Entry information : PtaPrx52(PTA00062024)
Entry ID 3592
Creation 2006-08-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2006-08-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx52(PTA00062024)
Name PtaPrx52(PTA00062024)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx076]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Xylem
Inducer Mechanical damage
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx52
start..stop
S start..stop
PabPrx121 584 0 6..334 4..333
GbPrx24 517 0 32..334 28..331
CmichPrx06 499 1e-179 7..333 1..331
SmPrx08-1_40 384 3e-134 9..331 5..328
Literature and cross-references PtaPrx52(PTA00062024)
Literature Li L., Zhang X.-H., Joshi C.P., Chiang V.L.;
Compression stress responsive expression of ferritin (Accession No. AF028072) and peroxidase genes (Accession No. AF028073) in the developing xylem of loblolly pine (Pinus taeda) (PGR98-064);
Plant Physiol. 116:1604-1605(1998).
Protein ref. UniProtKB:   O22602
EST ref. GenBank:   AF028073
Protein sequence: PtaPrx52(PTA00062024)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336
PWM (Da):   %s   36092.18  
PI (pH):   %s   6.35
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLGTNTMAGS GVALMLMVVS SGWMLIDLVS AQGTLDPNFY SKTCPNVVQI VATVVNKHLK QDNTIGAPIV RMFFHDCFVR GCDASVLLIS PNKTAERDSI PNLTLSQFDV IDEIKSNLEK  ACPGVVSCAD ILALAARDAV LQSGGPTWAV ELGRRDGLTS RSSDAISHLP SSRSNAQALI DSFSSNGLSI RDLVTLSGAH TFGKSHCSTV SWRLYGPTKG GIDPTLNKTY AVGLMNQCTL 
PINANATIPL DPSTPNIFDK NYFQDLLQNE GIFASDSALV IDSRTKVFVK EYANDEDSFR DQFGDAMIRL GRVQILTGQQ GEIRKRCGFV NSNSAV 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTGGAA CTAATACTAT GGCTGGTTCG GGGGTAGCAT TGATGCTGAT GGTAGTAAGC TCAGGCTGGA TGTTAATAGA TCTAGTCTCT GCACAGGGCA CCCTGGACCC AAATTTTTAC  AGCAAGACTT GTCCCAATGT GGTGCAAATT GTTGCCACTG TTGTTAACAA GCATTTGAAG CAGGACAACA CTATAGGAGC TCCTATTGTT CGCATGTTCT TCCATGATTG CTTCGTGAGG  GTGAGTACTT GAGTCATATT GGAATTACAA GCAGCAGTAA TAGTCCTTTG GGTATTAAGT ATTTCAGTTA TATTGGAATT AAAAGCATCA TTAATAGCCC TTTGGGTATA ATTAATGCTC  TGTTTATTAT GAGTAAAGTT ATTGAGAAAT TTGGGTTTTG TGCTGGTTTT GTGTAGGGCT GTGATGCATC TGTTTTGTTG ATTTCTCCAA ATAAAACTGC AGAGAGAGAT TCAATTCCCA  ACCTCACTCT CAGCCAATTT GATGTTATTG ATGAAATAAA GAGCAATTTG GAGAAAGCAT GCCCAGGTGT CGTTTCCTGT GCGGATATCC TGGCTCTTGC TGCCAGAGAT GCAGTTTTAC  AGGTGAGATC ATAGCTCTCT TCCAGACTGT TTGGCTACAA TAGTATTGTT GTGGGTTTGG TATAAGAAAG CTGCTTTATA AGGTAAGGAG ATCTTAGTAA TAAAAGCATT ACTGCACATC  TGAAATACAA TCAATGAAAA GTAATATTTA AGGCTAGTCT CAGCAAAAAT ACCAGTTGCC TCTTTGGGAA AGTCACAGTA TGCCGCTTGG TTGTGCTTGG AGCTATATTG TTCACAGATT  AATTCTTTGA TCAGGATAGT GATGAGAATT ACACCATTCT TGTGTTTTGG AACAAAAGTA TGGATTGCGT ACTCCTACAG ATTTTGCAGG TCTCAGGGTT ACATTGTAAT TGGATGGAAG  GGAAACCAGA TAACTATACT TATCTTTATT TTTTCCGGTT TTGAGAATAT TTTTTATTTA TTTTCGTTAT CTTGATTGTT GAATCCAGGA ATATTCTGTT ATCATATAGA TACAAATGAA  GTTAAAAAAT TAATTCCAAA ATATTCTATA AATCAACAAT AAGTTAAGTT TAGGGGATAA TCTGATAAAC ACTCACAATC ATGGTTCACA ATAACACACA ATAAAGCCGT GATAATTAAA  ATTGTCTGAA CAAAAAATAA ACTGACATAA CTATTCATGA AGAGATTTTT AAAAAGATAA CTGGAAGTAA TTGACACATT TCAACCATAC ATAGTCAAGA ATAAACTATG GCGTAAAGCA  AATCTCTTTT TCAGATGGAT TCTTTTTTCA TAACTCAATT TAGAATTTTG TTTTATTTTG AAATTCTAAA TTAATTTAGA ATTTTGTCTT ACTTTGAAAT TGTAAATTTA AATTGAGATA  TGTTGTAACT TATTAGTGAA TAATTGTATT TGATGTAATA GTGAAAGGAA ATCAATAAAT TTATTTATAA ATTAAAAAAT GTAAAACTGA AATATGTTAG CTTGAAGTTT CTTCAATTGT  GTGAGTTCAA ATATTCAGAA ACATATTGTA ACTGGCTAAT TTGTGAATAA TTGTATTTGA TGTAATAGTA ACAACTTATA AGTTAAAAAA AAATTCCATA CATCATTGAA ATATAAATAA  ACTAATATTA CGCCAAAATG TTATTGCAGT CAGGAGGACC CACATGGGCT GTTGAACTGG GTCGAAGAGA CGGGCTTACA TCTCGCAGCT CTGATGCAAT ATCTCACCTT CCTTCGTCTC  GATCCAATGC CCAAGCTCTC ATCGACAGTT TTAGCTCTAA TGGTTTAAGC ATAAGAGACC TTGTCACTCT TTCAGGTATG ACTAATAGAT TTTAATCTTT TTAATAGTAA TTATGAATGA  ATGTGGCAAT GAATTGGGCA TATTTTGATC CTAGATTCTA GAAATATTTA GAAATAGATA GATAGTGAAT CAACGGTTTG TATCTAATTT CAAAATATTC CCAAATTCTA AATATATTTT  TCTGTAATAG ACACAAGTTA TACACAAATG AGTCAATATG GTTTCCATTG TTTCACAGGC GCCCATACAT TTGGTAAATC CCACTGCTCT ACTGTTTCAT GGCGCCTCTA TGGACCCACA  AAGGGCGGGA TCGATCCTAC ACTGAACAAA ACATATGCAG TGGGCTTAAT GAACCAATGT ACCTTACCCA TCAACGCAAA TGCAACAATC CCACTGGACC CATCTACTCC GAACATATTC  GACAAAAACT ACTTCCAGGA TCTGTTGCAG AATGAGGGCA TTTTTGCCTC GGACTCTGCA CTGGTAATCG ATTCCAGGAC CAAGGTTTTT GTGAAAGAGT ATGCTAATGA TGAAGACTCT 
TTTCGTGACC AGTTCGGTGA TGCCATGATC CGCTTGGGCA GGGTTCAGAT CCTGACTGGC CAACAGGGTG AGATTCGTAA GAGATGTGGT TTTGTCAATT CAAACTCAGC TGTGTAG 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTGGAA CTAATACTAT GGCTGGTTCG GGGGTAGCAT TGATGCTGAT GGTAGTAAGC TCAGGCTGGA TGTTAATAGA TCTAGTCTCT GCACAGGGCA CCCTGGACCC AAATTTTTAC  AGCAAGACTT GTCCCAATGT GGTGCAAATT GTTGCCACTG TTGTTAACAA GCATTTGAAG CAGGACAACA CTATAGGAGC TCCTATTGTT CGCATGTTCT TCCATGATTG CTTCGTGAGG  GGCTGTGATG CATCTGTTTT GTTGATTTCT CCAAATAAAA CTGCAGAGAG AGATTCAATT CCCAACCTCA CTCTCAGCCA ATTTGATGTT ATTGATGAAA TAAAGAGCAA TTTGGAGAAA  GCATGCCCAG GTGTCGTTTC CTGTGCGGAT ATCCTGGCTC TTGCTGCCAG AGATGCAGTT TTACAGTCAG GAGGACCCAC ATGGGCTGTT GAACTGGGTC GAAGAGACGG GCTTACATCT  CGCAGCTCTG ATGCAATATC TCACCTTCCT TCGTCTCGAT CCAATGCCCA AGCTCTCATC GACAGTTTTA GCTCTAATGG TTTAAGCATA AGAGACCTTG TCACTCTTTC AGGCGCCCAT  ACATTTGGTA AATCCCACTG CTCTACTGTT TCATGGCGCC TCTATGGACC CACAAAGGGC GGGATCGATC CTACACTGAA CAAAACATAT GCAGTGGGCT TAATGAACCA ATGTACCTTA  CCCATCAACG CAAATGCAAC AATCCCACTG GACCCATCTA CTCCGAACAT ATTCGACAAA AACTACTTCC AGGATCTGTT GCAGAATGAG GGCATTTTTG CCTCGGACTC TGCACTGGTA  ATCGATTCCA GGACCAAGGT TTTTGTGAAA GAGTATGCTA ATGATGAAGA CTCTTTTCGT GACCAGTTCG GTGATGCCAT GATCCGCTTG GGCAGGGTTC AGATCCTGAC TGGCCAACAG 
GGTGAGATTC GTAAGAGATG TGGTTTTGTC AATTCAAACT CAGCTGTGTA G 

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