Entry information : HsGPx06
Entry ID 3605
Creation 2006-08-23 (Marcia Pinheiro Margis)
Last sequence changes 2016-06-28 (Harold Duruflé)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-06-28 (Harold Duruflé)
Peroxidase information: HsGPx06
Name HsGPx06
Class Animal glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx1006]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Chordata Mammalia Hominidae Homo
Organism Homo sapiens (human)    [TaxId: 9606 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Testis
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HsGPx06
start..stop
S start..stop
PtroGPx06 438 2e-159 1..221 1..221
MmulGPx06 427 4e-155 1..221 1..221
BtGPx06 377 2e-135 1..220 1..220
RnoGPx06 343 8e-122 1..221 1..221
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1..87 87 N° 2 4840..4993 154 N° 3 9315..9432 118 N° 4 9942..10041 100
N° 5 11246..11452 207  
join(1..87,4840..4993,9315..9432,9942..10041,11246..11452)


exon

Literature and cross-references HsGPx06
Literature Kryukov G.V., Castellano S., Novoselov S.V., Lobanov A.V., Zehtab O., Guigo R., Gladyshev V.N.Characterization of mammalian selenoproteomes. Science 300:1439-1443(2003).
Protein ref. UniProtKB:   P59796
DNA ref. GenBank:   NC_000006.11 (28483520..28472072)
mRNA ref. GenBank:   AY324826
Cluster/Prediction ref. Genebank:   257202 UniGene:   Hs.448570
Protein sequence: HsGPx06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   221 (202)
PWM (Da):   %s   24667.48 (22490.4)  
PI (pH):   %s   6.5 (6.51) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-221
Sequence 262
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MFQQFQASCLVLFFLVGFAQQTLKPQNRKVDCNKGVTGTIYEYGALTLNGEEYIQFKQFAGKHVLFVNVAAYUGLAAQYPELNALQEELKNFGVIVLAFPCNQFGKQEPGTNSEILLGLKYVCPGSGFVPSFQLFEKGDVNGEKEQKVFTFLKNSCPPTSDLLGSSSQLFWEPMKVHDIRWNFEKFLVGPDGVPVMHWFHQAPVSTVKSDILEYLKQFNTH

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 6, introns 4), 3 cDNA and 1 EST.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
GAAGGGCTAG CGACTGACAG AAATAACTAC CCTGTCTCCC ACCTGCAGGA ATGTCTAACA AAGCATCCAT CTTCCTCCTT CTTTGCTCCA CACTCGTGCC TACCCAGCCT CCTGATGACC  AAACCATCCT GTACTACCCA AGCACCTGCT TAGCATGTGT GTGTAGCTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTATGGATAT GTAGAATTGT ATTTGTTGGT ATATGCATAG GTGTATGTAT  GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT TGAAGATTAA GGAAAAGAAC ACCTATCTCT CCAACTCTCT GATCCTGAAA TATCTATTCC AAAGGAAAAT CATATTTTAG GGTAGATGAA  TCAGACTATC CTGTGTCCCT AAAAAAGCAA TCCCGAGAAG TTGTGACATC TATCCCTTCC CCTTCCTGAA AGTTTTAAAG AAAGCAGGAG CTGGCCGCAA GACTCTAGGC CTCCTTCATA  GCCTCTCTCC TCTAAGATAG GCATGCATTG TTAAACTCTT TTCTCCTTAA TTCTCCTTTA TTCCCCTGCC ACCCAGTAGT TCTCATGTAG GACCTCTGAA GGCAGAGTGA GAGCAGAAAC  CCCACCTCAC ATGAAGGGAA GGGCATCTCC ATGATGGTGG ATCCCAAAAC CCCTCTGGGT CGCACCCTGC CAGAGCCTTC CTTGGTGCCT GTCCCTTAGT GCATTCAGGT CATGGCACCT  GGGCAGGGGT GTCCCTGTAT TCTGAATGAT GGGCTTTCTC CTCACCCTGA GCCTCCTCAA CTTTAAGCTT ATTTTGATCA CTGTCTCAAA TTTAAAAATT CTGCAGCAAC CTGGCTCTGT  GTGGTGTTTT CCCAGTCCCA TATTATGTCC AGTCATACTT CTTCTTTCTC TGTCACTTTG TCCCTGCTTT CTTGATTCCC TTGTCTTGTT CTTCAGTATT TTGTTTTTCT CAAAAATGCT  CTAGAACTTT CCTTGGCACA TATAAAAGCA CGGCTGGAAC TGGTTGCTCA GAGCTGCTGT GACCGTGAGC ACAGATCTCT TCGTGTCAGG TCCCTCTGCA CCCTCCCGTT CAGGTCTCTT  GACCAGGCCC CTACATGACA GGAATCCTTG CCTCTCAAAG AATCCTCTCT CTCTCTCTAC AACAAATATG CATATGTTTG TTTTTTTTTT TAAGTATTTA TTGATCATTC TTGGGTGTTT  CTCAGAGAGG GGGATTTGGC AGGGTCATAG GACAATAGTG GAGGGAAGGT CAGCAGACAA ACATGTGAAC AAAGGTCTCT GGTTTTCCTA GGCAGAGGGC CCTGCTGCCT TCTGCACTGT  TTTTGTCGCT GGGTAGTTGA GATTAGGGAG TGGTGATGAC TCTTAACCAG TATGCTGCCT TCAAGCATCT GTTTAACAAA GCACATCGTG CACCGCCCTT AATCCATTTA ACCCTTAGTG  GACACAGCAC ATGTTTCAGA GAGCACAGGG TTGGGGGTAA GGTTATAGAT TAACAGCATC CCAAGGCAGA AGAATTTTTC CTAGTACAGA ACAAAATGGA GTCTCCTATG TCTACTTCTG  TCTACACAGA CACAATAACA ATCTGATCTC TCTTTCTTTT CCCCACATTT CCCCCTTTTC TATTCGACAA AACCGCCATT GTCATCATGG CCCGTTCTCA ATGAGCTGTT GGGTACACCT  CCCAGACGGC GTGGCGGCCG AGCAGAGGGG CTCCTCACTT CCCAGACAGG GCTGCCGGGC AGAGGGGCCC CCCCACCTCC CAGACGGGGC GGCGGCCGGG CAGAGGGGCT CCCCACTTCC  CAGACCGGGC AGCTGGGCAG AGGCGCCCCC CACCTCCCGG ACTGGGCGGC TGGCCGGGCA GAGGCTGCCC CCCACCTCCC GGACGGGGCG GCTGCCGGGC GGAGACACTC CTCACTTCCC 
AGACGGGGCG GCTGCCGGGC GGAGGGGCTC CCCACTTCCC AGACCAGGCG GCTGCTGGGC GGAGGGGGTC CTCACTTCTC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AGAATGTGGG AACACCAAAA CCTATGAAGT TGGGGTTTTA GGCCATTTGA CCTACTGATG AGGTCCATAA TGAAATGTCT CCTTACCTCT CAAGGGCTCA TTACTACAAG GTGAGCAAAT  GTAAATTGTC CCAGATAGTA AAGATTTCAT CACAGTAATT ATGATCCAAA TGGAACCAGA GCAAGAGCTC TGGAGTAGGA CGCAGAAGTT GCCTTCATTT CACTGTTACC CACCTTGTGA  CTTTTTATAT GTTATCTCTC TCTCTGAGCT TCAGTTTTCT CATACATGAA ACTATGTGAA TACAGTTCTA GTTGTTTACC ATTGTCAGGC CATGTGGTAA GTGCTTTATA GTTATTATCA  CATTTAATTG TTACAGCAGC CCTACAAGGT AGATAATATT ATTATTCTGA TTTCACAGAT GAGAAAACTG GGGACAGACA CATTAACTTT GATTTCAGAT TCAAGGAGCT AGTCAGTGGC  ACTGACAGGT ATTGAATTCA ATGGTCTTTA TAGCCTCGTA GTCAAAGTTT CAGCCATTTT TTTGAGCTAA AAGCAGGAGA AGGGTAAAGA ACTTGGGAAT GTGTGTAGGT CTGTTCCATA  AGAGGCAAGC ATCTGACCTG CTGCCTTAAG GAGCTGCATA GCTGGATCAG GTATCAGTGA TCAGGACATA GATTATAGGC TTTTGAAAAG AGTTCAGAAA TCTGAGATAA CTAAAAGCTT  GTCTTTCAAG AGAGTTCATA AGAACTCAAC CCCACCCAGA CTTTAGTTTC AAGAGGCAGA GAATGCCTTT TGTGTGAAGC TGGCAGAGGC AACGCAGGTG GAGCAGGCTC GATGGTGAGG  GGTTTACAAC TGAAGAGGAA GGGGGTGTGT GTAGGGAGTG GAGGTGGGTG TGTATGAATG CCACTCTGCG ATTGGAGGGT GCTTCTTCAA ATTGGTCCCT GCCAGGGGCT CAAAAGGGGC 
TGAAATCCTG GGGACCTCAG AGTCGTCTAA AACTCCTAGC C 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGTTCCAGCAGTTCCAGGCCTCCTGTCTTGTCCTGTTTTTCCTGGTTGGCTTTGCTCAGCAGACCCTAAAGCCTCAAAATAGGAAGGTGAGCATGGGGCAGGGGATCCGAGCTGATTCCA
GCACGTGATGACCAACCTGGCTGCCAGAGTTGCAAGGAGTTCTCTACTCTCCCCTTTCGAAGGACAAGATCTGCATTCCCAGCCCTTCTTCACAAATCCTGACATTGCTATCCTTAGCAG
GCTCTCCCTAAATCCACTGTCTCTTACTTGCATCTTTTCCTCTGCACCTAGTAGCTCTTTGAACTGAATGTATGTGGAGTGGGGTTGGGGGGCTGCCTCAGCACATTCCCCTTTGCCACT
TCCCCCTGGTGGCCCCTTGATAGCCTAGAGCCTGTCCCCTTCATGCTGGTCCATAACTTGGAGTAGCGCTGTGGATCCCAACAAATGAGGCATGAAGTCGCAAATGGATTGACAGGGAGG
CTGCCCTGGTTACTCCTGGAGAGGCTGCTCAGCCAGAAACCCAGAGGGAGAGGTGAGAGAATCTGGGCTTGCGATCTGCACTAGGAGTTTCTAGGTCACAGAAAGAGGAGCTCCCCACCA
CCACACCCCTAGAAAAATAAAATGCATAAGGCCAATATGGTTGTCCACTAATATTAATTTTAGGGAAGGTCATGAGGTGAGGTAGAGACAAAGCTCAGCTCAGAGTAGGCTTTGTTCTCA
GATCTTGGTGTTGCTCCCAAATCTCCTGATGCCATTTAGAAAAGTCCCCCCACTGGATGTCCATAGTCACCCCTGTGAAAGATGTGTATATATGTCTTAGGATGCGGACTGAGCAGATCA
CCTGAGGCACCCGCAAATTTTAACTTTAAAATCAGATGAATTTATTCAAAAGCAGCCTCAGTGGTGGCCATATGCCAATTATATATCTTTTGTTAGTTCCTTTCTGTCCTCTATAAAAGG
TGGCGTACAATGCCTATCATATAATGCAGTGATTCCCAGACTTGAGCTTACCTAAGAGATAGCTGGTTAAAGCACAATTGCTGGGCCCCACCCAAGACTTTCTGATTCAGTAAGTTTTAG
GGGGAGCCCAGGAATTTGCATTTCTAAAATGCTTCCGGTTGATACTCATGCAGGTCTCCACACCTGAAGCTTTGAGCTTTAATCTCTGTTACTGGATTCATATGAAGTGTAAGATGGTGC
CTATTACAAGCCATAAGACAGCTTACTTACTTACTTTCCAGAAAGGTAACAGATCACTTGAACGGACAACCTCCAAGGGTCATCAGATCTATGTCAGCCACTGCTGCCTGGTTGGGTGTG
GAATTCTCGATGTAAAATAGCATCTTGTGAATTAAAAGCTGTGTTCTAGGGTATTCTGTCTTCTTCAAACAGATGTAAGCAAACTAGAGCAGAACTGAAAACTGGGTAGGAAGGATTGAG
CTCTTCGAGTCTGCAGTTTTCGTGGGATTCTGCATCTCATTTCACAGAGTGACATCCTCATGAGAACCAAATCTTTGGAAGTTGTTGCACCCAGAGCTAAGGTAGCACAAAGGCAAGAAA
ATGGAGGCATACAAATGACAGCTCACATGGTGATTTCCGTGTGACTTTTTATTATAGTAGCAAGAAAGACAAATGCTGGAAATTATTTAGCTCAGACGTAAGGTGTCATGAAGGCAAAAC
GAATGCAGGCATATAGATGATAACTCCATCATAGTGGGTTTCTTAGGCTAATGTTCCCAAATATTGTGACTAATGTATATGCACAGATGTGTACAGAAATATGGACTTGAAAGGGCTTGC
CCCTTGGTCAAGCCTCCTTCTCTCCAAGGATAATGAAGGAGAAGCTGTGGCCTTGTGTCGTGGTAACAGACTCAGAAGATGATAAAGAGTTTCTTGCCCCACTCTGCCCACAGTAGCTCA
CCCACAGGCAATTCCTTCCCTGCATGGGGTATGCTTTTATGGACTGAGATCCTGTGAAGCCCAGTTTAAATTACTCTAAAATTCTATGATTTTTCTTCATATGGCCAGGACTTATAGCCT
CTCTTACCACATAACATGTTAGCCTTTTGTTCCAGGTTCTGTATGCCTTTTATTCTTGGCATGCTTGTGGGTAGAAAAGTTTTTCCGCTCTGTGCTATTTTATGAACTTTAATTCATGAG
CAGTTCAGGCTGTTTCACCACAATATAAAGAAGTGGGTGCCAAGGATGAGTTTTCAAGGTACCAGCGAAACCGGAAAAGTTCCCTTGTCCCTCTCACAAGGCATGCGACGGGGCGTGTGG
CTCGCTGCTTCAGTTCCCCGCCGCTCAAACCTGTACGGGAGCAGAGGGGGAGCATACAAACTAGCAGATTGTGGAGCTCCAACCTTAAGGCAGTGTCTAGGAGTGAATGTTTACAACTGA
AGCCCCAGTGGGCGTGTGTTACAGGGTGCTCTTAGTTCAGCCACCCATAGGCAGCTTGTGTTAGCTCCATTAGACCCCTGCCTTATCACAAAGACAGAGGACTTTCTGTATCCCAGGGAT
CTTGCCTTGGTTTACGAGAAGAATCGGATCACACGTGGGCATGGAGAATAAGTGCAAGGTTTTATTAAGTGGAAGTAGCTCTCATCAGATGGGGGAGCCAAAAGAGAGATGGTTTTTCCC
TGGAGCCCGGCCAAACTCCATGTCCTTCCGCTGTCAATGGCCTTCCAGTGTGCTCCTACTGTGTTCAAAATTGGTGGGTTTTTGGCCTCACTGACTTCAAGAATGAAACCCAGTTCTTTA
AGGCAGCGTGTCCAGAATTTGTTCCTTCTGATGTTCGGATGTGTTCAGAGTTTGTTCCTTCTGGCGGGTTTGTGGTCTTGCTGGCTCAAGAGTGAAGCTGCAGAGGCTCAAGAGTGAAGC
TGCAAAGCCTCGCGGTCAGTGTTACAGCTCTTAAGGCAGCGCGTCTGGAGTTGTTCATTCCTCCCGGTGGGTTCGTGGTCTCGCTGGCTTCAGGAGTGAAGCTGTAGACCTTCACGGTGA
GTGTTACAGCTTGTAAAGGCAGTGTGGACCCCAAGAATGAGCAGCAGCAAGACTTATTGCAAAGAGCGAAAGAACAAAGCTCCCACAGTGTGGAAGGGGACCCACGGGGGCTGCCACTGC
TGGCTCCGGCAGCCGCCTTTTATTCTTATCTGGCCACACCCACATCCTGCTGATTGGTCCATTTTACAGAGAGCCGAGTGGTCTGTTTTGACAGGGTGCGGATTGGTGCCTTTACAATCC
CTGAGCTAGACACAAAAGTGCTCCACTTCCCCACTAGATTAGCTAGATACAGAGTGTCCACACAAAGGTTCTCCATGTCCCCACCAGAGCAGCTAGATACAGAGTGTCAACTGGTGCATT
CACAAACCCTGAGCTAGACACAGGGTGCTGATTGGTGTGTTTACAAACCTTGAGCTAGATACAGAGTGCCGATTGGTGTATTTACAATCCCTTAGCTAGACATAAAGGTTCTCCCAGTCC
CCACCAGACTCAGGAGCCCAGCTGGCTTCAGCCAGTGGATGCCGCACCACGGCCGCAGGCCGAGCTGCCTGCCAGTCCCGCGCCCTGCGCCCGCACTCCTCAGCCCTTGGGTGGCCGATG
GGACTGGGCGGCGTGGAGCAGGGGGCGGTGCTCGTCGGGGAGGCTCGGGCCGCGCAGGAGCCCACGGAGCGGGAGGAGGCTCAGGCATGGCGGGCTGCAGGTCCCAAGCCCTGCCCCGCG
GGGTGGCAGCTAAGGCCCAGCGAGAAGTCGAGCACAGCAGCTGCTGGCCTTGGTGCTAAGCTCCTCAGTGCCCGGGGCCGGCTGGCCGCTCCGAGTGCGGGGCCCGCTGAGCCCACTCCC
ACGTGGAATTCGCGCTGGCCCGCAAGTGCCACGCGCAGCCCTGGTTCCCTCCAGCGCCTCTCCCTCCACAACTCCTCGGAAGCTGAGGGGGCCGGCTCCGGCCTTGGCCAGCCCAGAAGG
GGGCTCCCACAGTGCAGCCGCGGGCTGAAGGGCCTCTTAAGCGCGACCAGAGTGGGCGCCAAGGCCGAGGAGGCGCGGAGAGCGAGCAAAGGCTGTGAGGGCTGCTAGCATGTTGTCACC
TCTCACCACGATGGTGCATTGCTCTCCACGTCCAGCCAGTTGAGTGTGTTCCTCCGCTGATGTGCTTCTCTCCACATCCAGCGCCAGTGCCTCTGGCTGCTAGGGTCTCAGAGTTTTTAT
AGGCACAGACCCATTTGAGTGAGAAGGCAGGAGTGCCTGTCCTCATGTAGGTCCGTAGGCACAGGCCCGAGGGTGGAGCCCTAGTTAGGTACCCGCCTTTCTCTACCCAGCACTTCCCGG
CCGCCCCTCCCCCATCACCAGTGATTACCCCATTGGCAAGCCTGGAAAGGCCCTTCAGTGGCATCTGGAGAAGTTATGGGCCTGATTTTGGGGGACAGGAATTACAATATAAGAACATGT
AGATGAGAAGTTTGTGCAAAACTTACTTATGAGAAATCCTGCAAAATCTGTTAAGAGTATCTGAGAGAGGACGGCATGACTTGAACGGAGTGTTAGGATGTCGGGGGAGAATGCAGTGTC
AGGGAACAGAGGTAAATGTTATTAATCTTCTGGAAACGGGAAGAATATTATGAAATGCTTGTCTTGCCACACACACAAAAAAATGGCTTGTAATTTAGAAGACATAAATTCTAGCTATGG
CATCAGCTCTAACTAAAAATTTTACTTGGAAAGATCCCTTCAGTTCTTAGAATTTCAAGATATTACATGAAGGGTCTTCGAGTGTTTTGAAAAAGTCCACAAATGTTGGGAATTATTTTT
TATCTTATATCGTTATGGTTATTTTTGTAAAATTCCAGGTGGATTGCAACAAAGGGGTAACAGGCACCATCTATGAGTATGGAGCCCTCACCCTCAACGGCGAGGAGTACATCCAATTCA
AGCAGTTTGCAGGCAAGCACGTCCTGTTTGTCAATGTGGCCGCCTATTGAGGCTTGGCAGCTCAGTATCCTG
GTAAGAACTCACGTTTCAACTCTTTTGGAAGCAGCATTGCCAGATAGC
CATATTCTAATTCCAGAAGGTTTTACCAATGTGTTATTGGAGGATGCGATGGGAGAACTGATCAGGTGACTCTACCTCCCTAAATGCTGCTCCTGCTCTGCTCCTTAGAATATCAGGATA
ATTATTTCCAGATTTGAGAACTAAGACCTTCCCAAAGACTTAAAGACCACCAGGAGCACACTTGCAGTTGAACAAGTTGAATGTGTTACTCGGTACCCTGAAGGAGAACATGTTCTATAG
AGAACCATGGGGTTTCTTAATAAGAAAGTATTAGAAAGGACTTACTATAGAATCTGAACTTTTGTTACGTGATTTGGAGACGAGTTCAAGGAATTGAAGTTCTGTTCTGGATTGGATGCC
ATCAAGAACTGTGAGCAATTATATGATTTGGTGTCTTAATCAATCATATCTACATGGGGAGAGAAACGAAGACTAAAGCTGTAACTGGTAAAGAAGCAGCAGTCACTCATATTGGCAAGA
ATAGGGTGGTACCTGGTCATTGTTGCGATTTGGACAATGTTCGTGCTTTGTCTATGTTCAGTTACAATTATGCAGTGGCCTTGTTTTTGCCTTGATTCATCATGATCACATGTTATGTGA
TATTGTTTGTATGAAACTGTTCTATGAAGTTGTTTATGTTTCCTAGCAGAGTGCTAAAGCCTAGCTGTGACTCCCAGGCCAGATACCTGGCTTTCAAGGACTGATTTTATGCTTCTCATC
GGTTACTTCTGATAAAAACAGGAGAGATGAGTGATCTTTGATATTCTGGAAAATGCCCTTGGGTTCTGTAGGCACCTGCAAATGACCAAGAGGGAAATGAAGTTTTCTGTCTGGGCAGCC
TTTGATTGGTACAAGGGCTGTGTAGTGTGACTGGCAATGTAGAAGAATGCTCCATCTCGCCAACCTTGGCCTAACCTTCTGTGGTAGCTGAGGTGTGTTTCCATTTTCTTTGTGCCCTTA
TTGGAGAAGAGTTTTGCATTACTGTTGGTCCAGAAAAGGTTATTTAAAATTTTAGATCAATTATACTAGAGATAGATACAGCTTTGGACGGGCCAAGAACTTTATTTTATGCTTTTAAAA
AATGGCTCAAGATAAATTTAAAAGATTTATTGCACCAAATGCCACAGAGAAGTGGATCAAAATAATACATGAACAAATTTTGTTTTGTTTTGAGACAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTG
GAGTGCAGTGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTAGGTTCAAGTGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGTGATTACAGGCATGCACCACTATATCTAGCTAATT
TTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTAGCAGAGGCAGTGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAATGATCCACAAGTCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA
CAGGCATGAGCCACCGCACCTGGTCTATACAAAAACAAGTTTTAAGAAAAATTTTCCACACATTGACACTATTATCTGTTCAGCTGATCAAAAATATATAAACCCTATCAATTTTTCTTA
ATGGATTTTCAGTAATAAAAATCCCAGAATTTTAGCCCTTTTAAGTAACACTTAAAGTCAAGCATATTGTAATCTCATGTCTAAAAGATCTGGCTCACCAAATTTTGACATTTTAAAATT
AACATTCAGAGGATGCTACATGATTTAAGCCAAAATTCTAATAAAATTCCGGCTCCTCCAAAGTACAAATGGCTCACATTTACCAAGAGTAGCTGAATACTTTTCCAATTTAATGGTAAA
ATTATGCATAAAAAGATGCTCTCAAAAGTACAGATTAGGATAAGAATCACACATTTAAAATAATTTGGGGGTCCCTTTGTTATTACTATTATTTTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCGCC
CAGGCTGGAGTGCAGGGGCACAATCTTGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCTGGGATTCAAGCTATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTACAGGTGCATATCACCTCGCCCA
GCTAATTTTTTTTTTTTTTAATAGAGACTGGGTTTCACTATGTTGGTCAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCAACTGCTTCAATCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCA
TGAGCCACCACACCCGGCCTCAATTTTTTTATTTTTATGTACACTCAAGTCTAGGGAAAACCTGAAAAGCTACAGACTAAATTTTTATTATAAGAGCCCAAACAACAATTTAGTATCATT
TAGTAAGTGAGAAAGTTAAAAGAACTTGCCAAAGGAATAGAATCAAGTTCTGCCAATTGTGTCTACTATAGGACCTCAGGACCTAGGTATTAGAGCCCAAACGACAGTTTTGTATCATTT
AGCAGGCAAGAATTCTCCTCCCTTCAAAAAGTTAAATTTGAAAAATATGGTAAATTTTAAAAGTTGTGATGTGTAAACGCAGTTCCATGGAATGTGAAGCTGCTCTTAAATTTGTTTTAA
TTTAATTTAATTTTAACTTAAATTTGCTACATATTGAATAGGCAATATACTTCCAACATTCAAAATTCAAGAGATATAAAAAGGTTTAACAGTGGCACTTGCCATGTTCCCTTCTCTTTA
GGCAACCATTATTATCAGTTTATGGTGTATATTTCCAGAAATCTGTTATGCATATACAAGCAAACATTTCTCTCTCACTTTCTTTCTCTCAAGCACATACACATACACAAACATACACAC
AGAAATGATTATGCACATTGCTTTTTCACATATATCACATACAGTGGGGACAGGAGTGGTGGCTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGA
CCAAGGTGGCCGGATCACTCTTGAACATCAGGAGTTTCAGACCAGCCTTGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAATTACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTA
ATCCCAACTACTCAGGAGGCTAAAGCATGAGAATCTCTTGAACCTGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAAATCCTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGAGACTCTGTCTAAA
AACAAAACAAAAAAACATGGTGAGCTTCCTCATTCATTTTAAGGCATAGTATTCCATTGTGTTGCTGTGATATAATTTATTAAATTAGTTCATGAGAATTTTAAAGAGCACCTCATTCAA
ATTTTACTCCAGATGAGAAAATTGAGAGAATTAAAGAAACTTGCCAAAGGAATAGAATCAAGGTCTGTTAAGTGTGTCTGCTATAGAAAGGAAATATTCTTGATGGCCAAAGATAAGAGA
GAGATGAGTTTCGATAGCAACCGAAGAACTATAGAAAAACAGGAAGGCACTCTCTATTTAAGAGGAGGTTCTTAGGGGACATTCCAGCAGGCAGAGCTGAATCTGAATGACAATGGCCAG
TACAAGTTCTGAGGTCTGAATAAATCTTACCTGAAAATAGCTGAAGATGGAAATTATGATTCAAGTCTAAACAGACAAGCTGGAAGGTTCCTGACAGTAGTAAAGAGCAATTTGGAGTTT
ATGGCCTGGCGTCCCAGGGAGTGTTCCAGGGCATGTTGCAGCATCAGTTAGGTCACTGGAATTGAGGAGAGGGTACAGAATACTGTAGAGGATAGCCTTGGAATTTCTCTTTCTCTACCA
CTCCCAGGGTGGAGCACCAAGGAGTACTCCTGGGAATGGGACTGGAACTGGAGTGTCTGGTTGTGTCACCATGGGACATTGTATGAGTGGGGCCGGGGGGATGCAGGGATAGGTGGGTAG
GATTTCCATTTTGTTTGCTTTTTCCTTACAATTTTTTTTGATCAATTCATCAACTAAGGAAGACAGTGGCATTCAAATCTGACTTCTCTTTAGAGTCAAACAGGACTCCCACACAAGGCT
ACCAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAAAAAAAAAAATAAGAGTTCTCATTGGATGGTAAAGTGTAGCCAGGCATGGGAGCTACTGTATAAGAAAAACAGCAGCCATT
CAGATGCATTTCTGGAAACGTGTGCTCTAGTCTTTTTTTTTTTTCTCTACTCCTTTGATCTCTGTAACCTTGAATCTTTCCCTTCTTAGTCCTCGGTTTATTCATGTGATAAATGGATAC
ATTCAGTGATCTTTCACTGCTTGAGGTAGGCCTCCTGACCAGCCCACCCCTGCTATTCATTGTCCACTTACAGAACTGAATGCACTACAGGAGGAGCTGAAGAATTTTGGTGTCATTGTG
TTGGCCTTTCCCTGCAACCAGTTTGGAAAACAAGAACCAGGAACAAACTCAGAAATACTTCTTGGTCTCAA
GTGAGTGCTTGCATGGGACCCTGCAGATGCCCTGTCGGGATTTCCATTC
CTCATTCCACCTAGATGCCTGCCTATTCTGGAAACTTCTGGGATAGGCCATAGATACATGGGTTGAAGCATATCCTTATGATGTTTTGAATTCAATCTATTCTATTCACAGTGCTCAAAT
ATTCTCTTTACTTTTGAATTATTTGATGGTGAGGCTAAGGGAAGATTGAATGGAAAAGAAGCATAGAGAAAAGAAGGGAGTATAAGAAATAAGAAATGGAAGTGAAGCAGGAAACCTAAG
CTCAAAATATTGCCTTCCAATTTTCTTAGAATTCTCTATTGGCGCCATAAAGCCTATTGCATAAAATCCTGCTTCCCACAGACTATCTTTTCTTATCTTCCCTGTGCACAGCCTCTTCCC
TTTATCTTGAATTTCCTGTGGTAGTGAATTGGTGGTGGCCATTATTTTCCATCCATGTCTTAATTTGTATCTTGCTGGGAACAACTTTGGTTCACTGCAGGTATGTGTGTCCAGGTAGTG
GCTTTGTCCCCAGTTTCCAGCTCTTTGAGAAAGGGGATGTGAATGGAGAAAAAGAACAGAAGGTCTTTACTTTCCTGAAG
GTGCATGAGTATAAACCTGGCATGGATGGGTTAGCTAGAA
ATGCTCTGAAAGCAGTGGGGCTCATGTCTAGGGTTGTGGTTGGACTCCTTGGAAAAGAGATGCTCAGATAAGTTCAAGGCTCATGGCAATATCTGCTGTGATGCTTTAGCTTTAAGTAGA
GGAAACCCATGATGGACAATAGCTCTGACATGGACTACCCTCCTGTATTGAATGGAATGATTCATTCATTCAGCAATCATTTATCAGATCTCCAGTATGTGCTATATGAGTTAACAAACA
TTAATAGCGCATAGTCTGTTCCCTGAAGGAACTCACATTTAATCAGGAGACAGACATGGATGATACAGAATACCATGTGGTAAATGCTTTTAGAGTCACAGAGTGGTAAAAATACAGAAT
ACCAGGATAGAAGGACCCCCGAGGGTCTCTTTGTCTACTCAGCCCGAAATGCTGGTCTGCAGAACAATGCTGGTCCTGCTGAAATTTTCACTCATCCACAGCAAACAAGGGAAAAAAGAC
AATGCAGAATTTTTCATAAAGCTCAACTTATTGAATATAAGACCAACATTTATTCTGACATTAAATTACTATTACGTTTACCCATATAAATTGCCCTTTACTTACTCAAAAATGGTGCTA
TAATCAATTTTATGTGGTACAACTGAGTATTTAAAAATCCCTTAATTTTTAAATGTGTGCTTACAGTAGACTTTTAATTTTTCTTATTGGCAAAATGAGTATTAGTGATTCTACGTTAAT
ATCCAAGGAAATAGTTATTGAAATTTTACTGGCTTATGAAGCCTATGAAGCCCCAAACTCTGCGAGCCACTACTCTAAATCAATCTCTTTTTTTTTCTGCTAAGGAAACGAACTGTAGAA
ATGATATGACTTGCCCAAGGAAACAGAAAATAGTCTTTTACTGAATCATCGTGATAAAACCATGGAAATAGAGGAAAGACAGGGAAAGGAGGAATGCTTTCTATTTACCATTATACTCTC
TAACTCTCGGTTATTTGGTAGTTGGTGTATTGGTATTGATACATTGCAGTGTCTGTGGTTGATTGGAAGCATGCAAAGTAGTTAATATATTAAAATACATAATGGTGAGTAGACTCTCTA
GTCTGGAGATAAAACTGTACCACACAGAAGTAGAAATAAAGTAGAAATAAATGTATATCTCTACTTTCTATATCTCTGCTCCAGAACTCCTGCCCTCCGACCTCTGATCTTTTGGGCTCA
TCAAGCCAACTCTTCTGGGAGCCCATGAAGGTCCATGATATCCGCTGGAACTTTGAGAAATTTCTGGTGGGGCCCGATGGAGTCCCTGTCATGCATTGGTTCCACCAGGCTCCAGTCAGC
ACAGTCAAGTCAGACATCCTGGAGTACCTAAAGCAGTTCAATACCCACTAG

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGTTCCAGCAGTTCCAGGCCTCCTGTCTTGTCCTGTTTTTCCTGGTTGGCTTTGCTCAGCAGACCCTAAAGCCTCAAAATAGGAAGGTGGATTGCAACAAAGGGGTAACAGGCACCATCT
ATGAGTATGGAGCCCTCACCCTCAACGGCGAGGAGTACATCCAATTCAAGCAGTTTGCAGGCAAGCACGTCCTGTTTGTCAATGTGGCCGCCTATTGAGGCTTGGCAGCTCAGTATCCTG
AACTGAATGCACTACAGGAGGAGCTGAAGAATTTTGGTGTCATTGTGTTGGCCTTTCCCTGCAACCAGTTTGGAAAACAAGAACCAGGAACAAACTCAGAAATACTTCTTGGTCTCAAGT
ATGTGTGTCCAGGTAGTGGCTTTGTCCCCAGTTTCCAGCTCTTTGAGAAAGGGGATGTGAATGGAGAAAAAGAACAGAAGGTCTTTACTTTCCTGAAG
AACTCCTGCCCTCCGACCTCTG
ATCTTTTGGGCTCATCAAGCCAACTCTTCTGGGAGCCCATGAAGGTCCATGATATCCGCTGGAACTTTGAGAAATTTCTGGTGGGGCCCGATGGAGTCCCTGTCATGCATTGGTTCCACC
AGGCTCCAGTCAGCACAGTCAAGTCAGACATCCTGGAGTACCTAAAGCAGTTCAATACCCACTAG

Retrieve as FASTA