Entry information : PtaAPx02(PTA00023182)
Entry ID 3498
Creation 2006-08-15 (Felipe Teixeira)
Last sequence changes 2006-08-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-04 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaAPx02(PTA00023182)
Name PtaAPx02(PTA00023182)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Roots
Shoot tips
Somatic embryos
Xylem
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaAPx02
start..stop
S start..stop
PpAPx02 498 0 1..250 1..250
PgAPx02 491 2e-179 1..250 1..250
PabAPx02 491 2e-179 1..250 1..250
PsiAPx01 488 3e-178 1..250 1..250
Literature and cross-references PtaAPx02(PTA00023182)
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Pta.4666
Protein sequence: PtaAPx02(PTA00023182)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   250
PWM (Da):   %s   27829.04  
PI (pH):   %s   5.83
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYKRYPTVSE EYQKSVEKCK RKLRGLIAEK KCAPIMLRLA WHSAGTYDFK TKTGGPFGTI RHPDEIAHNA NNGLDIAIRL LEPIKEQFPM ISYADFYQLA GVVAVEITGG PDIPFHPGRP  DKTEPPEEGR LPDATKGVDH LRDVFGHMGL SDKDIVALSG GHTLGRCHKE RSGFEGAWTS NPLIFDNSYF KELLSGEKEG LLQLPSDKAL LEDPIFRSYV EKYAADEDAF FADYAEAHLK 
LSELGFAEEE 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (incorrect prediction, extra exon in 5' with a very large intron) and 118 ESTs.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATAAGC GATATCCTAC AGTAAGTGAA GAATACCAGA AATCCGTGGA GAAATGCAAG AGGAAGCTTC GCGGCCTCAT TGCAGAGAAG AAATGCGCTC CGATCATGCT CCGTCTCGCG  TGAGTTTTGA TAATCAATCA ATCTTGTAAA GCTTTTGTTT GAATGACTTT GTTTTGGATC GAAGTTAAAG ATCCTGTAAA TTTGCTTCAG ATGGCACTCT GCTGGAACTT ATGATTTTAA  GACCAAGACG GGAGGACCTT TCGGAACGAT TAGGCACCCG GATGAGATCG CACACAATGC CAATAATGGT CTTGACATTG CGATCAGGCT GCTGGAACCC ATCAAGGAGC AGTTTCCTAT  GATTTCATAC GCCGATTTCT ATCAGGTACG TTTTAGGCAC TGAATCTTGT TTTTCTTGGG GTTTTGGCAG TTAGGGTTTG GGGTTTGTGT GGGGTTTGTG GGGCATTGAT AAATTTGGTC  TGCTGAACTG CAGCTCGCTG GTGTCGTGGC TGTTGAAATT ACAGGAGGGC CGGACATCCC TTTCCATCCA GGAAGACCAG TAAGAACCGG CCATAAAACT CCATCCATGT TAATGGAAAT  TGTGTGTGCT GTTAACAAGC TGATAGTGGT GTAGGTTTTG GCGTGTATTT TGTAAATATT CCATTATCAT GCCATGATAA ATTTGAATGT GTTCCCTTCT TCTGTTGTGC AGGATAAAAC  TGAGCCTCCA GAGGAGGGCC GTTTACCTGA TGCCACTAAA GGTATGATCA CTGCCATCGT TTTATATATC AATGAATTTA TAACTACCGC CTATCCATCT TAACCCCGGA GTGATGGAAG  AGGTTATCAA ATTCTTCAGG TGGTAATTTA AATGTTTTTG CTTCTACTTG GTATGCTTGA ATATAGTCTT TAAAGGTACT AACAGGTCTA TTATGACTAT GCCACCGAAG GTACGATCAG  TGCCCGTGTA TTATATATCA ATTAATTTAT TACTACCACC AATCCATCTT ATCCCCAGAG TGATGGGAAG AGGTTATCAA ATTCTTCAGG TGGTGATTTC AATATTTTTG CCTCTGCTTG  GTATACTTGA ATATGGAAGG TATTGTGACT GAATTTATAA CTACCACTGA TGCGTCTTGG ACCCAGACCT ATGGGAAGAG GTTATCAAAT TCGTGGAGGC ATAAATTTCA ATGTTGTTGC  AATTACTTGG TATGCTTAAA TACTATTTAG CTGGTTGCTT GTTAGGAAAC ATGAATAGGT TCATGATTGG TTGTAGTATA AAGTTCCTAA TATGCCAGGA TTTTTATGTC ATCGGGTATT  CACATAGGTA ATGATTTATC TATTAACATA ATGGTTGATT GGGTGTGAAC TTGATACTCT TGCTTTCTCA AATTTTCCTT CCTTACTCTT ACATGACATC TTAGAATTGT TTCTGTCACT  GACATCTCTG CTCTCCTCTG TCTCTCGATT CCTTTTTAGT TATCTCTTGT CACCTCTCTG CTCATAACAG ATTTGCAATT AGGATATGTT TCCAGAGCAA ATAGCATCTT GAAATTGTTT  TCAGGCCTAT GAAATCTTCT CCTCTATTGC TCTCCCCTGA TACGTAGGTG TGCATATCTG GAATTAGGTT ACCGTGTCTC CATAGCAAAT GGTCTTTAAG TTTGTGCTGA TAGCATTCTG  GAAACATCCT TGGTATAGTT AAATAGCTTT TTAAGTCCTT GAGGTTTGTG GGTATGCAAA TATTGATATA GTTACCTCTG GCCAAAATAA TATATGTCAA TAGCAATCGC AATGTTCTTG  AGCTGCTCCT CTGCATTTTA GAAGACTACT TGGGAAACAT CGATATTGCT ATCTCTTGCT AAGATGATAT GTGTCAGTAC TAAGTAGCAG TCGTGTTTTT GGGAATTCAC TATACAATTT  AAGCTGTTGC GTGTATGAAA ACGTCCATAA TCTTGGTTGA TGGTAAAGTT TCATACAGCC TTAAGGGGTC TTGGTTGGAT AGGAAAGTAA CATGTTTAGC TACTTGGTGC CTATTGCAAG  TCCTACCTTT GCAGATACCA GTCATCCACC CAGGGCATCG TAGTCAAATG GATCTTCAAA GAGTGTTCAA AGCTGATTAT AGTCCATTTT AAATTCTCCA GCTACAACCC ATTTGAAGAA  TTGGGCTTTG GCTTCTTAGT CAAATGGACT TTCAGAGAGT GTTCAATGCT TTGACTACAG TTCATAGTAA ACTCTTCAGC TGCAGTCCAA TGTAAATTCT TCCAGATGGA AGAGGGGCTT  GGTTGCTCTA CAGAAACAAA TTGTCCAAAA AAATCAGTGA TATAGCTACC TCTTGCTATT TCTGGACTAT ATGTGCCAGT GCCTGATCTT ACACTCCACT ATGAATATGT GCCTGTATCT  CATGCTGAGT GTTGACAACT TAATTTGAGT GTCAGGTTAG TCTTCTTAGA TCTCCTTGGG TTGTACAATG GGCCTGTATT GAATTTATCT TTTCGAATTG TGCTTGCAGG GGTTGATCAT  TTGAGGGATG TGTTTGGTCA CATGGGCTTA AGTGACAAGG ATATTGTGGC ACTTTCTGGT GGCCACACCT TGGGTAGATG CCACAAGGAG CGATCTGGCT TTGAGGGTGC ATGGACGTCC  AATCCTCTGA TATTTGACAA TTCCTATTTC AAGGAACTTC TTAGTGGAGA GAAGGAAGGT TTGCTTCAGC TTCCTTCCGA TAAGGCATTG TTGGAGGATC CGATTTTCCG ATCTTATGTG  GAGAAGTACG CAGCGGTATG TGCTAGTAGC CAACCTTTTT TTTGGAAATT CAATTTTAAA GTACTCATTG CCAGTTTTCT TTTCTGGAAA ATGAAAAACC ATATGATGAA TCATAGCCAT  TTTGAGTAAG TTTGGCATTA GCGATTATAT GCTTTGAATC CTTGATCCTG CCTCGCTATG GGTATGTGAC AATCTCGTTG GAATAACTCA ACTGTTTGTA AACAGGATGA GGATGCCTTT  TTTGCTGATT ATGCGGAAGC TCACTTGAAG CTCTCTGAAC TGGGGTAGGT TAACATTATT AATTTTTTTT TTTTTATAAC CAATGCTTTC TTGGCAAGTG CAACGTGGTC TTCATATAGT 
AAATTCTACA TCTCTTACAT TTCAGGTTTG CAGAGGAGGA GTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTATAAGC GATATCCTAC AGTAAGTGAA GAATACCAGA AATCCGTGGA GAAATGCAAG AGGAAGCTTC GCGGCCTCAT TGCAGAGAAG AAATGCGCTC CGATCATGCT CCGTCTCGCA  TGGCACTCTG CTGGAACTTA TGATTTTAAG ACCAAGACGG GAGGACCTTT CGGAACGATT AGGCACCCGG ATGAGATCGC ACACAATGCC AATAATGGTC TTGACATTGC GATCAGGCTG  CTGGAACCCA TCAAGGAGCA GTTTCCTATG ATTTCATACG CCGATTTCTA TCAGCTCGCT GGTGTCGTGG CTGTTGAAAT TACAGGAGGG CCGGACATCC CTTTCCATCC AGGAAGACCA  GATAAAACTG AGCCTCCAGA GGAGGGCCGT TTACCTGATG CCACTAAAGG GGTTGATCAT TTGAGGGATG TGTTTGGTCA CATGGGCTTA AGTGACAAGG ATATTGTGGC ACTTTCTGGT  GGCCACACCT TGGGTAGATG CCACAAGGAG CGATCTGGCT TTGAGGGTGC ATGGACGTCC AATCCTCTGA TATTTGACAA TTCCTATTTC AAGGAACTTC TTAGTGGAGA GAAGGAAGGT  TTGCTTCAGC TTCCTTCCGA TAAGGCATTG TTGGAGGATC CGATTTTCCG ATCTTATGTG GAGAAGTACG CAGCGGATGA GGATGCCTTT TTTGCTGATT ATGCGGAAGC TCACTTGAAG 
CTCTCTGAAC TGGGGTTTGC AGAGGAGGAG TAA 

Retrieve as FASTA