Entry information : PcMnP01-1B_RP78 (PcMnP01b_RP78)
| Entry ID | 3829 |
|---|---|
| Creation | 2006-08-29 (Filippo Passardi) |
| Last sequence changes | 2011-11-23 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2012-03-28 (Catherine Mathe (Scipio)) |
Peroxidase information: PcMnP01-1B_RP78 (PcMnP01b_RP78)
| Name (synonym) | PcMnP01-1B_RP78 (PcMnP01b_RP78) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Manganese peroxidase [Orthogroup: MnP001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Corticiaceae Phanerochaete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Phanerochaete chrysosporium [TaxId: 5306 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '3829' 'complement(join(853774..853856,853915..854329,854399..854620,854693..854870,854933..854999,855057..855108,855169..855288))' |
Exons►
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Literature and cross-references PcMnP01-1B_RP78 (PcMnP01b_RP78)
| Literature | Martinez,D., Larrondo,L.F., Putnam,N., Sollewijn Gelpke,M.D., Huang,K., Chapman,J., Helfenbein,K.G., Ramaiya,P., Detter,J.C., Larimer,F., Coutinho,P.M., Henrissat,B., Berka,R., Cullen,D. and Rokhsar,D. Genome sequence of the lignocellulose degrading fungus Phanerochaete chrysosporium strain RP78. Nat. Biotechnol. 22 (6), 695-700 (2004). |
|---|---|
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_15 (855288..853774) |
Protein sequence: PcMnP01-1B_RP78 (PcMnP01b_RP78)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (9 introns). No EST. Strain="RP-78". | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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