTAAC AGGAGTATTC TTCTCATTAC AAACTCAGTG ATATCAGTCA GTCTTTTGTA CATATGTCTG  AAATGGCATG TTCATATAAT GTGCATGAAT TTGTGATAGC AGGTTCCGAC CACCTTCGAA AAGTTTTCAA CAGAATGGGA TTGGAAGACA AGGATATAGT AGCACTCTCT GGAGGCCACA  CTCTGGTAAG CATTGAAAAA GTTGAGATAT GTTTGCTATA AAATGACATG GGTTTTGGGA CTCTTACACT ATTTGTATAC TATGCTACGC TCATTTTGAT ATCATATAAA GAGTTATATG  ATACTCTTTA TATGATATAA AGAGTAAGGG GTAGAATTTG TTTAATAGAA TTAGAAAATA AATTATAATT TAGTTGTTAA TTAAATGGAA ATGGTTAGTT GTTATGAGTT AATGTAGGCT  GACCCATTAT TATTAAAGGA AAATCAAGCT ACTTGAAATT ATTCCACTTG TGGTTAGTAA AGGATAGGCT TTCACTCCTA CCATCTTAGT TTTGAACAGA ACCTTGGGCA GTGACCCTAT  TTTATAAGTT AAAGAAAAAA AATCTTAACC AAACAAAAGC AATTTTAAAA TGGAGTTGTC TTTACTGCTA CTTTTTGGAC ATTCCCCTAC TTGAATCAGG CCAAAAAATT TGAGGTGAAA  TCTTGATTTG TGTTATTTCA ACTGGTTTTT TTATTGTATA AATTGATTCA ACACACAAAA CCTTTAGGGC ATTTCTATTG TGCAGGGGTT ACCATCAGAC ATGTGATTTC AATAAATTCC  TGACAGATTT AAGAGAAATT AAATCTGAAA AACCCACAAA AAAACTTCTA AAAAATCTCA CTAAAAACAA TTAATTTTAA AATATATTCT AAACCAAAAA AATTATTnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn ATTTAAATTT  AAATATAATA TTACAATATT TAAATTCAGA TTTAGCTTTG AATATCCTAT AAACAAAATA GGGATGAAAT TAAATAATTA ACACACAATT AAACTAAAAT TAAAAGCAAT AATTAACACA  CAAATATACT TACACAGCCA TCATATTTTA CCTCTATTGA GAACGGTGTT CGATACGAGC TATCTCCACA AACAATTAAA AGTTTGAGAT AGTTTCTCTC TAATCATCCC TAAAGACAGA  GATCTATGAG ATAATAGTAA TAATTCAATT CTTGAGATAG TTTCTCCCCA ATCATCTGTA AAAACAAAGA GACGCCTGAG ATAATCTCTC CCTGATTGTA ATTATTTTTA TGTTTTAATC  ATCTCAAAAA ACAATGAGAT TCCTGGGATT ATCTCTCGCT GGCAATAATT CTTTTCTTCT TTCAGTTAGA GGTTGGGCAT ATAATTATTT GAGAATTATG TAAAATTAAA TTGACAAAAA  TAATTGAACA TTTGCAAATT CTAAATAAAT TTTATAGCTG TAAATATTCT ATTTGAATTT AAACTTTTAA TTTAGTAAAT TTCTACTCAT ATTCAATCAT ATAAATATAA TATTCTAATT  TTTTTGGAAT ATGATGTTAG ACTGTTTTTA ATAGGTAAAT TATTATTAGA TTAATTTCAT TTATTAAAAA TGGAAATCTT CCAAATTATT CTAGAATTCA AGGCCTTAAG CTATTTCACA  TATTAAAGGT TTACCCCAAT ATTATTTGAC TACCTTCATG CACGGGAAAA GATGGACAAA CTTTTTTATG TTTTTGTACC AACCATCCCA CAGTATTTGG ATCCACGTTG AAGGCTATAA  ATTAGATCTC ATATTCAAAG TTTAAGCAAG CACTCATAAA CTTACTAGCA CACCACATAT CCATAATCCT AATAATAGTT TCTATTGATT TACTTGTAAT GATTTATTTC TTATGGCAGG  GAAGATGTCA CAAGGAGAGA TCCGGATACG AAGGTCCATG GACAAAAACT CCACTAATAT TTGATAATTC CTACTTCAAG TATGAACTCT AACATTCACT TTAGCTTATT GTATAATTGG  GCCATTTCAT GTGTTACTGT CTAATGGTTG TTAACTTGTG CATCATCAGG GAACTCTTGA TTGGTGAACA AGAAGGCTTG ATACAGCTCC CTTCCGACAA GGCTCTTTTG CAGGATCCTA  TATTTAGTAA ATATGTCCAT CTTTATGCTA AGGTACAATA ATTAAATTTG CCTCTCGCAT GTTGTATTTT AGAGTTTAAT ATTTTGAGAG TTTCAAGTGA AAATTCTTAT TCCAATTACA 
TGAATATTGC AGGACGAGAA TGCATTCTTT GCTGATTATG CAGAGGCTCA TCTAAAGCTT TCTGAGCTTG GGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTTAG TATATCCTCA GGTAAGCGAG GAGTACAGAT TGGCTGTTGA AAGCTGTCGC AGAAAGCTGC GAGGATTAAT CCAAGAAAAA CACTGCGCTC CACTCATTCT GCGATTAGCA  TGGCATTCCG CCGGGACGTA TGATGCAAAC ACTAAAACTG GAGGACCTTT TGGAACCATC AGGAATAAGG GGGAACTCTC TCATGCTGCC AACGCAGGAC TTGACAATGC TGTGAAGCTC  CTTCAACCCA TTAAAGAACA GTTCTCCATT CTTAGCTATG CAGACTTTTA TCAGCTTGCA GGGGTTGTAG CCGTTGAGGT TACAGGGGGG CCCTCAGTAA CTTTCCATCC AGGAAGGATA  GATAGCGATG AGATCCCTGA AGAAGGCAGG CTACCTGATG CCACTGGAGG TTCCGACCAC CTTCGAAAAG TTTTCAACAG AATGGGATTG GAAGACAAGG ATATAGTAGC ACTCTCTGGA  GGCCACACTC TGGGAAGATG TCACAAGGAG AGATCCGGAT ACGAAGGTCC ATGGACAAAA ACTCCACTAA TATTTGATAA TTCCTACTTC AAGGAACTCT TGATTGGTGA ACAAGAAGGC  TTGATACAGC TCCCTTCCGA CAAGGCTCTT TTGCAGGATC CTATATTTAG TAAATATGTC CATCTTTATG CTAAGGACGA GAATGCATTC TTTGCTGATT ATGCAGAGGC TCATCTAAAG 
CTTTCTGAGC TTGGGTAA 

Retrieve as FASTA