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Entry information : AmelPxt01
Entry ID 3670
Creation 2007-01-09 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2016-01-15 (Achraf Jemmat)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AmelPxt01
Name AmelPxt01
Class Invertebrate peroxinectin    [Orthogroup: Pxt001]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Arthropoda Insecta Apidae Apis
Organism Apis mellifera (Honey bee)    [TaxId: 7460 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AmelPxt01
start..stop		 S start..stop
NviPxt02 922 0 28..774 26..774
TcasPxt02 637 0 93..772 33..696
FchPxt01 449 3.1e-148 102..770 4..652
PlenPxt01 452 5.76e-148 102..770 137..785
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '3670' 'join(2354969..2355050,2361450..2361593,2375031..2375337,2377658..2377875,2380546..2380584,2381676..2381852,2382003..2382199,2382310..2382493,2382740..2383082,2383176..2383506,2383657..2383855,2383945..2384054)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 2354969..2355050 80 N° 2 2361450..2361593 142 N° 3 2375031..2375337 305 N° 4 2377658..2377875 216
N° 5 2380546..2380584 37 N° 6 2381676..2381852 175 N° 7 2382003..2382199 195 N° 8 2382310..2382493 182
N° 9 2382740..2383082 341 N° 10 2383176..2383506 329 N° 11 2383657..2383855 197 N° 12 2383945..2384054 108
join(2354969..2355050,2361450..2361593,2375031..2375337,2377658..2377875,2380546 ..2380584,2381676..2381852,2382003..2382199,2382310..2382493,2382740..2383082,23 83176..2383506,2383657..2383855,2383945..2384054)


exon

Literature and cross-references AmelPxt01
Literature Zhang,L. et al., Direct Submission(04-NOV-2010) Human Genome Sequencing Center, Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine.
Protein ref. GenBank:   XP_392481.4
DNA ref. GenBank:   NW_001253451.1 (2354969..2384054)
Protein sequence: AmelPxt01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   776
PWM (Da):   %s   87089.28  
PI (pH):   %s   7.6
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MFLIAPVDNNRWAYTMHGLEKPMDHVSAGGLMAGSVATLAILWVSLQTMGFLGNTHTIGAYKLPISLQNYLASYTGLPMTNYPYEGGVVDTGRTHNRRYPHIDEAVLNNSISFAQSLVDR
MSTLERNIANAGVELMAHTPAGKQFLDSYPSEDAFERGLDAIVAMKASSYLLHQSCHRFGLDPPHRARFISTLSLEGTPLNSTCPSSRHKGCNSLAKYRNIDGSCNNVQNPSWGSAMTAY
TRILFPQYFGCPGREILSSSRMWIQEPRRMGHTRKPLPGARSISVAVSTPNDQSDVSRTLTVMQWGQFVANDISYTPMRKMVSTGKPISCCRSDGNTLSPRYVHPDCSVIMVPDRDPIYG
QHYVRCMNYVRSLPVLKAECTFGPAEMNQASHFLDGSAIYGSTLKKSRQLREFEGGRLRVHKESNHEFLPIGEDEISSACAKNCYNSGDYRVNTHPQLAVIHTIWHREHNRIADKLAELN
PNWSDETLFQEARRIVIAEIQHITYKEWLPILLGKRYTRAVGLTVGNSYSRNYNSEDDPAISNEVATAALRFLTSLMQGKISLTDDKRQINKTVSLSEYFFKPIIIESDEVFDGLLRGMA
TQTSQKMDVSIIEDVTSKLFAAGQDSLGLDAISLDIQRGRDHGLPGYNHYRKYCGLPIANTFDDFLDYISVMMKKLRALYAHPDDVDLIIGGMAERPVDDGLLGPTFRCLIFEQFSRTRR
TDRYFYDSAYQPHPFTPEQLAQIRNVTLARIFCDNGNNITQMQPNVFLRPQAE

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="DH4". Similar to peroxinectin. Phylogenetically on the branch with Dm chorion peroxidase
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTTCTTATTGCACCAGTGGACAATAATCGCTGGGCCTATACGATGCACGGATTGGAGAAGCCTATGGATCACGTGTCTGTGGTAATGTGCCTGCTAACTATATTTTAAATATTTACT
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AATGACGTCAATGTTTTTTCAAACTTCATTTCATTATCTTAAATGTGATGTGGAATGAACAATATCCTACAACCATAATTATTAGAATAATTTGAACGTTCAACACAATAACAATTTTGA
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ATGTAATTAAAATATTGTAATAATTACATTTTATTTATTATAAATATTTTAAAACCATCTTCTGAACTCCTAACAGTGCTTCATTCTCTAAAAATGTAAAATTCTACCTTCTATATTCTA
AAATTCACCAACTAATAATTCTTTCGAAATTTTTAATTGAATATTGACACAACAATTCTATGTTCAATCATTTATCATTTCCTATTTATTTTTTTTTAATTTCTACGTTACACGTTTAAA
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CCTATCTAATTTCTACCAACATAATTCAAACATCATTCAAAACACTTCAAGAGTGTTAAATTTATTGCTCCTCGTCACAATCACCGTTATATATTCGTTATACATTTCTTTTTTCATTAT
TAAAAGCATTCAATATTATCAACTTTATTATTTGCTTAAATATCTCATTGAAGATTATTGCCACTTCGAATACAATATCAACGTTTAACCAAGCAAATTGATCATACAAATTACTCTTGC
AAAAACTTAACTCGCGTGTTAGATCCACCTCTGAATTTATATTATACACAGAAGCACAAAATCTCTCTTGCCGCAAAAAAAATTGACAGCCTTAAATAATATATCCCATATATATATATA
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GTCCGTCATCGCGGCACAAGGGGTGCAATTCTCTGGCCAAGTACCGAAACATCGACGGCAGTTGCAATAATGTCCAAAATCCAAGCTGGGGTAGTGCGATGACCGCGTACACCAGAATTC
TCTTCCCCCAGTATTTCGACGGTAAGGGTGTTTCCTACCGTGTGACGATCAGCAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAGGAAAAAGAAAGAAATTTTAAAGACAAATGACTTGT
CTACCATATTTCACTACAATCGTCCGTTTTAGAGAAATTCGCGAAAAAATTCGTCGACGGTCTACGGCTCGAAATTATTATCGTTTCGTTTCTCGCTGGGCACACTTCGGTTTTTTTTAT
CTCTCGCTCGTAGCGTAACGCGATACGCGTCGTTTGCTGTGTTTTTTACGCTCGGCTTTGGACGGAATCGGACATTCTGGACGGACGCAAGAAACGGAAGCGGCGAACGGGAAGAAGAAT
ATTATCGAGATACATTTGAACCCTCTATGTACCGTGTTGTTGTCGTTATTTGTGTGGAATAATAATCGTTCAATTATTTGCAGCCTCTGAACGCTCTTGGCGCTTCCTTCTTCTCCTTTT
CTCACGTATCCGTCCCCTCACTCCTCTGATTGTCGTTTGATATTTTTTTTTTTTTTCTTTTGTTGTACTAATTTCTTCTGGAAGGGAATGATTTCGTTTCTTTTCTTTTAACTTACGATT
TAGAACGGCCGATGATCCAAGGATATTATTTTGTCGATCACGTTTGTACGCGATTTTCTTGTGGAAAGAAAAGATTCCATCTATATTCTTATTCTTATGGGATATAGGATGTGTTTGATC
TGTTTTCATCTGTGTTGTGGAGATGTATTTTGTGTCCCACGTTCGATCATCTATTTTCTAATTCCGATTTCTGAATTCATTGAGAAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTCTCCAACGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCGCCTGAGAAGAAACCCTAACTTTTATCCCTAAGGATAGGGAACG
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CAAGAGAGGGGGTTGAATAGAAAAGAGAGAGAGGATAGAGAGAATTCTGTAGTCCGTAAACGCGGTGCTCGTGTTCAGTCGTCTTCAGTCCAACTTGGATACGCTCCTCGGCTTGTCCTC
AGCAGCCAGTTTTCATAAACGTATCCGCGAAATATTTTTCCCACTTTGCCGTGAATTGAACCAAAGGTGAATGCACCTGTACGAGCAGATACTCCAACTAGAGTATCTATTCCAAGACTA
ACGAGTTCATTAACGAAACCGGTCTAATTTATTTGAAATTTCTATCAGAAGGAAAATCTTCTCCTTCTGTTTGATCAATCTCGTCTCAACTCAACGTGTGCGCGTCGAAATTAATAGGAA
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TATTTTATCCTCGTGTTTTATTACAATGTTCGGTTCCGTTAATTTAGTTGGCCTACAAAATAACAGGCAGTAAAGAAAATAATATCATTTTCAATATTTCAATAAAAGCACACGTACTTA
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TTATACATTCTAAACGAATTTTGTGAAAGTTAGAAAATAGAAAATTCGAGATATTTAATACTATATTTCAAATGTTATACTTTATTATTATTATTTATTATTCTTAGAATTTTATATTGA
TTTTTTTTTTTTTTTTACGATTTCTATACTCCAAGTATTTTCTCTAGTACAGTATCTTGTTACTGTTATGAAATATAGAATGTAGCTACTTATCTCTCAGAGTATTGTACTCGTTCACCT
CGTACTACTGCACTGGTAGATATATACGATATACCGCTTGAATATATAAATTTAATAATTTAATATTAATAACCAATTTATTTCTTATTCAAAGTACGGACATTAAAAGGAAAACAATAG
TTTTCAATTCTAAGGAAGAAATTTTAATTATGTAGTAATCTCAAAAATATTGAATTTTTAATTTTTATCGTAAAACTTTTTTATTCGAGTATGTTTATATCTAAATAGCAAGACAAGACA
AGTTGAAGACAATATTACGAAAGTAAATATTGAGACACACGTCCTGGGAATTCGACCGGTAATTTCCGAATCCAAACGAATTATTCTATACAACGTGTGCGTTCAAATTCTCACATCATA
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TACTTGTCTTTCTTGTCTCTATTGTTTCTCTTGCTTCTGAAAACATTACTTAAATTATTCGTATATATATTTGTATAAAAATACATAAGTTAAACGAAATTTGAAACTTTTATTGAAATT
TCAAATAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAGAGGAAAAAATGTTGAGTACAAACAATAATATTGATTTTTCGTATCTGAAATGTTATCTAGGTCAAGATACTATTTTTTAAAACACTTAG
TCATTTATCAATATCTCGATTGCACTTATATTTATATGTATATAGTTATATAAATAACATACATATAAATAAAAATTTTTAAAAAAGATATCAATAACGAAATTGCATCGTATAATGCAA
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CGTACTTTATCTACTGTACATTATTGATTGAAAAATGTGGTAGTGAAAAAATTTAAAAAATATTTTTGTGAACGATCAAATGATACGATAAATAAAAAAAAAAAATAAAATTTATTCAAA
AATTGAAATGGAAATTTTGATAAGTTATAAGTAATAAATTATTTTTTTAAACTAATATCATGCTATAATGGTGGATTTTGAGTCATTATTATTGTAGAAAATAATTTTAAAAATTCGTAG
AAATATACGATGTGTTTTTAATTACAGCTAATTTAATATTCTAATAATAATCATACAAGTGTTTGAATTAATAAAGATGAATTAATACATTGAAAAAAACATTTGCACTCCATATGCGTT
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